Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Infrastructure for transnational access and discovery in structural biology

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Initial Data Management plan (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Second update of the iNEXT-Discovery Data Management plan (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Second update of the iNEXTDiscovery Data Management plan

API for structure refinement and model building pipeline for fragment screening (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Report on structural biology data management practices (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Report on structural biology data management practices (EMBL-EBI)

Next generation of myISPyB available to all facilities (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Generation of PDB-Dev-compatible mmCIF files from models / restraints (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Generation of PDBDevcompatible mmCIF files from models restraints

Report on standardized data model for fragment screening data (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Report on standardized data model for fragment screening data EMBLEBI

Protocol and standards for NMR fragment screening experiments (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
API enabling communication between crystallization facilities and synchrotrons (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

API enabling communication between crystallization facilities and synchrotrons (EMBL-GR)

First update of the iNEXT-Discovery Data Management plan (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Tools and protocols for BMRB deposition of protein interaction data (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Database blueprint for NMR (meta)data for fragment screening (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Database blueprint for NMR metadata for fragment screening

33 specialized access days to cryo-EM at CEITEC (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Protocols for joint NMR/cryo-EM structural refinement of membrane proteins and viral capsids (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Protocols for joint NMRcryoEM structural refinement of membrane proteins and viral capsids

910 hours to MX, BioSAXS, plate screens and in vivo crystallisation at SOLEIL (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
9 fragment campaigns at HZB-MX (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
130 days to solid-state NMR at BMRZ (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

30 days to solid-state NMR at BMRZ

Instrument for automated measurement of ice thickness in cryo-EM (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Instrument for automated measurement of ice thickness in cryoEM EMBLHD

Characterization of RNA refolding by in-cell NMR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Characterization of RNA refolding by incell NMR

Protocol isotope labelled photochemically locked RNAs in prokaryotes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
New statistical model implemented in PanDDA software (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
856 hours to ALBA-CELLS (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
130 days to solid-state NMR at CERM/CIRMMP (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
203 days to solution NMR at UU (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
40 days of high-resolution cryo-EM at CBI (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
192 hours of SSX to the BioMAX at MAX IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
86 days of cryo-EM at AU (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
NMR for kinetics and thermodynamics of protein-ligand interaction (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

NMR for kinetics and thermodynamics of proteinligand interaction

250 days to solution NMR at BMRZ (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

350 days to solution NMR at BMRZ

Second report on training activities (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
140 days for macromolecular interactions at NKI (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Approved schematic plan for iNEXT-Discovery ARIA (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Scripts for automatization of 3D fiducialisation in SRCLXM (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
106 days of cryo-EM access at NeCEN (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Robust, automated sample evaluation workflow for X-ray crystallography (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Robust, automated sample evaluation workflow for X-ray crystallography (EMBL-HH)

Report on Thematic Calls (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
12 cryo soft X-ray tomography experiments at DIAMOND (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Protocols for lamella production with cryo-FIB (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Protocols for lamella production with cryoFIB

Provide grid maps scored based on ice thickness to microscope (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Provide grid maps scored based on ice thickness to microscope EMBLHD

Workflow for real-time in-cell NMR measurements in the bioreactor (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Workflow for realtime incell NMR measurements in the bioreactor

Data exchange standards for dataset exchange and analysis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
First report on training activities (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Data collection protocols optimized for ligand detection (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Data collection protocols optimized for ligand detection (EMBL-GR)

152 days of access to the CryoCNB facility (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Dissemination plan (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
208 days of supervised standard cryo-EM at EMBL-HD (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
First report on outreach and dissemination (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Review of implementation quality and improved usage (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
116 days of solution NMR at RALF-NMR, Grenoble (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Report on networking within the consortium and with (potential) users (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
71 days of access to electron microscopy platform at ABSL (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Robust, automated sample evaluation workflow for single-particle cryo-EM (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Robust automated sample evaluation workflow for singleparticle cryoEM

Optimised NMR experiments for light-induced kinetics and transitions (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Optimised NMR experiments for lightinduced kinetics and transitions

Diffraction-based score as a function of each crystallization condition (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Diffraction-based score as a function of each crystallization condition (EMBL-HH)

In situ NMR laser illumination device combing at least 3 wavelengths (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
NMR methods for site-specific measurement of dynamical parameters (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

NMR methods for sitespecific measurement of dynamical parameters

Protocols for 3D fiducialisation for SRCLXM and SRCLEM (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Scripts for cryo-FIB automatization (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Scripts for cryoFIB automatization EMBLHD

Robust, automated implementation of sample evaluation workflow for cryo-ET (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Robust automated implementation of sample evaluation workflow for cryoET

Report on user experience about iNEXT-Discovery access protocols (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Report to Open Science journal on iNEXT-Discovery Covid-19 research projects (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
List of ARIA captured data for proposal and user experience evaluation approved (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
29 days of cryo-EM/tomography at CBI (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Web report of capabilities to conduct time-resolved NMR experiments (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
113 days of sample preparation and characterization at EMBL-HH (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Second report on outreach and dissemination (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Report on outreach activities to attract industry users (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Report on outreach activities to attract industry users EMBLGR

88 days of solid-state NMR at RALF-NMR, Lyon (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Final report (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
220 days to NMR at CEITEC (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Proof of concept for advance data analysis pipelines at EMBL-GR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Protocol isotope labelled photochemically locked RNAs in eukaryotes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Sustainability Working Group meeting report (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
202 days to solid-state NMR at UU (min. 50 days DNP) (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

202 days to solid-state NMR at UU (minimum of 50 days DNP)

Document on collaboration of iNEXT-Discovery and food community (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
10 days to Online Crystallography at EMBL-GR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
1320 hours of MX/SAXS at EMBL-HH (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Analysis of binding location and affinity increase of ligated fragments (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
126 days of access to cryo-EM at DIAMOND (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
320 hours to the HZB-MX beamlines (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Second progress report (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Software framework for custom-built data analysis pipelines (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Software framework for custombuilt data analysis pipelines

Protocols to correlate cellular ssNMR with cryo-EM and microscopy readouts (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Protocols to correlate cellular ssNMR with cryoEM and microscopy readouts

72 days to fragment screening by MX at EMBL-GR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
12 fragment screening campaigns at DIAMOND (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Report on expanding interaction possibilities with industry (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Report on expanding interaction possibilities with industry (EMBL-GR)

262 days to solution NMR at CERM/CIRMMP (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Position paper on developments in time-resolved structural biology approaches (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
60 days of correlative cryo-EM at EMBL-HD (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
115 standard access days to cryo-EM at CEITEC (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Report on measures to compensate for the absence of hands-on on-site training (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Report on measures to compensate for the absence of handson onsite training M24 NKI

10 serial, 8 nanocrystallography, 10 long wavelength experiments at DIAMOND (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Processing of multiple facility data in common pipelines (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Sustainability plan (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
ssNMR methods for kinetics of drug-receptor interaction in cell surfaces (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

ssNMR methods for kinetics of drugreceptor interaction in cell surfaces

First progress report (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Investigation of RNA refolding from user application (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Tool for identification of follow-up compounds from fragment hits (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Tool for identification of followup compounds from fragment hits

77 days of optimization cryo-EM at CBI (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
70 Mail-in bioSAXS experiments at DIAMOND (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
6 days to ligand binding characterization at EMBL-GR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Combining solution NMR and SAXS/SANS data for IDPs (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Combining solution NMR and SAXSSANS data for IDPs

Light-induced transition in a photo-switchable fluorescent protein (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Lightinduced transition in a photoswitchable fluorescent protein

440 hours of FragMAX at MAX IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Software tool for automated analysis of spectra (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Management Guidelines in place (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Pilot repository for fragment screening data (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Pilot repository for fragment screening data (EMBL-EBI)

Cryo-EM image-based quality scores by on-the-fly image processing (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

CryoEM imagebased quality scores by onthefly image processing

Publikacje

Ligand-Based Competition Binding by Real-Time 19F NMR in Human Cells (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Luchinat E, Barbieri L, Davis B, Brough PA, Pennestri M, Banci L.
Opublikowane w: Journal of Medicinal Chemistry, 2024, ISSN 1520-4804
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.3c01600

The CCP4 suite: integrative software for macromolecular crystallography (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Agirre J, Atanasova M, Bagdonas H, Ballard CB, Baslé A, Beilsten-Edmands J, Borges RJ, Brown DG, Burgos-Mármol JJ, Berrisford JM, Bond PS, Caballero I, Catapano L, Chojnowski G, Cook AG, Cowtan KD, Croll TI, Debreczeni JÉ, Devenish NE, Dodson EJ, Drevon TR, Emsley P, Evans G, Evans PR, Fando M, Foadi J, Fuentes-Montero L, Garman EF, Gerstel M, Gildea RJ, Hatti K, Hekkelman ML, Heuser P, Hoh SW,
Opublikowane w: Acta Crystallogr D Struct Biol., 2023, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798323003595

Overarching control of autophagy and DNA damage response by CHD6 revealed by modeling a rare human pathology (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Yulia Kargapolova, Rizwan Rehimi, Hülya Kayserili, Joanna Brühl, Konstantinos Sofiadis, Anne Zirkel, Spiros Palikyras, Athanasia Mizi, Yun Li, Gökhan Yigit, Alexander Hoischen, Stefan Frank, Nicole Russ, Jonathan Trautwein, Bregje van Bon, Christian Gilissen, Magdalena Laugsch, Eduardo Gade Gusmao, Natasa Josipovic, Janine Altmüller, Peter Nürnberg, Gernot Längst, Frank J. Kaiser, Erwan Watr
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-23327-1

Studies on the Interaction between Model Proteins and Fluorinated Ionic Liquids (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Alves MMS, Melo MN, Mertens HDT, Pereiro AB, Archer M
Opublikowane w: Pharmaceutics, 2023, ISSN 1999-4923
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/pharmaceutics15010157

Status and perspective of protein crystallography at the first multi-bend achromat based synchrotron MAX IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ana Gonzalez, Tobias Krojer, Jie Nan, Monika Bjelčić, Swati Aggarwal, Ishkan Gorgisyan, Mirko Milas, Mikel Eguiraun, Cecilia Casadei, Manoop Chenchiliyan, Andrius Jurgilaitis, David Kroon, Byungnam Ahn, John Carl Ekström, Oskar Aurelius, Dean Lang, Thomas Ursby, Marjolein M. G. M. Thunnissen
Opublikowane w: Journal of Synchrotron Radiation, Numer 32, 2025, ISSN 1600-5775
Wydawca: Journal of Synchrotron Radiation
DOI: 10.1107/s1600577525002255

Modulation of Aβ42 Aggregation Kinetics and Pathway by Low‐Molecular‐Weight Inhibitors (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Marie‐Theres Hutchison, Giovanni Bellomo, Alexey Cherepanov, Elke Stirnal, Boris Fürtig, Christian Richter, Verena Linhard, Elina Gurewitsch, Moreno Lelli, Nina Morgner, Thomas Schrader, Harald Schwalbe
Opublikowane w: ChemBioChem, Numer 24, 2023, ISSN 1439-4227
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202200760

Algorithmic robustness to preferred orientations in single particle analysis by CryoEM (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: C.O.S. Sorzano, D. Semchonok, S.-C. Lin, Y.-C. Lo, J.L. Vilas, A. Jiménez-Moreno, M. Gragera, S. Vacca, D. Maluenda, M. Martínez, E. Ramírez-Aportela, R. Melero, A. Cuervo, J.J. Conesa, P. Conesa, P. Losana, L. del Caño, J. Jiménez de la Morena, Y.C. Fonseca, R. Sánchez-García, D. Strelak, E. Fernández-Giménez, F. de Isidro, D. Herreros, P.L. Kastritis, R. Marabini, B.D. Bruce, J.M. Caraz
Opublikowane w: Journal of Structural Biology, Numer 213/1, 2021, Strona(/y) 107695, ISSN 1047-8477
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2020.107695

Discovery of novel druggable pockets on polyomavirus VP1 through crystallographic fragment-based screening to develop capsid assembly inhibitors (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Osipov EM, Munawar AH, Beelen S, Fearon D, Douangamath A, Wild C, Weeks SD, Van Aerschot A, Von Delft F, Strelkov SV.
Opublikowane w: RSC Chemical Biology, 2022, ISSN 2633-0679
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2cb00052k

Site-Selective Functionalized PD-1 Mutant for a Modular Immunological Activity against Cancer Cells (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Fallarini S, Cerofolini L, Salobehaj M, Rizzo D, Gheorghita GR, Licciardi G, Capialbi DE, Zullo V, Sodini A, Nativi C, Fragai M.
Opublikowane w: Biomacromolecules, 2023, ISSN 1526-4602
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biomac.3c00893

Whole-proteome structures shed new light on posttranslational modifications (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Robbie P. Joosten, Jon Agirre
Opublikowane w: PLoS Biol, 2022, ISSN 1545-7885
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001673

Amyloid-like DNA bridging: a new mode of DNA shaping (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Frank Wien, Marcos Gragera, Tatsuhito Matsuo, Gautier Moroy, María Teresa Bueno-Carrasco, Rocío Arranz, Antoine Cossa, Anne Martel, Heloisa N Bordallo, Svemir Rudić, Marisela Velez, Johan R C van der Maarel, Judith Peters, Véronique Arluison
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 53, 2025, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf169

UBAP2L ensures homeostasis of nuclear pore complexes at the intact nuclear envelope (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Liao Y, Andronov L, Liu X, Lin J, Guerber L, Lu L, Agote-Arán A, Pangou E, Ran L, Kleiss C, Qu M, Schmucker S, Cirillo L, Zhang Z, Riveline D, Gotta M, Klaholz BP, Sumara I
Opublikowane w: Journal of Cell Biology, 2024, ISSN 1540-8140
Wydawca: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.202310006

Monitoring Protein-Ligand Interactions in Human Cells by Real-Time Quantitative In-Cell NMR using a High Cell Density Bioreactor (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Letizia Barbieri, Enrico Luchinat
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 169, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62323

High-resolution structure of stem-loop 4 from the 5'-UTR of SARS-CoV-2 solved by solution state NMR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Vögele J, Hymon D, Martins J, Ferner J, Jonker HRA, Hargrove AE, Weigand JE, Wacker A, Schwalbe H, Wöhnert J, Duchardt-Ferner E.
Opublikowane w: Nucleic Acid Research, 2023, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad762

ZART: A novel multiresolution reconstruction algorithm with motion-blur correction for single particle analysis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Herreros D, Kiska J, Ramirez E, Filipovic J, Carazo JM, Sorzano COS.
Opublikowane w: Journal of Molecular Biology, 2023, ISSN 0022-2836
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2023.168088

A bitopic agonist bound to the dopamine 3 receptor reveals a selectivity site (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sandra Arroyo-Urea, Antonina L. Nazarova, Ángela Carrión-Antolí, Alessandro Bonifazi, Francisco O. Battiti, Jordy Homing Lam, Amy Hauck Newman, Vsevolod Katritch, Javier García-Nafría
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-51993-4

