OrganVision: Technology for real-time visualizing and modelling of fundamental process in living organoids towards new insights into organ-specific health, disease, and recovery

SAM for Robust Mitochondria Instance Segmentation in Fluorescence Microscopy

Autoren: Jadhav, S., Prasad, D. K., & Agarwal, K.
Veröffentlicht in: Proceedings of the IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, 2026
Herausgeber: IEEE

Faster and deeper laser materials processing with ultrasound

Autoren: Marti Duocastella
Veröffentlicht in: The 9th International Congress on Laser Advanced Materials Processing, LAMP 2025, 2025
Herausgeber: LAMP

Engineered heart tissue with a pharmacological off-switch as a tool to study theinfluence of cardiac work on cardiomyocyte maturation

Autoren: Rajiven Srikantharajah, Tim Stüdemann, Christoph Manthey, Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

Forward modeling of mesoscopic imaging with radiative transfer equation

Autoren: Y. Qin, Y. Zhong, and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy, 2025
Herausgeber: Focus on Microscopy

Transplanted iPSC-derived cardiomyocytes actively contribute to left ventricular function

Autoren: Tim Stüdemann, Judith Rössinger, Christoph Manthey, Birgit Geertz, Rajiven Srikantharajah, Constantin von Bibra, Aya Shibamiya, Maria Köhne, Antonius Wiehler, J. Simon Wiegert, Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

Adaption of Subspace Based Optimization Method for Dark Field Microscopy Data

Autoren: Yingying Qin, Ankit Butola, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2024 IEEE International Symposium on Antennas and Propagation and INC/USNC‐URSI Radio Science Meeting (AP-S/INC-USNC-URSI), 2024, Seite(n) 927-928
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ap-s/inc-usnc-ursi52054.2024.10685990

Cardiac Repair Mechanisms - Insights from Opto- and Chemogenetic Approaches

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: ICGEB, Seminar Series, 2025
Herausgeber: ICGEB

THE TRANSLATIONAL PATH TO HEART REGENERATION: GENETIC APPROACHES

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: CNIC Regeneration Symposium

Development of multimodal Rayleigh light-sheet and Frequency-encoded Microscopy for label-free chemical imaging of highly dynamic biological systems

Autoren: D. Bhattacharya, A. Courtier, A. Rowlings, S. Lane, Laura Rodríguez, B. Creith, M. Duocastella, S. Mahajan
Veröffentlicht in: 2025, 2025
Herausgeber: Focus on Microscopy

Practical challenges in inverse scattering for RI reconstruction with label-free coherent microscopy

Autoren: Yingying Qin
Veröffentlicht in: Photonics & Electromagnetics Research Symposium (PIERS 2026), 2026
Herausgeber: PIERS

The design space of RI reconstruction for label-free optical microscopy

Autoren: Y. Huang, Y. Qin, Y. Zhong and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Engineered heart tissue and optogenetics – a powerful and versatile combination

Autoren: Karl-Felix Müller, Bangfen Pan, Julius Hansen, Julia Krause, Grit Höppner, Tim Stüdemann, Ingke Braren, Florian Weinberger, Arne Hansen, Christine E. Gee, Torsten Christ, Thomas Eschenhagen, Justus Stenzig
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

Artificial intelligence solution for microscopy and nanoscopy

Autoren: Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: CEDAS Conference, Ausgabe No abstracts was asked., 2021
Herausgeber: University of Bergen

Haphazard Inputs as Images in Online Learning

Autoren: Rohit Agarwal, Aryan Dessai, Arif Ahmed Sekh, Krishna Agarwal, Alexander Horsch, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: 2025 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN), 2025, Seite(n) 1-9
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ijcnn64981.2025.11228356

3D refractive index imaging from coherent label-free microscopy: inverse scattering reconstruction and the influence of illumination modes

Autoren: Yingying Qin, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Quantitative Phase Imaging XII, 2026, Seite(n) 44
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.3079110

Tissue Engineering und Stammzellen am Herz

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Annual meeting German Transplantation Society, 2022
Herausgeber: Annual meeting German Transplantation Society

Computational PSF Estimation Enables Aberration-Free Deconvolution

Autoren: F. Niknam, K. Agarwal
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2025, 2025
Herausgeber: Focus on Microscopy

Ultrasound-enabled light focusing for enhanced laser materials processing

Autoren: Marti Duocastella
Veröffentlicht in: COLA 2024, 17th International Conference on Laser Ablation, 2024
Herausgeber: MITOS S.A.

Biomimetic hydrogel topology facilitates cell plasticity via actin remodeling to modulate cell motility: A multimodal optical imaging-based evaluation

Autoren: Ghosh, B. and Agarwal
Veröffentlicht in: TERMIS 2025, 2025
Herausgeber: TERMIS

Computational Microscopy

Autoren: Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT

Blind reconstruction of challenging raw data outperforms commercial 3DSIM

Autoren: I.S. Opstad, S. Acuña, S. Ströhl, F. Ströhl, B.S. Ahluwalia, K. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Monitoring mitochondria turnover and transfer in cardiac cells

Autoren: Åsa B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT

Laser additive fabrication of tailored micro-optics

Autoren: Marti Duocastella, Ernest Martí-Jerez, Salvatore Surdo
Veröffentlicht in: Proceedings Volume PC11989, Laser-based Micro- and Nanoprocessing XVI, 2022, Seite(n) The submissions are abstract only and open access. The videos of talks are on demand.
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.2608835

MUSICAL – a versatile super-resolution microscopy solution for gentle imaging of physical characteristics of biological samples

Autoren: Sebastian Acuña and Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: 4th International Conference On Optics, Photonics, And Lasers (OPL-2023)

Illumination Mode Effects in Three-dimensional Inverse Scattering for Label-free Optical Imaging

Autoren: Y. Qin, Y. Zhong and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Photonics & Electromagnetics Research Symposium (PIERS 2026), 2026
Herausgeber: PIERS

Reconstruction of Objects at Cell Scale from Microscope Images with Inverse Scattering Algorithm

Autoren: Yingying Qin, Yu Zhong, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2025 International Conference on Electromagnetics in Advanced Applications (ICEAA), 2025, Seite(n) 0314-0314
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/iceaa65662.2025.11305969

How optical microscopes can shape the future of nanoscience

Autoren: Marti Duocastella
Veröffentlicht in: Capita Selecta 2025-2026, 2026
Herausgeber: KU Lueven

