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Structural and functional studies of the interaction between non coding RNAs and the RNA polymerase

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Piccolo è bello nel mondo degli RNA

I piccoli RNA non codificanti hanno un ruolo chiave nella regolazione dell’espressione genica in tutte le forme di vita. La ricerca recente ha evidenziato il loro ruolo nella regolazione del materiale del DNA, la cromatina.

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6S RNA abbonda nei batteri e si lega alla RNA polimerasi sigma70 (sigma70-RNAP). sigma70, fattore sigma di riferimento, aiuta a trascrivere la maggior parte dei geni nelle cellule in crescita. Il progetto NCRNAP (“Structural and functional studies of the interaction between non coding RNAs and the RNA polymerase”), finanziato dall’UE, ha studiato la struttura di 6S RNA nel complesso con RNAP. I ricercatori del progetto sono riusciti a isolare 6S RNA da Escherichia coli. Utilizzando elettroeluizione e cromatografia di affinità hanno prodotto un campione di elevata purezza in quantità di milligrammi per un’analisi continuativa e studi strutturali. Sono stati istituiti i protocolli per la produzione del complesso di nucleoproteine in vivo. Il campione è stato analizzato utilizzando microscopia crioelettronica, spettroscopia di massa non dissociante e diffusione dei raggi X a piccoli angoli. Lo sviluppo di un modello a bassa risoluzione di sigma70-RNAP continua. Si è scoperto che i piccoli RNA non codificanti formano complessi con le RNA polimerasi in animali e piante superiori con un vero nucleo. Ciò apre la strada a una migliore comprensione della regolazione dell’espressione genica in sistemi più sofisticati. Inoltre la RNAP batterica è il bersaglio di molte classi di antibiotici, e le informazioni strutturali potrebbero essere utilizzate per scoprire nuovi composti guida.

Parole chiave

RNA non codificanti, espressione genica, 6S RNA, RNA polimerasi, studi funzionali

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