Comprehensive Fragment Screening of the SARS-CoV-2 Proteome Explores Novel Chemical Space for Drug Development (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Berg H, Wirtz Martin MA, Altincekic N, Alshamleh I, Kaur Bains J, Blechar J, Ceylan B, de Jesus V, Dhamotharan K, Fuks C, Gande SL, Hargittay B, Hohmann KF, Hutchinson MT, Korn SM, Krishnathas R, Kutz F, Linhard V, Matzel T, Meiser N, Niesteruk A, Pyper DJ, Schulte L, Trucks S, Azzaoui K, Blommers MJJ, Gadiya Y, Karki R, Zaliani A, Gribbon P, Almeida MDS, Anobom CD, Bula AL, Buetikofer M, Caruso
Opublikowane w: Angew Chem Int Ed Engl., 2022, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202205858

An integrative structural study of the human full-length RAD52 at 2.2 Å resolution (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Beatrice Balboni, Roberto Marotta, Francesco Rinaldi, Giulia Milordini, Giulia Varignani, Stefania Girotto, Andrea Cavalli
Opublikowane w: Communications Biology, Numer 7, 2024, ISSN 2399-3642
Wydawca: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42003-024-06644-1

Structural conservation of antibiotic interaction with ribosomes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Paternoga H, Crowe-McAuliffe C, Bock LV, Koller TO, Morici M, Beckert B, Myasnikov AG, Grubmüller H, Nováček J, Wilson DN.
Opublikowane w: Nature Structural and Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01047-y

Protein delivery to living cells by thermal stimulation for biophysical investigation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Torricella F, Barbieri L, Bazzurro V, Diaspro A, Banci L.
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 20452322, 2022, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-022-21103-9

Phage T3 overcomes the BREX defense through SAM cleavage and inhibition of SAM synthesis by SAM lyase (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Andriianov A, Trigüis S, Drobiazko A, Sierro N, Ivanov NV, Selmer M, Severinov K, Isaev A.
Opublikowane w: Cell Reports, 2023, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112972

Solution structure of the voltage-gated Tim23 channel in complex with a mitochondrial presequence peptide (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Shu Zhou, Maosen Ruan, Yunyan Li, Jing Yang, Suwen Bai, Christian Richter, Harald Schwalbe, Can Xie, Bing Shen & Junfeng Wang
Opublikowane w: Cell Research, 2020, ISSN 1001-0602
Wydawca: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-020-00452-y

Characterization of a glycoside hydrolase endolysin from Acinetobacter baumannii phage AbTZA1 with high antibacterial potency and novel structural features (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Premetis GE, Stathi A, Papageorgiou AC, Labrou NE.
Opublikowane w: FEBS Journal, 2022, ISSN 1742-464X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/febs.16686

On bias, variance, overfitting, gold standard and consensus in single-particle analysis by cryo-electron microscopy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sorzano COS, Jiménez-Moreno A, Maluenda D, Martínez M, Ramírez-Aportela E, Krieger J, Melero R, Cuervo A, Conesa J, Filipovic J, Conesa P, Del Caño L, Fonseca YC, Jiménez-de la Morena J, Losana P, Sánchez-García R, Strelak D, Fernández-Giménez E, de Isidro-Gómez FP, Herreros D, Vilas JL, Marabini R, Carazo JM.
Opublikowane w: Acta Crystallogr D Struct Biol, 2022, ISSN 2059-7983
Wydawca: John Wiley and Sons Inc.
DOI: 10.1107/s2059798322001978

New restraints and validation approaches for nucleic acid structures in PDB-REDO (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ida de Vries, Tim Kwakman, Xiang-Jun Lu, Maarten L. Hekkelman, Mandar Deshpande, Sameer Velankar, Anastassis Perrakis, Robbie P. Joosten
Opublikowane w: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Numer 77/9, 2021, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798321007610

Structural heterogeneity and dynamics in the apical stem loop of s2m from SARS-CoV-2 Delta by an integrative NMR spectroscopy and MD simulation approach (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Maria A Wirtz Martin, Joseph A Makowski, Tobias Matzel, Adam H Kensinger, Alexander Herr, Christian Richter, Hendrik R A Jonker, Anna Wacker, Jeffrey D Evanseck, Harald Schwalbe
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 53, 2025, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf552

Integrated NMR/Molecular Dynamics Determination of the Ensemble Conformation of a Thermodynamically Stable CUUG RNA Tetraloop (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Oxenfarth A, Kümmerer F, Bottaro S, Schnieders R, Pinter G, Jonker HRA, Fürtig B, Richter C, Blackledge M, Lindorff-Larsen K, Schwalbe H
Opublikowane w: Journal of the American Chemical Society, 2023, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c03578

Studies of proline conformational dynamics in IDPs by 13C-detected cross-correlated NMR relaxation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Marco Schiavina, Ruth Konrat, Irene Ceccolini, Borja Mateos, Robert Konrat, Isabella C. Felli, Roberta Pierattelli
Opublikowane w: Journal of Magnetic Resonance, Numer 354, 2023, Strona(/y) 107539, ISSN 1090-7807
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmr.2023.107539

A Sample Preparation Pipeline for Microcrystals at the VMXm Beamline (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Adam D. Crawshaw, Emma V. Beale, Anna J. Warren, Andrew Stallwood, Graham Duller, Jose Trincao, Gwyndaf Evans
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 172, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62306

The Intriguing mitoNEET: Functional and Spectroscopic Properties of a Unique [2Fe-2S] Cluster Coordination Geometry (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Camponeschi F, Piccioli M, Banci L.
Opublikowane w: Molecules, 2022, ISSN 1420-3049
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules27238218

A morpheein equilibrium regulates catalysis in phosphoserine phosphatase SerB2 from Mycobacterium tuberculosis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Pierson E, De Pol F, Fillet M, Wouters J.
Opublikowane w: Commun Biol., 2023, ISSN 2399-3642
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-023-05402-z

Subcellular targets and recognition mechanism of Ralstonia solanacearum effector RipE1 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tsakiri D, Kotsaridis K, Michalopoulou VA, Zhang N, Marinos S, Kountourakis N, Kokkinidis M, Martin GB, Sarris PF.
Opublikowane w: ISCIENCE, 2025, ISSN 2589-0042
Wydawca: Cell Press Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.isci.2025.112307

Determinants of receptor tyrosine phosphatase homophilic adhesion: structural comparison of PTPRK and PTPRM extracellular domains (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hay IM, Shamin M, Caroe ER, Mohammed ASA, Svergun DI, Jeffries CM, Graham SC, Sharpe HJ, Deane JE.
Opublikowane w: Journal of Biological Chemistry, 2022, ISSN 0021-9258
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102750

Toward protein NMR at physiological concentrations by hyperpolarized water — Finding and mapping uncharted conformational spaces (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Epasto LM, Che K, Kozak F, Selimovic A, Kadeřávek P, Kurzbach D.
Opublikowane w: Science Advances, 2022, ISSN 2375-2548
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.abq5179

Structural basis for different membrane-binding properties of E. coli anaerobic and human mitochondrial β-oxidation trifunctional enzymes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sah-Teli SK, Pinkas M, Hynönen MJ, Butcher SJ, Wierenga RK, Novacek J, Venkatesan R.
Opublikowane w: Structure, 2023, ISSN 0969-2126
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.str.2023.04.011

Fixed Target Serial Data Collection at Diamond Light Source (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sam Horrell, Danny Axford, Nicholas E. Devenish, Ali Ebrahim, Michael A. Hough, Darren A. Sherrell, Selina L. S. Storm, Ivo Tews, Jonathan A. R. Worrall, Robin L. Owen
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 168, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62200

Identification of potential aggregation hotspots on Aβ42 fibrils blocked by the anti-amyloid chaperone-like BRICHOS domain (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Kumar R, Le Marchand T, Adam L, Bobrovs R, Chen G, Fridmanis J, Kronqvist N, Biverstål H, Jaudzems K, Johansson J, Pintacuda G, Abelein A.
Opublikowane w: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45192-4

Structural plasticity of NFU1 upon interaction with binding partners: insights into the mitochondrial [4Fe-4S] cluster pathway (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Da Vela S, Saudino G, Lucarelli F, Banci L, Svergun DI, Ciofi-Baffoni S.
Opublikowane w: J Mol Biol, 2023, ISSN 0022-2836
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2023.168154

Evaluation of the Higher Order Structure of Biotherapeutics Embedded in Hydrogels for Bioprinting and Drug Release (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Domenico Rizzo, Linda Cerofolini, Anna Pérez-Ràfols, Stefano Giuntini, Fabio Baroni, Enrico Ravera, Claudio Luchinat, Marco Fragai
Opublikowane w: Analytical Chemistry, 2021, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.1c01850

Chaperoning of the histone octamer by the acidic domain of DNA repair factor APLF (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Corbeski I, Guo X, Eckhardt BV, Fasci D, Wiegant W, Graewert MA, Vreeken K, Wienk H, Svergun DI, Heck AJR, van Attikum H, Boelens R, Sixma TK, Mattiroli F, van Ingen H
Opublikowane w: Science Advances, 2022, ISSN 2375-2548
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.abo0517

High-Resolution Studies of Proteins in Natural Membranes by Solid-State NMR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: David Beriashvili, Raymond D. Schellevis, Federico Napoli, Markus Weingarth, Marc Baldus
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 169, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62197

Experiences From Developing Software for Large X-Ray Crystallography-Driven Protein-Ligand Studies. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Pearce NM, Skyner R, Krojer T.
Opublikowane w: Front. Mol. Biosci., Numer Section Structural BIology, 2022, ISSN 2296-889X
Wydawca: Lausanne
DOI: 10.3389/fmolb.2022.861491

CryoEM structure and small-angle X-ray scattering analyses of porcine retinol-binding protein 3 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Vineeta Kaushik, Luca Gessa, Nelam Kumar, Matyáš Pinkas, Mariusz Czarnocki-Cieciura, Krzysztof Palczewski, Jiří Nováček, Humberto Fernandes
Opublikowane w: Open Biology, Numer 15, 2025, ISSN 2046-2441
Wydawca: Royal Society Publishing
DOI: 10.1098/rsob.240180

In-cell NMR: Why and how? (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Theillet FX, Luchinat E.
Opublikowane w: Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy, 2022, ISSN 0079-6565
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pnmrs.2022.04.002

1H, 13C, and 15N backbone chemical-shift assignments of SARS-CoV-2 non-structural protein 1 (leader protein) (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ying Wang, John Kirkpatrick, Susanne zur Lage, Sophie M. Korn, Konstantin Neißner, Harald Schwalbe, Andreas Schlundt, Teresa Carlomagno
Opublikowane w: Biomolecular NMR Assignments, 2021, ISSN 1874-2718
Wydawca: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s12104-021-10019-6

Intrinsically disordered plant protein PARCL co-localizes with RNA in phase-separated condensates whose formation can be regulated by mutating the PLD (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ostendorp A, Ostendorp S, Zhou Y, Chaudron Z, Wolffram L, Rombi K, von Pein L, Falke S, Jeffries CM, Svergun DI, Betzel C, Morris RJ, Kragler F, Kehr J
Opublikowane w: Journal of Biological Chemistry, Numer 00219258, 2022, ISSN 0021-9258
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102631

Dissociation of β2m from MHC class I triggers formation of noncovalent transient heavy chain dimers (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Cindy Dirscherl, Sara Löchte, Zeynep Hein, Janine-Denise Kopicki, Antonia Regina Harders, Noemi Linden, Andreas Karner, Johannes Preiner, Julian Weghuber, Maria Garcia-Alai, Charlotte Uetrecht, Martin Zacharias, Jacob Piehler, Peter Lanzerstorfer, Sebastian Springer
Opublikowane w: Journal of Cell Science, Numer 135, 2023, ISSN 0021-9533
Wydawca: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.259498

Targeting the Main Protease (Mpro, nsp5) by Growth of Fragment Scaffolds Exploiting Structure-Based Methodologies (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Altincekic N, Jores N, Löhr F, Richter C, Ehrhardt C, Blommers MJJ, Berg H, Öztürk S, Gande SL, Linhard V, Orts J, Abi Saad MJ, Bütikofer M, Kaderli J, Karlsson BG, Brath U, Hedenström M, Gröbner G, Sauer UH, Perrakis A, Langer J, Banci L, Cantini F, Fragai M, Grifagni D, Barthel T, Wollenhaupt J, Weiss MS, Robertson A, Bax A, Sreeramulu S, Schwalbe H.
Opublikowane w: ACS Chemical Biology, 2024, ISSN 1554-8929
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.3c00720

Binding adaptation of GS-441524 diversifies macro domains and downregulate SARS-CoV-2 de-MARylation capacity (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: A.C. Tsika, A. Gallo, N.K. Fourkiotis, A.I. Argyriou, S. Sreeramulu, F. Löhr, V.V. Rogov, C. Richter, V. Linhard, S.L. Gande, N. Altincekic, R. Krishnathas, I. Elamri, H. Schwalbe, J. Wollenhaupt, M.S. Weiss, G.A. Spyroulias
Opublikowane w: Journal of Molecular Biology, 2022, ISSN 0022-2836
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2022.167720

Progression of herpesvirus infection remodels mitochondrial organization and metabolism (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Leclerc S, Gupta A, Ruokolainen V, Chen JH, Kunnas K, Ekman AA, Niskanen H, Belevich I, Vihinen H, Turkki P, Perez-Berna AJ, Kapishnikov S, Mäntylä E, Harkiolaki M, Dufour E, Hytönen V, Pereiro E, McEnroe T, Fahy K, Kaikkonen MU, Jokitalo E, Larabell CA, Weinhardt V, Mattola S, Aho V, Vihinen-Ranta M
Opublikowane w: PLoS Pathog, 2024, ISSN 1553-7374
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.ppat.1011829

Phase distortion-free paramagnetic NMR spectra (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Enrico Ravera
Opublikowane w: Journal of Magnetic Resonance Open, Numer 8-9, 2021, Strona(/y) 100022, ISSN 2666-4410
Wydawca: Elsevier Inc
DOI: 10.1016/j.jmro.2021.100022

Disentangling Chromophore States in a Reversibly Switchable Green Fluorescent Protein: Mechanistic Insights from NMR Spectroscopy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Nina Eleni Christou, Karine Giandoreggio-Barranco, Isabel Ayala, Oleksandr Glushonkov, Virgile Adam, Dominique Bourgeois, Bernhard Brutscher
Opublikowane w: Journal of the American Chemical Society, Numer 143/19, 2021, Strona(/y) 7521-7530, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c02442

Molecular Basis of Multiple Mitochondrial Dysfunctions Syndrome 2 Caused by CYS59TYR BOLA3 Mutation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Giovanni Saudino, Dafne Suraci, Veronica Nasta, Simone Ciofi-Baffoni, Lucia Banci
Opublikowane w: International Journal of Molecular Sciences, Numer 22/9, 2021, Strona(/y) 4848, ISSN 1422-0067
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22094848