NorViVQA: Visual Question Answering for Visually Impaired in Norwegian Language

Autoren: Pal, R., Kar, S., & Prasad, D. K.
Veröffentlicht in: Proceedings of the Symposium of the Norwegian AI Society 2025, 2025
Herausgeber: Norwegian AI Society

Adaptation and performance of well-known non-linear inverse solvers in optical microscopy

Autoren: Yingying Qin, Ankit Butola, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2024 IEEE International Symposium on Antennas and Propagation and INC/USNC‐URSI Radio Science Meeting (AP-S/INC-USNC-URSI), 2024, Seite(n) 1147-1148
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ap-s/inc-usnc-ursi52054.2024.10687253

MUSICAL: a family of computational techniques for fluorescence nanoscopy

Autoren: Sebastian Acuña and Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2023, 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

3D refractive index reconstruction from phaseless coherent label-free imaging

Autoren: Y. Qin, A. Butola, Y. Zhong, and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2025, 2025
Herausgeber: Focus on Microscopy

Forward and Inverse Modeling of Mesoscopic Optical Microscopy Using the Radiative Transfer Equation

Autoren: Y. Qin, K. Agarwal and Y. Zhong
Veröffentlicht in: Photonics & Electromagnetics Research Symposium (PIERS 2026), 2026
Herausgeber: PIERS

Computational Adaptive Optics for Thick Tissue Microscopy via Linear Bayesian Modeling of Anisotropic Scattering

Autoren: F. Niknam, K. Agarwal
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2026, 2026
Herausgeber: Focus on Microscopy

Shape based forward solver for multi-nested body in label-free microscopy

Autoren: Y. Huang, Y. Qin and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy, 2025
Herausgeber: Focus on Microscopy

Fast and High-Fidelity Deconvolution Enabled by Modified Richardson-Lucy Algorithm

Autoren: F. Niknam, K. Agarwal
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2025, 2025
Herausgeber: Focus on Microscopy

Live measurement of cancer cell motility and plasticity by label-free imaging of intracellular actin dynamics using gradient light interference microscopy

Autoren: Ghosh, B. and Agarwal
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2025, 2025
Herausgeber: Focus on Microscopy

MUSI-tAF: autofluorescence-based super-resolution of collagen fibrils in fixed tissues for density estimation

Autoren: B. Ghosh, S. Acuña, K. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Pluripotent stem cell-based heart repair

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: TRON, Translational Oncology, curATalk Seminar Series, 2024
Herausgeber: TRON

Preliminary Test Study on RI Reconstruction Performance with Label-free Microscope Data by Inverse Scattering Algorithms

Autoren: Y. Qin, A. Butola, and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Photonics & Electromagnetics Research Symposium (PIERS 2024), 2024
Herausgeber: PIERS

MUS-CARS: development of a computational resolution enhancement towards label-free chemical imaging

Autoren: D. Bhattacharya, D. Lamparte, K. Agarwal, S. Willaime-Morawek, S. Mahajan
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2026, 2026
Herausgeber: Focus on Microscopy

Contractile force of transplanted cardiomyocytes actively supports heartfunction after injury

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: German Cardiac Society

A simple and flexible platform for optogenetic pacing in cardiac tissue engineering

Autoren: Bangfen Pan, Julius Hansen, Tim Stüdemann, Florian Weinberger, Thomas Eschenhagen, Justus Stenzig
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

Evaluating LLM-as-a-Judge for Medical Term Simplification

Autoren: Buhnila, I., Sinha, A., Agarwal, R., Prasad, D. K., & Constant, M
Veröffentlicht in: ACL BioNLP, 2026
Herausgeber: ACL

Toward faster and deeper optical microscopes by combining ultrasound with light

Autoren: Marti Duocastella
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Spanish and Portuguese Advanced Optical Meeting (SPAOM)

OrganVision - Nanoscopic window into the life of heart

Autoren: Giulia De Poli, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: AI4future

Inverse scattering based 3D refractive index imaging: modeling, reconstruction and illumination effects

Autoren: Y. Qin and K. Agarwal
Veröffentlicht in: XXXVIth URSI General Assembly and Scientific Symposium (URSI GASS 2026), 2026
Herausgeber: URSI

Physics-guided Loss Functions Impact Performance of Deep-learning-based Inverse-scattering-problem Solver

Autoren: K. Agarwal, Z. Liu, M. Roy, D. K. Prasad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Photonics and Electromagnetics Research Symposium (PIERS)

Stem cell-derived cardiomyocyte transplantation – pharmacological considerations

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: ISHR World Congress, 2022
Herausgeber: ISHR

Challenges and Role of Federated Learning in Microscopy Data Analysis

Autoren: A. A. Sekh
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Acousto-Optic Light Engineering for High-Speed Microscopy

Autoren: Martí Duocastella
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: Frontiers in Lasers and Applications

Encoded light for high-speed optical microscopy

Autoren: Marti Duocastella
Veröffentlicht in: 12th International Weber Symposium, 2025
Herausgeber: Istituto Italiano di Tecnologia

Human engineered heart tissue transplantation in a guinea pig chronic injury model

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: International Society for Heart Research

Acousto-Optic Deflector–Based Structured Illumination and Frequency-Encoded Multiphoton Microscopy for Scanless Imaging of Biological Tissues

Autoren: Martin Skorsetz, Aisada König, Grzegorz Rieger, Martí Duocastella, Karsten König
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2026, 2026
Herausgeber: Focus on Microscopy

Generative Adversarial Networks for Virtual Fluorescent Staining

Autoren: Lorenzo Venieri
Veröffentlicht in: 24th International Conference on Group Decision and Negotiation, 2024
Herausgeber: 24th International Conference on Group Decision and Negotiation

MABNET: Master Assistant Buddy Network With Hybrid Learning for Image Retrieval

Autoren: R. Agarwal, G. Das, S. Aggarwal, A. Horsch, D.K. Prasad
Veröffentlicht in: IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP), 2023
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/icassp49357.2023.10094987

On Generalization of 3D Generative Models

Autoren: Bhansal, Arushika, Abhinanda Ranjit Punnakkal, and Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: AAI Workshop 2025, 2025
Herausgeber: AAI Workshop 2025

