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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Allostery in Drug Discovery

Leistungen

Veröffentlichungen

Functional modulation of PTH1R activation and signalling by RAMP2

Autoren: Nemec K, Schihada H, Kleinau G, Zabel U, Grushevskyi OE, Scheerer P, Lohse MJ, Maiellaro I.
Veröffentlicht in: PNAS, Ausgabe 10916490, 2022, ISSN 1091-6490
Herausgeber: United States National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2122037119

Alchemical Free Energy Calculations on Membrane-Associated Proteins

Autoren: Michail Papadourakis, Hryhory Sinenka, Pierre Matricon, Jérôme Hénin, Grace Brannigan, Laura Pérez-Benito, Vineet Pande, Herman van Vlijmen, Chris de Graaf, Francesca Deflorian, Gary Tresadern, Marco Cecchini, Zoe Cournia
Veröffentlicht in: Journal of Chemical Theory and Computation, Ausgabe Volume 19; Ausgabe 21, 2023, Seite(n) 7437–7458, ISSN 1549-9618
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jctc.3c00365

Machine learning approaches in predicting allosteric sites

Autoren: Francho Nerín-Fonz, Zoe Cournia
Veröffentlicht in: Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe Volume 85, 2024, Seite(n) 102774, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2024.102774

Is the Neuropeptide PEN a Ligand of GPR83?

Autoren: Yvonne Giesecke, Vahid Asimi, Valentina Stulberg, Gunnar Kleinau, Patrick Scheerer, Beate Koksch, Carsten Grötzinger
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe Volume 24; Ausgabe 20, 2023, Seite(n) 15117, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms242015117

Intramolecular activity regulation of adhesion GPCRs in light of recent structural and evolutionary information

Autoren: Gunnar Kleinau, Amal Hassan Ali, Franziska Wiechert, Michal Szczepek, Andrea Schmidt, Christian M.T. Spahn, Ines Liebscher, Torsten Schöneberg, Patrick Scheerer
Veröffentlicht in: Pharmacological Research, Ausgabe Volume 197, 2023, Seite(n) 106971, ISSN 1043-6618
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.phrs.2023.106971

SH2db, an information system for the SH2 domain

Autoren: Dávid Bajusz, Gáspár Pándy-Szekeres, Ágnes Takács, Elvin D de Araujo, György M Keserű
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe Volume 51; Ausgabe W1, 2023, Seite(n) W542–W552, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad420

Evaluation of Pharmacological Rescue of Melanocortin-4 Receptor Nonsense Mutations by Aminoglycoside

Autoren: Höpfner F, Paisdzior S, Reininghaus N, Sohail I, Scheerer P, Annibale P, Biebermann H, Kühnen P.
Veröffentlicht in: Life, 2022, ISSN 2075-1729
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/life12111793

Structural Basis for Highly Selective Class II Alpha Phosphoinositide-3-Kinase Inhibition

Autoren: Murat Kücükdisli, Hassen Bel-Abed, Davide Cirillo, Wen-Ting Lo, Nina-Louisa Efrém, André Horatscheck, Liudmila Perepelittchenko, Polina Prokofeva, Theresa A. L. Ehret, Silke Radetzki, Martin Neuenschwander, Edgar Specker, Guillaume Médard, Susanne Müller, Stephanie Wilhelm, Bernhard Kuster, Jens Peter von Kries, Volker Haucke, Marc Nazaré
Veröffentlicht in: Journal of Medicinal Chemistry, Ausgabe Volume 66; Ausgabe 20, 2023, Seite(n) 14278-14302, ISSN 0022-2623
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.3c01319

Structure of the actively translating plant 80S ribosome at 2.2 Å resolution

Autoren: Julia Smirnova, Justus Loerke, Gunnar Kleinau, Andrea Schmidt, Jörg Bürger, Etienne H. Meyer, Thorsten Mielke, Patrick Scheerer, Ralph Bock, Christian M. T. Spahn, Reimo Zoschke
Veröffentlicht in: Nature Plants, Ausgabe Volume 9, 2023, Seite(n) 987–1000, ISSN 2055-0278
Herausgeber: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41477-023-01407-y

Molecular Effects of Auto-Antibodies on Angiotensin II Type 1 Receptor Signaling and Cell Proliferation

