Cel
We propose to develop an integrated microscopical approach to probe structure-function relationships of large uncrystallised macromolecular assemblies of high resolution. We aim at elucidating both the structural and the functional aspects of the molecules at the resolution level of 12 nm. Our problem-oriented methodology development is directly supported by the availability of recombinant protein (in its wild type and in mutated forms). Our test system is the type 3 isoforrn of the ryanodine receptor calcium release channel family. The integrated approach synergetically combines: 1) Three-dimensional (3D) cryo-electron microscopy of single macromolecules embedded in vitreous ice using the "angular reconstitution" method [Serysheva et al., 1995]. One objective is to push the attainable resolution to the 1 nm level, which resolution is feasible [R. Henderson, Quart. Rev. Bio phys 28 (1995) 171-193]. A Simple Super Computer (SSC) consisting of an array of Pentium-based computers (to be programmed by subcontractor Image Science Software GmbH) will provide the necessary computing resources. 2) Molecular Recognition Force Microscopy (MRFM, Hinterdorfer et al., 1996). Atomic force microscopy (AFM) [Z. Shao, J. Yang, Quart. Rev. Biophys 28 (1995) 195-251] is combined with molecular recognition by attaching an antibody to the AFM tip via a flexible linker molecule. This novel type of scanning probe microscope will be used to map antigenic sites in the RyR3 protein. 3) Single Dye Tracing (SDT, Schmidt et al., 1995) for time-resolved (ms range) imaging of single fluorescent molecules (label on antibodies against RyR3 in this proposal) within a membrane. This technique can be combined with the patch-clamp techniques which combination allows the measurement of the functional activities of single channels while quantitatively observing the behavior of the dyes (angular and lateral motion, co-localization). The combination of the above techniques (Partners 1 and 3), in close interaction with the supporting biochemistry (Partner 2) providing specific clones and antibodies, will allow unprecedented insights into structure-function relations at resolution levels to 1 nm. Although X-ray crystallography may provide resolutions of 0.3 nm (assuming one manages to crystallise the protein), our approach (which uses no crystals at all) provides fast structural determinations of different isoforms in various conformations and allows direct correlations between functional activity and 3D structural organization.
The partners in this project are international leaders who have made major discoveries in their fields.
The Linz group has pioneered the MRFM and the SDT technologies. The London group has invented the angular reconstitution approach with which a number of 3D structures were recently determined. The Milano group was the first to describe the RyR3 isoform.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze informatyka oprogramowanie
- nauki przyrodnicze nauki o Ziemi i pokrewne nauki o środowisku geologia mineralogia krystalografia
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia nieorganiczna berylowce
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka mikroskopia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
4040 Linz - Auhof
Austria
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.