Cardiac Repair Mechanisms - Insights from Opto- and Chemogenetic Approaches

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: NIH PCTC Cardiovascular Bioengineering Symposium, 2025
Herausgeber: NIH

Adaptation of Inverse Scattering Algorithms for 3D Refractive Index Reconstruction with Coherent Label-free Microscope Data

Autoren: Y. Qin, A. Butola, and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Photonics & Electromagnetics Research Symposium PIERS 2024, 2024
Herausgeber: PIERS

Deep imaging in scattering media using ultrasonic endoscopes

Autoren: Marti Duocastella
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT

Pluripotent stem cell-based heart repair

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Cardioascona 2024, 2024
Herausgeber: Ascona

Analysing the interaction between cardiomyocyte work and cell-cycle with human stem cell derived engineered heart tissue

Autoren: Nancy Shehata
Veröffentlicht in: Cardiovascular Bioengineering Symposium, 2025
Herausgeber: Cardiovascular Bioengineering Symposium

The quest for the perfect microscope: fast, label-free and deep

Autoren: Marti Duocastella
Veröffentlicht in: Imaging Across Scales- From Molecules to Humans, Southampton, UK, 2024
Herausgeber: University of Southampton

AI for Biological problems: Challenges, Solutions, and Lessons from Microscopy and Life-Science Applications

Autoren: Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT

Label-free chemical imaging with computerised super-resolution method to explore demyelination in Alzheimer’s Disease

Autoren: Dipanjan Bhattacharya
Veröffentlicht in: ARUK Annual meeting 2025, 2025
Herausgeber: ARUK

Shaping light with sound for fast and deep 3D imaging

Autoren: Marti Duocastella
Veröffentlicht in: SPIE Defense + Security, Washington DC, USA, 2026
Herausgeber: SPIE

Guided U-Net aided Efficient Image Data Storing with Shape Preservation

Autoren: N. Banerjee, S. Malakar, D. K. Gupta, A. Horsch, D.K. Prasad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Asian Conference on Pattern Recognition (ACPR2023)

Shape-based Forward Modeling via SIEs for Label-free Microscopy

Autoren: Y. Huang, Y. Qin and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Photonics & Electromagnetics Research Symposium, 2025
Herausgeber: PIERS

Project presentation

Autoren: Matteo Bregonzio
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: GO BEYOND 2022

Reconstructing 3D shape from 3D ThunderSTORM Point Clouds

Autoren: S. Jadhav, S. Majhi, A.S. Chowdhury, D.K. Prasad, K. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Development of a label-free computational resolution enhancement method towards biomedical applications

Autoren: D. Bhattacharya
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT

Cardiac Repair Mechanisms - Insights from Opto- and Chemogenetic Approaches

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: McEwen Stem Cell Insitute, Seminar Series, 2025
Herausgeber: McEwen Stem Cell Institute

Quantitative phase imaging of fast dynamic events using acousto-optics and pulsed illumination

Autoren: Christos Alexandropoulos, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Stem Cell-Derived Engineered Heart Tissue Develops in the Absence of Contractility

Autoren: C. Manthey, T. Stüdemann, A. Shibamiya, M. Köhne, G. Penalosa Ruiz, J. Rössinger, R. Srikantharajah, C. Schulz, T. Christ, T. Eschenhagen, F. Weinberger
Veröffentlicht in: Annual Meeting of the German Cardiac Society, 2023
Herausgeber: Clinical Research in Cardiology

No Imputation Needed: A Switch Approach to Irregularly Sampled Time Series

Autoren: Rohit Agarwal, Aman Sinha, Ayan Vishwakarma, Xavier Coubez, Marianne Clausel, Mathieu Constant, Alexander Horsch, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: NeurIPS 2025 Workshop, 2025
Herausgeber: NeurIPS 2025 Workshop

Multimodal Femtosecond Fiber Laser Microscopy of Engineered Heart Tissues with Acousto-Optic Deflectors

Autoren: K König, M Duocastella, M Skorsetz, D Pankin, G Rieger, F Weinberger, N Shehata, A König
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2025, 2025
Herausgeber: Focus on Microscopy

Toward Clinical 3D Pathology: Opportunities and Technological Challenges in Light Microscopy

Autoren: F. Niknam, Y. Anbarestani
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Intercellular transfer of cardiac mitochondria evaluated by high-sensitivity 3D imaging cytometry, high-resolution microscopy and high-throughput cell respirometry

Autoren: Kenneth B. Larsen, Mauro Calvoli, Mireia Nager, Trine B. Kalstad and Asa B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: Cell Press Symposium: Multifaceted Mitochondria, 2026
Herausgeber: Cell Press

Cardiac Work Inhibits Cell Cycle Activity in Engineered Heart Tissue

Autoren: R. Srikantharajah, N. Shehata, T. Stüdemann, C. Manthey, T. Eschenhagen, F. Weinberger
Veröffentlicht in: The Thoracic and Cardiovascular Surgeon, 56th Annual Meeting of the German Society for Pediatric Cardiology (DGPK), 2024
Herausgeber: Georg Thieme Verlag KG
DOI: 10.1055/s-0044-1780731

Modified Richardson-Lucy Algorithm enables High-Fidelity and Fast Deconvolution

Autoren: F. Niknam, K. Agarwal
Veröffentlicht in: BioPhysics Symposium, 2024
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

High-Fidelity Volumetric Tissue Microscopy: Integrating Computational Adaptive Optics with Accelerated Deconvolution

Autoren: F. Niknam, K. Agarwal
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Pluripotent stem cell-based heart repair

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Queen Mary University, London Cardiovascular Seminar Series, 2024
Herausgeber: Queen Mary University

Toward Reliable CIE Inversion for Optical Microscopy: A Framework for Hyper-parameter Selection and Efficient Reconstruction

Autoren: Y. Huang, Y. Qin, Y. Zhong and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Photonics & Electromagnetics Research Symposium (PIERS 2025), 2025
Herausgeber: PIERS

Hedging Is Not All You Need: A Simple Baseline for Online Learning Under Haphazard Inputs

Autoren: Himanshu Buckchash, Momojit Biswas, Rohit Agarwal, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: ICASSP 2025 - 2025 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP), 2026, Seite(n) 1-5
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/icassp49660.2025.10889697

Gradient Light Interference Microscopy for labelfree detection of early changes in kidney cells embedded in a soft and stiff hydrogel matrix

