Understanding and targeting the functional consequences of aneuploidy in cancer

Projektinformationen

CancerAneuploidy

ID Finanzhilfevereinbarung: 945674

DOI

10.3030/945674

EK-Unterschriftsdatum 2 Dezember 2020

Startdatum 1 Oktober 2021

Enddatum 30 September 2027

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 612 500,00

EU-Beitrag

€ 1 612 500,00

Koordiniert durch

TEL AVIV UNIVERSITY
Israel

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (20)

Integrating mutation, copy number, and gene expression data to identify driver genes of recurrent chromosome-arm losses

Autoren: Ron Saad, Ron Shamir, Uri Ben-David
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 44, 2026, Seite(n) 116455, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2025.116455

Feeder-free culture of human pluripotent stem cells drives MDM4-mediated gain of chromosome 1q

Autoren: Dylan Stavish, Christopher J. Price, Gabriele Gelezauskaite, Haneen Alsehli, Kimberly A. Leonhard, Seth M. Taapken, Erik M. McIntire, Owen Laing, Bethany M. James, Jack J. Riley, Johanna Zerbib, Duncan Baker, Amy L. Harding, Lydia H. Jestice, Thomas F. Eleveld, Ad J.M. Gillis, Sanne Hillenius, Leendert H.J. Looijenga, Paul J. Gokhale, Uri Ben-David, Tenneille E. Ludwig, Ivana Barbaric
Veröffentlicht in: Stem Cell Reports, Ausgabe 19, 2024, Seite(n) 1217-1232, ISSN 2213-6711
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stemcr.2024.06.003

Chromosome 7 Gain Compensates for Chromosome 10 Loss in Glioma

Autoren: Nishanth Ulhas Nair, Alejandro A. Schäffer, E. Michael Gertz, Kuoyuan Cheng, Johanna Zerbib, Avinash Das Sahu, Gil Leor, Eldad D. Shulman, Kenneth D. Aldape, Uri Ben-David, Eytan Ruppin
Veröffentlicht in: Cancer Research, Ausgabe 84, 2024, Seite(n) 3464-3477, ISSN 0008-5472
Herausgeber: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/0008-5472.can-24-1366

Aneuploidy as a driver of human cancer

Autoren: Eran Sdeor, Hajime Okada, Ron Saad, Tal Ben-Yishay, Uri Ben-David
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2024, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-024-01916-2

FBXW7 E3 ligase prevents centriole overduplication by degrading the Plk4 phosphorylated STIL-SAS6 cartwheel assembly

Autoren: Ushma Anand, Amit Bloomberg, Pradip Bhattacharjee, Swarnendu Mukhopadhyay, Binshad Badarudeen, Shivani Ramakrishnan, Uri Ben-David, Tapas K. Manna
Veröffentlicht in: Journal of Biological Chemistry, Ausgabe 302, 2026, Seite(n) 111104, ISSN 0021-9258
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2025.111104

CKAP5 stabilizes CENP-E at kinetochores by regulating microtubule-chromosome attachments

Autoren: R Bhagya Lakshmi; Pinaki Nayak; Linoy Raz; Apurba Sarkar; Akshay Saroha; Pratibha Kumari; Vishnu M Nair; Delvin P Kombarakkaran; S Sajana; Sanusha M G; Sarit S Agasti; Raja Paul; Uri Ben-David; Tapas K Manna
Veröffentlicht in: Crossref, Ausgabe 3, 2023, ISSN 1469-3178
Herausgeber: EMBO Press
DOI: 10.1038/s44319-024-00106-9

p53 inactivation drives breast cancer metastasis to the brain through SCD1 upregulation and increased fatty acid metabolism

Autoren: Kathrin Laue, Sabina Pozzi, Johanna Zerbib, Rebecca Bertolio, Yonatan Eliezer, Yael Cohen-Sharir, Tom Winkler, Manuel Caputo, Alessia A. Ricci, Lital Adler, Rami Khoury, Giuseppe Longobardi, Rachel Slutsky, Alicia I. Leikin-Frenkel, Shai Ovadia, Katharina Lange, Alessandra Rustighi, Silvano Piazza, Andrea Sacconi, Rayna Y. Magesh, Faith N. Keller, Jean Berthelet, Alexander Schäffer, Ron Saad, Sah
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 58, 2026, Seite(n) 116-131, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-025-02446-1

