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OrganVision: Technology for real-time visualizing and modelling of fundamental process in living organoids towards new insights into organ-specific health, disease, and recovery

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Leistungen

Veröffentlichungen

Engineered heart tissue with a pharmacological off-switch as a tool to study theinfluence of cardiac work on cardiomyocyte maturation

Autoren: Rajiven Srikantharajah, Tim Stüdemann, Christoph Manthey, Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

Transplanted iPSC-derived cardiomyocytes actively contribute to left ventricular function

Autoren: Tim Stüdemann, Judith Rössinger, Christoph Manthey, Birgit Geertz, Rajiven Srikantharajah, Constantin von Bibra, Aya Shibamiya, Maria Köhne, Antonius Wiehler, J. Simon Wiegert, Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

THE TRANSLATIONAL PATH TO HEART REGENERATION: GENETIC APPROACHES

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: CNIC Regeneration Symposium

Engineered heart tissue and optogenetics – a powerful and versatile combination

Autoren: Karl-Felix Müller, Bangfen Pan, Julius Hansen, Julia Krause, Grit Höppner, Tim Stüdemann, Ingke Braren, Florian Weinberger, Arne Hansen, Christine E. Gee, Torsten Christ, Thomas Eschenhagen, Justus Stenzig
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

Blind reconstruction of challenging raw data outperforms commercial 3DSIM

Autoren: I.S. Opstad, S. Acuña, S. Ströhl, F. Ströhl, B.S. Ahluwalia, K. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Laser additive fabrication of tailored micro-optics (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Marti Duocastella, Ernest Martí-Jerez, Salvatore Surdo
Veröffentlicht in: Proceedings Volume PC11989, Laser-based Micro- and Nanoprocessing XVI, 2022, Seite(n) The submissions are abstract only and open access. The videos of talks are on demand.
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.2608835

MUSICAL – a versatile super-resolution microscopy solution for gentle imaging of physical characteristics of biological samples

Autoren: Sebastian Acuña and Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: 4th International Conference On Optics, Photonics, And Lasers (OPL-2023)

MUSI-tAF: autofluorescence-based super-resolution of collagen fibrils in fixed tissues for density estimation

Autoren: B. Ghosh, S. Acuña, K. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Contractile force of transplanted cardiomyocytes actively supports heartfunction after injury

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: German Cardiac Society

A simple and flexible platform for optogenetic pacing in cardiac tissue engineering

Autoren: Bangfen Pan, Julius Hansen, Tim Stüdemann, Florian Weinberger, Thomas Eschenhagen, Justus Stenzig
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

Toward faster and deeper optical microscopes by combining ultrasound with light

Autoren: Marti Duocastella
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Spanish and Portuguese Advanced Optical Meeting (SPAOM)

OrganVision - Nanoscopic window into the life of heart

Autoren: Giulia De Poli, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: AI4future

Physics-guided Loss Functions Impact Performance of Deep-learning-based Inverse-scattering-problem Solver

Autoren: K. Agarwal, Z. Liu, M. Roy, D. K. Prasad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Photonics and Electromagnetics Research Symposium (PIERS)

Acousto-Optic Light Engineering for High-Speed Microscopy

Autoren: Martí Duocastella
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: Frontiers in Lasers and Applications

Human engineered heart tissue transplantation in a guinea pig chronic injury model

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: International Society for Heart Research

MABNET: Master Assistant Buddy Network With Hybrid Learning for Image Retrieval (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: R. Agarwal, G. Das, S. Aggarwal, A. Horsch, D.K. Prasad
Veröffentlicht in: IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP), 2023
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/icassp49357.2023.10094987

Guided U-Net aided Efficient Image Data Storing with Shape Preservation

Autoren: N. Banerjee, S. Malakar, D. K. Gupta, A. Horsch, D.K. Prasad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Asian Conference on Pattern Recognition (ACPR2023)

Project presentation

Autoren: Matteo Bregonzio
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: GO BEYOND 2022

Reconstructing 3D shape from 3D ThunderSTORM Point Clouds

Autoren: S. Jadhav, S. Majhi, A.S. Chowdhury, D.K. Prasad, K. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Quantitative phase imaging of fast dynamic events using acousto-optics and pulsed illumination