Autoren: B. Ghosh, K. A. Fenton, K. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Label-free multimodal femtosecond fiber laser microscopy of organoids with acousto-optic deflectors

Autoren: Karsten König, Aisada König, Dmitry Pankin, Martin Skorsetz, Florian Weinberger, Nancy Shehata, Krishna Agarwal, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: Multiphoton Microscopy in the Biomedical Sciences XXV, 2025, Seite(n) 42
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.3039099

A Privacy-Preserving Approach to Data and Artificial Intelligence

Autoren: Matteo Bregonzio
Veröffentlicht in: Bioscopy Conference, 2026
Herausgeber: UiT

Creating In Vitro Kidney Glomerular Microenvironment In 3d Hydrogels For Studying Chronic Kidney Diseases

Autoren: Ghosh, B., K Fenton, K Agarwal
Veröffentlicht in: Tissue Engineering Part A, 2024
Herausgeber: Sage Journals

Analysing the interaction between cardiomyocyte work and cell-cycle with human stem cell derived engineered heart tissue

Autoren: Nancy Shehata
Veröffentlicht in: Gordon Research Conference - Cardiac Regulatory Mechanism, 2024
Herausgeber: Gordon Research Conference - Cardiac Regulatory Mechanism

A Blind Deconvolution Approach for Wide-Field Microscopy

Autoren: Farhad Niknam, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Optica Imaging Congress 2024 (3D, AOMS, COSI, ISA, pcAOP), 2024, Seite(n) JF2A.6
Herausgeber: Optica Publishing Group
DOI: 10.1364/3d.2024.jf2a.6

Stem-cell based heart repair – pharmacological perspective

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

Towards a Physics-Informed Deep Learning Approach for 3D Phaseless Microscopy

Autoren: Nicola Cuzzocrea, Nadia Mammone, Cosimo Ieracitano, Yingying Qin, Krishna Agarwal, Martina T. Bevacqua
Veröffentlicht in: 2026 IEEE MTT-S International Microwave Biomedical Conference (IMBioC), 2026, Seite(n) 1-3
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/imbioc69142.2026.11541160

Computational modeling of light transport for mesoscopic optical microscopy

Autoren: Y. Qin, Y. Zhong and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Bioscopy conference, 2026
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Controlling light with sound for enhanced materials processing

Autoren: Martí Duocastella
Veröffentlicht in: Laser Applications in Microelectronic and Optoelectronic Manufacturing (LAMOM) XXIX, Ausgabe Abstract is open access, 2024, Seite(n) 27
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.3001039

What is Good Enough Myocardial Repair, Recovery or Remission in Chronic HF? Basic Science Perspective

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: U-Cars Symposium 2022

Finding an Appropriate Dose for Engineered Heart Tissue

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: Cardiovascular Bioengineering Symposium

Kilohertz frequency encoded microscopy using acousto-optic deflectors

Autoren: Andrea Marchese, Pietro Ricci, Peter Saggau, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Cardiac tissue engineering – opportunities for cardiac regeneration

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: CNIC Regeneration Symposium, 2022
Herausgeber: CNIC

Analysing the interaction between cardiomyocyte work and cell-cyclehuman stem cell derived engineered heart tissue

Autoren: Nancy Shehata
Veröffentlicht in: Cardiovascular Bioengineering Symposium, XXV ISHR World Congress, 2025
Herausgeber: ISHR

Generation of human engineered heart tissue with a chemo- and optogenetic Off-On switch

Autoren: Judith Rössinger, Tim Stüdemann, Aya Shibamiya, Torsten Christ, Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

A different perspective on illumination choice for label-free scattering microscopy

Autoren: Y. Qin, Y. Zhong, and K. Agarwal
Veröffentlicht in: Focus on Microscopy 2026, 2026
Herausgeber: Focus on Microscopy

Marked increase in mitochondria degradation in engineered heart tissue during reperfusion

Autoren: Mireia Nager Grifo
Veröffentlicht in: Experimental Health Research Conference, 2023
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Chemogenetics to study the interplay between cardiac contractility and cardiomyocyte morphology

Autoren: Judith Rössinger
Veröffentlicht in: Keystone Conference, 2023
Herausgeber: Keystone Conference

"“Focus on engineered heart tissue transplantation: The HeartVision project”, invited talk at NORHEART seminar: ""Mechanisms in Cardiac Metabolism and Mitochondrial function: Highlighting Translational Aspects"", UiT, 2026"

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2026, Seite(n) No abstracts were published. The seminar was open to all and streamed. Link to the program provided.
Herausgeber: UiT-The Arctic University of Norway

Predicting Early Diabetic Kidney Disease Using a 3D Mesangial Model and Bayesian Mechano-Chemical Stratification

Autoren: Biswajoy Ghosh, Farhad Niknam, Nikhil Kumar, Kristin Andreassen Fenton, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2023.12.10.571017

Codeset: Modelling Irregularly Sampled Time Series Without Imputation

Autoren: Rohit Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Github

MiShape: 3D Shape Modelling of Mitochondria in Microscopy

Autoren: Abhinanda R. Punnakkal, Suyog S Jadhav, Alexander Horsch, Krishna Agarwal, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Arxiv

Replication Data for: Multiple signal classification as a blind reconstruction approach for three-dimensional structured illumination microscopy

Autoren: Ida S. Opstad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: DataverseNO

LysoTracker Deep Red exhibits photoconversion in multi-color structured illumination microscopy

Autoren: Ida Sundvor Opstad, Kenneth Bowitz Larsen, Åsa Birna Birgisdottir, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: BiorXiv
DOI: 10.1101/2023.10.29.564502

Fluorescence microscopy videos of mitochondria in H9c2 cardiomyoblasts

Autoren: Ida S. Opstad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: DataverseNO

Contractility governs cardiomyocyte cell cycle activity

Autoren: Nancy Shehata, Rajiven Srikantharajah, Eleonore Baier, Christoph Manthey, Tim Stüdemann, Marie Nehring, Anita Covic, Christian Müller, Bente Siebels, Paula Nissen, Anika Witten, Magdalena Zafra Castellano, Yago Rodriguez, Lucia Zamacona Gomez, Imke Janssen, Jorge Rodriguez, Andrea Garza Enriquez, Miguel Angel Garitagoitia Romero, Romina Di Mattia, Andreas Dendorfer, Alessandra Moretti, Christine
Veröffentlicht in: 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.19.671096