The folding landscapes of human telomeric RNA and DNA Gquadruplexesare markedly different (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Diana Müller, Irene Bessi, Christian Richter, and Harald Schwalbe
Opublikowane w: Angewandte Chemie (International Edition), 2021, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202100280

Cost-Effective Protein Production in CHO Cells Following Polyethylenimine-Mediated Gene Delivery Showcased by the Production and Crystallization of Antibody Fabs (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Meskova K, Martonova K, Hrasnova P, Sinska K, Skrabanova M, Fialova L, Njemoga S, Cehlar O, Parmar O, Kolenko P, Pevala V, Skrabana R.
Opublikowane w: Antibodies, 2023, ISSN 2073-4468
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/antib12030051

OUP accepted manuscript (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tamas Lazar, Elizabeth Martínez-Pérez, Federica Quaglia, András Hatos, Lucía B Chemes, Javier A Iserte, Nicolás A Méndez, Nicolás A Garrone, Tadeo E Saldaño, Julia Marchetti, Ana Julia Velez Rueda, Pau Bernadó, Martin Blackledge, Tiago N Cordeiro, Eric Fagerberg, Julie D Forman-Kay, Maria S Fornasari, Toby J Gibson, Gregory-Neal W Gomes, Claudiu C Gradinaru, Teresa Head-Gordon, Malene Rin
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, 2020, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa1021

pH variations enable guanine crystal formation within iridosomes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Zohar Eyal, Rachael Deis, Anna Gorelick-Ashkenazi, Yuval Barzilay, Yonatan Broder, Asher Perry Kellum, Neta Varsano, Michal Hartstein, Andrea Sorrentino, Ron Rotkopf, Ifat Kaplan-Ashiri, Katya Rechav, Rebecca Metzler, Lothar Houben, Leeor Kronik, Peter Rez, Dvir Gur
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, 2025, ISSN 1552-4450
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-025-02020-0

Intracellular Binding/Unbinding Kinetics of Approved Drugs toCarbonic Anhydrase II Observed by in-Cell NMR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Enrico Luchinat, Letizia Barbieri, Matteo Cremonini, Alessio Nocentini, Claudiu T. Supuran, and Lucia Banci
Opublikowane w: ACS Chemical Biology, 2020, ISSN 1554-8929
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.0c00590

Structural studies of β-glucosidase from the thermophilic bacterium <i>Caldicellulosiruptor saccharolyticus</i> (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Anastasia I. Sotiropoulou, Dimitris G. Hatzinikolaou, Evangelia D. Chrysina
Opublikowane w: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Numer 80, 2024, Strona(/y) 733-743, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr Journals
DOI: 10.1107/s2059798324009252

Controlling the incorporation of fluorinated amino acids in human cells and its structural impact (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Azzurra Costantino, Lan B. T. Pham, Letizia Barbieri, Vito Calderone, Gili Ben‐Nissan, Michal Sharon, Lucia Banci, Enrico Luchinat
Opublikowane w: Protein Science, Numer 33, 2024, ISSN 0961-8368
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1002/pro.4910

Exploring the druggability of conserved RNA regulatory elements in the SARS‐CoV‐2 genome (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sridhar Sreeramulu, Christian Richter, Hannes Berg, Maria A Wirtz Martin, Betül Ceylan, Tobias Matzel, Jennifer Adam, Nadide Altincekic, Kamal Azzaoui, Jasleen Kaur Bains, Marcel J.J. Blommers, Jan Ferner, Boris Fürtig, M. Göbel, J Tassilo Grün, Martin Hengesbach, Katharina F. Hohmann, Daniel Hymon, Bozana Knezic, Jason Martins, Klara R Mertinkus, Anna Niesteruk, Stephen A Peter, Dennis J Pype
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, 2021, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202103693

Structure of the drug target ClpC1 unfoldase in action provides insights on antibiotic mechanism of action (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Weinhäupl K, Gragera M, Bueno-Carrasco MT, Arranz R, Krandor O, Akopian T, Soares R, Rubin E, Felix J, Fraga H
Opublikowane w: Journal of Biological Chemistry, Numer 00219258, 2022, ISSN 0021-9258
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102553

Cryo-EM density maps adjustment for subtraction, consensus and sharpening (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: E. Fernández-Giménez, M. Martínez, R. Sánchez-García, R. Marabini, E. Ramírez-Aportela, P. Conesa, J.M. Carazo, C.O.S. Sorzano
Opublikowane w: Journal of Structural Biology, Numer 213/4, 2021, Strona(/y) 107780, ISSN 1047-8477
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2021.107780

Real-Time Quantitative In-Cell NMR: Ligand Binding and Protein Oxidation Monitored in Human Cells Using Multivariate Curve Resolution (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Enrico Luchinat, Letizia Barbieri, Timothy F. Campbell, Lucia Banci
Opublikowane w: Analytical Chemistry, Numer 92/14, 2020, Strona(/y) 9997-10006, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.0c01677

The Extended Hadamard Transform: Sensitivity-Enhanced NMR Experiments Among Labile and Non-Labile 1Hs of SARS-CoV-2-derived RNAs (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Kim J, Novakovic M, Jayanthi S, Lupulescu A, Kupče Ē, Grün JT, Mertinkus K, Oxenfarth A, Schwalbe H, Frydman L.
Opublikowane w: ChemPhysChem, 2022, ISSN 1439-4235
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cphc.202100704

Molecular determinants for recognition of serotonylated chromatin (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Laura Pulido-Cortés, Hajo Gielingh, Vito Thijssen, Minglong Liu, Ryoji Yoshisada, Leonardo Romão Soares, Sheikh Nizamuddin, Florian Friedrich, Holger Greschik, Ling Peng, Rodrigo Vargas Honorato, Manfred Jung, Alexandre M J J Bonvin, Martin L Biniossek, Roland Schüle, Seino Jongkees, Hugo van Ingen, H Th Marc Timmers
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 53, 2025, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf612

Molecular mechanisms and evolutionary robustness of a color switch in proteorhodopsins (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Mao J, Jin X, Shi M, Heidenreich D, Brown LJ, Brown RCD, Lelli M, He X, Glaubitz C.
Opublikowane w: Science Advances, 2024, ISSN 2375-2548
Wydawca: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.adj0384

A thermosensitive gel matrix for bioreactor-assisted in-cell NMR of nucleic acids and proteins (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Dzurov M, Pospíšilová Š, Krafčíková M, Trantírek L, Vojtová L, Ryneš J
Opublikowane w: J Biomol NMR, 2023, ISSN 0925-2738
Wydawca: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10858-023-00422-7

Rapid protein delivery to living cells for biomolecular investigation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Francesco Torricella, Alessio Bonucci, Panagis Polykretis, Francesca Cencetti, Lucia Banci
Opublikowane w: Biochemical and Biophysical Research Communications, Numer 570, 2021, Strona(/y) 82-88, ISSN 0006-291X
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.bbrc.2021.07.006

Biochemical and Structural Characterization of CRH-1, a Carbapenemase from Chromobacterium haemolyticum Related to KPC β-Lactamases (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Brunetti F, Ghiglione B, Gudeta DD, Gutkind G, Guardabassi L, Klinke S, Power P.
Opublikowane w: Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2024, ISSN 1098-6596
Wydawca: ASM Journals
DOI: 10.1128/aac.00061-23

Modulation of the substrate specificity of the kinase PDK1 by distinct conformations of the full-length protein (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sacerdoti M, Gross LZF, Riley AM, Zehnder K, Ghode A, Klinke S, Anand GS, Paris K, Winkel A, Herbrand AK, Godage HY, Cozier GE, Süß E, Schulze JO, Pastor-Flores D, Bollini M, Cappellari MV, Svergun D, Gräwert MA, Aramendia PF, Leroux AE, Potter BVL, Camacho CJ, Biondi RM.
Opublikowane w: Science Signaling, 2023, ISSN 1937-9145
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/scisignal.add3184

Cyanobacterial Argonautes and Cas4 family nucleases cooperate to interfere with invading DNA (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Pilar Bobadilla Ugarte, Stefanie Halter, Sumanth K. Mutte, Clint Heijstek, Theophile Niault, Ilya Terenin, Patrick Barendse, Balwina Koopal, Mark Roosjen, Sjef Boeren, Vasili Hauryliuk, Martin Jinek, Adrie H. Westphal, Daan C. Swarts
Opublikowane w: Molecular Cell, 2025, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2025.03.025

Ultrastructure of macromolecular assemblies contributing to bacterial spore resistance revealed by in situ cryo-electron tomography (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Bauda E, Gallet B, Moravcova J, Effantin G, Chan H, Novacek J, Jouneau PH, Rodrigues CDA, Schoehn G, Moriscot C, Morlot C
Opublikowane w: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45770-6

Crystal structure of the Phospholipase A and acyltransferase 4 (PLAAT4) catalytic domain (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Wehlin A, Cornaciu I, Marquez JM, Perrakis A, von Castelmur E.
Opublikowane w: Journal of Structural Biology, Numer 10478477, 2022, ISSN 1047-8477
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2022.107903

Frag4Lead: growing crystallographic fragment hits by catalog using fragment-guided template docking (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: A. Metz, J. Wollenhaupt, S. Glöckner, N. Messini, S. Huber, T. Barthel, A. Mehrabed, H.-D. Gerber, A. Heine, G. Klebe and M. S. Weiss
Opublikowane w: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Numer 77/8, 2021, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798321008196

Blood pH Analysis in Combination with Molecular Medical Tools in Relation to COVID-19 Symptoms (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Siebert H-C, Eckert T, Bhunia A, Klatte N, Mohri M, Siebert S, Kozarova A, Hudson JW, Zhang R, Zhang N, Li L, Gousias K, Kanakis D, Yan M, Jiménez-Barbero J, Kožár T, Nifantiev NE, Vollmer C, Brandenburger T, Kindgen-Milles D, Haak T, Petridis AK.
Opublikowane w: Biomedicines, 2023, ISSN 2227-9059
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/biomedicines11051421

Structure-function studies of a novel laccase-like multicopper oxidase from Thermothelomyces thermophila provide insights into its biological role (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Kosinas C, Zerva A, Topakas E, Dimarogona M.
Opublikowane w: Acta Crystallogr D Struct Biol, 2023, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798323004175

A modular platform for automated cryo-FIB workflows (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Klumpe S, Fung HKH, Goetz SK, Zagoriy I, Hampoelz B, Zhang X, Erdmann PS, Baumbach J, Müller CW, Beck M, Plitzko JM, Mahamid J
Opublikowane w: Elife, 2021, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.70506

Single Particle Cryo-Electron Microscopy: From Sample to Structure (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Joshua B.R. White, Daniel P. Maskell, Andrew Howe, Martin Harrow, Daniel K. Clare, C. Alistair Siebert, Emma L. Hesketh, Rebecca F. Thompson
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 171, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62415

Determination of intracellular protein–ligand binding affinity by competition binding in-cell NMR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Enrico Luchinat, Letizia Barbieri, Matteo Cremonini, Matteo Pennestri, Alessio Nocentini, Claudiu T. Supuran, Lucia Banci
Opublikowane w: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Numer 77/10, 2021, Strona(/y) 1270-1281, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798321009037

Updated restraint dictionaries for carbohydrates in the pyranose form (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Atanasova M, Nicholls RA, Joosten RP, Agirre J.
Opublikowane w: Acta Crystallogr D Struct Biol, 2022, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr/Wiley
DOI: 10.1107/s2059798322001103

Structural and functional features of a broad-spectrum prophage-encoded enzybiotic from Enterococcus faecium (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Premetis GE, Stathi A, Papageorgiou AC, Labrou NE.
Opublikowane w: Scientific Reports, 2023, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-34309-2

Bio-SAXS of single-stranded DNA-binding proteins: radiation protection by the compatible solute ectoine (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hallier DC, Smales GJ, Seitz H, Hahn MB.
Opublikowane w: Phys Chem Chem Phys, 2023, ISSN 1463-9076
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2cp05053f

Image processing tools for the validation of CryoEM maps (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: C.O.S. Sorzano, J.L. Vilas, E. Ramírez-Aportela, J. Krieger, D. del Hoyo, D. Herreros, E. Fernandez-Giménez, D. Marchán, J.R. Macías, I. Sánchez, L. del Caño, Y. Fonseca- Reyna, P. Conesa, A. García-Mena, J. Burguet, J. García Condado, J. Méndez García, M. Martínez, A. Muñoz-Barrutia, R. Marabini, J. Vargas, J.M. Carazo
Opublikowane w: Faraday Discussions, 2022, ISSN 1364-5498
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2fd00059h

The Coming of Age of In-Cell Solution NMR (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Luchinat E, Cremonini M, Banci L
Opublikowane w: Chemical Reviews, 2022, ISSN 0009-2665
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.chemrev.1c00790

Staphylococcus aureus sacculus mediates activities of M23 hydrolases (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Razew A, Laguri C, Vallet A, Bougault C, Kaus-Drobek M, Sabala I, Simorre JP.
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-42506-w

Common transthyretin-derived amyloid fibril structures in patients with hereditary ATTR amyloidosis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Steinebrei M, Baur J, Pradhan A, Kupfer N, Wiese S, Hegenbart U, Schönland SO, Schmidt M, Fändrich M.
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43301-3

Facilitated crystal handling using a simple device for evaporation reduction in microtiter plates (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tatjana Barthel, Franziska U. Huschmann, Dirk Wallacher, Christian G. Feiler, Gerhard Klebe, Manfred S. Weiss, Jan Wollenhaupt
Opublikowane w: Journal of Applied Crystallography, Numer 54/1, 2021, Strona(/y) 376-382, ISSN 1600-5767
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s1600576720016477

FragMAX Facility for Crystallographic Fragment and Ligand Screening at MAX IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sandesh Kanchugal P., Elmir Jagudin, Gustavo M. A. Lima, Vladimir O. Talibov, Afshan Begum, Jie Nan, Mikel Eguiraun, Ana Gonzalez, Céleste Sele, Maria Nyblom, Wolfgang Knecht, Derek T. Logan, Tove Sjögren, Marjolein Thunnissen, Thomas Ursby, Marc Obiols‐Rabasa, Magnus Larsson, Uwe Mueller, Tobias Krojer
Opublikowane w: Applied Research, Numer 4, 2025, ISSN 2702-4288
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/appl.202400263

Protocol for image registration of correlative soft X-ray tomography and super-resolution structured illumination microscopy images (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Nina Vyas, Stephan Kunne, Thomas M. Fish, Ian M. Dobbie, Maria Harkiolaki, Perrine Paul-Gilloteaux
Opublikowane w: STAR Protocols, Numer 2/2, 2021, Strona(/y) 100529, ISSN 2666-1667
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.xpro.2021.100529

Cryo-EM and Single-Particle Analysis with Scipion (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: A. Jiménez-Moreno, L. del Caño, M. Martínez, E. Ramírez-Aportela, A. Cuervo, R. Melero, R. Sánchez-García, D. Strelak, E. Fernández-Giménez, F.P. de Isidro-Gómez, D. Herreros, P. Conesa, Y. Fonseca, D. Maluenda, J. Jiménez de la Morena, J.R. Macías, P. Losana, R. Marabini, J.M. Carazo, C.O.S. Sorzano
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 171, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62261