Autoren: Christos Alexandropoulos, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Gradient Light Interference Microscopy for labelfree detection of early changes in kidney cells embedded in a soft and stiff hydrogel matrix

Autoren: B. Ghosh, K. A. Fenton, K. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Stem-cell based heart repair – pharmacological perspective

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

What is Good Enough Myocardial Repair, Recovery or Remission in Chronic HF? Basic Science Perspective

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: U-Cars Symposium 2022

Finding an Appropriate Dose for Engineered Heart Tissue

Autoren: Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: Cardiovascular Bioengineering Symposium

Kilohertz frequency encoded microscopy using acousto-optic deflectors

Autoren: Andrea Marchese, Pietro Ricci, Peter Saggau, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Focus on Microscopy

Generation of human engineered heart tissue with a chemo- and optogenetic Off-On switch

Autoren: Judith Rössinger, Tim Stüdemann, Aya Shibamiya, Torsten Christ, Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The submissions were abstract only and are open access.
Herausgeber: ISHR World Congress

Codeset: Modelling Irregularly Sampled Time Series Without Imputation

Autoren: Rohit Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Github

MiShape: 3D Shape Modelling of Mitochondria in Microscopy

Autoren: Abhinanda R. Punnakkal, Suyog S Jadhav, Alexander Horsch, Krishna Agarwal, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Arxiv

Replication Data for: Multiple signal classification as a blind reconstruction approach for three-dimensional structured illumination microscopy

Autoren: Ida S. Opstad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: DataverseNO

LysoTracker Deep Red exhibits photoconversion in multi-color structured illumination microscopy (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ida Sundvor Opstad, Kenneth Bowitz Larsen, Åsa Birna Birgisdottir, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: BiorXiv
DOI: 10.1101/2023.10.29.564502

Fluorescence microscopy videos of mitochondria in H9c2 cardiomyoblasts

Autoren: Ida S. Opstad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: DataverseNO

Online Learning under Haphazard Input Conditions: A Comprehensive Review and Analysis (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Rohit Agarwal; Arijit Das; Alexander Horsch; Krishna Agarwal; Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: CoRR, Ausgabe 2, 2024
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2404.04903

"""OrganVision: An ERC funded interdisciplinary collaboration project” invited talk at IMB conference"

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2022, Seite(n) The entire event was open for all. The program was broadcast on digital stream of university. temporary link to program is given.
Herausgeber: IMB conference

Multifocus microscopy with optically sectioned axial superresolution (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ströhl, Florian; Hansen, Daniel Henry; Nager Grifo, Mireia; Birgisdottir, Åsa Birna
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2022
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2206.01257

"""Monitoring mitochondria degradation in cardiac cells"" invited talk at the NORHEART seminar ""Targeting mitochondria in cardiovascular disease"""

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2021
Herausgeber: NORHEART seminar

Tool & Video Protocol: Tool on fluorescence microscopy images of fixed cardiomyoblasts

Autoren: Abhinanda Punakkal et al.
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: JOVE

“Monitoring degradation of mitochondria in cardiac cells”, invited talk at Annual meeting of the Scandinavian Physiological Society

Autoren: A. B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: 2021, Seite(n) No abstracts or papers were submitted. Program is open access.
Herausgeber: Scandinavian Physiological Society

Latent Graph Attention for Enhanced Spatial Context (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ayush Singh, Yash Bhambhu, Himanshu Buckchash, Deepak K. Gupta, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Arxiv, 2023
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2307.04149

Fluorescence microscopy videos of mitochondria and endosomes in H9c2 cardiomyoblasts

Autoren: Ida S. Opstad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: DataverseNO

pNNCLR: Stochastic Pseudo Neighborhoods for Contrastive Learning based Unsupervised Representation Learning Problems (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Momojit Biswas, Himanshu Buckchash, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2308.06983

Towards a More Inclusive AI: Progress and Perspectives in Large Language Model Training for the S\'ami Language

Autoren: Paul, Ronny; Buckchash, Himanshu; Parida, Shantipriya; Prasad, Dilip K.
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2024
Herausgeber: Arxiv

Summer School Course Tutorial Codeset “Interpretable DL Playground”

Autoren: Ayush Somani
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Github