Dataset and codeset for BMWP: the first Bengali math word problems dataset for operation prediction and solving

Autoren: Sanchita Mondal
Veröffentlicht in: Dataset, 2025
Herausgeber: Github

Aux-Drop: Handling Haphazard Inputs in Online Learning Using Auxiliary Dropouts

Autoren: R. Agarwal
Veröffentlicht in: Codeset, 2023
Herausgeber: Github

Online Learning under Haphazard Input Conditions: A Comprehensive Review and Analysis

Autoren: R. Agarwal
Veröffentlicht in: Dataset, 2026
Herausgeber: Github

Online Learning under Haphazard Input Conditions: A Comprehensive Review and Analysis

Autoren: Rohit Agarwal; Arijit Das; Alexander Horsch; Krishna Agarwal; Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: CoRR, Ausgabe 2, 2024
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2404.04903

"""OrganVision: An ERC funded interdisciplinary collaboration project” invited talk at IMB conference"

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The entire event was open for all. The program was broadcast on digital stream of university. temporary link to program is given.
Herausgeber: IMB conference

Multifocus microscopy with optically sectioned axial superresolution

Autoren: Ströhl, Florian; Hansen, Daniel Henry; Nager Grifo, Mireia; Birgisdottir, Åsa Birna
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2022
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2206.01257

Activity Report 2021

Autoren: Institut de Nanociència i Nanotecnologia
Veröffentlicht in: instname:, Ausgabe 1, 2021
Herausgeber: University of Barcelona

"""Monitoring mitochondria degradation in cardiac cells"" invited talk at the NORHEART seminar ""Targeting mitochondria in cardiovascular disease"""

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2021
Herausgeber: NORHEART seminar

Tool & Video Protocol: Tool on fluorescence microscopy images of fixed cardiomyoblasts

Autoren: Abhinanda Punakkal et al.
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: JOVE

Phase 1 digital staining AI model codesets using Co-Fl-Lf datasets from conventional microscopes

Autoren: Lorenzo Venieri
Veröffentlicht in: Dataset, 2024
Herausgeber: Github

«Mitophagy is induced in engineered heart tissue after simulated ischemia and reperfusion», invited talk at NORHEART seminar « Pathways and Regulatory Mechanisms in Metabolism and Mitochondrial Function», UiT-The Arctic University of Norway, Tromsø, Norway, May 12-13, 2025

Autoren: M. Nager
Veröffentlicht in: 2025, Seite(n) No abstracts were published. Seminar open to all NORHEART members and was streamed. Link to program provided.
Herausgeber: UiT-The Arctic University of Norway

“Monitoring degradation of mitochondria in cardiac cells”, invited talk at Annual meeting of the Scandinavian Physiological Society

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2021, Seite(n) No abstracts or papers were submitted. Program is open access.
Herausgeber: Scandinavian Physiological Society

Wasserstein GAN for three-dimensional multi-channel virtual fluorescent staining

Autoren: Andrea Masella
Veröffentlicht in: Codeset, 2024
Herausgeber: Github

"«Interdisciplinary collaboration synergy» , invited talk at a ""Research leader seminar"", Faculty of Health Sciences, UiT, 2026"

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2026, Seite(n) No abstracts were published from the seminar. Seminar open to all invited research leaders at the Faculty. Link to the program is provided.
Herausgeber: UiT-The Arctic University of Norway

Latent Graph Attention for Enhanced Spatial Context

Autoren: Ayush Singh, Yash Bhambhu, Himanshu Buckchash, Deepak K. Gupta, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Arxiv, 2023
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2307.04149

Codeset: Presenting CODS (Cell Organelle Dynamic Simulation)

Autoren: A. V. Celeste
Veröffentlicht in: Codeset, 2023
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Codeset and dataset for: Graph-based hostile content detection in Hindi language. Discover Computing.

Autoren: Chakraborty, A., Joardar, S., Prasad, D. K., & Sekh, A. A.
Veröffentlicht in: Dataset, 2025
Herausgeber: Github

Fluorescence microscopy videos of mitochondria and endosomes in H9c2 cardiomyoblasts

Autoren: Ida S. Opstad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: DataverseNO

«Monitoring mitochondria turnover and transfer in cardiac cells», invited talk at the Bioscopy conference, UiT, Tromsø, Norway, 2026

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2026, Seite(n) No abstracts were published. Link to the program is provided.
Herausgeber: UiT-The Arctic University of Norway

pNNCLR: Stochastic Pseudo Neighborhoods for Contrastive Learning based Unsupervised Representation Learning Problems

Autoren: Momojit Biswas, Himanshu Buckchash, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2308.06983

Towards a More Inclusive AI: Progress and Perspectives in Large Language Model Training for the S\'ami Language

Autoren: Paul, Ronny; Buckchash, Himanshu; Parida, Shantipriya; Prasad, Dilip K.
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2024
Herausgeber: Arxiv

"""HeartVision-a success story"", invited speaker at the IMB conference 2025, Faculty of Health Sciences UiT, 2025"

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2025, Seite(n) No abstracts were published. Conference open to all employees at IMB, UiT. Link to the program provided.
Herausgeber: UiT-The Arctic University of Norway

"""Exploiting cardiomyocytes derived from human induced pluripotent stem cells and engineered heart tissue for studying cellular mechanism in the human heart"", invited talk at the Experimental Health Research Conference (EHRC), Faculty of Health Sciences, UiT, 2025"

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2025, Seite(n) No abstracts were published from the conference. Link to the conference program is provided.
Herausgeber: UiT-The Arctic University of Tromsø

Summer School Course Tutorial Codeset “Interpretable DL Playground”

Autoren: Ayush Somani
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Github

"""Marked increase in mitochondria degradation in engineered heart tissue during reperfusion"""

Autoren: A. B. Birgisdottir and M.N. Grifo
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Mimisbrunnr conference

"""Mitophagy is induced in engineered heart tissue after simulated ischemia and reperfusion"", invited talk to present the published paper´s main findings at a webinar organized by MITOtalks and Focal plane, 2025."