Advances in Xmipp for Cryo–Electron Microscopy: From Xmipp to Scipion (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Strelak D, Jiménez-Moreno A, Vilas JL, Ramírez-Aportela E, Sánchez-García R, Maluenda D, Vargas J, Herreros D, Fernández-Giménez E, de Isidro-Gómez FP, Horacek J, Myska D, Horacek M, Conesa P, Fonseca-Reyna YC, Jiménez J, Martínez M, Harastani M, Jonić S, Filipovic J, Marabini R, Carazo JM, Sorzano COS
Opublikowane w: Molecules, 2021, ISSN 1420-3049
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules26206224

Guanine crystal formation by the unicellular organism Phacotus lenticularis is part of a cellular stress response (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Noy Shaked, Andrea Sorrentino, Neta Varsano, Sefi Addadi, Ziv Porat, Iddo Pinkas, Steve Weiner, Lia Addadi
Opublikowane w: PLOS ONE, Numer 20, 2025, Strona(/y) e0316193, ISSN 1932-6203
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0316193

Structural basis of poxvirus fusion regulation and anti-A16/G9 antibody-mediated neutralization and protection (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Annalisa Meola, Riccardo Vernuccio, Leandro Battini, Guillermo Albericio, Pilar Delgado, Rebecca Bamford, Laura Pokorny, Manon Broutin, Alejandro Martínez León, Sébastien Gallien, María Gil, María A. Noriega, Florence Guivel-Benhassine, Françoise Porrot, Jeanne Postal, Julian Buchrieser, Mathieu Hubert, Ahmed Haouz, Pierre Lafaye, Mariano Esteban, Jochen S. Hub, Matthieu Mahévas, Pascal Cha
Opublikowane w: Cell, 2025, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2025.07.040

Oxidation of the Mycobacterium tuberculosis key virulence factor Protein Tyrosine Phosphatase A (MptpA) reduces its phosphatase activity (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Niesteruk A,Sreeramulu S, Jonker HRA, Richter C, Schwalbe H.
Opublikowane w: FEBS letters, 2022, ISSN 1873-3468
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/1873-3468.14348

Protein structure and interactions elucidated with in-cell NMR for different cell cycle phases and in 3D human tissue models (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jan Rynes, Eva Istvankova, Michaela Dzurov Krafcikova, Enrico Luchinat, Letizia Barbieri, Lucia Banci, Kristyna Kamarytova, Tomas Loja, Bohumil Fafilek, Gustavo Rico-Llanos, Pavel Krejci, Libor Macurek, Silvie Foldynova-Trantirkova, Lukas Trantirek
Opublikowane w: Communications Biology, Numer 8, 2025, ISSN 2399-3642
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-025-07607-w

Real-time NMR spectroscopy in the study of biomolecular kineticsand dynamics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: György Pintér, Katharina F. Hohmann, J. Tassilo Grün, Julia Wirmer-Bartoschek, Clemens Glaubitz, Boris Fürtig, Harald Schwalbe
Opublikowane w: Magnetic Resonance Discussions, 2021, ISSN 2699-0059
Wydawca: Copernicus Publications
DOI: 10.5194/mr-2021-16

Identification and Characterization of an RRM‐Containing, RNA Binding Protein in Acinetobacter baumannii (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ciani C, Pérez‐Ràfols A, Bonomo I, Micaelli M, Esposito A, Zucal C, Belli R, D’Agostino VG, Bianconi I, Calderone V, Cerofolini L, Massidda O, Whalen MB, Fragai M, Provenzani A.
Opublikowane w: Biomolecules, 2022, ISSN 2218-273X
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/biom12070922

Towards Consistency in Geometry Restraints for Carbohydrates in the Pyranose form: Modern Dictionary Generators Reviewed (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Joosten RP, Nicholls RA, Agirre J.
Opublikowane w: Curr Med Chem., 2022, ISSN 1875-533X
Wydawca: Bentham Science Publishers
DOI: 10.2174/0929867328666210902140754

Beta and Gamma Amino Acid-Substituted Benzenesulfonamides as Inhibitors of Human Carbonic Anhydrases (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Balandis B, Šimkūnas T, Paketurytė-Latvė V, Michailovienė V, Mickevičiūtė A, Manakova E, Gražuli S, Belyakov S, Kairys V, Mickevičius V, Zubrienė A, Matulis D.
Opublikowane w: Pharmaceuticals, 2022, ISSN 1424-8247
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ph15040477

FragMAXapp : crystallographic fragment-screening data-analysis and project-management system (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gustavo M. A. Lima, Elmir Jagudin, Vladimir O. Talibov, Laila S. Benz, Costantino Marullo, Tatjana Barthel, Jan Wollenhaupt, Manfred S. Weiss, Uwe Mueller
Opublikowane w: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Numer 77/6, 2021, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798321003818

Optimization of the Lead Compound NVP-BHG712 as Colorectal Cancer Inhibitor (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tröster A, DiPrima M, Jores N, Kudlinzki D, Sreeramulu S, Gande SL, Linhard V, Ludig D, Schug A, Saxena K, Reinecke M, Heinzlmeir S, Leisegang MS, Wollenhaupt J, Lennartz F, Weiss MS, Kuster B, Tosato G, Schwalbe H.
Opublikowane w: Chemistry, 2023, ISSN 0947-6539
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202203967

Integrated NMR and MD structure and dynamics of the stem loop II motif (s2m) from the Omicron variant of SARS-CoV-2 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tobias Matzel, Joseph Makowski, Adam H. Kensinger, Andreas Oxenfarth, Maria A. Wirtz Martin, Jeffrey Evanseck, Harald Schwalbe
Opublikowane w: RNA, 2025, Strona(/y) rna.080576.125, ISSN 1355-8382
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1261/rna.080576.125

The missing link: covalent linkages in structural models (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Robert A. Nicholls, Marcin Wojdyr, Robbie P. Joosten, Lucrezia Catapano, Fei Long, Marcus Fischer, Paul Emsley, Garib N. Murshudov
Opublikowane w: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Numer 77/6, 2021, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798321003934

A high-field cellular DNP-supported solid-state NMR approach to study proteins with sub-cellular specificity (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Beriashvili D, Yao R, D'Amico F, Krafčíková M, Gurinov A, Safeer A, Cai X, Mulder MPC, Liu Y, Folkers GE, Baldus M
Opublikowane w: Chemical Science, 2023, ISSN 2041-6520
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3sc02117c

Structural and molecular insights into a bifunctional glycoside hydrolase 30 xylanase specific to glucuronoxylan (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Christina Pentari, Christos Kosinas, Efstratios Nikolaivits, Maria Dimarogona, Evangelos Topakas
Opublikowane w: Biotechnology and Bioengineering, Numer 121, 2024, Strona(/y) 2067-2078, ISSN 0006-3592
Wydawca: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/bit.28731

Structural Heterogeneity in a Phototransformable Fluorescent Protein Impacts its Photochemical Properties (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Maity A, Wulffelé J, Ayala I, Favier A, Adam V, Bourgeois D, Brutscher B
Opublikowane w: Advanced Science, 2023, ISSN 2198-3844
Wydawca: WIley
DOI: 10.1002/advs.202306272

Small molecule MMRi62 targets MDM4 for degradation and induces leukemic cell apoptosis regardless of p53 status (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Lama R, Xu C, Galster SL, Querol-García J, Portwood S, Mavis CK, Ruiz FM, Martin D, Wu J, Giorgi MC, Bargonetti J, Wang ES, Hernandez-Ilizaliturri FJ, Koudelka GB, Chemler SR, Muñoz IG, Wang X
Opublikowane w: Frontiers in Oncology, 2022, ISSN 2234-943X
Wydawca: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2022.933446

Program VUE: analysing distributions of cryo-EM projections using uniform spherical grids (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Urzhumtseva L, Barchet C, Klaholz BP, Urzhumtsev AG.
Opublikowane w: Journal of Applied Crystallography, 2024, ISSN 1600-5767
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s1600576724002383

High-resolution cryo-EM performance comparison of two latest-generation cryo electron microscopes on the human ribosome (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Fréchin L, Holvec S, von Loeffelholz O, Hazemann I, Klaholz BP
Opublikowane w: Journal of Structural BIology, 2022, ISSN 1047-8477
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2022.107905

Ligand binding to a Ni–Fe cluster orchestrates conformational changes of the CO-dehydrogenase–acetyl-CoA synthase complex (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jakob Ruickoldt, Julian Kreibich, Thomas Bick, Jae-Hun Jeoung, Benjamin R. Duffus, Silke Leimkühler, Holger Dobbek, Petra Wendler
Opublikowane w: Nature Catalysis, 2025, ISSN 2520-1158
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41929-025-01365-y

Polθ is phosphorylated by PLK1 to repair double-strand breaks in mitosis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gelot C, Kovacs MT, Miron S, Mylne E, Haan A, Boeffard-Dosierre L, Ghouil R, Popova T, Dingli F, Loew D, Guirouilh-Barbat J, Del Nery E, Zinn-Justin S, Ceccaldi R.
Opublikowane w: Nature, 2023, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06506-6

A Fijivirus Major Viroplasm Protein Shows RNA-Stimulated ATPase Activity by Adopting Pentameric and Hexameric Assemblies of Dimers (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gabriela Llauger, Roberto Melero, Demián Monti, Gabriela Sycz, Cristián Huck-Iriart, María L. Cerutti, Sebastián Klinke, Evelyn Mikkelsen, Ariel Tijman, Rocío Arranz, Victoria Alfonso, Sofía M. Arellano, Fernando A. Goldbaum, Yann G. J. Sterckx, José-María Carazo, Sergio B. Kaufman, Pablo D. Dans, Mariana del Vas, Lisandro H. Otero
Opublikowane w: mBio, Numer 14, 2024, ISSN 2150-7511
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.00023-23

Di-phosphorylated BAF shows altered structural dynamics and binding to DNA, but interacts with its nuclear envelope partners (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Agathe Marcelot, Ambre Petitalot, Virginie Ropars, Marie-Hélène Le Du, Camille Samson, Stevens Dubois, Guillaume Hoffmann, Simona Miron, Philippe Cuniasse, Jose Antonio Marquez, Robert Thai, François-Xavier Theillet, Sophie Zinn-Justin
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab184

The complex structure of Fomes fomentarius represents an architectural design for high-performance ultralightweight materials (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Pylkkänen R, Werner D, Bishoyi A, Weil D, Scoppola E, Wagermaier W, Safeer A, Bahri S, Baldus M, Paananen A, Penttilä M, Szilvay GR, Mohammadi P.
Opublikowane w: Science Advances, 2023, ISSN 2375-2548
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.ade5417

Introducing NMR strategies to define water molecules that drive metal binding in a transcriptional regulator (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Villarruel Dujovne M, Bringas M, Felli IC, Ravera E, Di Lella S, Capdevila DA
Opublikowane w: Journal of Magnetic Resonance Open, 2023, ISSN 2666-4410
Wydawca: ScienceDirect/Elsevier
DOI: 10.1016/j.jmro.2023.100114

Evasion of cGAS and TRIM5 defines pandemic HIV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Zuliani-Alvarez L, Govasli ML, Rasaiyaah J, Monit C, Perry SO, Sumner RP, McAlpine-Scott S, Dickson C, Rifat Faysal KM, Hilditch L, Miles RJ, Bibollet-Ruche F, Hahn BH, Boecking T, Pinotsis N, James LC, Jacques DA, Towers GJ.
Opublikowane w: nature microbiology, Numer 20585276, 2022, ISSN 2058-5276
Wydawca: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41564-022-01247-0

SARS-CoV-2 M pro inhibition by a zinc ion: structural features and hints for drug design (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Deborah Grifagni, Vito Calderone, Stefano Giuntini, Francesca Cantini, Marco Fragai, Lucia Banci
Opublikowane w: Chemical Communications, Numer 57/64, 2021, Strona(/y) 7910-7913, ISSN 1359-7345
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cc02956h

Dynamic interactions and Ca2+-binding modulate the holdase-type chaperone activity of S100B preventing tau aggregation and seeding (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Guilherme G. Moreira, François-Xavier Cantrelle, Andrea Quezada, Filipa S. Carvalho, Joana S. Cristóvão, Urmi Sengupta, Nicha Puangmalai, Ana P. Carapeto, Mário S. Rodrigues, Isabel Cardoso, Güenter Fritz, Federico Herrera, Rakez Kayed, Isabelle Landrieu, Cláudio M. Gomes
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-26584-2

Kinetic and Structural Studies of the Plastidial <i>Solanum tuberosum</i> Phosphorylase (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Symeon M. Koulas, Efthimios Kyriakis, Anastasia S. Tsagkarakou, Demetres D. Leonidas
Opublikowane w: ACS Omega, 2024, ISSN 2470-1343
Wydawca: ACS Publications
DOI: 10.1021/acsomega.4c06313

Innovative Approach for a Classic Target: Fragment Screening on Trypanothione Reductase Reveals New Opportunities for Drug Design (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Fiorillo A, Colotti G, Exertier C, Liuzzi A, Seghetti F, Salerno A, Caciolla J, Ilari A.
Opublikowane w: Frontiers in molecular biosciences, 2022, ISSN 2296-889X
Wydawca: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fmolb.2022.900882

Structural Insights into the Role of β3 nAChR Subunit in the Activation of Nicotinic Receptors (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Giastas P, Papakyriakou A, Tsafaras G, Tzartos SJ, Zouridakis M.
Opublikowane w: Molecules, 2022, ISSN 1420-3049
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules27144642

Secondary structure determination of conserved SARS-CoV-2 RNA elements by NMR spectroscopy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Anna Wacker, Julia E Weigand, Sabine R Akabayov, Nadide Altincekic, Jasleen Kaur Bains, Elnaz Banijamali, Oliver Binas, Jesus Castillo-Martinez, Erhan Cetiner, Betül Ceylan, Liang-Yuan Chiu, Jesse Davila-Calderon, Karthikeyan Dhamotharan, Elke Duchardt-Ferner, Jan Ferner, Lucio Frydman, Boris Fürtig, José Gallego, J Tassilo Grün, Carolin Hacker, Christina Haddad, Martin Hähnke, Martin Hengesb
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 48/22, 2020, Strona(/y) 12415-12435, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa1013

Principal component analysis is limited to low-resolution analysis in cryoEM (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Carlos Oscar S. Sorzano, Jose Maria Carazo
Opublikowane w: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Numer 77/6, 2021, Strona(/y) 835-839, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798321002291

Solid-state NMR - a complementary technique for protein framework characterization (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Cerofolini L, Ramberg KO, Padilla LC, Antonik P, Ravera E, Luchinat C, Fragai M, Crowley PB.
Opublikowane w: Chemical Communications, 2023, ISSN 1364-548X
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2cc05725e