"""Marked increase in mitochondria degradation in engineered heart tissue during reperfusion"""

Autoren: A. B. Birgisdottir and M.N. Grifo
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Mimisbrunnr conference

MABNET: Master Assistant Buddy Network With Hybrid Learning for Image Retrieval

Autoren: R. Agarwal
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Github

Modelling Irregularly Sampled Time Series Without Imputation (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Rohit Agarwal, Aman Sinha, Dilip K. Prasad, Marianne Clausel, Alexander Horsch, Mathieu Constant, Xavier Coubez
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2309.08698

Paper Code: Virtual Labeling of Mitochondria in Living Cells using Physics-guided Deep Learning

Autoren: Ayush Somani
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: Github

Arctic LLM Workshop Hands-on Tutorial Session

Autoren: Ayush Somani
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Github

Dense Video Captioning: A Survey of Techniques, Datasets and Evaluation Protocols (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Qasim, Iqra; Horsch, Alexander; Prasad, Dilip K.
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2023
Herausgeber: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2311.02538

Fluorescence microscopy and correlative brightfield videos of mitochondria and vesicles in H9c2 cardiomyoblasts (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ida S. Opstad, Åsa B. Birgisdottir, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe vol. 11, 2024, Seite(n) Article 125, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41597-024-02970-5

Latent Graph Attention for Spatial Context in Light-Weight Networks: Multi-Domain Applications in Visual Perception Tasks (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ayush Singh, Yash Bhambhu, Himanshu Buckchash, Deepak K. Gupta, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Applied Sciences, Ausgabe 14, 2025, Seite(n) 10677, ISSN 2076-3417
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/app142210677

Modulating cardiac physiology in engineered heart tissue with the bidirectional optogenetic tool BiPOLES (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Barbora Schwarzová, Tim Stüdemann, Muhammed Sönmez, Judith Rössinger, Bangfen Pan, Thomas Eschenhagen, Justus Stenzig, J Simon Wiegert, Torsten Christ, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Pflugers Archive, European Journal of Physiology, 2023, ISSN 0031-6768
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00424-023-02869-x

Scan-less microscopy based on acousto-optic encoded illumination (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Andrea Marchese , Pietro Ricci , Peter Saggau, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: Nanophotonics, Ausgabe Volume 13, Ausgabe 1, 2024, Seite(n) 63-73, ISSN 2192-8614
Herausgeber: Berlin de Gruyter
DOI: 10.1515/nanoph-2023-0616

An UltraMNIST classification benchmark to train CNNs for very large images (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Deepak K. Gupta, Udbhav Bamba, Abhishek Thakur, Akash Gupta, Rohit Agarwal, Suraj Sharan, Ertugul Demir, Krishna Agarwal, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 11, 2024, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41597-024-03587-4

Mitophagy is induced in human engineered heart tissue after simulated ischemia and reperfusion (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Mireia Nàger, Kenneth B. Larsen, Zambarlal Bhujabal, Trine B. Kalstad, Judith Rössinger, Truls Myrmel, Florian Weinberger, Asa B. Birgisdottir
Veröffentlicht in: Journal of Cell Science, Ausgabe 138, 2025, ISSN 0021-9533
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.263408

TERMIS 2023 – European Chapter Manchester Central Conference Centre Manchester, UK March 28–31, 2023 (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Biswajoy Ghosh, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Tissue Engineering Part A, 2023, ISSN 1937-3341
Herausgeber: Mary Ann Liebert Inc.
DOI: 10.1089/ten.tea.2023.29043.abstracts

Multilingual visual question answering for visually impaired people (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ratnabali Pal, Samarjit Kar, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Discover Artificial Intelligence, Ausgabe 5, 2025, ISSN 2731-0809
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s44163-025-00482-8

Propagating Transparency: A Deep Dive into the Interpretability of Neural Networks (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ayush Somani, Alexander Horsch, Ajit Bopardikar, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Nordic Machine Intelligence, Ausgabe 4, 2024, Seite(n) 1-18, ISSN 2703-9196
Herausgeber: University of Oslo Library
DOI: 10.5617/nmi.10755