Autoren: M. Nager and A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2025, Seite(n) No abstracts published. Webinar open to all that registrered. Link to webinar announcement provided.
Herausgeber: MITOtalks and Focal Plane

3DMSL - 3D Mitochondria Shape Library for Optical Microscopy

Autoren: Punnakkal, Abhinanda Ranjit; Jadhav, Suyog S; Celeste, Aaron Vaughn; Horsch, Alexander; Agarwal, Krishna; Prasad, Dilip K
Veröffentlicht in: Dataset, 2024
Herausgeber: DataverseNO
DOI: 10.18710/jx6jxf

MABNET: Master Assistant Buddy Network With Hybrid Learning for Image Retrieval

Autoren: R. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Github

""" Insights into Cardiac Repair Mechanisms from Engineered Heart Tissue"". Keynote talk at NOR-MPS-the annual NOR-MPS; Nordic Organoid and Microphysiological Systems Convention, University of Oslo, Oslo, Norway, 2026"

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2026, Seite(n) No abstracts were published. Link to the program is attached.
Herausgeber: University of Oslo

Label-free acoustic and optical microscopy of live tumor spheroids in hydrogel for high-throughput 3D In-vitro drug screening

Autoren: Biswajoy Ghosh, Komal Agarwal, Anowarul Habib, Krishna Agarwal, Frank Melandsø
Veröffentlicht in: 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2024.08.28.610181

Finding an Appropriate Dose for Engineered Heart Tissue

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Translational Research Seminar Series, SickKids Hospital, Toronto, Canada, Ausgabe No abstract submitted, 2021
Herausgeber: SickKids Hospital

"""Exploiting engineered heart tissue to decipher mitochondria quality control in the human heart"", invited talk at NOR-MPS, the annual Nordic Organoid and Microphysiological Systems Convention Oslo, Norway, 2026"

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2025, Seite(n) No abstracts published from the symposium. Link to the program provided.
Herausgeber: University of Oslo

Modelling Irregularly Sampled Time Series Without Imputation

Autoren: Rohit Agarwal, Aman Sinha, Dilip K. Prasad, Marianne Clausel, Alexander Horsch, Mathieu Constant, Xavier Coubez
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2309.08698

Paper Code: Virtual Labeling of Mitochondria in Living Cells using Physics-guided Deep Learning

Autoren: Ayush Somani
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: Github

Arctic LLM Workshop Hands-on Tutorial Session

Autoren: Ayush Somani
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Github

Dense Video Captioning: A Survey of Techniques, Datasets and Evaluation Protocols

Autoren: Qasim, Iqra; Horsch, Alexander; Prasad, Dilip K.
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2023
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2311.02538

Evidence for the inhibition of cardiomyocytes cycle activity by cardiac contraction

Autoren: Nancy Sorial Samy Shehata
Veröffentlicht in: 2026
Herausgeber: University of Hamburg

Reconstructing 3D Geometries of sub-cellular structures from SMLM clouds

Autoren: S. Jadhav
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Multiple Signal Classification Algorithm: A computational microscopy tool for fluorescence microscopy

Autoren: Sebastián Andrés Acuña Maldonado
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: MUNIN, UiT

Study of mitochondrial degradation induced by cryoinjury in engineered heart tissue

Autoren: Synne Amalie Hansen
Veröffentlicht in: 2024
Herausgeber: UiT-The Arctic University of Norway

Scalable Online Deep Learning for Streaming Data with Variable Feature Spaces: Architectures, Imparting Scalability and Data Transformation

Autoren: Rohit Agarwal
Veröffentlicht in: 2025
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Presenting CODS (Cell Organelle Dynamic Simulation)

Autoren: Aaron Celeste
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Advanced Microscopy for Real-time Imaging of Biological Samples

Autoren: Christos Alexandropoulos
Veröffentlicht in: 2026
Herausgeber: Universitat de Barcelona

Generative Adversarial Networks For Three-Dimensional Multi-Channel Virtual Fluorescent Staining

Autoren: Lorenzo Venieri
Veröffentlicht in: 2024
Herausgeber: Università di Bologna
DOI: 10.5281/zenodo.13382862

Study of mitochondrial transfer in hiPSC derived cardiomyocytes and engineered heart tissue

Autoren: Kristiana Imsa
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Encoded illumination for high-speed optical microscopy

Autoren: Eva Maria Torres-Riera
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Universitat Politecnica de Catalunya

Scattering-enhanced intensity based tomography

Autoren: Yingying Qin, Ankit Butola, Yu Zhong, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: IEEE Transactions on Computational Imaging, 2026, Seite(n) 1-9, ISSN 2333-9403
Herausgeber: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
DOI: 10.1109/tci.2026.3707064

IReCAPTCHA: a robust image-reasoning CAPTCHA system

Autoren: Bidyut Das, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Cybersecurity, Ausgabe 9, 2026, ISSN 2523-3246
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s42400-025-00484-0

Fluorescence microscopy and correlative brightfield videos of mitochondria and vesicles in H9c2 cardiomyoblasts

Autoren: Ida S. Opstad, Åsa B. Birgisdottir, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe vol. 11, 2024, Seite(n) Article 125, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41597-024-02970-5

Latent Graph Attention for Spatial Context in Light-Weight Networks: Multi-Domain Applications in Visual Perception Tasks

Autoren: Ayush Singh, Yash Bhambhu, Himanshu Buckchash, Deepak K. Gupta, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Applied Sciences, Ausgabe 14, 2025, Seite(n) 10677, ISSN 2076-3417
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/app142210677

Graph-based hostile content detection in Hindi language

Autoren: Angana Chakraborty, Subhankar Joardar, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Discover Computing, Ausgabe 28, 2025, ISSN 2948-2992
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s10791-025-09790-0

Modulating cardiac physiology in engineered heart tissue with the bidirectional optogenetic tool BiPOLES

Autoren: Barbora Schwarzová, Tim Stüdemann, Muhammed Sönmez, Judith Rössinger, Bangfen Pan, Thomas Eschenhagen, Justus Stenzig, J Simon Wiegert, Torsten Christ, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Pflugers Archive, European Journal of Physiology, 2023, ISSN 0031-6768
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00424-023-02869-x

Scan-less microscopy based on acousto-optic encoded illumination

Autoren: Andrea Marchese , Pietro Ricci , Peter Saggau, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: Nanophotonics, Ausgabe Volume 13, Ausgabe 1, 2024, Seite(n) 63-73, ISSN 2192-8614
Herausgeber: Berlin de Gruyter
DOI: 10.1515/nanoph-2023-0616