Targeting EPHA2 with Kinase Inhibitors in Colorectal Cancer (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tröster A, Jores N, Mineev KS, Sreeramulu S, DiPrima M, Tosato G, Schwalbe H.
Opublikowane w: ChemMedChem, 2023, ISSN 1860-7179
Wydawca: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/cmdc.202300420

A 3D Cartographic Description of the Cell by Cryo Soft X-ray Tomography (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Johannes Groen, Andrea Sorrentino, Lucía Aballe, Robert Oliete, Ricardo Valcárcel, Chidinma Okolo, Ilias Kounatidis, Maria Harkiolaki, Ana Joaquina Pérez-Berná, Eva Pereiro
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 169, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62190

Small-molecule MMRi36 induces apoptosis in p53-mutant lymphomas by targeting MDM2/MDM4/XIAP for degradation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rati Lama, Wenjie Wu, Cory K. Mavis, Federico M. Ruiz, Javier Querol-García, Diana Martin, Sherry R. Chemler, Dhyan Chandra, David W. Goodrich, Francisco J. Hernandez-Ilizaliturri, Inés G. Muñoz, Xinjiang Wang
Opublikowane w: Frontiers in Oncology, Numer 14, 2024, ISSN 2234-943X
Wydawca: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2024.1462231

Unraveling the mechanism of [4Fe‐4S] cluster assembly on the N‐terminal cluster binding site of NUBP1 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Beatrice Bargagna, Sara Matteucci, Simone Ciofi‐Baffoni, Francesca Camponeschi, Lucia Banci
Opublikowane w: Protein Science, Numer 32, 2023, ISSN 0961-8368
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1002/pro.4625

Strategies for Optimization of Cryogenic Electron Tomography Data Acquisition (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Felix Weis, Wim J. H. Hagen, Martin Schorb, Simone Mattei
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 169, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62383

EFFECTS of BORON SUPPLEMENTATION on DAIRY CALVES’ HEALTH: A METABOLOMICS STUDY (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Abdullah Basoglu, ADAM ABDEL-AZIZ ADAM, NURI BASPINAR, ALESSIA VIGNOLI, GAIAI MEONI, Leonardo Tenori, Erdem Gullersoy, Rumeyhisa Bicici
Opublikowane w: Assiut Veterinary Medical Journal, 2023, Strona(/y) 0-0, ISSN 2314-5226
Wydawca: The Faculty of Veterinary Medicine, Assiut University, Assiut, Egypt
DOI: 10.21608/avmj.2023.218730.1157

Epitope Mapping and Binding Assessment by Solid-State NMR Provide a Way for the Development of Biologics under the Quality by Design Paradigm (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Domenico Rizzo, Linda Cerofolini, Stefano Giuntini, Luisa Iozzino, Carlo Pergola, Francesca Sacco, Angelo Palmese, Enrico Ravera, Claudio Luchinat, Fabio Baroni, Marco Fragai
Opublikowane w: Journal of the American Chemical Society, 2022, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c03232

Structure of the Borrelia bacteriophage φBB1 procapsid (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rūmnieks J, Füzik T, Tārs K.
Opublikowane w: Journal of Molecular Biology, 2023, ISSN 0022-2836
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2023.168323

Structural and bioinformatics analyses identify deoxydinucleotide-specific nucleases and their association with genomic islands in gram-positive bacteria (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sofia Mortensen, Stanislava Kuncová, Justin D Lormand, Tanner M Myers, Soo-Kyoung Kim, Vincent T Lee, Wade C Winkler, Holger Sondermann
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 53, 2025, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae1235

<scp>NMR</scp> screening of low molecular weight inhibitors targeting the papain‐like protease (<scp>PLPro</scp>) of <scp>SARS</scp>‐<scp>CoV</scp>‐2 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Dennis J. Pyper, Sridhar Sreeramulu, Benjamin T. Lanham, Elizabeth M. Engle, David Fushman, Harald Schwalbe
Opublikowane w: FEBS Open Bio, 2025, ISSN 2211-5463
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1002/2211-5463.70082

Di-<i>meta</i>-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides as Potent and Selective Anticancer Inhibitors of Carbonic Anhydrase IX and XII (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Aivaras Vaškevičius, Mantas Žvirblis, Maija Kurtenoka, Janis Leitans, Elena Manakova, Vaida Paketurytė-Latvė, Agnė Kvietkauskaitė, Andris Kazaks, Vladislava Eimonta, Kamilė Čerepenkaitė, Justina Kazokaitė-Adomaitienė, Aurelija Mickevičiu̅tė, Vaida Juozapaitienė, Kaspars Tars, Saulius Gražulis, Jurgita Matulienė, Virginija Dudutienė, Kirill Shubin, Daumantas Matulis, Asta Zubrien
Opublikowane w: Journal of Medicinal Chemistry, 2025, ISSN 0022-2623
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.5c01142

Multitasking Pharmacophores Support Cabotegravir-Based Long-Acting HIV Pre-Exposure Prophylaxis (PrEP) (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Wan Z, Shi M, Gong Y, Lucci M, Li J, Zhou J, Yang X-L, Lelli M, He X, Mao J.
Opublikowane w: Molecules, 2024, ISSN 1420-3049
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules29020376

The COVID19-NMR Consortium: A Public Report on the Impact of this New Global Collaboration (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Duchardt-Ferner E, Ferner J, Fürtig B, Hengesbach M, Richter C, Schlundt A, Sreeramulu S, Wacker A, Weigand JE, Wirmer-Bartoschek J, Schwalbe H.
Opublikowane w: Angewandte Chemie, 2023, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ange.202217171

The future of integrated structural biology (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Harald Schwalbe, Pauline Audergon, Natalie Haley, Claudia Alen Amaro, Jon Agirre, Marc Baldus, Lucia Banci, Wolfgang Baumeister, Martin Blackledge, Jose Maria Carazo, Kristina Djinovic Carugo, Patrick Celie, Isabella Felli, Darren J. Hart, Thomas Hauß, Lari Lehtiö, Kresten Lindorff-Larsen, José Márquez, André Matagne, Roberta Pierattelli, Antonio Rosato, Frank Sobott, Sridhar Sreeramulu, Jan
Opublikowane w: Structure, 2024, ISSN 0969-2126
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.str.2024.08.014

Structural and biochemical characterization of the C‐terminal region of the human <scp>RTEL</scp>1 helicase (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Giuseppe Cortone, Melissa A. Graewert, Manil Kanade, Antonio Longo, Raghurama Hegde, Amaia González‐Magaña, Belén Chaves‐Arquero, Francisco J. Blanco, Luisa M. R. Napolitano, Silvia Onesti
Opublikowane w: Protein Science, Numer 33, 2024, ISSN 0961-8368
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1002/pro.5093

X-ray structure and enzymatic study of a bacterial NADPH oxidase highlight the activation mechanism of eukaryotic NOX (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Isabelle Petit-Hartlein, Annelise Vermot, Michel Thepaut, Anne-Sophie Humm, Florine Dupeux, Jerome Dupuy, Vincent Chaptal, Jose Antonio Marquez, Susan ME Smith, Franck Fieschi
Opublikowane w: eLife, Numer 13, 2024, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.93759

NMR characterization and ligand binding site of the stem loop 2 motif (s2m) from the Delta variant of SARS-CoV-2 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Matzel T, Wirtz Martin M, Herr A, Wacker A, Richter C, Sreeramulu S, Schwalbe H.
Opublikowane w: Matzel T, Wirtz Martin M, Herr A, Wacker A, Richter C, Sreeramulu S, Schwalbe H., 2024, ISSN 1469-9001
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1261/rna.079902.123

Protein in-cell NMR spectroscopy at 1.2 GHz (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Enrico Luchinat, Letizia Barbieri, Matteo Cremonini, Lucia Banci
Opublikowane w: Journal of Biomolecular NMR, 2021, ISSN 0925-2738
Wydawca: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10858-021-00358-w

Ultra-high Performance Liquid Chromatography−Ion Mobility−High-Resolution Mass Spectrometry to Evaluate the Metabolomic Response of Durum Wheat to Sustainable Treatments (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Riboni N, Bianchi F, Mattarozzi M, Caldara M, Gullì M, Graziano S, Maestri E, Marmiroli N, Careri M.
Opublikowane w: J Agric Food Chem, 2023, ISSN 0021-8561
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jafc.3c04532

Discovery of a functionally selective serotonin receptor (5-HT1AR) agonist for the treatment of pain (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ullrich A, Schneider J, Braz JM, Neu E, Staffen N, Stanek M, Bláhová J, Hove T, Albert T, Allikalt A, Löber S, Bhardwaj K, Rodriguez-Rosado S, Fink E, Rasmussen T, Hübner H, Inoue A, Shoichet BK, Basbaum AI, Böttcher B, Weikert D, Gmeiner P.
Opublikowane w: Science Advances, 2025, ISSN 2375-2548
Wydawca: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.adv926

Backbone and side chain resonance assignment of the intrinsically disordered human DBNDD1 protein (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Wiedemann C, Obika KB, Liebscher S, Jirschitzka J, Ohlenschläger O, Bordusa F.
Opublikowane w: Biomol NMR Assign., 2022, ISSN 1874-2718
Wydawca: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s12104-022-10086-3

Toward Dual-Target Glycomimetics against Two Bacterial Lectins to Fight <i>Pseudomonas aeruginosa</i>–<i>Burkholderia cenocepacia</i> Infections: A Biophysical Study (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Giulia Antonini, Mario Fares, Dirk Hauck, Patrycja Mała, Emilie Gillon, Laura Belvisi, Anna Bernardi, Alexander Titz, Annabelle Varrot, Sarah Mazzotta
Opublikowane w: Journal of Medicinal Chemistry, 2025, ISSN 0022-2623
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.5c00405

Large-Scale Recombinant Production of the SARS-CoV-2 Proteome for High-Throughput and Structural Biology Applications (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Nadide Altincekic, Sophie Marianne Korn, Nusrat Shahin Qureshi, Marie Dujardin, Martí Ninot-Pedrosa, Rupert Abele, Marie Jose Abi Saad, Caterina Alfano, Fabio C. L. Almeida, Islam Alshamleh, Gisele Cardoso de Amorim, Thomas K. Anderson, Cristiane D. Anobom, Chelsea Anorma, Jasleen Kaur Bains, Adriaan Bax, Martin Blackledge, Julius Blechar, Anja Böckmann, Louis Brigandat, Anna Bula, Matthias Büt
Opublikowane w: Frontiers in Molecular Biosciences, Numer 8, 2021, ISSN 2296-889X
Wydawca: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fmolb.2021.653148

Approximating deformation fields for the analysis of continuous heterogeneity of biological macromolecules by 3D Zernike polynomials (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: David Herreros, Roy R. Lederman, James Krieger, Amaya Jiménez-Moreno, Marta Martínez, David Myška, David Strelak, Jiri Filipovic, Ivet Bahar, Jose Maria Carazo, Carlos Oscar S. Sanchez
Opublikowane w: IUCrJ, Numer 8/6, 2021, ISSN 2052-2525
Wydawca: IUCrJ
DOI: 10.1107/s2052252521008903

Solid‐state NMR Reveals Reorganization of the Aspergillus fumigatus Cell Wall Due to a Host‐Defence Peptide (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ajit Kumar Bishoyi, Jacq van Neer, Salima Bahri, Sophie Lorenz, Hans de Cock, Marc Baldus
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, 2025, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202509012

Scipion3: A workflow engine for cryo-electron microscopy image processing and structural biology (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Conesa P, Fonseca YC, Jiménez de la Morena J, Sharov G, de la Rosa-Trevín JM, Cuervo A, García Mena A, Rodríguez de Francisco B, del Hoyo D, Herreros D, Marchan D, Strelak D, Fernández-Giménez E, Ramírez-Aportela E, de Isidro-Gómez FP, Sánchez I, Krieger J, Vilas JL, del Cano L, Gragera M, Iceta M, Martínez M, Losana P, Melero R, Marabini R, Carazo JM, Sorzano COS.
Opublikowane w: Biological Imaging, 2023, ISSN 2633-903X
Wydawca: Cambridge University Press
DOI: 10.1017/s2633903x23000132

Structural deficits in key domains of Shank2 lead to alterations in postsynaptic nanoclusters and to a neurodevelopmental disorder in humans (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hassani Nia F, Woike D, Bento I, Niebling S, Tibbe D, Schulz K, Hirnet D, Skiba M, Hönck HH, Veith K, Günther C, Scholz T, Bierhals T, Driemeyer J, Bend R, Failla AV, Lohr C, Alai MG, Kreienkamp HJ
Opublikowane w: Molecular Psychiatry, 2022, ISSN 1359-4184
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41380-022-01882-3

Directed Evolution of Phi Class Glutathione Transferases Involved in Multiple-Herbicide Resistance of Grass Weeds and Crops (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ioannou E, Papageorgiou AC, Labrou NE.
Opublikowane w: International Journal of Molecular Sciences, 2022, ISSN 1422-0067
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms23137469

Analysis and validation of overall N-glycan conformation in Privateer (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Dialpuri JS, Bagdonas H, Atanasova M, Schofield LC, Hekkelman ML, Joosten RP, Agirre J.
Opublikowane w: Acta Crystallogr D Struct Biol, 2023, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798323003510

Teixobactin kills bacteria by a two-pronged attack on the cell envelope (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Shukla R, Lavore F, Maity S, Derks MGN, Jones CR, Vermeulen BJA, Melcrová A, Morris MA, Becker LM, Wang X, Kumar R, Medeiros-Silva J, van Beekveld RAM, Bonvin AMJJ, Lorent JH, Lelli M, Nowick JS, MacGillavry HD, Peoples AJ, Spoering AL, Ling LL, Hughes DE, Roos WH, Breukink E, Lewis K, Weingarth M.
Opublikowane w: Nature, 2022, ISSN 1476-4687
Wydawca: Nature Research (subsidiary of Springer Nature)
DOI: 10.1038/s41586-022-05019-y

Cryo-EM structure of transcription termination factor Rho from Mycobacterium tuberculosis reveals bicyclomycin resistance mechanism (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Saridakis E, Vishwakarma R, Lai-Kee-Him J, Martin K, Simon I, Cohen-Gonsaud M, Coste F, Bron P, Margeat E, Boudvillain M
Opublikowane w: Commun Biol., Numer 5(1):120, 2022, ISSN 2399-3642
Wydawca: Springer Nature Limited
DOI: 10.1038/s42003-022-03069-6

Amyloid fibril structure from the vascular variant of systemic AA amyloidosis. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Banerjee S, Baur J, Daniel C, Pfeiffer PB, Hitzenberger M, Kuhn L, Wiese S, Bijzet J, Haupt C, Amann KU, Zacharias M, Hazenberg BPC, Westermark GT, Schmidt M, Fändrich M.
Opublikowane w: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-34636-4

The Internal Structural Dynamics of Elastin-Like Polypeptide Assemblies by <sup>13</sup>C-Direct Detected NMR Spectroscopy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Dörte Brandis, Pavel Kadeřávek, Dennis Kurzbach
Opublikowane w: Analytical Chemistry, 2025, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.4c05163