Multifocus microscopy with optical sectioning and high axial resolution (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Florian Ströhl, Daniel Henry Hansen, Mireia Nager Grifo, Åsa Birna Birgisdottir
Veröffentlicht in: Optica, Ausgabe Vol. 9, Ausgabe 11, 2022, Seite(n) 1210-1218, ISSN 2334-2536
Herausgeber: Optica Publishing Group
DOI: 10.1364/optica.468583

BMWP: the first Bengali math word problems dataset for operation prediction and solving (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Sanchita Mondal, Debnarayan Khatua, Sourav Mandal, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Discover Artificial Intelligence, Ausgabe 5, 2025, ISSN 2731-0809
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s44163-025-00243-7

Author Correction: Viewing life without labels under optical microscopes (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Biswajoy Ghosh, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe 7, 2024, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-024-06977-x

AI-driven analysis by identifying risk factors of VL relapse in HIV co-infected patients (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Abhishek Kumar, Sanchita Mondal, Debnarayan Khatua, Debashree Guha, Budhaditya Mukherjee, Arista Lahiri, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-025-07406-7

HnRNP K mislocalisation is a novel protein pathology of frontotemporal lobar degeneration and ageing and leads to cryptic splicing (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Alexander Bampton, Ariana Gatt, Jack Humphrey, Sara Cappelli, Dipanjan Bhattacharya, Sandrine Foti, Anna-Leigh Brown, Yasmine Asi, Yi Hua Low, Marco Foiani, Towfique Raj, Emanuele Buratti, Pietro Fratta, Tammaryn Lashley
Veröffentlicht in: Acta Neuropathologica, Ausgabe 142, 2021, Seite(n) 609-627, ISSN 0001-6322
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00401-021-02340-0

3D refractive index reconstruction from phaseless coherent optical microscopy data using multiple scattering-based inverse solvers - a study (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Yingying Qin, Ankit Butola, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Inverse Problems, Ausgabe volume 40, no. 1, 2023, Seite(n) article 015003, ISSN 0266-5611
Herausgeber: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1361-6420/ad0c29

Abstract 14720: Marked Increase in Mitochondria Degradation in Engineered Heart Tissue During Reperfusion (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Mireia Nager, Zambarlal Bhujabal, Kenneth B Bowitz Larsen, Trine B Kalstad, Truls Myrmel, Asa B Birgisdottir
Veröffentlicht in: Circulation, Ausgabe 146, 2023, ISSN 0009-7322
Herausgeber: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1161/circ.146.suppl_1.14720

Modulation of cardiomyocyte contractility and action potentials with chemogenetic chloride currents (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Muhammed Sönmez, Tim Stüdemann, Christoph Manthey, Anita Covic, Nancy Shehata, Junsoo Im, Barbora Schwarzova, Judith Rössinger, Rajiven Srikantharajah, Aya Shibamiya, Edzard Schwedhelm, Thomas Eschenhagen, Torsten Christ, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: The Journal of Physiology, Ausgabe 603, 2025, Seite(n) 1399-1415, ISSN 0022-3751
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1113/jp286428

Impulse initiation in engrafted pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes can stimulate the recipient heart (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Tim Stüdemann, Barbora Schwarzova, Till Schneidewind, Birgit Geertz, Constantin von Bibra, Marie Nehring, Judith Rössinger, J. Simon Wiegert, Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Stem Cell Reports, 2026, ISSN 2213-6711
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1101/2023.11.12.566756

Snapshot Quantitative Phase Imaging with Acousto-Optic Chromatic Aberration Control (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Christos Alexandropoulos, Laura Rodríguez-Suñé, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: Sensors, Ausgabe 25, 2025, Seite(n) 4503, ISSN 1424-8220
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/s25144503

Viewing life without labels under optical microscopes (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Biswajoy Ghosh, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Communication Biology, Ausgabe vol. 6, 2023, Seite(n) article number 559, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-023-04934-8

BGPCN: A BERT and GPT-2-based Relational Graph Convolutional Network for hostile Hindi information detection (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Angana Chakraborty, Subhankar Joardar, Dilip K. Prasad, Arif Ahmed Sekh
Veröffentlicht in: Array, Ausgabe 28, 2026, Seite(n) 100601, ISSN 2590-0056
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.array.2025.100601

