Tissue-wide identification of genome alterations in cancer

Projektinformationen

TWIGA

ID Finanzhilfevereinbarung: 101021019

DOI

10.3030/101021019

EK-Unterschriftsdatum 12 Juli 2021

Startdatum 1 Oktober 2021

Enddatum 30 September 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 631 250,00

EU-Beitrag

€ 2 631 250,00

Koordiniert durch

KUNGLIGA TEKNISKA HOEGSKOLAN
Sweden

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (4)

Spatially resolved clonal copy number alterations in benign and malignant tissue.

Autoren: Erickson A, He M, Berglund E, Marklund M, Mirzazadeh R, Schultz N, Kvastad L, Andersson A, Bergenstråhle L, Bergenstråhle J, Larsson L, Alonso Galicia L, Shamikh A, Basmaci E, Díaz De Ståhl T, Rajakumar T, Doultsinos D, Thrane K, Ji AL, Khavari PA, Tarish F, Tanoglidi A, Maaskola J, Colling R, Mirtti T, Hamdy FC, Woodcock DJ, Helleday T, Mills IG, Lamb AD, Lundeberg J.
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe Aug 608 (7922), 2022, Seite(n) 360-367, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05023-2

Spatial landmark detection and tissue registration with deep learning

Autoren: Markus Ekvall, Ludvig Bergenstråhle, Alma Andersson, Paulo Czarnewski, Johannes Olegård, Lukas Käll, Joakim Lundeberg
Veröffentlicht in: Nature Methods, 2024, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02199-5

Expansion spatial transcriptomics

Autoren: Yuhang Fan, Žaneta Andrusivová, Yunming Wu, Chew Chai, Ludvig Larsson, Mengxiao He, Liqun Luo, Joakim Lundeberg, Bo Wang
Veröffentlicht in: Nature Methods, 2023, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01911-1

Spatial landscapes of cancers: insights and opportunities

Autoren: Julia Chen, Ludvig Larsson, Alexander Swarbrick, Joakim Lundeberg
Veröffentlicht in: Nature Reviews Clinical Oncology, Ausgabe 21, 2024, Seite(n) 660-674, ISSN 1759-4774
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41571-024-00926-7

Other (1)

SnapShot: Spatial transcriptomics

Autoren: Ludvig Larsson 1, Ludvig Bergenstråhle 1, Mengxiao He 1, Zaneta Andrusivova 1, Joakim Lundeberg 1
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 185, 15, 2022, Seite(n) 2840-2840
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.cell.2022.06.002

Non-peer reviewed articles (1)

Learning Stationary Markov Processes with Contrastive Adjustment

Autoren: Bergenstråhle, Ludvig; Lagergren, Jens; Lundeberg, Joakim
Veröffentlicht in: arXiv, Ausgabe 2, 2023, ISSN 2331-8422
Herausgeber: ArXiv.org
DOI: 10.48550/arxiv.2303.05497