AlphaFill: enriching AlphaFold models with ligands and cofactors (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hekkelman ML, De Vries I, Joosten RP, Perrakis A
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 15487091, 2022, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-022-01685-y

The structured organization of Deinococcus radiodurans' cell envelope (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Farci D, Haniewicz P, Piano D.
Opublikowane w: Proc Natl Acad Sci U S A., 2022, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2209111119

splitSMLM, a spectral demixing method for high-precision multi-color localization microscopy applied to nuclear pore complexes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Andronov L, Genthial R, Hentsch D, Klaholz BP.
Opublikowane w: Communications Biology, Numer 23993642, 2022, ISSN 2399-3642
Wydawca: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42003-022-04040-1

The SDBC is active in quenching oxidative conditions and bridges the cell envelope layers in Deinococcus radiodurans (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Farci D, Graça AT, Iesu L, de Sanctis D, Piano D.
Opublikowane w: Journal of Biological Chemistry, 2022, ISSN 0021-9258
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102784

Improved detection of magnetic interactions in proteins based on long-lived coherences (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ianc O, Teleanu F, Ciumeică A, Lupulescu A, Sadet A, Vasos PR.
Opublikowane w: Communications Chemistry, 2024, ISSN 2399-3669
Wydawca: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42004-024-01195-2

Purification and Structural Characterization of the Auxiliary Activity 9 Native Lytic Polysaccharide Monooxygenase from Thermoascus aurantiacus and Identification of Its C1- and C4-Oxidized Reaction Products (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Weishuai Yu, Imran Mohsin, Anastassios C. Papageorgiou and Duochuan Li
Opublikowane w: Catalysts, 2022, ISSN 2073-4344
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/catal12020139

In-cell NMR suggests that DNA i-motif levels are strongly depleted in living human cells (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Víšková P, Ištvánková E, Ryneš J, Džatko Š, Loja T, Živković ML, Rigo R, El-Khoury R, Serrano-Chacón I, Damha MJ, González C, Mergny JL, Foldynová-Trantírková S, Trantírek L.
Opublikowane w: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-46221-y

PAXX binding to the NHEJ machinery explains functional redundancy with XLF (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Seif-El-Dahan M, Kefala-Stavridi A, Frit P, Hardwick SW, Chirgadze DY, Maia De Oliviera T, Britton S, Barboule N, Bossaert M, Pandurangan AP, Meek K, Blundell TL, Ropars V, Calsou P, Charbonnier JB, Chaplin AK
Opublikowane w: Science Advances, 2023, ISSN 2375-2548
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.adg2834

Cryo-EM structure of a lysozyme-derived amyloid fibril from hereditary amyloidosis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sara Karimi-Farsijani, Kartikay Sharma, Marijana Ugrina, Lukas Kuhn, Peter Benedikt Pfeiffer, Christian Haupt, Sebastian Wiese, Ute Hegenbart, Stefan O. Schönland, Nadine Schwierz, Matthias Schmidt, Marcus Fändrich
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-54091-7

Structural rearrangement of amyloid-β upon inhibitor binding suppresses formation of Alzheimer’s disease related oligomers (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Tobias Lieblein, Rene Zangl, Janosch Martin, Jan Hoffmann, Marie J Hutchison, Tina Stark, Elke Stirnal, Thomas Schrader, Harald Schwalbe, Nina Morgner
Opublikowane w: eLife, Numer 9, 2020, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.59306

NMR quality control of fragment libraries for screening (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sridhar Sreeramulu, Christian Richter, Till Kuehn, Kamal Azzaoui, Marcel Jules José Blommers, Rebecca Del Conte, Marco Fragai, Nils Trieloff, Peter Schmieder, Marc Nazaré, Edgar Specker, Vladimir Ivanov, Hartmut Oschkinat, Lucia Banci, Harald Schwalbe
Opublikowane w: Journal of Biomolecular NMR, 2020, ISSN 0925-2738
Wydawca: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10858-020-00327-9

Development of in vitro-grown spheroids as a 3D tumor model system for solid-state NMR spectroscopy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Reinier Damman, Alessandra Lucini Paioni, Katerina T. Xenaki, Irati Beltrán Hernández, Paul M. P. van Bergen en Henegouwen, Marc Baldus
Opublikowane w: Journal of Biomolecular NMR, Numer June 19 2020, 2020, ISSN 0925-2738
Wydawca: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10858-020-00328-8

The basics of small-angle neutron scattering (SANS for new users of structural biology) (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Cy M. Jeffries, Zuzanna Pietras, Dmitri I. Svergun
Opublikowane w: EPJ Web of Conferences, Numer 236, 2020, Strona(/y) 03001, ISSN 2100-014X
Wydawca: EDP Sciences
DOI: 10.1051/epjconf/202023603001

Structure-Based Identification and Functional Characterization of a Lipocalin in the Malaria Parasite Plasmodium falciparum (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Paul-Christian Burda, Thomas Crosskey, Katharina Lauk, Aimo Zurborg, Christoph Söhnchen, Benjamin Liffner, Louisa Wilcke, Emma Pietsch, Jan Strauss, Cy M. Jeffries, Dmitri I. Svergun, Danny W. Wilson, Matthias Wilmanns, Tim-Wolf Gilberger
Opublikowane w: Cell Reports, Numer 31/12, 2020, Strona(/y) 107817, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2020.107817

Anomeric Selectivity of Trehalose Transferase with Rare l -Sugars (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Luuk Mestrom, Stefan R. Marsden, Hessel van der Eijk, Jesper U. Laustsen, Cy M. Jeffries, Dmitri I. Svergun, Peter-Leon Hagedoorn, Isabel Bento, Ulf Hanefeld
Opublikowane w: ACS Catalysis, Numer 10/15, 2020, Strona(/y) 8835-8839, ISSN 2155-5435
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscatal.0c02117

19F‐NMR‐based fragment screening for 14 different biologically active RNAs and 10 DNA and protein counter‐screens (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Oliver Binas, Vanessa de Jesus, Tom Landgraf, Albrecht Eduard Völklein, Jason Martins, Daniel Hymon, Hannes Berg, Jasleen Kaur Bains, Thomas Biedenbänder, Boris Fürtig, Santosh Lakshmi Gande, Anna Niesteruk, Andreas Oxenfarth, Nusrat Shahin Qureshi, Tatjana Schamber, Robbin Schnieders, Alix Tröster, Anna Wacker, Julia Wirmer-Bartoschek, Maria Alexandra Wirtz Martin, Elke Stirnal, Kamal Azzaoui
Opublikowane w: ChemBioChem, Numer Aug 14 2020, 2020, ISSN 1439-4227
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202000476

Cryo-Structured Illumination Microscopic Data Collection from Cryogenically Preserved Cells (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Nina Vyas, Nina Perry, Chidinma A. Okolo, Ilias Kounatidis, Thomas M. Fish, Kamal L. Nahas, Archana Jadhav, Mohamed A. Koronfel, Johannes Groen, Eva Pereiro, Ian M. Dobbie, Maria Harkiolaki
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 171, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62274

Scipion Flexibility Hub: an integrative framework for advanced analysis of conformational heterogeneity in cryoEM (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Herreros D, Krieger JM, Fonseca Y, Conesa P, Harastani M, Vuillemot R, Hamitouche I, Serrano Gutiérrez R, Gragera M, Melero R, Jonic S, Carazo JM, Sorzano COS
Opublikowane w: Acta Crystallogr D Struct Biol, 2023, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798323004497

Structural insights into the mechanism of DNA branch migration during homologous recombination in bacteria (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Leonardo Talachia Rosa, Émeline Vernhes, Anne-Lise Soulet, Patrice Polard, Rémi Fronzes
Opublikowane w: The EMBO Journal, 2024, ISSN 1460-2075
Wydawca: European Molecular Biology Organization, Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s44318-024-00264-5

3D Heteronuclear Magnetization Transfers for the Establishment of Secondary Structures in SARS-CoV-2-Derived RNAs (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jihyun Kim, Mihajlo Novakovic, Sundaresan Jayanthi, Adonis Lupulescu, Eriks Kupce, J. Tassilo Grün, Klara Mertinkus, Andreas Oxenfarth, Christian Richter, Robbin Schnieders, Julia Wirmer-Bartoschek, Harald Schwalbe, Lucio Frydman
Opublikowane w: Journal of the American Chemical Society, 2021, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c01914

Heteronuclear decoupling with Rotor-Synchronized Phase-Alternated Cycles (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Simion A, Schubeis T, Tanguy Le Marchand T, Vasilescu M, Pintacuda G, Lesage A, Filip C
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, 2022, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0098135

NMR Studies on the Structure of Yeast Sis1 and the Dynamics of Its Interaction with Ssa1-EEVD (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Carolina O. Matos, Glaucia M. S. Pinheiro, Icaro P. Caruso, Gisele C. Amorim, Fabio C. L. Almeida, Carlos H. I. Ramos
Opublikowane w: Molecules, Numer 30, 2024, Strona(/y) 11, ISSN 1420-3049
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules30010011

Conservation and divergence of the G-interfaces of Drosophila melanogaster septins (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: de Freitas Fernandes A, Leonardo DA, Cavini IA, Rosa HVD, Vargas JA, D'Muniz Pereira H, Nascimento AS, Garratt RC
Opublikowane w: Cytoskeleton (Hoboken), 2022, ISSN 1949-3584
Wydawca: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/cm.21740

The Automated Crystallography Pipelines at the EMBL HTX Facility in Grenoble. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Irina Cornaciu, Raphael Bourgeas, Guillaume Hoffmann, Florine Dupeux, Anne-Sophie Humm, Vincent Mariaule, Andrea Pica, Damien Clavel, Gael Seroul, Peter Murphy, José Antonio Márquez
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 172, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62491

The structure of the <i>Vibrio natriegens</i> 70S ribosome in complex with the proline-rich antimicrobial peptide Bac5(1–17) (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Karoline Raulf, Timm O Koller, Bertrand Beckert, Alexander Lepak, Martino Morici, Mario Mardirossian, Marco Scocchi, Gert Bange, Daniel N Wilson
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 53, 2025, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf324

An automated platform for structural analysis of membrane proteins through serial crystallography (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Robert D. Healey, Shibom Basu, Anne-Sophie Humm, Cedric Leyrat, Xiaojing Cong, Jérome Golebiowski, Florine Dupeux, Andrea Pica, Sébastien Granier, José Antonio Márquez
Opublikowane w: bioRxiv, Numer June 3, 2021, 2021, ISSN 0362-4331
Wydawca: New York Times Company
DOI: 10.1101/2021.06.03.446146

Sarbecovirus programmed ribosome frameshift RNA element folding studied by NMR spectroscopy and comparative analyses (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: María Hernández-Marín, Ángel Cantero-Camacho, Ignacio Mena, Sergio López-Núñez, Adolfo García-Sastre, José Gallego
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae704

Direct Expression of Fluorinated Proteins in Human Cells for 19F In-Cell NMR Spectroscopy (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Pham LBT, Costantino A, Barbieri L, Calderone V, Luchinat E, Banci L.
Opublikowane w: J Am Chem Soc, 2023, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c12086

Shedding Light on Osteosarcoma Cell Differentiation: Impact on Biomineralization and Mitochondria Morphology (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rossi F, Picone G, Cappadone C, Sorrentino A, Columbaro M, Farruggia G, Catelli E, Sciutto G, Prati S, Oliete R, Pasini A, Pereiro E, Iotti S, Malucelli E
Opublikowane w: International Journal of Molecular Sciences, 2023, ISSN 1422-0067
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms24108559

Workflow and Tools for Crystallographic Fragment Screening at the Helmholtz-Zentrum Berlin (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jan Wollenhaupt, Tatjana Barthel, Gustavo M. A. Lima, Alexander Metz, Dirk Wallacher, Elmir Jagudin, Franziska U. Huschmann, Thomas Hauß, Christian G. Feiler, Martin Gerlach, Michael Hellmig, Ronald Förster, Michael Steffien, Andreas Heine, Gerhard Klebe, Uwe Mueller, Manfred S. Weiss
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 169, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62208

Unveiling the dimer/monomer propensities of Smad MH1-DNA complexes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Lidia Ruiz, Zuzanna Kaczmarska, Tiago Gomes, Eric Aragon, Carles Torner, Regina Freier, Blazej Baginski, Pau Martin-Malpartida, Natàlia de Martin Garrido, José. A. Marquez, Tiago N. Cordeiro, Radoslaw Pluta, Maria J. Macias
Opublikowane w: Computational and Structural Biotechnology Journal, Numer 19, 2021, Strona(/y) 632-646, ISSN 2001-0370
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2020.12.044

In‐cell NMR of functional riboswitch aptamers in eukaryotic cells (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: P. Broft, S. Dzatko, M. Krafcikova, Robert Hansel-Hertsch, A. Wacker, Volker Doetsch, L. Trantirek, Harald Schwalbe
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, 2020, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202007184

Magnetotactic bacteria from diverse <i>Pseudomonadota</i> families biomineralize intracellular Ca-carbonate (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Camille C Mangin, Karim Benzerara, Marine Bergot, Nicolas Menguy, Béatrice Alonso, Stéphanie Fouteau, Raphaël Méheust, Daniel Chevrier, Christian Godon, Elsa Turrini, Neha Mehta, Arnaud Duverger, Cynthia Travert, Vincent Busigny, Elodie Duprat, Romain Bolzoni, Corinne Cruaud, Eric Viollier, Didier Jézéquel, David Vallenet, Christopher T Lefèvre, Caroline L Monteil
Opublikowane w: The ISME Journal, 2025, ISSN 1751-7362
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1093/ismejo/wrae260

Adding Size Exclusion Chromatography (SEC) and Light Scattering (LS) Devices to Obtain High-Quality Small Angle X-Ray Scattering (SAXS) Data (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Melissa A. Graewert, Stefano Da Vela, Tobias W. Gräwert, Dmitry S. Molodenskiy, Clément E. Blanchet, Dmitri I. Svergun, Cy M. Jeffries
Opublikowane w: Crystals, Numer 10/11, 2020, Strona(/y) 975, ISSN 2073-4352
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cryst10110975

Magnetization transfer to enhance NOE cross‐peaks among labile protons: Applications to imino‐imino sequential walks in SARS‐CoV‐2‐derived RNAs (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Mihajlo Novakovic, Eriks Kupce, Tali Scherf, Andreas Oxenfarth, Robbin Schnieders, Tassilo Grün, Julia Wirmer-Bartoschek, Christian Richter, Harald Schwalbe, Lucio Frydman
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, 2021, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202015948

Cryo-EM structure of the fully assembled Elongator complex. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jaciuk M, Scherf D, Kaszuba K, Gaik M, Rau A, Kościelniak A, Krutyhołowa R, Rawski M, Indyka P, Graziadei A, Chramiec-Głąbik A, Biela A, Dobosz D, Lin TY, Abbassi NE, Hammermeister A, Rappsilber J, Kosinski J, Schaffrath R, Glatt S.
Opublikowane w: Nucleic Acid Research, 2023, ISSN 1362-4962
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/nar/gkac1232

