Decoding the organization and regeneration of locomotor neuronal networks in tetrapods by integrating genomics, systems neuroscience, numerical modeling, and biorobotics

Projektinformationen

SALAMANDRA

ID Finanzhilfevereinbarung: 951477

DOI

10.3030/951477

EK-Unterschriftsdatum 19 Februar 2021

Startdatum 1 September 2021

Enddatum 31 August 2027

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 9 559 650,00

EU-Beitrag

€ 9 559 650,00

Koordiniert durch

ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE
Switzerland

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Conference proceedings (5)

Bio-inspired Controllers Facilitate Sim-to-Real Transfer

Autoren: Gupta, Astha; Melo, Kamilo; Arreguit, Jonathan; Paez, Laura; Estrada, Matthew; Ijspeert, Auke
Veröffentlicht in: Proceedings of the 11th International Symposium on Adaptive Motion of Animals and Machines, Ausgabe 5, 2023
Herausgeber: University of Osaka Institutional Knowledge Archive

Bio-inspired Controllers Facilitate Sim-to-Real Transfer

Autoren: Gupta, Astha; Melo, Kamilo; Arreguit, Jonathan; Paez, Laura; Estrada, Matthew; Ijspeert, Auke
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2023
Herausgeber: Adaptive Motion of Animals and Machines Organizing Committee
DOI: 10.18910/92331

Coupling spiking neural networks and mechanical simulations to investigate walking and swimming in salamanders

Autoren: Pazzaglia, Alessandro; Bicanski, Andrej; Arreguit, Jonathan; Ferrario, Andrea; Ryczko, Dimitri; Ijspeert, Auke
Veröffentlicht in: Proceedings of the 11th International Symposium on Adaptive Motion of Animals and Machines, Ausgabe 2, 2023
Herausgeber: University of Osaka Institutional Knowledge Archive
DOI: 10.18910/92332

An integrated neuromechanical model of the mouse to study neural control of locomotion

Autoren: Ramalingasetty, Shravan Tata; Markin, Sergey N.; Lockhart, Andrew B.; Arreguit, Jonathan; Shevtsova, Natalia A.; Ijspeert, Auke J.; Rybak, Ilya A.; Danner, Simon M.
Veröffentlicht in: Proceedings of 11th International Symposium on Adaptive Motion in Animals and Machines Symposium, Ausgabe 5, 2023
Herausgeber: University of Osaka Institutional Knowledge Archive

An integrated neuromechanical model of the mouse to study neural control of locomotion

Autoren: Ramalingasetty, Shravan Tata; Markin, Sergey N.; Lockhart, Andrew B.; Arreguit, Jonathan; Shevtsova, Natalia A.; Ijspeert, Auke J.; Rybak, Ilya A.; Danner, Simon M.
Veröffentlicht in: Ausgabe 3, 2023
Herausgeber: Adaptive Motion of Animals and Machines Organizing Committee
DOI: 10.18910/92326

Peer reviewed articles (17)

Energy efficiency and neural control of continuous versus intermittent swimming in a fishlike robot

Autoren: Xiangxiao Liu, François A. Longchamp, Luca Zunino, Louis Gevers, Lisa R. Schneider, Selina I. Bothner, André Guignard, Alessandro Crespi, Guillaume Bellegarda, Alexandre Bernardino, Eva A. Naumann, Auke J. Ijspeert
Veröffentlicht in: Science Robotics, Ausgabe 11, 2026, ISSN 2470-9476
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/scirobotics.adw7868

Macrophages modulate fibrosis during newt lens regeneration

Autoren: Georgios Tsissios, Anthony Sallese, J. Raul Perez-Estrada, Jared A. Tangeman, Weihao Chen, Byran Smucker, Sophia C. Ratvasky, Erika Grajales-Esquivel, Arielle Martinez, Kimberly J. Visser, Alberto Joven Araus, Hui Wang, András Simon, Maximina H. Yun, Katia Del Rio-Tsonis
Veröffentlicht in: Stem Cell Research & Therapy, Ausgabe 15, 2024, ISSN 1757-6512
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13287-024-03740-1

Dopamine-sensitive neurons in the mesencephalic locomotor region control locomotion initiation, stop, and turns

Autoren: Andrea Juárez Tello, Cornelis Immanuel van der Zouwen, Léonie Dejas, Juan Duque-Yate, Joël Boutin, Katherine Medina-Ortiz, Jacinthlyn Sylvia Suresh, Jordan Swiegers, Philippe Sarret, Dimitri Ryczko
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 43, 2024, Seite(n) 114187, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2024.114187

Using deep reinforcement learning to investigate stretch feedback during swimming of the lamprey

Autoren: Oliver Hausdörfer, Astha Gupta, Auke J Ijspeert, Daniel Renjewski
Veröffentlicht in: Bioinspiration & Biomimetics, Ausgabe 20, 2025, Seite(n) 026024, ISSN 1748-3182
Herausgeber: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1748-3190/adb8b1

Multisensory feedback makes swimming circuits robust against spinal transection and enables terrestrial crawling in elongate fish

Autoren: Kotaro Yasui, Astha Gupta, Qiyuan Fu, Shura Suzuki, Jeffrey Hainer, Laura Paez, Keegan Lutek, Jonathan Arreguit, Takeshi Kano, Emily M. Standen, Auke J. Ijspeert, Akio Ishiguro
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 122, 2025, Seite(n) 1-12, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2422248122

