Szybkie i tanie badania DNA w kierunku E. coli
Konwencjonalne komercyjne systemy identyfikacji E. coli zostały uznane za kosztowne i czasochłonne. Nie nadawały się one również do badania większej liczby próbek w ramach programu badań przesiewowych. Konsekwencją było opracowanie w ramach projektu ANTRES rzetelnego i niedrogiego systemu identyfikacji bakterii E. coli przy zastosowaniu metody hybrydyzacji DNA z użyciem filtrów. Aby opracować specyficzne gatunkowo sondy DNA, naukowcy wybrali dwa różne geny docelowe. Był to gen lacZ kodujący galaktozydazę i gen uidA kodujący glukuronidazę. Te geny były wcześniej stosowane do tworzenia sond DNA do identyfikacji bakterii E. coli. Każda sonda została przebadana w serii doświadczeń typu blot z koloniami przy zastosowaniu szczepów referencyjnych różnych gatunków bakterii. Podczas tego procesu okazało się, że sonda uidA jest dokładniejsza i wybrano ją do dalszego rozwoju. Sonda uidA została sprawdzona za pomocą podrzędnej próbki izolatów. Wyniki zostały porównane z wynikami uzyskanymi za pomocą konwencjonalnego systemu identyfikacji bakteryjnej API 20E. Te dwie różne metody dały zgodne wyniki w przypadku większości izolatów. Dlatego metoda typu blot z koloniami oparta na sondzie uidA została uznana za technikę odpowiednią do identyfikacji bakterii E. coli. Nowy system wymaga mniej czasu i jest 10-krotnie tańszy od konwencjonalnej techniki. Został więc przyjęty do stosowania w identyfikacji bakterii E. coli w ramach badania bazowego ARS.