The Molecular Chaperone CCT Sequesters Gelsolin and Protects it from Cleavage by Caspase-3 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Cuéllar J, Vallin J, Svanström A, Maestro-López M, Bueno-Carrasco MT, Ludlam WG, Willardson BM, Valpuesta JM, Grantham J
Opublikowane w: J Mol Biol, 2021, ISSN 0022-2836
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2021.167399

Biomimetic, peptide-guided silica formation by real-time NMR of elastin-like and R5 fusion peptides – Bimodal peptide aggregation drives dual-pathway silicification mechanisms (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Dörte Brandis, Dominik Obrist, Martin F.T. Haßler, Dennis Kurzbach
Opublikowane w: Journal of Molecular Biology, 2025, Strona(/y) 169303, ISSN 0022-2836
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2025.169303

Achieving Efficient Fragment Screening at XChem Facility at Diamond Light Source (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Alice Douangamath, Ailsa Powell, Daren Fearon, Patrick M. Collins, Romain Talon, Tobias Krojer, Rachael Skyner, Jose Brandao-Neto, Louise Dunnett, Alexandre Dias, Anthony Aimon, Nicholas M. Pearce, Conor Wild, Tyler Gorrie-Stone, Frank von Delft
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 171, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62414

Periplasmic protein quality control at atomic level in live cells (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Lisandro J. González, Francisco J. Hita, Letizia Pontoriero, Roberta Pierattelli, Andres Binolfi, Alejandro J. Vila
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 16, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-62340-6

Enlarging the scenario of site directed 19F labeling for NMR spectroscopy of biomolecules (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Vitali V, Torricella F, Massai L, Messori L, Banci L.
Opublikowane w: Scientific reports, 2023, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-49247-2

Optimising in-cell NMR acquisition for nucleic acids (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Annecke HTP, Eidelpes R, Feyrer H, Ilgen J, Gürdap CO, Dasgupta R, Petzold K
Opublikowane w: J Biomol NMR, 2024, ISSN 0925-2738
Wydawca: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10858-024-00448-5

Engineered Nonviral Protein Cages Modified for MR Imaging (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Kaster MA, Levasseur MD, Edwardson TGW, Caldwell MA, Hofmann D, Licciardi G, Parigi G, Luchinat C, Hilvert D, Meade TJ
Opublikowane w: ACS Applied Bio Materials, 2023, ISSN 2576-6422
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsabm.2c00892

Crystallographic Fragment Screening on the Shigella Type III Secretion System Chaperone IpgC (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gárdonyi M, Hasewinkel C, Wallbaum J, Wollenhaupt J, Weiss MS, Klebe G, Reuter K, Heine A
Opublikowane w: ACS Omega, 2023, ISSN 2470-1343
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsomega.3c07058

Emerging Themes in CryoEM─Single Particle Analysis Image Processing (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Vilas JL, Carazo JM, Sorzano COS
Opublikowane w: Chemical Reviews, 2022, ISSN 0009-2665
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.chemrev.1c00850

X-ray structure of the metastable SEPT14-SEPT7 coiled coil reveals a hendecad region crucial for heterodimerization (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Cavini IA, Winter AJ, D'Muniz Pereira H, Woolfson DN, Crump MP, Garratt RC
Opublikowane w: Acta Crystallogr D Struct Biol, 2023, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798323006514

Mg2+-dependent conformational equilibria in CorA and an integrated view on transport regulation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Johansen NT, Bonaccorsi M, Bengtsen T, Larsen AH, Tidemand FG, Pedersen MC, Huda P, Berndtsson J, Darwish T, Yepuri NR, Martel A, Pomorski TG, Bertarello A, Sansom M, Rapp M, Crehuet R, Schubeis T, Lindorff-Larsen K, Pintacuda G, Arleth L.
Opublikowane w: Elife, 2022, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.71887

Secretory IgA and T cells targeting SARS-CoV-2 spike protein are transferred to the breastmilk upon mRNA vaccination (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Juliana Goncalves, A. Margarida Juliano, Nadia Charepe, Marta Alenquer, Diogo Athayde, Filipe Ferreira, Margarida Archer, Maria Joao Amorim, Fatima Serrano, Helena Soares
Opublikowane w: Cell Reports Medicine, 2021, ISSN 2666-3791
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.xcrm.2021.100468

Structural and Functional Characterization of the Newly Designed Antimicrobial Peptide Crabrolin21 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Cantini F, Giannì P, Bobone S, Troiano C, van Ingen H, Massoud R, Perini N, Migliore L, Savarin P, Sanders C, Stella L, Sette M
Opublikowane w: Membranes, 2023, ISSN 2077-0375
Wydawca: Molecular Diversity Preservation International
DOI: 10.3390/membranes13030365

The cryo-EM structure of the S-layer deinoxanthin-binding complex of Deinococcus radiodurans informs properties of its environmental interactions (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Farci D, Haniewicz P, de Sanctis D, Iesu L, Kereïche S, Winterhalter M, Piano D.
Opublikowane w: J Biol Chem., 2022, ISSN 0021-9258
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102031

1H‑Detected Biomolecular NMR under Fast Magic-Angle Spinning (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Le Marchand T, Schubeis T, Bonaccorsi M, Paluch P, Lalli D, Pell AJ, Andreas LB, Jaudzems K, Stanek J, Pintacuda G.
Opublikowane w: Chemical Reviews, 2022, ISSN 1520-6890
Wydawca: ACS
DOI: 10.1021/acs.chemrev.1c00918

iNEXT-Discovery and Instruct-ERIC: Integrating High-End Services for Translational Research in Structural Biology (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hans Wienk, Lucia Banci, Susan Daenke, Eva Pereiro, Harald Schwalbe, David Ian Stuart, Manfred S. Weiss, Anastassis Perrakis
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 177, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/63435

Molecular basis for transposase activation by a dedicated AAA+ ATPase (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: de la Gándara Á, Spínola-Amilibia M, Araújo-Bazán L, Núñez-Ramírez R, Berger JM, Arias-Palomo E.
Opublikowane w: Nature, 2024, ISSN 1476-4687
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41586-024-07550-6

RAPP-containing arrest peptides induce translational stalling by short circuiting the ribosomal peptidyltransferase activity (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Morici M, Gabrielli S, Fujiwara K, Paternoga H, Beckert B, Bock LV, Chiba S, Wilson DN
Opublikowane w: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-46761-3

A round-robin approach provides a detailed assessment of biomolecular small-angle scattering data reproducibility and yields consensus curves for benchmarking (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jill Trewhella, Patrice Vachette, Jan Bierma, Clement Blanchet, Emre Brookes, Srinivas Chakravarthy, Leonie Chatzimagas, Thomas E. Cleveland, Nathan Cowieson, Ben Crossett, Anthony P. Duff, Daniel Franke, Frank Gabel, Richard E. Gillilan, Melissa Graewert, Alexander Grishaev, J. Mitchell Guss, Michal Hammel, Jesse Hopkins, Qingqui Huang, Jochen S. Hub, Greg L. Hura, Thomas C. Irving, Cy Michael Je
Opublikowane w: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Numer 78, 2022, Strona(/y) 1315-1336, ISSN 2059-7983
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1107/s2059798322009184

Modelling covalent linkages in CCP 4 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Robert A. Nicholls, Robbie P. Joosten, Fei Long, Marcin Wojdyr, Andrey Lebedev, Eugene Krissinel, Lucrezia Catapano, Marcus Fischer, Paul Emsley, Garib N. Murshudov
Opublikowane w: Acta Crystallographica Section D Structural Biology, Numer 77/6, 2021, ISSN 2059-7983
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2059798321001753

Combining Solid‐State NMR with Structural and Biophysical Techniques to Design Challenging Protein‐Drug Conjugates (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Linda Cerofolini, Kristian Vasa, Elisa Bianconi, Maria Salobehaj, Giulia Cappelli, Alice Bonciani, Giulia Licciardi, Anna Pérez‐Ràfols, Luis Padilla‐Cortés, Sabrina Antonacci, Domenico Rizzo, Enrico Ravera, Caterina Viglianisi, Vito Calderone, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Antonio Macchiarulo, Stefano Menichetti, Marco Fragai
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, Numer 62, 2023, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202303202

Mixed‐Valence Compounds as Polarizing Agents for Overhauser Dynamic Nuclear Polarization in Solids** (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Andrei Gurinov, Benedikt Sieland, Andrey Kuzhelev, Hossam Elgabarty, Thomas D. Kühne, Thomas Prisner, Jan Paradies, Marc Baldus, Konstantin L. Ivanov, Svetlana Pylaeva
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, Numer 60/28, 2021, Strona(/y) 15371-15375, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202103215

GluA4 AMPA receptor gating mechanisms and modulation by auxiliary proteins (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Carlos Vega-Gutiérrez, Javier Picañol-Párraga, Irene Sánchez-Valls, Victoria del Pilar Ribón-Fuster, David Soto, Beatriz Herguedas
Opublikowane w: Nature Structural &amp; Molecular Biology, 2025, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-025-01666-7

Nucleocapsid assembly drives Ebola viral factory maturation and dispersion (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Melina Vallbracht, Bianca S. Bodmer, Konstantin Fischer, Jana Makroczyova, Sophie L. Winter, Lisa Wendt, Moritz Wachsmuth-Melm, Thomas Hoenen, Petr Chlanda
Opublikowane w: Cell, 2024, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2024.11.024

The structure of the human 80S ribosome at 1.9 Å resolution reveals the molecular role of chemical modifications and ions in RNA (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Holvec S, Barchet C, Lechner A, Fréchin L, De Silva SNT, Hazemann I, Wolff P, von Loeffelholz O, Klaholz BP
Opublikowane w: Nature Structural & Molecular Biology, 2024, ISSN 1545-9985
Wydawca: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41594-024-01274-x

Design, Quality and Validation of the EU-OPENSCREEN Fragment Library Poised to a High-Throughput Screening Collection (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jalencas X, Berg H, Espeland LO, Sreeramulu S, Kinnen F, Richter C, Georgiou C, Yadrykhinsky V, Specker E, Jaudzems K, Mileti T, Harmel R, Gribbon P, Schwalbe H, Brenk R, Jirgensons A, Zaliani A, Mestres J.
Opublikowane w: RSC Medicinal Chemistry, 2024, ISSN 2632-8682
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3md00724c

AI revolutions in biology: The joys and perils of AlphaFold (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Anastassis Perrakis, Titia K. Sixma
Opublikowane w: EMBO Reports, 2021, ISSN 1469-3178
Wydawca: EMBO Press
DOI: 10.15252/embr.202154046

Structures of annexin A2-PS DNA complexes show dominance of hydrophobic interactions in phosphorothioate binding (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hyjek-Składanowska M, Anderson BA, Mykhaylyk V, Orr C, Wagner A, Poznański JT, Skowronek K, Seth P, Nowotny M
Opublikowane w: Nucleic Acid Research, 2022, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac774

Sample preparation strategies for efficient correlation of 3D SIM and soft X-ray tomography data at cryogenic temperatures (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Chidinma A. Okolo, Ilias Kounatidis, Johannes Groen, Kamal L. Nahas, Stefan Balint, Thomas M. Fish, Mohamed A. Koronfel, Aitziber L. Cortajarena, Ian M. Dobbie, Eva Pereiro, Maria Harkiolaki
Opublikowane w: Nature Protocols, Numer 16/6, 2021, Strona(/y) 2851-2885, ISSN 1754-2189
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41596-021-00522-4

Preparation and Cryo-FIB micromachining of <em>Saccharomyces cerevisiae</em> for Cryo-Electron Tomography (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jana Moravcová, Matyáš Pinkas, Radka Holbová, Jiří Nováček
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 177, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62351

High-resolution structures of a thermophilic eukaryotic 80S ribosome reveal atomistic details of translocation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Miglė Kišonaitė, Klemens Wild, Karine Lapouge, Thomas Ruppert, Irmgard Sinning
Opublikowane w: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-27967-9

Rational design of the zonulin inhibitor AT1001 derivatives as potential anti SARSCoV-2 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Di Micco S, Rahimova R, Sala M,Scala MC, Vivenzio G, Musella S, Andrei G, Remans K, Mammri L, Snoeck R, Bifulco G, Di Matteo F, Vestuto V, Campiglia P, Márquez JA, Fasano A.
Opublikowane w: European Journal of Medicinal Chemistry, Numer 02235234, 2022, ISSN 0223-5234
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ejmech.2022.114857

The translating bacterial ribosome at 1.55 Å resolution generated by cryo-EM imaging services (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Fromm SA, O'Connor KM, Purdy M, Bhatt PR, Loughran G, Atkins JF, Jomaa A, Mattei S.
Opublikowane w: Nature communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-36742-3

A multi-scale numerical approach to study monoclonal antibodies in solution (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Polimeni M, Zaccarelli E, Gulotta A, Lund M, Stradner A, Schurtenberger P
Opublikowane w: APL Bioengineering, 2024, ISSN 2473-2877
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0186642

Estimating conformational landscapes from Cryo-EM particles by 3D Zernike polynomials (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: D. Herreros, R. R. Lederman, J. M. Krieger, A. Jiménez-Moreno, M. Martínez, D. Myška, D. Strelak, J. Filipovic, C. O. S. Sorzano, J. M. Carazo
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 14, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-35791-y

Integration of NMR Spectroscopy in an Analytical Workflow to Evaluate the Effects of Oxidative Stress on Abituzumab: Beyond the Fingerprint of mAbs (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Cerofolini L, Ravera E, Fischer C, Trovato A, Sacco F, Palinsky W, Angiuoni G, Fragai M, Baroni F.
Opublikowane w: Analytical Chemistry, 2023, ISSN 1520-6882
Wydawca: ACS Publications
DOI: 10.1021/acs.analchem.3c00317

The macromolecular crystallography beamlines of the Helmholtz-Zentrum Berlin at the BESSY II storage ring: history, current status and future directions (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Uwe Mueller, Tatjana Barthel, Laila S. Benz, Volodymyr Bon, Thomas Crosskey, Camilla Genter Dieguez, Ronald Förster, Christine Gless, Thomas Hauß, Udo Heinemann, Michael Hellmig, David James, Frank Lennartz, Melanie Oelker, Ruslan Ovsyannikov, Parinita Singh, Markus C. Wahl, Gert Weber, Manfred S. Weiss
Opublikowane w: Journal of Synchrotron Radiation, Numer 32, 2025, ISSN 1600-5775
Wydawca: IUCr Journals
DOI: 10.1107/s1600577525001110

NMR-based Fragment Screening in a Minimum Sample but Maximum Automation Mode (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hannes Berg, M. A. Wirtz Martin, A. Niesteruk, C. Richter, S. Sreeramulu, H. Schwalbe
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 172, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62262