An UltraMNIST classification benchmark to train CNNs for very large images

Autoren: Deepak K. Gupta, Udbhav Bamba, Abhishek Thakur, Akash Gupta, Rohit Agarwal, Suraj Sharan, Ertugul Demir, Krishna Agarwal, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 11, 2024, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41597-024-03587-4

Mitophagy is induced in human engineered heart tissue after simulated ischemia and reperfusion

Autoren: Mireia Nàger, Kenneth B. Larsen, Zambarlal Bhujabal, Trine B. Kalstad, Judith Rössinger, Truls Myrmel, Florian Weinberger, Asa B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: Journal of Cell Science, Ausgabe 138, 2025, ISSN 0021-9533
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.263408

TERMIS 2023 – European Chapter Manchester Central Conference Centre Manchester, UK March 28–31, 2023

Autoren: Biswajoy Ghosh, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Tissue Engineering Part A, 2023, ISSN 1937-3341
Herausgeber: Mary Ann Liebert Inc.
DOI: 10.1089/ten.tea.2023.29043.abstracts

Multilingual visual question answering for visually impaired people

Autoren: Ratnabali Pal, Samarjit Kar, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Discover Artificial Intelligence, Ausgabe 5, 2025, ISSN 2731-0809
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s44163-025-00482-8

Propagating Transparency: A Deep Dive into the Interpretability of Neural Networks

Autoren: Ayush Somani, Alexander Horsch, Ajit Bopardikar, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Nordic Machine Intelligence, Ausgabe 4, 2024, Seite(n) 1-18, ISSN 2703-9196
Herausgeber: University of Oslo Library
DOI: 10.5617/nmi.10755

Mitochondrial dynamics and quantification of mitochondria‐derived vesicles in cardiomyoblasts using structured illumination microscopy

Autoren: Ida S. Opstad, Gustav Godtliebsen, Balpreet Singh Ahluwalia, Truls Myrmel, Krishna Agarwal, Åsa Birna Birgisdottir
Veröffentlicht in: Journal of Biophotonics, Ausgabe 15, 2023, ISSN 1864-063X
Herausgeber: Wiley - VCH Verlag GmbH & CO. KGaA
DOI: 10.1002/jbio.202100305

Multifocus microscopy with optical sectioning and high axial resolution

Autoren: Florian Ströhl, Daniel Henry Hansen, Mireia Nager Grifo, Åsa Birna Birgisdottir
Veröffentlicht in: Optica, Ausgabe Vol. 9, Ausgabe 11, 2022, Seite(n) 1210-1218, ISSN 2334-2536
Herausgeber: Optica Publishing Group
DOI: 10.1364/optica.468583

BMWP: the first Bengali math word problems dataset for operation prediction and solving

Autoren: Sanchita Mondal, Debnarayan Khatua, Sourav Mandal, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Discover Artificial Intelligence, Ausgabe 5, 2025, ISSN 2731-0809
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s44163-025-00243-7

Improving visual question answering for visually impaired people leveraging pre-trained models

Autoren: Ratnabali Pal, Samarjit Kar, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Discover Applied Sciences, Ausgabe 8, 2026, ISSN 3004-9261
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s42452-025-07996-x

The multifaceted role of autophagy and mitophagy in cardiovascular health and disease

Autoren: Mireia Nàger, Mauro Calvoli, Kenneth B. Larsen, Asa B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: Autophagy Reports, Ausgabe 4, 2025, ISSN 2769-4127
Herausgeber: Informa UK Limited
DOI: 10.1080/27694127.2025.2572511

3D Mitochondria Shape Library for Optical Microscopy (3DMSL): A multimodal dataset for deep learning based mitochondrial analysis

Autoren: Abhinanda R. Punnakkal, Suyog S. Jadhav, Aaron V. Celeste, Alexander Horsch, Krishna Agarwal, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Data in Brief, Ausgabe 65, 2026, Seite(n) 112507, ISSN 2352-3409
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.dib.2026.112507

Author Correction: Viewing life without labels under optical microscopes

Autoren: Biswajoy Ghosh, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe 7, 2024, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-024-06977-x

AI-driven analysis by identifying risk factors of VL relapse in HIV co-infected patients

Autoren: Abhishek Kumar, Sanchita Mondal, Debnarayan Khatua, Debashree Guha, Budhaditya Mukherjee, Arista Lahiri, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-025-07406-7

HnRNP K mislocalisation is a novel protein pathology of frontotemporal lobar degeneration and ageing and leads to cryptic splicing

Autoren: Alexander Bampton, Ariana Gatt, Jack Humphrey, Sara Cappelli, Dipanjan Bhattacharya, Sandrine Foti, Anna-Leigh Brown, Yasmine Asi, Yi Hua Low, Marco Foiani, Towfique Raj, Emanuele Buratti, Pietro Fratta, Tammaryn Lashley
Veröffentlicht in: Acta Neuropathologica, Ausgabe 142, 2021, Seite(n) 609-627, ISSN 0001-6322
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00401-021-02340-0

3D refractive index reconstruction from phaseless coherent optical microscopy data using multiple scattering-based inverse solvers - a study

Autoren: Yingying Qin, Ankit Butola, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Inverse Problems, Ausgabe volume 40, no. 1, 2023, Seite(n) article 015003, ISSN 0266-5611
Herausgeber: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1361-6420/ad0c29

Multiphoton Imaging With Frequency Encoded Illumination Using Dual Acousto-Optic Deflectors

Autoren: M. Skorsetz, A. König, G. Rieger, K. König
Veröffentlicht in: IEEE Photonics Journal, Ausgabe 18, 2026, Seite(n) 1-6, ISSN 1943-0655
Herausgeber: Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI: 10.1109/jphot.2026.3660905

Abstract 14720: Marked Increase in Mitochondria Degradation in Engineered Heart Tissue During Reperfusion

Autoren: Mireia Nager, Zambarlal Bhujabal, Kenneth B Bowitz Larsen, Trine B Kalstad, Truls Myrmel, Asa B Birgisdottir
Veröffentlicht in: Circulation, Ausgabe 146, 2023, ISSN 0009-7322
Herausgeber: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1161/circ.146.suppl_1.14720

