Wyciszanie RNA w zielenicach

Wyciszanie RNA to złożony i słabo poznany aspekt systemów biologicznych, polegający na tym, że niewielkie cząsteczki RNA mogą hamować ekspresję genu. C. reinhardtii jest jednokomórkową zielenicą, która mogłaby posłużyć jako użyteczny model ułatwiający naukowcom zrozumienie mechanizmu wyciszania RNA w roślinach. Finansowany ze środków UE projekt "Untangling the network of RNA silencing pathways in plants" (RNAI IN PLANTS) ma na celu opisanie różnych ścieżek wyciszania RNA w C. reinhardtii. Aby zbadać te ścieżki, naukowcy musieli wypracować technikę wprowadzania mutacji do genów wyciszających RNA. Skuteczną metodę opracowano w pierwszym roku projektu. Metodę tę zastosowano do wyprodukowania 22 mutantów C. reinhardtii z defektami w różnych genach uczestniczących w wyciszaniu RNA. Zaklasyfikowano je do trzech grup, w zależności od tego, które cząsteczki RNA wciąż podlegały ekspresji. Inną nowo opracowaną technikę zastosowano do identyfikacji genów, które zostały zmutowane. Kilka mutantów miało zmutowany gen Ago3 (ważny ze względu na kontrolę wyciszania RNA), tymczasem inne miały zmutowany enzym DCL3 (ważny przy transkrypcji RNA). Informacje zgromadzone podczas projektu zostały wykorzystane do oznaczenia mutacji na genomie C. reinhardtii. Istotnym wkładem projektu RNAI IN PLANTS jest utworzenie niezawodnej metody dalszego badania wyciszania RNA w tym organizmie modelowym.