Capire il patogeno dell’antracnosi da Ascochyta
L’antracnosi da Ascochyta è una malattia fungina che colpisce i piselli, i ceci e altri importanti colture leguminose. Attualmente costituisce un rilevante fattore limitante della produttività di tali colture, preziose in funzione di alimenti e per la capacità di migliorare i terreni. Con il supporto di un finanziamento dell’UE, il progetto ASCOTRANSSEQ si è impegnato per capire meglio il fungo che causa l’antracnosi da Ascochyta, utilizzando tecniche di sequenziamento ad alta intensità di elaborazione. In particolare, i ricercatori hanno cercato geni già associati a patogenicità (vale a dire infettività e danni alla pianta). Un risultato importante del progetto è stato una sequenza canonica del genoma di una specie di Ascochyta, l’A. rabiei, messa insieme ricavandola da quattro varianti del fungo. Un altro branca del progetto ha identificato tutti i geni trascritti dal fungo durante la sua crescita in presenza e assenza del suo ospite. Nell’ambito di tale processo sono stati identificati oltre 22 000 geni, di cui 597 risultano maggiormente espressi quando il fungo sta crescendo su una pianta. Da tali informazioni, i ricercatori hanno determinato singole variazioni genetiche con consentono al fungo di infettare la pianta. Tra queste, ASCOTRANSSEQ ha identificato i geni che disattivano i sistemi di difesa della pianta e gli enzimi che deteriorano la membrana cellulare della pianta, nonché le tossine che uccidono le cellule della pianta e gli enzimi che assimilano le cellule morte della pianta. ASCOTRANSSEQ ha prodotto un’ampia quantità di informazioni sulla genetica del fungo Ascochyta. Ne deriverà un maggior risalto per la ricerca sui metodi per prevenire e trattare l’antracnosi da Ascochyta, con probabili effetti di ampia portata sull’agricoltura delle leguminose.
Parole chiave
Antracnosi da Ascochyta, leguminosa, malattia fungina, sequenziamento del genoma, virulenza
