Projektbeschreibung
Die Rolle der Mikroumgebung von Melanomen bei der Antwort auf die Immuntherapie
Tumore sind räumlich organisierte Anordnungen bestimmter Zelltypen mit Phänotypen, die durch die Koexpression mehrerer Proteine definiert sind. Die immunologische Tumormikroumgebung spielt bei den Wechselwirkungen zwischen Immunzellen und Stromazellen eine zentrale Rolle und bestimmt so über den Krankheitsfortschritt und das Ansprechen auf die Therapie. Vor kurzem wurde eine Plattform zur Multiplex-Ionenstrahl-Bildgebung vorgestellt, die es ermöglicht, 40 Proteine mit intakten Gewebeabschnitten gleichzeitig in subzellulärer Auflösung abzubilden. Das EU-finanzierte Projekt ImageMelanoma schlägt vor, diese Plattform nun zu nutzen, um die immunologische Tumormikroumgebung anhand von mehreren Dutzend Proben zu erforschen und ihre Funktion beim Ansprechen auf unterschiedliche Immuntherapien zu bestimmen. In seiner Studie wird das Projektteam Melanomprofile erstellen, um die Mechanismen der Organisation von immunologischen Tumormikroumgebungen zu entschlüsseln, neue experimentelle Instrumente für die Nachverfolgung und das Barcoding tausender Tumorzellen entwickeln und auf maschinellem Lernen beruhende Algorithmen zur Datenanalyse einsetzen.
Ziel
Immunotherapies targeting immune regulators are revolutionizing cancer treatment, most prominently in melanoma, but only for a subset of patients. While it is known that the immune tumor microenvironment (iTME) plays a vital role in this process, there is limited understanding on how distinct tumor, immune and stroma cells interact as a system to collectively define progression and response to treatment, and there is no biomarker to predict patient response. Tumors are spatially organized ecosystems that are comprised of distinct cell types, each of which can assume a variety of phenotypes defined by coexpression of multiple proteins. To underscore this complexity, and move beyond single cells to multicellular interactions, it is essential to interrogate cellular expression patterns within their native context in the tissue.
We have recently pioneered MIBI-TOF (Multiplexed Ion Beam Imaging by Time of Flight), a novel platform that enables simultaneous imaging of forty proteins within intact tissue sections at subcellular resolution. We propose to (1) Use MIBI-TOF to chart the iTME in dozens of clinical samples from melanoma patients and delineate its function in response to different immunotherapies. (2) Profile murine melanoma tumors to elucidate genetic and temporal mechanisms that drive iTME organization in vivo. (3) Develop new experimental tools for tracing and barcoding thousands of cells to decouple the effects of tumor genetics and the immune microenvironment on tumor organization and clonal dynamics. (4) Develop machine-learning-based algorithms to analyze this novel data and facilitate accessibility of the scientific community to high-dimensional imaging to study human malignancies.
This proposal applies state-of-the-art imaging technology and computation to unravel design principles of the iTME in melanoma, with a grand goal to reveal basic principles in tumor immunology and improve treatment and diagnostics.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Onkologie Hautkrebs Melanom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Ökologie Ökosystem
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Immunologie Immuntherapie
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
ERC-STG - Starting Grant
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2020-STG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
7610001 Rehovot
Israel
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.