Projektbeschreibung
Transkriptionsfaktor-Isoformen in der Adipogenese
Das Fettgewebe ist der Schlüssel zur Stoffwechselregulation, und das Verständnis der Entwicklung der Adipozyten ist ein wichtiger Schritt zur Entwicklung wirksamer Behandlungs- und Interventionsstrategien für Stoffwechselerkrankungen. Die Adipogenese wird durch ein Genregulationsnetzwerk (GRN) aus sukzessiv aktivierten Transkriptionsfaktoren (TF) reguliert. Viele dieser Transkriptionsfaktoren existieren in unterschiedlichen Proteinformen, sogenannten Isoformen. Bei einigen Transkriptionsfaktoren hat sich erwiesen, dass ihre Isoformen unterschiedlich funktionieren. Ziel des EU-finanzierten Projekts FatTFIso ist zu untersuchen, inwieweit das adipogene Genregulationsnetzwerk durch TF-Isoformen moduliert wird. Die Erkenntnisse aus diesem Projekt werden unser Wissen über Transkriptionsmechanismen erweitern, welche die Adipogenese antreiben. Die Ergebnisse werden weitreichende Auswirkungen auf das Verständnis der Rolle der TF-Isoformen in der Genregulation haben und die Komplexität der genregulatorischen Mechanismen verdeutlichen, die der Zell- und Gewebespezifität zugrunde liegen.
Ziel
Metabolism-related disorders like obesity are on the rise worldwide, posing a major global disease burden. Fat tissue is a key site of metabolic regulation, and understanding how adipocytes develop is an important step in designing effective treatment or intervention strategies. This proposal aims to understand the gene regulatory network (GRN) underlying adipogenesis and to which extent this GRN is modulated by transcription factor (TF) isoforms. Adipogenesis is regulated by a network of successively activated TFs. Many of these TFs have multiple isoforms, a handful of which (e.g. PPARγ) are known to function divergently from their reference forms. Thus, this project will investigate the potentially key role of TF isoforms in shaping the adipogenic program and its robustness. In Objective 1, I will combine computational analysis with a novel microfluidic in vitro TF–DNA binding assay to characterize the DNA binding specificities of TF isoforms with the goal of identifying those that have the potential to rewire GRNs. In Objective 2, I will screen for TF isoforms that modulate the process of adipogenesis, using a novel droplet-based single-cell technology to assay how adipocyte differentiation changes in response to TF isoform overexpression. ChIP-seq and single-cell transcriptome profiling, combined with powerful computational analysis, will elucidate the molecular basis of these changes in relation to GRNs. Findings from this project will improve our understanding of transcriptional mechanisms in adipogenesis. Furthermore, results will have broad implications for the role of TF isoforms in gene regulation, highlighting the complexity of gene regulatory mechanisms that underlie cell and tissue specificity.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Schweiz