Opis projektu
Informacje na temat interakcji pomiędzy mitochondrialnymi oraz jądrowymi genomami u trzmieli
Jądrowe mitochondrialne DNA (ang. nuclear mitochondrial DNA, NUMT) to niefunkcyjne kopie genów o pochodzeniu mitochondrialnym znajdujące się w genomie jądrowym. Z kolei heteroplazmia to obecność różnych genotypów mitochondrialnych w tym samym organizmie. Mimo że są to całkowicie odrębne zjawiska molekularne, oba mogą stać się przeszkodami, jak również nowymi narzędziami badań nad ewolucją. Twórcy finansowanego ze środków UE projektu EVOBOMICS zamierzają zbadać NUMT, heteroplazmię, genomy jądrowe oraz genomy mitochondrialne z perspektywy ewolucyjnej. Badacze zidentyfikują NUMT i heteroplazmię u trzmieli. Wyniki projektu wraz z połączonym sekwencjonowaniem mitochondrialnych i jądrowych genomów pomogą zrozumieć ich ewolucję i interakcje.
Cel
Cutting edge sequencing technology enables, for the first time, the characterization of high quality numts (non-functional copies of genes of mitochondrial origin present in the nuclear genome) and heteroplasmy (the presence of different mitochondrial genotypes in the same organism). Although they are completely distinct molecular phenomena, both can be at the same time obstacles and new tools for evolutionary studies. EVOBOMICS is three projects in one, in which numts, heteroplasmy and genomes (nuclear and mitochondrial) will be studied at the same time and from an evolutionary perspective. The following hypotheses will be tested: i) Numts and heteroplasmy are common in a target model taxon (bumblebees); ii) The number of numts in any given species will increase/decrease proportionately with its nuclear genome size; iii) Ancestral numts are related to speciation events, and thus provide a novel tool for constructing and investigating phylogenies; iv) Numts can be used as molecular marker for phylogenomic reconstruction as truly RGCs (rare genomic changes); v) Heteroplasmy is not a temporary state and is shared among close related species; vi) Heteroplasmy can interfere in species delimitation and is related to speciation events.
My previous experience and preliminary results ensure the feasibility of EVOBOMICS. During my PhD in Brazil, I initiated an unprecedented and unique research programme into the evolution of mitochondrial genomes, with a focus on numts and heteroplasmy in bees. So far, five articles have been published. Together, these studies suggest that numts and heteroplasmy are common phenomena in bees, and this is likely to be representative of many other taxa. These studies had to be interrupted due to motherhood, but now, EVOBOMICS will give me the opportunity to develop this new research area using innovative methodological approaches, and to update and improve my skills, providing a key stepping stone for my career in Evolutionary Biology.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznemorfologia biologicznamorfologia porównawcza
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
TW20 0EX Egham
Zjednoczone Królestwo