Małe jest piękne w świecie RNA
6S RNA jest powszechne u bakterii i wiąże się z polimerazą sigma 70 RNA (sigma70-RNAP). Uczestnicząca w metabolizmie podstawowym sigma 70 pomaga w transkrypcji większości genów podczas wzrostu komórek. W ramach finansowanego przez UE projektu "Structural and functional studies of the interaction between non coding RNAs and the RNA polymerase" (NCRNAP) badano strukturę 6S RNA w kompleksie z RNAP. Naukowcy biorący udział w projekcie z powodzeniem wyizolowali 6S RNA z Escherichia coli. Przy pomocy elektroelucji i chromatografii powinowactwa wytworzyli próbkę o wysokiej czystości w ilościach miligramowych, celem kontynuowania analizy i badań strukturalnych. Ustanowiono protokoły produkcji in vivo kompleksów nukleoprotein. Próbkę poddano analizie używając mikroskopii krioelektronowej, niedysocjacyjnej spektroskopii masowej oraz techniki rozpraszania promieniowani rentgenowskich pod małymi kątami. Trwa opracowywanie modelu sigma70-RNAP o niskiej rozdzielczości. Odkryto, że małe niekodujące RNA mogą tworzyć kompleksy z polimerazami RNA u wyższych zwierząt i roślin z wyodrębnionym jądrem komórkowym. To otwiera drogę do lepszego wyjaśnienia regulacji ekspresji genetycznej w bardziej złożonych systemach. Co więcej, bakteryjna RNAP jest celem molekularnym wielu klas antybiotyków i informacje strukturalne mogą posłużyć do odkrycia nowych związków wiodących.
Słowa kluczowe
Niekodujące RNA, ekspresja genów, RNA 6S, polimeraza RNA, badania czynnościowe
