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Characterizing the roles of transcription factor isoforms in rewiring gene regulatory networks during adipogenesis

Descrizione del progetto

Isoforme del fattore di trascrizione nell’adipogenesi

Il tessuto adiposo è un sito critico della regolazione metabolica, e comprendere in che modo si sviluppano gli adipociti è un passo importante nella progettazione del trattamento e delle strategie di intervento efficaci per i disturbi metabolici. L’adipogenesi viene regolata da una rete di regolazione genica (GRN, Gene Regulatory Network) dei fattori di trascrizione (FT) successivamente attivati. Molti di questi FT esistono in diverse forme proteiche, definite isoforme, e per alcuni FT è stato dimostrato che le relative isoforme agiscono in modo diverso l’una dall’altra. Il progetto FatTFIso, finanziato dall’UE, si propone di studiare fino a che punto la GRN adipogenica sia modulata dalle isoforme dell’FT. I risultati del progetto miglioreranno la nostra comprensione dei meccanismi trascrizionali che guidano l’adipogenesi. I risultati avranno ampie ripercussioni per il ruolo delle isoforme dell’FT nella regolazione genica, mettendo in evidenza la complessità dei meccanismi di regolazione genica alla base della specificità di cellule e tessuti.

Obiettivo

Metabolism-related disorders like obesity are on the rise worldwide, posing a major global disease burden. Fat tissue is a key site of metabolic regulation, and understanding how adipocytes develop is an important step in designing effective treatment or intervention strategies. This proposal aims to understand the gene regulatory network (GRN) underlying adipogenesis and to which extent this GRN is modulated by transcription factor (TF) isoforms. Adipogenesis is regulated by a network of successively activated TFs. Many of these TFs have multiple isoforms, a handful of which (e.g. PPARγ) are known to function divergently from their reference forms. Thus, this project will investigate the potentially key role of TF isoforms in shaping the adipogenic program and its robustness. In Objective 1, I will combine computational analysis with a novel microfluidic in vitro TF–DNA binding assay to characterize the DNA binding specificities of TF isoforms with the goal of identifying those that have the potential to rewire GRNs. In Objective 2, I will screen for TF isoforms that modulate the process of adipogenesis, using a novel droplet-based single-cell technology to assay how adipocyte differentiation changes in response to TF isoform overexpression. ChIP-seq and single-cell transcriptome profiling, combined with powerful computational analysis, will elucidate the molecular basis of these changes in relation to GRNs. Findings from this project will improve our understanding of transcriptional mechanisms in adipogenesis. Furthermore, results will have broad implications for the role of TF isoforms in gene regulation, highlighting the complexity of gene regulatory mechanisms that underlie cell and tissue specificity.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2019

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 203 149,44
Indirizzo
BATIMENT CE 3316 STATION 1
1015 LAUSANNE
Svizzera

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Regione
Schweiz/Suisse/Svizzera Région lémanique Vaud
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 203 149,44
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