Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Characterizing the roles of transcription factor isoforms in rewiring gene regulatory networks during adipogenesis

Opis projektu

Rola izoform czynników transkrypcyjnych w adipogenezie

Tkanka tłuszczowa jest głównym miejscem, w którym odbywa się regulacja metaboliczna, a zrozumienie procesu rozwoju adipocytów jest ważnym krokiem w opracowywaniu skutecznych strategii leczenia i interwencji stosowanych w przypadku zaburzeń metabolicznych. Przebieg adipogenezy regulowany jest przez sieć regulatorową genu obejmującą kolejno aktywowane czynniki transkrypcyjne. Wiele z tych czynników istnieje w różnych formach białka, tzw. izoformach, a w przypadku niektórych z nich wykazano, że różnią się one od siebie pod względem funkcjonowania ich izoform. Celem finansowanego ze środków UE projektu FatTFIso jest zbadanie, w jakim stopniu sieć regulatorowa genu adipogenezy modulowana jest przez izoformy czynników transkrypcyjnych. Uzyskane w ramach tego projektu wnioski pogłębią nasze zrozumienie mechanizmów transkrypcyjnych napędzających proces adipogenezy. Wyniki projektu dostarczą istotnych informacji na temat roli izoform czynników transkrypcyjnych w regulacji genów, podkreślając złożoność mechanizmów regulacji genów, które leżą u podstaw specyficzności komórek i tkanek.

Cel

Metabolism-related disorders like obesity are on the rise worldwide, posing a major global disease burden. Fat tissue is a key site of metabolic regulation, and understanding how adipocytes develop is an important step in designing effective treatment or intervention strategies. This proposal aims to understand the gene regulatory network (GRN) underlying adipogenesis and to which extent this GRN is modulated by transcription factor (TF) isoforms. Adipogenesis is regulated by a network of successively activated TFs. Many of these TFs have multiple isoforms, a handful of which (e.g. PPARγ) are known to function divergently from their reference forms. Thus, this project will investigate the potentially key role of TF isoforms in shaping the adipogenic program and its robustness. In Objective 1, I will combine computational analysis with a novel microfluidic in vitro TF–DNA binding assay to characterize the DNA binding specificities of TF isoforms with the goal of identifying those that have the potential to rewire GRNs. In Objective 2, I will screen for TF isoforms that modulate the process of adipogenesis, using a novel droplet-based single-cell technology to assay how adipocyte differentiation changes in response to TF isoform overexpression. ChIP-seq and single-cell transcriptome profiling, combined with powerful computational analysis, will elucidate the molecular basis of these changes in relation to GRNs. Findings from this project will improve our understanding of transcriptional mechanisms in adipogenesis. Furthermore, results will have broad implications for the role of TF isoforms in gene regulation, highlighting the complexity of gene regulatory mechanisms that underlie cell and tissue specificity.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2019

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Wkład UE netto
€ 203 149,44
Adres
BATIMENT CE 3316 STATION 1
1015 Lausanne
Szwajcaria
Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Région lémanique Vaud
Rodzaj działalności
Higher or Secondary Education Establishments
Linki
Koszt całkowity
€ 203 149,44