«Small is beautiful» dans le monde de l'ARN
L'ARN 6S est abondant dans les bactéries et se lie à la polymérase de l'ARN (ARNP sigma70). Comme une intendante, sigma70 aide à transcrire la plupart des gènes dans les cellules en croissance. Le projet NCRNAP («Structural and functional studies of the interaction between non coding RNAs and the RNA polymerase»), financé par l'UE, a étudié la structure de l'ARN 6S en complexe avec l'ARNP. Les chercheurs du projet ont réussi à isoler l'ARN 6S dans Escherichia coli. Par électro-élution et chromatographie d'affinité, ils ont produit un échantillon de grande pureté dans des quantités de l'ordre du milligramme pour des analyses et des études structurelles continues. Des protocoles ont été établis pour la production du complexe de nucléoprotéine in vivo. L'échantillon a été analysé par la cryo-microscopie électronique, la spectroscopie de masse non dissociante et la diffusion de rayons X à petit angle. Le développement d'un modèle à basse résolution d'ARNP-sigma70 se poursuit. Il a été observé que les petits ARN non codants forment des complexes avec les ARN polymérases chez les animaux supérieurs et les plantes avec un vrai noyau. Cela devrait permettre de mieux comprendre à l'avenir la régulation de l'expression des gènes dans les systèmes plus sophistiqués. De plus, l'ARNP bactérien est la cible de nombreuses catégories d'antibiotiques et des informations structurelles pourraient servir à découvrir de nouveaux composés candidats.
Mots‑clés
ARN non codants, expression génique, ARN 6S, ARN polymérase, études fonctionnelles
