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Glycomics by High-throughput Integrated Technologies

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Un diagnostic précoce du cancer avec une simple prise de sang

Les protéines liées à des glucides sont d'importants biomarqueurs du cancer. Des chercheurs européens ont présenté de nouvelles améliorations dans l'analyse à haut débit (AHD) des échantillons de sang, permettant ainsi une détection précoce et un meilleur pronostic.

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La glycosylation des protéines, à savoir la liaison enzymatique des glucides aux acides aminés des protéines, est une étape ultérieure à la traduction dans la synthèse des protéines. Elle est importante pour les processus physiologiques et des maladies, dont le cancer. En vue de mettre au point des technologies permettant une analyse AHD rapide et précise de la glycosylation à partir d'un simple échantillon de sang, les chercheurs ont lancé le projet GLYCOHIT (Glycomics by high-throughput integrated technologies) financé par l'UE. L'un des principaux objectifs était l'amélioration des techniques en place. À cette fin, le groupe a mis au point une méthode ultra-performante basée sur la chromatographie liquide d'interactions hydrophiles (UPLC-HILIC) pour l'analyse d'une liaison glucide/protéine spécifique dans les échantillons cliniques. La méthode UPLC-HILIC et les techniques d'analyse des données ont été validées à l'aide d'échantillons prélevés sur des patients atteints d'un cancer du sein, et de nouveaux marqueurs de glycane potentiels ont été identifiés. Les glucides n-glycosylés, comme l'asparagine, sont associés à la pathogenèse du cancer. Des chercheurs ont mis au point une méthode AHD pour la chromatographie liquide associée à la spectrométrie de masse en tandem avec ionisation à pression atmosphérique (CL-SM/SM) en vue d'identifier les sites de glycosylation des protéines grâce à une méthode d'analyse automatique. De nouvelles méthodes ont également été mises au point pour accélérer l'analyse et améliorer la sensibilité de la détection des glycobiomarqueurs. Les microréseaux de lectine utilisent les lectines (des protéines qui se lient à des sucres spécifiques) immobilisées sur un substrat afin de détecter la présence de glycane dans un échantillon. Les microréseaux de lectine utilisent les lectines (des protéines qui se lient à des sucres spécifiques) immobilisées sur un substrat afin de détecter la présence de glycane dans un échantillon. Les chercheurs ont mis au point de nouvelles sources de lectines, dont des analogues de lectine ou des molécules capables de se lier aux glycanes. Cette approche a permis la création de réseaux de lectine autorisant une détection rapide et fiable des glycobiomarqueurs et l'analyse des glycoprofils dans les échantillons volumineux. Pour conclure, le projet GLYCOHIT a mis au point des groupes de sondes sans marquage permettant une analyse rapide, précise et sensible des glycobiomarqueurs associés au cancer. L'application de nouveaux biomarqueurs et de nouvelles technologies de laboratoire devrait limiter les délais de diagnostic, passant ainsi de plusieurs jours à quelques minutes seulement.

Mots‑clés

Cancer, biomarqueurs, glycosylation des protéines, GLYCOHIT, lectines, microréseaux

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