Increased RNA and Protein Degradation Is Required for Counteracting Transcriptional Burden and Proteotoxic Stress in Human Aneuploid Cells

Autoren: Marica Rosaria Ippolito, Johanna Zerbib, Yonatan Eliezer, Eli Reuveni, Sonia Viganò, Giuseppina De Feudis, Eldad D. Shulman, Anouk Savir Kadmon, Rachel Slutsky, Tiangen Chang, Emma M. Campagnolo, Silvia Taglietti, Simone Scorzoni, Sara Gianotti, Sara Martin, Julia Muenzner, Michael Mülleder, Nir Rozenblum, Carmela Rubolino, Tal Ben-Yishay, Kathrin Laue, Yael Cohen-Sharir, Ilaria Vigorito, France
Veröffentlicht in: Cancer Discovery, 2024, Seite(n) OF1-OF22, ISSN 2159-8274
Herausgeber: American Association for Cancer Research Inc.
DOI: 10.1158/2159-8290.cd-23-0309

Human aneuploid cells depend on the RAF/MEK/ERK pathway for overcoming increased DNA damage

Autoren: Johanna Zerbib, Marica Rosaria Ippolito, Yonatan Eliezer, Giuseppina De Feudis, Eli Reuveni, Anouk Savir Kadmon, Sara Martin, Sonia Viganò, Gil Leor, James Berstler, Julia Muenzner, Michael Mülleder, Emma M. Campagnolo, Eldad D. Shulman, Tiangen Chang, Carmela Rubolino, Kathrin Laue, Yael Cohen-Sharir, Simone Scorzoni, Silvia Taglietti, Alice Ratti, Chani Stossel, Talia Golan, Francesco Nicassio
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-52176-x

Cell and Nuclear Size Is Associated with Chromosomal Instability and Tumorigenicity in Cancer Cells That Undergo Whole Genome Doubling

Autoren: Mathew Bloomfield, Sydney M. Huth, Daniella S. McCausland, Ron Saad, Nazia Bano, Tran N. Chau, Megan L. Sweet, Nicolaas C. Baudoin, Andrew McCaffrey, Kai Fluet, Eva M. Schmelz, Uri Ben-David, Daniela Cimini
Veröffentlicht in: Cancer Research, Ausgabe 86, 2026, Seite(n) 2126-2142, ISSN 0008-5472
Herausgeber: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/0008-5472.can-24-3718

Evolutionary rescue by aneuploidy in tumors exposed to anticancer drugs

Autoren: Remus Stana, Uri Ben-David, Daniel B Weissman, Yoav Ram
Veröffentlicht in: GENETICS, Ausgabe 230, 2025, ISSN 1943-2631
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/genetics/iyaf098

DNA-based copy number analysis confirms genomic evolution of PDX models

Autoren: Anna C. H. Hoge, Michal Getz, Anat Zimmer, Minjeong Ko, Linoy Raz, Rameen Beroukhim, Todd R. Golub, Gavin Ha & Uri Ben-David
Veröffentlicht in: npj Precision Oncology, 2022, ISSN 2397-768X
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41698-022-00268-6

Short-term molecular consequences of chromosome mis-segregation for genome stability

Autoren: Lorenza Garribba; Giuseppina De Feudis; Valentino Martis; Martina Galli; Marie Dumont; Yonatan Eliezer; René Wardenaar; Marica Rosaria Ippolito; Divya Ramalingam Iyer; Andréa E. Tijhuis; Diana C. J. Spierings; Michael Schubert; Silvia Taglietti; Chiara Soriani; Simon Gemble; Renata Basto; Nick Rhind; Floris Foijer; Uri Ben-David; Daniele Fachinetti; Ylli Doksani; Stefano Santaguida
Veröffentlicht in: Nature Communications, Vol 14, Iss 1, Pp 1-17 (2023), Ausgabe 2, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37095-7