The Mesencephalic Locomotor Region: Multiple Cell Types, Multiple Behavioral Roles, and Multiple Implications for Disease

Autoren: Dimitri Ryczko
Veröffentlicht in: The Neuroscientist, Ausgabe epub ahead of print, 2022, Seite(n) epub ahead of print, ISSN 1073-8584
Herausgeber: Sage Science Press
DOI: 10.1177/10738584221139136

Balancing central control and sensory feedback produces adaptable and robust locomotor patterns in a spiking, neuromechanical model of the salamander spinal cord

Autoren: Alessandro Pazzaglia, Andrej Bicanski, Andrea Ferrario, Jonathan Arreguit, Dimitri Ryczko, Auke Ijspeert
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 21, 2025, Seite(n) e1012101, ISSN 1553-7358
Herausgeber: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1012101

FARMS: Framework for Animal and Robot Modeling and Simulation

Autoren: Arreguit, Jonathan; Ramalingasetty, Shravan; Ijspeert, Auke
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2023.09.25.559130

Chromosome-scale genome assembly reveals how repeat elements shape non-coding RNA landscapes active during newt limb regeneration

Autoren: Thomas Brown, Ketan Mishra, Ahmed Elewa, Svetlana Iarovenko, Elaiyaraja Subramanian, Alberto Joven Araus, Andreas Petzold, Bastian Fromm, Marc R. Friedländer, Lennart Rikk, Miyuki Suzuki, Ken-ichi T. Suzuki, Toshinori Hayashi, Atsushi Toyoda, Catarina R. Oliveira, Ekaterina Osipova, Nicholas D. Leigh, Maximina H. Yun, András Simon
Veröffentlicht in: Cell Genomics, Ausgabe 5, 2025, Seite(n) 100761, ISSN 2666-979X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.xgen.2025.100761

Cell-type specific sensory and motor activity in the cuneiform nucleus and pedunculopontine nucleus in mice

Autoren: Cornelis Immanuel van der Zouwen, Andrea Juárez Tello, Jacinthlyn Sylvia Suresh, Juan Duque-Yate, Ted Hsu, Vaibhav Konanur, Joël Boutin, Mitchell F. Roitman, Dimitri Ryczko
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-025-05572-2

Artificial embodied circuits uncover neural architectures of vertebrate visuomotor behaviors

Autoren: Xiangxiao Liu, Matthew D. Loring, Luca Zunino, Kaitlyn E. Fouke, François A. Longchamp, Alexandre Bernardino, Auke J. Ijspeert, Eva A. Naumann
Veröffentlicht in: Science Robotics, Ausgabe 10, 2025, ISSN 2470-9476
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/scirobotics.adv4408

From retina to motoneurons: A substrate for visuomotor transformation in salamanders

Autoren: Aurélie Flaive, Dimitri Ryczko
Veröffentlicht in: Journal of Comparative Neurology, Ausgabe 530(14), 2022, Seite(n) 2518-2536, ISSN 0021-9967
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/cne.25348

Cell-type profiling in salamanders identifies innovations in vertebrate forebrain evolution

Autoren: Jamie Woych, Alonso Ortega Gurrola, Astrid Deryckere , Eliza C. B. Jaeger, Elias Gumnit, Gianluca Merello, Jiacheng Gu, Alberto Joven Araus, Nicholas D. Leigh, Maximina Yun, András Simon, Maria Antonietta Tosches
Veröffentlicht in: Science, 2022, ISSN 1095-9203
Herausgeber: AAAS
DOI: 10.1126/science.abp9186

Integration of feedforward and feedback control in the neuromechanics of vertebrate locomotion: a review of experimental, simulation and robotic studies

Autoren: Ijspeert, Auke; Daley, Monica
Veröffentlicht in: Journal of Experimental Biology, 2023, ISSN 0022-0949
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jeb.245784

Locomotor pattern generation and descending control: a historical perspective

Autoren: Réjean Dubuc; Jean-Marie Cabelguen; Dimitri Ryczko
Veröffentlicht in: Journal of Neurophysiology, Ausgabe 1, 2023, ISSN 0022-3077
Herausgeber: American Physiological Society
DOI: 10.1152/jn.00204.2023

Understanding the microenvironment and how this controls cell fate

Autoren: Elaine Fuchs, Erik Sahai, Ashani T. Weeraratna, Benjamin Deneen, Carmen Chak-Lui Wong, András Simon
Veröffentlicht in: Developmental Cell, Ausgabe 58, 2023, Seite(n) 2819-2821, ISSN 1534-5807
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2023.11.025

Investigating the effect of morphology on the terrestrial gaits of amphibious fish using a reconfigurable robot

Autoren: Louis Gevers, Astha Gupta, Laura Paez, Qiyuan Fu, Emily Standen, Auke Ijspeert
Veröffentlicht in: Bioinspiration & Biomimetics, Ausgabe 20, 2025, Seite(n) 046002, ISSN 1748-3182
Herausgeber: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1748-3190/addc27

Non-peer reviewed articles (1)

Sequencing and chromosome-scale assembly of the giant Pleurodeles waltl genome

Autoren: Thomas Brown, Ahmed Elewa, Svetlana Iarovenko, Elaiyaraja Subramanian, Alberto Joven Araus, Andreas Petzold, Miyuki Suzuki, Ken-ichi Suzuki, Toshinori Hayashi, Atsushi Toyoda, Catarina Oliveira, Ekaterina Osipova, Nicholas Leigh, Andras Simon, Maximina Yun
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.10.19.512763