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Glycomics by High-throughput Integrated Technologies

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La diagnosi precoce del cancro con un semplice esame del sangue

Le proteine con legami glucidici sono importanti biomarcatori del cancro. Alcuni scienziati europei hanno dimostrato nuovi sviluppi nell’analisi ad alta processività (HTP) di campioni clinici ematici per un rilevamento precoce e una diagnosi migliore.

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La glicosilazione delle proteine, il legame enzimatico degli zuccheri con gli aminoacidi delle proteine, è un passo post-traduzionale nella produzione delle proteine importante per i processi fisiologici e patologici, incluso il cancro. Per sviluppare tecnologie che possano essere utilizzate per un’analisi HTP rapida e accurata della glicosilazione da un semplice esame del sangue, gli scienziati hanno avviato il progetto GLYCOHIT (Glycomics by high-throughput integrated technologies). Una delle priorità era il miglioramento delle tecniche esistenti. A tal fine il consorzio ha sviluppato un metodo solido e sensibile di cromatografia liquida ultraperformante e cromatografia a interazione idrofila (UPLC-HILIC) per l’analisi di uno specifico legame zucchero-proteina nei campioni clinici. Il metodo UPLC-HILIC e le tecniche di analisi dei dati sono stati valutati utilizzando campioni da pazienti con carcinoma mammario e sono stati identificati nuovi potenziali marcatori di glicani. Gli zuccheri legati all’azoto dell’asparagina (N-glicani) sono associati alla patogenesi del cancro. Gli scienziati hanno sviluppato un metodo HTP per cromatografia liquida abbinato a spettrometria di massa tandem con ionizzazione chimica a pressione atmosferica (LC-MS/MS) per identificare i siti di glicosilazione delle proteine insieme a un metodo di analisi automatizzato. Sono stati sviluppati nuovi metodi anche per velocizzare l’analisi e migliorare la sensibilità di rilevamento dei glicobiomarcatori. I microarray con metodo lectina utilizzano le lectine (proteine che legano zuccheri specifici) immobilizzate su un substrato per rilevare la presenza di glicani in un campione. I ricercatori hanno sviluppato nuove fonti di lectine, inclusi imitatori della lectina specificamente progettati o molecole leganti i glicani. Questo sforzo ha portato alla creazione di piattaforme di array di lectine per il rilevamento rapido ed efficace dei glicobiomarcatori a l’analisi dei profili glico-proteici in grandi serie di campioni. In conclusione GLYCOHIT ha sviluppato piattaforme di sensori senza marcatori né coloranti per analizzare in modo rapido, specifico e sensibile i glicobiomarcatori associati al cancro. L’applicazione di nuovi biomarcatori e tecnologie di laboratorio nella pratica clinica dovrebbe ridurre la durata della diagnosi dagli attuali giorni a pochi minuti.

Parole chiave

Cancro, biomarcatori, glicosilazione delle proteine, GLYCOHIT, lectine, microarray

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