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Structural and functional genomics tools for cattle research

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Construcción de un mapa BAC del genoma bovino

Un equipo de científicos ha construido un mapa del cromosoma artificial bacteriano («bacterial artificial chromosome» o BAC) de la vaca, que se ha convertido en un recurso valioso para la comunidad investigadora dedicada a la genómica bovina.

Salud

El proyecto BOVGEN ha creado herramientas genómicas avanzadas que permiten a los investigadores identificar los genes responsables de rasgos importantes del ganado. Se secuenció un conjunto de 20.000 fragmentos no redundantes de ADN complementario (ADNc) que se utilizaron para construir un mapa genético de alta densidad del genoma bovino. Esto ayudó a determinar la posición de los genes candidatos para los rasgos cartografiados. La información sobre los mapas de secuencia genética y los de híbridos de radiación se utilizó para construir un mapa físico de BAC de todo el genoma bovino. Esto, a su vez, se utilizó para la secuenciación del ADN objetivo. Se utilizaron cromosomas bacterianos para albergar los fragmentos de cromosomas bovinos. Estos anfitriones generaron muchas copias idénticas, o clones, de un fragmento de ADN bovino. El mapa BAC es una colección de clones que se superponen parcialmente hasta representar la totalidad del genoma. Los clones adyacentes y que están parcialmente superpuestos (o cóntigos) del BAC que presentaban secuencias finales o que llevaban incorporados marcadores genéticos ayudaron a determinar la posición y orientación de las secuencias. El mapa no sólo ayudó a identificar rasgos útiles, sino que además será de gran ayuda para las labores futuras de secuenciación del genoma completo del ganado. El mapa BAC y la información sobre la secuencia se pueden utilizar para seleccionar con mayor precisión el ganado que sea genéticamente superior para determinadas necesidades específicas. Éstas pueden incluir que la carne de vacuno sea más magra, una mayor producción de leche, la reducción de las necesidades de alimentación o la mejora de la salud. Los datos del proyecto BOVGEN se han puesto a disposición del «Proyecto internacional de secuenciación del genoma bovino» (International Bovine Genome Sequencing Project) para ayudar en el ensamblaje de las secuencias.

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