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Untangling the network of RNA silencing pathways in plants

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Silenziamento dell'RNA nelle alghe verdi

Silenziamento dell'RNA nelle alghe verdi

Il silenziamento dell'RNA è un aspetto complesso e poco conosciuto dei sistemi biologici attraverso il quale piccole molecole di RNA possono sopprimere l'espressione genica. La C. reinhardtii è un'alga unicellulare che potrebbe costituire un modello utile per aiutare gli scienziati a capire meglio il silenziamento dell'RNA nelle piante. Il progetto RNAI IN PLANTS ("Untangling the network of RNA silencing pathways in plants"), finanziato dall'UE, si proponeva di caratterizzare vari percorsi di silenziamento dell'RNA nella C. reinhardtii. Per studiare questi percorsi, i ricercatori hanno dovuto sviluppare una tecnica per introdurre mutazioni nei geni di silenziamento dell'RNA. È stato individuato un metodo valido nel primo anno del progetto. Questo metodo è stato applicato per produrre 22 C. reinhardtii mutanti con difetti in diversi geni coinvolti nel silenziamento dell'RNA. Questi sono stati divisi in tre gruppi sulla base di quali molecole dell'RNA erano ancora espresse. Un'altra tecnica sviluppata di recente è stata usata per identificare i geni che erano mutati. Diversi mutanti avevano un gene Ago3 mutato (importante per il controllo del silenziamento dell'RNA) mentre altri avevano un enzima DCL3 mutato (importante per elaborare le trascrizioni dell'RNA). Le informazioni raccolte durante il progetto sono state usate per mappare le mutazioni nel genoma del C. reinhardtii. Uno dei principali contributi di RNAI IN PLANTS è stata la determinazione di un metodo affidabile per studiare più a fondo il silenziamento dell'RNA in questo modello di organismo.

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