Tissue-wide identification of genome alterations in cancer

Informazioni relative al progetto

TWIGA

ID dell’accordo di sovvenzione: 101021019

DOI

10.3030/101021019

Data della firma CE 12 Luglio 2021

Data di avvio 1 Ottobre 2021

Data di completamento 30 Settembre 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 631 250,00

Contributo UE

€ 2 631 250,00

Coordinato da

KUNGLIGA TEKNISKA HOEGSKOLAN
Sweden

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (4)

Spatially resolved clonal copy number alterations in benign and malignant tissue.

Autori: Erickson A, He M, Berglund E, Marklund M, Mirzazadeh R, Schultz N, Kvastad L, Andersson A, Bergenstråhle L, Bergenstråhle J, Larsson L, Alonso Galicia L, Shamikh A, Basmaci E, Díaz De Ståhl T, Rajakumar T, Doultsinos D, Thrane K, Ji AL, Khavari PA, Tarish F, Tanoglidi A, Maaskola J, Colling R, Mirtti T, Hamdy FC, Woodcock DJ, Helleday T, Mills IG, Lamb AD, Lundeberg J.
Pubblicato in: Nature, Numero Aug 608 (7922), 2022, Pagina/e 360-367, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05023-2

Spatial landmark detection and tissue registration with deep learning

Autori: Markus Ekvall, Ludvig Bergenstråhle, Alma Andersson, Paulo Czarnewski, Johannes Olegård, Lukas Käll, Joakim Lundeberg
Pubblicato in: Nature Methods, 2024, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02199-5

Expansion spatial transcriptomics

Autori: Yuhang Fan, Žaneta Andrusivová, Yunming Wu, Chew Chai, Ludvig Larsson, Mengxiao He, Liqun Luo, Joakim Lundeberg, Bo Wang
Pubblicato in: Nature Methods, 2023, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01911-1

Spatial landscapes of cancers: insights and opportunities

Autori: Julia Chen, Ludvig Larsson, Alexander Swarbrick, Joakim Lundeberg
Pubblicato in: Nature Reviews Clinical Oncology, Numero 21, 2024, Pagina/e 660-674, ISSN 1759-4774
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41571-024-00926-7

Other (1)

SnapShot: Spatial transcriptomics

Autori: Ludvig Larsson 1, Ludvig Bergenstråhle 1, Mengxiao He 1, Zaneta Andrusivova 1, Joakim Lundeberg 1
Pubblicato in: Cell, Numero 185, 15, 2022, Pagina/e 2840-2840
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.cell.2022.06.002

Non-peer reviewed articles (1)

Learning Stationary Markov Processes with Contrastive Adjustment

Autori: Bergenstråhle, Ludvig; Lagergren, Jens; Lundeberg, Joakim
Pubblicato in: arXiv, Numero 2, 2023, ISSN 2331-8422
Editore: ArXiv.org
DOI: 10.48550/arxiv.2303.05497