Opis projektu
Lepsza rekonstrukcja drzew filogenetycznych
Drzewo filogenetyczne pokazuje zależności ewolucyjne pomiędzy osobnikami i całymi populacjami lub gatunkami. Powiązania te mają wiele zastosowań – od badania dynamiki epidemii do analizy dynamiki specjacji i wymierania grup gatunków. Zespół finansowanego ze środków Unii Europejskiej projektu PHYLOBD zamierza zająć się rekonstrukcją drzew filogenetycznych z danych sekwencyjnych. Wymaga to określenia prawdopodobieństwa wstępnego drzewa, na przykład modelu reprezentującego wcześniejsze wyobrażenie o dynamice ewolucji. Obecnie są one zbyt uproszczone i często niespójne z modelem wykorzystywanym na późniejszych etapach do wyciągania wniosków na temat dynamiki ewolucji. W ramach projektu badacze dopracują w pełni bayesowskie wnioskowanie filogenetyczne dzięki realizacji sprawnych i wydajnych wdrożeń trzech modeli prawdopodobieństwa wstępnego. W ten sposób opracują narzędzia pozwalające na rzetelne przedstawianie niejednorodnych wyników wnioskowania bayesowskiego.
Cel
"Phylogenetic trees represent the evolutionary relationships among individuals, populations, or species. These trees also contain information on the evolutionary dynamics in the underlying population, and can be used in a wide range of applications, from studying the dynamics of an epidemic to analyzing the speciation and extinction dynamics of groups of species.
Reconstructing phylogenetic trees from sequence data requires specifying a ""tree prior"", i.e. a model that represents a prior idea about the evolutionary dynamics. The adequacy of the tree prior influences the quality of the phylogenetic reconstruction, and consequently the quality of the inferred evolutionary dynamics. Unfortunately, the currently used priors are over-simplistic; in particular, they assume that evolutionary rates are constant in time and identical across lineages. These homogeneous tree priors are most often inconsistent with the model subsequently used to infer evolutionary dynamics, which is statistically problematic and likely to bias inferences. Several factors contribute to this issue: i) the computational challenges of carrying out ""full phylogenetic inferences"", that is analyses that co-estimate trees and dynamics, ii) the under-recognized influence of tree priors on phylogenetic reconstruction and subsequent analyses of evolutionary dynamics and iii) the lack of empirical guidance on the use and interpretation of rate-heterogeneous tree priors.
PHYLOBD will address this issue and significantly improve full Bayesian phylogenetic inference by: i) providing efficient implementations of tree priors that account for rate heterogeneity across lineages ii) evaluating the importance of using such tree priors iii) providing tools for an accurate representation of rate-heterogeneous Bayesian posteriors, and iv) providing efficient implementations of full Bayesian phylogenetic inference when data are sampled through time."
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
75230 Paris
Francja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.