Challenges and perspectives of heart repair with pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Thomas Eschenhagen, Florian Weinberger
Veröffentlicht in: Nature Cardiovascular Research, Ausgabe 3, 2024, Seite(n) 515-524, ISSN 2731-0590
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44161-024-00472-6

Analyzing Mitochondrial Morphology Through Simulation Supervised Learning (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Abhinanda Ranjit Punnakkal, Gustav Godtliebsen, Ayush Somani, Sebastian Andres Acuna Maldonado, Åsa Birna Birgisdottir, Dilip K. Prasad, Alexander Horsch, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Journal of Visualized Experiments, 2024, ISSN 1940-087X
Herausgeber: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/64880-v

Molecular histopathology of matrix proteins through autofluorescence super-resolution microscopy (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Biswajoy Ghosh, Jyotirmoy Chatterjee, Ranjan Rashmi Paul, Sebastian Acuña, Pooja Lahiri, Mousumi Pal, Pabitra Mitra, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 14, 2024, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-61178-0

Label-free correlative morpho-chemical tomography of 3D kidney mesangial cells (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ankit Butola, Biswajoy Ghosh, Jaena Park, Minsung Kwon, Alejandro De la Cadena, Sudipta S Mukherjee, Rohit Bhargava, Stephen A. Boppart, Krishna Agarwal
Veröffentlicht in: Journal of Biomedical Optics, Ausgabe 31, 2026, ISSN 1083-3668
Herausgeber: S P I E - International Society for Optical Engineering
DOI: 10.1117/1.jbo.31.3.036501

High-resolution visualization and assessment of basal and OXPHOS-induced mitophagy in H9c2 cardiomyoblasts (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Gustav Godtliebsen, Kenneth Bowitz Larsen, Zambarlal Bhujabal, Ida S Opstad, Mireia Nager, Abhinanda R Punnakkal, Trine B Kalstad, Randi Olsen, Trine Lund, Dilip K Prasad, Krishna Agarwal, Truls Myrmel, Asa Birna Birgisdottir
Veröffentlicht in: Autophagy, Ausgabe vol. 19, issue 10, 2023, Seite(n) 2769-2788, ISSN 1554-8627
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15548627.2023.2230837

Video-rate quantitative phase imaging with dynamic acousto-optic defocusing (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Christos Alexandropoulos, Martí Duocastella
Veröffentlicht in: Optics and Lasers in Engineering, Ausgabe Volume 169, October 2023, 2023, Seite(n) article 107692, ISSN 0143-8166
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.optlaseng.2023.107692

Virtual labeling of mitochondria in living cells using correlative imaging and physics-guided deep learning (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ayush Somani, Arif Ahmed Sekh, Ida S. Opstad, Åsa Birna Birgisdottir, Truls Myrmel, Balpreet Singh Ahluwalia, Alexander Horsch, Krishna Agarwal, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Biomedical Optics Express, Ausgabe Vol. 13, Ausgabe 10, 2022, Seite(n) 5495-5516, ISSN 2156-7085
Herausgeber: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.464177

Reconstructing 3D Geometries of sub-cellular structures from SMLM clouds

Autoren: S. Jadhav
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Multiple Signal Classification Algorithm: A computational microscopy tool for fluorescence microscopy

Autoren: Sebastián Andrés Acuña Maldonado
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: MUNIN, UiT

Presenting CODS (Cell Organelle Dynamic Simulation)

Autoren: Aaron Celeste
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Generative Adversarial Networks For Three-Dimensional Multi-Channel Virtual Fluorescent Staining (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Lorenzo Venieri
Veröffentlicht in: 2024
Herausgeber: Università di Bologna
DOI: 10.5281/zenodo.13382862

Study of mitochondrial transfer in hiPSC derived cardiomyocytes and engineered heart tissue

Autoren: Kristiana Imsa
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: UiT The Arctic University of Norway

Encoded illumination for high-speed optical microscopy

Autoren: Eva Maria Torres-Riera
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Universitat Politecnica de Catalunya

Auxiliary Network: Scalable and Agile Online Learning for Dynamic System with Inconsistently Available Inputs (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Rohit Agarwal, Krishna Agarwal, Alexander Horsch, Dilip K. Prasad
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Neural Information Processing, 2023, Seite(n) 549-561
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-031-30105-6_46

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