Autoren: Aurélie Philippe, Gunnar Kleinau, Jason Jannis Gruner, Sumin Wu, Daniel Postpieszala, David Speck, Harald Heidecke, Simon J. Dowell, Gabriela Riemekasten, Peter W. Hildebrand, Julian Kamhieh-Milz, Rusan Catar, Michal Szczepek, Duska Dragun, Patrick Scheerer
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe Volume 23; Ausgabe 7, 2022, Seite(n) 3984, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms23073984

Evolutionary analyses reveal immune cell receptor GPR84 as a conserved receptor for bacteria-derived molecules

Autoren: Schulze AS, Kleinau G, Krakowsky R, Rochmann D, Das R, Worth CL, Krumbholz P, Scheerer P, Stäubert C
Veröffentlicht in: iScience, Ausgabe 25890042, 2022, ISSN 2589-0042
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.isci.2022.105087

Glycomimetics for the inhibition and modulation of lectins

Autoren: Steffen Leusmann, Petra Ménová, Elena Shanin, Alexander Titz, Christoph Rademacher
Veröffentlicht in: Chemical Society Reviews, Ausgabe Volume 52, 2023, Seite(n) 3663-3740, ISSN 0306-0012
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2cs00954d

AI-based identification of therapeutic agents targeting GPCRs: introducing ligand type classifiers and systems biology

Autoren: Jonas Goßen, Rui Pedro Ribeiro, Dirk Bier, Bernd Neumaier, Paolo Carloni, Alejandro Giorgetti, Giulia Rossetti
Veröffentlicht in: Chemical Science, Ausgabe Volume 14, 2023, Seite(n) 8651-8661, ISSN 2041-6520
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3sc02352d

Secondary sites of the C-type lectin-like fold

Autoren: Jonathan Lefèbre, Torben Falk, Yunzhan Ning, Christoph Rademacher
Veröffentlicht in: Chemistry: A European Journal, Ausgabe Volume 30; Ausgabe 30, 2024, Seite(n) e202400660, ISSN 0947-6539
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202400660

A Setmelanotide-like Effect at MC4R Is Achieved by MC4R Dimer Separation

Autoren: Reininghaus N, Paisdzior S, Höpfner F, Jyrch S, Cetindag C, Scheerer P, Kühnen P, Biebermann H
Veröffentlicht in: Biomolecules, Ausgabe 2218273X, 2022, ISSN 2218-273X
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/biom12081119

Identification of the Allosteric Binding Site for Thiazolopyrimidine on the C-Type Lectin Langerin

Autoren: Hengxi Zhang, Carlos Modenutti, Yelha Phani Kumar Nekkanti, Maxime Denis, Iris A. Bermejo, Jonathan Lefèbre, Kateryna Che, Dongyoon Kim, Marten Kagelmacher, Dennis Kurzbach, Marc Nazaré, Christoph Rademacher
Veröffentlicht in: ACS Chemical Biology, Ausgabe Volume 17; Ausgabe 10, 2022, Seite(n) 2728–2733, ISSN 1554-8929
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.2c00626

The orchestrated signaling by PI3Kα and PTEN at the membrane interface

Autoren: Danai Maria Kotzampasi; Kyriaki Premeti; Alexandra Papafotika; Vasiliki Syropoulou; Savvas Christoforidis; Zoe Cournia; George Leondaritis
Veröffentlicht in: Computational and Structural Biotechnology Journal, Ausgabe 20, 2022, Seite(n) 5607-5621, ISSN 2001-0370
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2022.10.007

ChemFlow─From 2D Chemical Libraries to Protein–Ligand Binding Free Energies

Autoren: Diego E. Barreto Gomes, Katia Galentino, Marion Sisquellas, Luca Monari, Cédric Bouysset, and Marco Cecchini
Veröffentlicht in: Journal of Chemical Information and Modeling, 2023, ISSN 1549-960X
Herausgeber: ACS Publications
DOI: 10.1021/acs.jcim.2c00919

Angiotensin and Endothelin Receptor Structures With Implications for Signaling Regulation and Pharmacological Targeting

Autoren: Speck D, Kleinau G, Szczepek M, Kwiatkowski D, Catar R, Philippe A, Scheerer P
Veröffentlicht in: Frontiers in Endocrinology, Ausgabe 16642392, 2022, ISSN 1664-2392
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fendo.2022.880002

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