Opis projektu
Wizualizacja eksportu ludzkiego mRNA
Regulacja ekspresji genów w komórkach eukariotycznych zachodzi na różnych etapach transkrypcji, a także przed tym procesem i po jego zakończeniu. Nowo wytworzone przekaźnikowe RNA (mRNA) muszą zostać wyselekcjonowane i wyeksportowane z jądra komórkowego do cytoplazmy, gdzie ulegają translacji w białka. Zespół finansowanego ze środków Unii Europejskiej projektu TREXSpliceosome skupia się na procesie eksportu mRNA z jądra oraz na mechanizmie, dzięki któremu kompleks transkrypcyjno-eksportowy (TREX) wybiera i przesyła cząsteczki mRNA. Biorąc pod uwagę, że działanie TREX jest związane z wieloma chorobami, w tym z nowotworami, wyniki tych badań mogą przełożyć się w dużym stopniu na stabilność genomu.
Cel
Eukaryotic mRNA is transcribed, capped, spliced and poly-adenylated in the nucleus, but translated in the cytoplasm. Nuclear mRNA export is a key step in gene expression which is still poorly understood in mechanistic detail, but the multi-subunit transcription and export (TREX) complex plays a central role in the process. TREX bridges transcription, RNA processing and packaging to facilitate mRNA export licensing. Understanding TREX function is relevant to human health, as TREX protects against transcription-associated genome instability, is required for development, and has been linked to human disease, including several types of cancer. Despite its importance, many questions about TREX function remain, in particular, how is TREX recruited to mRNA and how is the export factor NXF1-NXT1 deposited on mature mRNA?
Here, I propose to study the mechanistic basis of TREX recruitment and function using structural biology and imaging approaches. The host laboratory recently purified an endogenous multi-megadalton spliceosome–TREX complex, whose three-dimensional cryo-EM structure I aim to determine. This will reveal how TREX is recruited to maturing mRNA to read out and relay the presence of activating and repressive marks to, ultimately, decide whether or not to export the mRNA. In close collaboration with the Balzarotti lab (IMP), I will use super-resolution microscopy (MINFLUX) to visualize post-recruitment functions of TREX in situ and test models of how deposition of the mRNA export factor NXF1-NXT is linked to export competence. Taken together, the proposed work will significantly enhance our understanding of TREX as a chaperone of nuclear mRNA processing and export.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki fizyczneoptykamikroskopiamikroskopia superrozdzielcza
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaonkologia
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaRNA
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiologia molekularnabiologia strukturalna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
1030 Wien
Austria