Nano-Differential Scanning Fluorimetry for Screening in Fragment-based Lead Discovery (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Misbha Ud Din Ahmad, Alexander Fish, Jeroen Molenaar, Sridhar Sreeramulu, Christian Richter, Nadide Altincekic, Harald Schwalbe, Hans Wienk, Anastassis Perrakis
Opublikowane w: Journal of Visualized Experiments, Numer 171, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62469

Higher resolution in cryo-EM by the combination of macromolecular prior knowledge and image-processing tools (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ramirez-Aportela E, Carazo JM, Sorzano COS
Opublikowane w: IUCrJ, 2022, ISSN 2052-2525
Wydawca: IUCr
DOI: 10.1107/s2052252522006959

Structural basis of CDNF interaction with the UPR regulator GRP78 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Melissa A. Graewert, Maria Volkova, Klara Jonasson, Juha A. E. Määttä, Tobias Gräwert, Samara Mamidi, Natalia Kulesskaya, Johan Evenäs, Richard E. Johnsson, Dmitri Svergun, Arnab Bhattacharjee, Henri J. Huttunen
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-52478-0

Rational Crystal Contact Engineering for Programmable Self-Assembled Protein Architectures (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Mantas Liutkus, Adriana Rojas, Aitziber Cortajarena
Opublikowane w: ChemRxiv, 2025, ISSN 2573-2293
Wydawca: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.26434/chemrxiv-2025-tnk5w

Controlled pH Alteration Enables Guanine Accumulation and Drives Crystallization within Iridosomes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Zohar Eyal, Anna Gorelick-Ashkenazi, Rachael Deis, Yuval Barzilay, Yonatan Broder, Asher Perry Kellum, Neta Varsano, Michal Hartstein, Andrea Sorrentino, Ifat Kaplan-Ashiri, Katya Rechav, Rebecca Metzler, Lothar Houben, Leeor Kronik, Peter Rez, Dvir Gur
Opublikowane w: BioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.07.20.604036

TIR domains produce histidine-ADPR conjugates as immune signaling molecules in bacteria (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sabonis D, Avraham C, Lu A, Herbst E, Silanskas A, Leavitt A, Yirmiya E, Zaremba M, Amitai G, Kranzusch PJ, Sorek R, Tamulaitiene G.
Opublikowane w: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.01.03.573942

Macrophage activation of cGAS and TRIM5 distinguish pandemic and non-pandemic HIV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Lorena Zuliani Alvarez, Morten L. Govasli, Jane Rasaiyaah, Chris Monit, Stephen O. Perry, Rebecca P. Sumner, Simon McAlpine-Scott, Claire Dickson, K. M. Rifat Faysal, Laura Hilditch, Richard J. Miles, Frederic Bibollet-Ruche, Beatrice H. Hahn, Till Boecking, Nikos Pinotsis, Leo C. James, David A. Jacques, Greg J. Towers
Opublikowane w: bioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2022.01.21.477263

An original potentiating mechanism revealed by the cryoEM structures of the human α7 nicotinic receptor in complex with nanobodies (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Prevost MS, Barilone N, Dejean De La Batie G, Pons S, Ayme G, England P, Gielen M, Bontems F, Pehau-Arnaudet G, Maskos U, Lafaye P, Corringer P-J.
Opublikowane w: bioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.01.03.522595

Phase distortion-free pNMR spectra

Autorzy: Enrico Ravera
Opublikowane w: arXiv.org, 2021, ISSN 2331-8422
Wydawca: arXiv.org / Cornell University

Organisation of axial regions of isolated mitotic chromosomes visualised by cryo correlative light and electron tomography (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gurudatt Patra, Mohamad Harastani, Kumiko Samejima, Lucy Remnant, Nathalie Troffer-Charlier, Corrine Crucifix, Alexandre Durand, Nils Marechal, Yves Lutz, Anna M. Steyer, Zhengyi Yang, Wim J. H. Hagen, William C. Earnshaw, Mikhail Eltsov
Opublikowane w: BioRxiv, 2025, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.02.06.636497

Structural mechanisms of autoinhibition and substrate recognition by the ubiquitin ligase HACE1 (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Düring J, Wolter M, Toplak J, Torres C, Dybkov O, Fokkens TJ, Urlaub H, Steinchen W, Dienemann C, Lorenz S.
Opublikowane w: Research Square, 2023, ISSN 2693-5015
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.21203/rs.3.rs-3220888/v1

Scipion-EM-ProDy: A Graphical Interface for the ProDy Python Package within the Scipion Workflow Engine enabling Integration of Databases, Simulations and Cryo-Electron Microscopy Image Processing (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Krieger JM, Sorzano COS, Carazo JM.
Opublikowane w: Preprints 2023, 2023080828, 2023, ISSN 2310-287X
Wydawca: Preprints
DOI: 10.20944/preprints202308.0828.v1

Improved detection of magnetic interactions in proteins based on long-lived coherences (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sadet A, Ianc O, Teleanu F, Ciumeică A, Lupulescu A, Vasos P.
Opublikowane w: Research Square, 2024, ISSN 2693-5015
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.21203/rs.3.rs-3694602/v1

A Modular Platform for Streamlining Automated Cryo-FIB Workflows (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Klumpe S, Fung HKH, Goetz SK, Zagoriy I, Hampoetz B, Zhang X, Erdmann PS, Baumbach J, Müller CW, Beck M, Plitzko JM, Mahamid J.
Opublikowane w: bioRxiv, 2021, ISSN 0362-4331
Wydawca: New York Times Company
DOI: 10.1101/2021.05.19.444745

Structural basis for activation and mechanism of the bacterial hexameric motors RadA and ComM in DNA branch migration during homologous recombination (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Talachia Rosa L, Vernhes E, Soulet AL, Polard P, Fronzes R.
Opublikowane w: BioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.02.15.580443

Iron Oxide Nanoparticles as Positive T1 Contrast Agents for Low-Field Magnetic Resonance Imaging at 64 mT (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Oberdick S, Jordanova K, Lundstrom J, Parigi G, Poorman M, Poorman G, Keenan K.
Opublikowane w: Research Square, 2023, ISSN 2693-5015
Wydawca: Research Square Company
DOI: 10.21203/rs.3.rs-2485292/v1

EasyGrid: A versatile platform for automated cryo-EM sample preparation and quality control (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Gemin O, Armijo V, Hons M, Bissardon C, Linares R, Bowler MW, Wolff G, Kovalev K, Babenko A, Salo VT, Schneider S, Rossi C, Lecomte L, Deckers T, Lauzier K, Janocha R, Felisaz F, Sinoir J, Galej WP, Mahamid J, Muller CW, Eustermann S, Mattei S, Cipriani F, Papp G.
Opublikowane w: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.01.18.576170

Inducible protein expression in stably transfected cells paves the way toward in-cell NMR studies in defined physiological states and 3D tissue cultures (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rynes J, Istvankova E, Krafcikova M, Luchinat E, Barbieri L, Banci L, Kamarytova K, Loja T, Fafilek B, Rico-Llanos G, Krejci P, Macurek L, Foldynova-Trantirkova S, Trantirek L.
Opublikowane w: ChemRxiv, 2024, ISSN 2573-2293
Wydawca: Cambridge Unversity Press
DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-jqd66-v2

Structure of the dopamine D3 receptor bound to a bitopic agonist reveals a new specificity site in an expanded allosteric pocket (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Arroyo-Urea S, Nazarova AL, Carrión-Antolí A, Bonifazi A, Battiti FO, Homing Lam J, Hauck Newman A, Katritch V, García-Nafría J.
Opublikowane w: Research Square, 2023, ISSN 2693-5015
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.21203/rs.3.rs-3433207/v1

From isolated polyelectrolytes to star-like assemblies: The role of sequence heterogeneity on the statistical structure of the intrinsically disordered Neurofilament-low tail domain

Autorzy: Kravikass M, Koren G, Saleh OA, Beck R.
Opublikowane w: arXiv, 2023, ISSN 2331-8422
Wydawca: Cornell University

Continuum architecture dynamics of vesicle tethering in exocytosis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Marta Puig-Tintó, Sebastian Ortiz, Sasha Meek, Raffaele Coray, Altair C. Hernández, Anna Castellet, Eric Kramer, Laura I. Betancur, Philipp Hoess, Markus Mund, Mercè Izquierdo-Serra, Baldo Oliva, Alex de Marco, Jonas Ries, Daniel Castaño-Díez, Carlo Manzo, Oriol Gallego
Opublikowane w: BioRxiv, 2025, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.02.05.635468

DNA i-motif levels are overwhelmingly depleted in living human cells: insights from in-cell NMR. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Trantirek L, Viskova P, Istvankova E, Rynes J, Dzatko S, Loja T, Lenarcic Zivkovic M, Rigo R, El-Khoury R, Serano I, Damha M, Gonzalez C, Mergny JL, Foldynova-Trantirkova S.
Opublikowane w: Research Square, 2023, ISSN 2693-5015
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.21203/rs.3.rs-3734993/v1

Improvements on marker-free images alignment for electron tomography (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sorzano COS, De Isidro-Gomez F, Fernandez-Gimenez E, Herreros D, Marco S, Carazo JM, Messaoudi C.
Opublikowane w: BioRxiv, Numer May 24 2020, 2020, ISSN 0362-4331
Wydawca: New York Times Company
DOI: 10.1101/2020.05.22.110445

Multitarget Virtual Screening for Drug Repurposing in COVID19

Autorzy: CO Sorzano, E Crisman, JM Carazo, R leon
Opublikowane w: ChemRxiv, Numer July 17 2020, 2020, ISSN 2573-2293
Wydawca: American Chemical Society (ACS), Chinese Chemical Society, Chemical Society of Japan, German Chemical Society (GDCh) and the Royal Society of Chemistry

The BAF A12T mutation reduces BAF affinity to lamin A/C, preventing its recruitment to nuclear ruptures in Nestor Guillermo Progeria Syndrome cells. (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Janssen AFJ, Marcelot A, Breusegem SY, Legrand P, Zinn-Justin S, Larrieu D
Opublikowane w: bioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.02.25.481780

Site-Directed Spin Labeling with the Bis-Nitroxide AsymPol Enables Targeted DNP MAS NMR of RNA (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Rubin Dasgupta, Christian Steinmetzger, Ancy T. Wilson, Satyaki Chatterjee, Gunnar W. Reginsson, Snorri Th. Sigurdsson, Katja Petzold
Opublikowane w: ChemRXiv, 2025, ISSN 2573-2293
Wydawca: Cambridge University Press
DOI: 10.26434/chemrxiv-2025-1tkv0

Annulate Lamellae biogenesis is essential for nuclear pore function (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Izabela Sumara, Junyan Lin, Arantxa Agote-Arán, Yongrong Liao, Rafael Schoch, Paolo Ronchi, Victor Cochard, Rui Zhu, Charlotte Kleiss, Marc Ruff, Guillaume Chevreux, Yannick Schwab, Bruno Klaholz
Opublikowane w: Research Square, 2024, ISSN 2693-5015
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.21203/rs.3.rs-5104543/v1

Intramolecular Structural Heterogeneity altered by Long-range Contacts in an Intrinsically Disordered Protein (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Koren G, Meir S, Holschuh L, Mertens HDT, Ehm T, Yahalom N, Golombek A, Schwartz T, Svergun DI, Saleh OA, Dzubiella J, Beck R.
Opublikowane w: arXiv e-prints, 2022, ISSN 2331-8422
Wydawca: Cornell University
DOI: 10.48550/arxiv.2212.01894

Plasticity of the binding pocket in peptide transporters underpins 2 promiscuous substrate recognition (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Kotov V, Killer M, Jungnickel KEJ, Lei J, Finocchio G, Steinke J, Bartels K, Strauss J, Dupeux F, Humm A-S, Cornaciu I, Márquez JA, Pardon E, Steyaert J, Löw C.
Opublikowane w: bioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.02.14.528348

Production and Preparation of Isotopically Labeled Human Membrane Proteins in Pichia pastoris for Fast-MAS-NMR Analyses (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Barret L, Schubeis T, Kugler V, Guyot L, Pintacuda G, Wagner R.
Opublikowane w: Methods Mol Biol. 2022, Numer 2507, 2022, Strona(/y) 201-221, ISBN 978-1-0716-2367-1
Wydawca: Springer
DOI: 10.1007/978-1-0716-2368-8_11

Cryo-focused ion beam lamella preparation protocol for in situ Structural Biology (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jana Moravcová, Radka Dopitová, Matyáš Pinkas, Jiří Nováček
Opublikowane w: Methods in Molecular Biology, Numer Vol. 2305, Ch. 15, 2021
Wydawca: Springer
DOI: 10.1007/978-1-0716-1406-8

Cryo-Focused Ion Beam Lamella Preparation Protocol for in Situ Structural Biology (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Moravcova J, Dopitova R, Pinkas M, Novacek J
Opublikowane w: Methods. Methods Mol Biol. 2021; 2305, 2021, Strona(/y) 301-322, ISBN 978-1-0716-1405-1
Wydawca: Springer
DOI: 10.1007/978-1-0716-1406-8_15

Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sorzano COS, Jiménez-Moreno A, Maluenda D, Ramírez-Aportela E, Martínez M, Cuervo A, Melero R, Conesa JJ, Sánchez-García R, Strelak D, Filipovic J, Fernández-Giménez E, de Isidro-Gómez F, Herreros D, Conesa P, Del Caño L, Fonseca Y, de la Morena JJ, Macías JR, Losana P, Marabini R, Carazo JM.
Opublikowane w: Methods. Methods Mol Biol. 2021; 2305, 2021, Strona(/y) 257-289, ISBN 978-1-0716-1405-1
Wydawca: Springer
DOI: 10.1007/978-1-0716-1406-8_13

Cryogenic Preparations of Biological Specimens for Cryo-Electron Tomography (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: D’Imprima E, Fung HKH, Zagoriy I, Mahamid J
Opublikowane w: Cryo-Electron Tomography - Structural Biology in situ, 2024, Strona(/y) 85-114, ISBN 978-3-031-51171-4
Wydawca: Springer Cham
DOI: 10.1007/978-3-031-51171-4_3

Mixed-valence compounds as polarizing agents for Overhauser dynamic nuclear polarization in solids

Autorzy: Andrei Gurinov, Benedikt Sieland, Andrei Kuzhelev, Hossam Elgabarty, Thomas D. Kuhne, Thomas Prisner, Jan Paradies, Marc Baldus, Konstantin L. Ivanov, and Svetlana Pylaeva
Opublikowane w: Condensed Matter - arXiv.org, 2021
Wydawca: Cornell University

Combining scattering experiments and colloid theory to characterize charge effects in concentrated antibody solutions

Autorzy: Gulotta A, Polimeni M, Lenton S, Starr CG, Kingsbury JS, Stradner A, Zaccarelli E, Schurtenberger P.
Opublikowane w: arXiv, 2023, ISSN 2331-8422
Wydawca: arXiv

Structural analysis of human ex vivo amyloid fibrils from systemic AA amyloidosis

Autorzy: Banerjee S
Opublikowane w: 2023
Wydawca: Banerjee S

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Moja broszura 0 0