Análisis rápidos y económicos basados en el ADN para la detección de E.coli
Los sistemas comerciales convencionales para identificar esta bacteria se consideraban demasiado caros y lentos. Tampoco eran adecuados para analizar el gran volumen de muestras usadas en un programa de detección. En respuesta a esto, el proyecto ANTRES ha desarrollado un sistema fiable y rentable para identificar la bacteria E.coli mediante hibridación del ADN en filtro. Los investigadores eligieron dos genes objetivo diferentes para desarrollar sondas de ADN para especies específicas, en concreto el gen lacZ, que codifica la galactosidasa, y el gen uidA, codificador de la glucuronidasa. Estos genes se han empleado anteriormente para crear sondas de ADN destinadas a la identificación de la E.coli. Se realizaron experimentos de hibridación en fase sólida con cada una de las sondas comparándolas con cepas de referencia de varias especies de bacterias. Durante este proceso se observó que la sonda de uidA era la más precisa de las dos y fue elegida para profundizar en su desarrollo. La sonda de uidA fue validada con una submuestra de aislados. Los resultados se compararon con los conseguidos usando el sistema convencional de identificación de bacterias API 20E. Los dos métodos ofrecieron resultados similares en casi todos los aislados. Por tanto, el método de hibridación en fase sólida basado en la sonda de uidA fue considerado una técnica adecuada para la detección de la E.coli. El nuevo sistema requería menos tiempo y una décima parte del coste de la técnica convencional. Por tanto, fue adoptado para la detección de la E.coli en el estudio de referencia de ARS.