High-speed fluctuation microscopy with acousto-optic illumination

Autoren: F Niknam, L Rodríguez-Suné, K Agarwal, M Duocastella
Veröffentlicht in: Journal of Physics: Photonics, Ausgabe 8, 2026, Seite(n) 025004, ISSN 2515-7647
Herausgeber: IOP Publishing
DOI: 10.1088/2515-7647/ae54eb

Modulation of cardiomyocyte contractility and action potentials with chemogenetic chloride currents

Autoren: Muhammed Sönmez, Tim Stüdemann, Christoph Manthey, Anita Covic, Nancy Shehata, Junsoo Im, Barbora Schwarzova, Judith Rössinger, Rajiven Srikantharajah, Aya Shibamiya, Edzard Schwedhelm, Thomas Eschenhagen, Torsten Christ, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: The Journal of Physiology, Ausgabe 603, 2025, Seite(n) 1399-1415, ISSN 0022-3751
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1113/jp286428

Chemogenetic engineered heart tissue to study the influence of contractility on cardiac maturation

Autoren: Rajiven Srikantharajah, Tim Stüdemann, Nancy Shehata, Christoph Manthey, Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Journal of Molecular and Cellular Cardiology Plus, Ausgabe 15, 2026, Seite(n) 100719, ISSN 2772-9761
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jmccpl.2025.100719

VisionAidQA: Advancing Visual Question Answering for the Visually Impaired

Autoren: Ratnabali Pal, Samarjit Kar, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: ACM Computing Surveys, Ausgabe 58, 2026, Seite(n) 1-36, ISSN 0360-0300
Herausgeber: Association for Computing Machinary, Inc.
DOI: 10.1145/3788861

Impulse initiation in engrafted pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes can stimulate the recipient heart

Autoren: Tim Stüdemann, Barbora Schwarzova, Till Schneidewind, Birgit Geertz, Constantin von Bibra, Marie Nehring, Judith Rössinger, J. Simon Wiegert, Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Stem Cell Reports, 2026, ISSN 2213-6711
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1101/2023.11.12.566756

Snapshot Quantitative Phase Imaging with Acousto-Optic Chromatic Aberration Control

Autoren: Christos Alexandropoulos, Laura Rodríguez-Suñé, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: Sensors, Ausgabe 25, 2025, Seite(n) 4503, ISSN 1424-8220
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/s25144503

Viewing life without labels under optical microscopes

Autoren: Biswajoy Ghosh, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Communication Biology, Ausgabe vol. 6, 2023, Seite(n) article number 559, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-023-04934-8

BGPCN: A BERT and GPT-2-based Relational Graph Convolutional Network for hostile Hindi information detection

Autoren: Angana Chakraborty, Subhankar Joardar, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Array, Ausgabe 28, 2026, Seite(n) 100601, ISSN 2590-0056
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.array.2025.100601

Challenges and perspectives of heart repair with pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes

Autoren: Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Nature Cardiovascular Research, Ausgabe 3, 2024, Seite(n) 515-524, ISSN 2731-0590
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44161-024-00472-6

Analyzing Mitochondrial Morphology Through Simulation Supervised Learning

Autoren: Abhinanda Ranjit Punnakkal, Gustav Godtliebsen, Ayush Somani, Sebastian Andres Acuna Maldonado, Åsa Birna Birgisdottir, Dilip K. Prasad, Alexander Horsch, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Journal of Visualized Experiments, 2024, ISSN 1940-087X
Herausgeber: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/64880-v

Molecular histopathology of matrix proteins through autofluorescence super-resolution microscopy

Autoren: Biswajoy Ghosh, Jyotirmoy Chatterjee, Ranjan Rashmi Paul, Sebastian Acuña, Pooja Lahiri, Mousumi Pal, Pabitra Mitra, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 14, 2024, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-61178-0

Label-free correlative morpho-chemical tomography of 3D kidney mesangial cells

Autoren: Ankit Butola, Biswajoy Ghosh, Jaena Park, Minsung Kwon, Alejandro De la Cadena, Sudipta S Mukherjee, Rohit Bhargava, Stephen A. Boppart, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Journal of Biomedical Optics, Ausgabe 31, 2026, ISSN 1083-3668
Herausgeber: S P I E - International Society for Optical Engineering
DOI: 10.1117/1.jbo.31.3.036501

High-resolution visualization and assessment of basal and OXPHOS-induced mitophagy in H9c2 cardiomyoblasts

Autoren: Gustav Godtliebsen, Kenneth Bowitz Larsen, Zambarlal Bhujabal, Ida S Opstad, Mireia Nager, Abhinanda R Punnakkal, Trine B Kalstad, Randi Olsen, Trine Lund, Dilip K Prasad, Krishna Agarwal, Truls Myrmel, Asa Birna Birgisdottir
Veröffentlicht in: Autophagy, Ausgabe vol. 19, issue 10, 2023, Seite(n) 2769-2788, ISSN 1554-8627
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15548627.2023.2230837

Video-rate quantitative phase imaging with dynamic acousto-optic defocusing

Autoren: Christos Alexandropoulos, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: Optics and Lasers in Engineering, Ausgabe Volume 169, October 2023, 2023, Seite(n) article 107692, ISSN 0143-8166
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.optlaseng.2023.107692

Virtual labeling of mitochondria in living cells using correlative imaging and physics-guided deep learning

Autoren: Ayush Somani, Arif Ahmed Sekh, Ida S. Opstad, Åsa Birna Birgisdottir, Truls Myrmel, Balpreet Singh Ahluwalia, Alexander Horsch, Krishna Agarwal, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Biomedical Optics Express, Ausgabe Vol. 13, Ausgabe 10, 2022, Seite(n) 5495-5516, ISSN 2156-7085
Herausgeber: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.464177

Auxiliary Network: Scalable and Agile Online Learning for Dynamic System with Inconsistently Available Inputs

Autoren: Rohit Agarwal, Krishna Agarwal, Alexander Horsch, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Neural Information Processing, 2023, Seite(n) 549-561
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-031-30105-6_46

Toward Faster Microscopy with Encoded Illumination

Autoren: Pietro Ricci, Andrea Marchese, Christos Alexandropoulos, Laura Rodríguez-Suñé, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: 19th Workshop on Information Optics, 2026, Seite(n) 33-36
Herausgeber: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-032-11838-7_7

Leistungen

Veröffentlichungen

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