High CDC20 levels increase sensitivity of cancer cells to MPS1 inhibitors

Autoren: Siqi Zheng, Linoy Raz, Lin Zhou, Yael Cohen-Sharir, Ruifang Tian, Marica Rosaria Ippolito, Sara Gianotti, Ron Saad, Rene Wardenaar, Mathilde Broekhuis, Maria Suarez Peredo Rodriguez, Soraya Wobben, Anouk van den Brink, Petra Bakker, Stefano Santaguida, Floris Foijer, Uri Ben-David
Veröffentlicht in: EMBO Reports, Ausgabe 26, 2026, Seite(n) 1036-1061, ISSN 1469-3178
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44319-024-00363-8

The cGAS–STING, p38 MAPK, and p53 pathways link genome instability to accelerated cellular senescence in ATM-deficient murine lung fibroblasts

Autoren: Majd Haj, Yann Frey, Amit Levon, Avishai Maliah, Tal Ben-Yishay, Rachel Slutsky, Riham Smoom, Yehuda Tzfati, Uri Ben-David, Carmit Levy, Ran Elkon, Yael Ziv, Yosef Shiloh
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 122, 2025, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2419196122

Machine-learning analysis reveals an important role for negative selection in shaping cancer aneuploidy landscapes

Autoren: Juman Jubran, Rachel Slutsky, Nir Rozenblum, Lior Rokach, Uri Ben‑David and Esti Yeger‑Lotem
Veröffentlicht in: Genome Biology, 2024, ISSN 1474-7596
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-024-03225-7

A compendium of Amplification-Related Gain Of Sensitivity genes in human cancer

Autoren: Veronica Rendo, Michael Schubert, Nicholas Khuu, Maria F. Suarez Peredo Rodriguez, Declan Whyte, Xiao Ling, Anouk van den Brink, Kaimeng Huang, Michelle Swift, Yizhou He, Johanna Zerbib, Ross Smith, Jonne Raaijmakers, Pratiti Bandopadhayay, Lillian M. Guenther, Justin H. Hwang, Amanda Iniguez, Susan Moody, Ji-Heui Seo, Elizabeth H. Stover, Levi Garraway, William C. Hahn, Kimberly Stegmaier, René
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-56301-2

Whole-Genome Duplication Shapes the Aneuploidy Landscape of Human Cancers

Autoren: Kavya Prasad; Mathew Bloomfield ; Hagai Levi ; Kristina Keuper ; Sara V. Bernhard; Nicolaas C. Baudoin; Gil Leor ; Yonatan Eliezer; Maybelline Giam; Cheng Kit Wong; Giulia Rancati; Zuzana Storchová ; Daniela Cimini ; Uri Ben-David
Veröffentlicht in: Cancer Research, 2022, ISSN 1538-7445
Herausgeber: AACR
DOI: 10.1158/0008-5472.can-21-2065

A p62-dependent rheostat dictates micronuclei catastrophe and chromosome rearrangements

Autoren: Sara Martin, Simone Scorzoni, Sara Cordone, Alice Mazzagatti, Galina V. Beznoussenko, Amanda L. Gunn, Melody Di Bona, Yonatan Eliezer, Gil Leor, Tal Ben-Yishay, Alessia Loffreda, Valeria Cancila, Maria Chiara Rainone, Marica Rosaria Ippolito, Valentino Martis, Fabio Bedin, Massimiliano Garrè, Laura Pontano Vaites, Paolo Vasapolli, Simona Polo, Dario Parazzoli, Claudio Tripodo, Alexander A. Mirono
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 385, 2024, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adj7446

Frequent aneuploidy in primary human T cells after CRISPR-Cas9 cleavage

Autoren: Alessio David Nahmad, Eli Reuveni , Ella Goldschmidt , Tamar Tenne, Meytal Liberman, Miriam Horovitz-Fried, Rami Khosravi, Hila Kobo, Eyal Reinstein, Asaf Madi, Uri Ben-David, Adi Barzel
Veröffentlicht in: nature biotechnology, 2022, ISSN 1546-1696
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41587-022-01377-0