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A Riboescaper study: Protein synthesis driven by deficiently assembled ribosomes

Descrizione del progetto

Conseguenze funzionali della biogenesi difettosa del ribosoma

La biogenesi ribosomiale è un processo complesso strettamente coordinato con la richiesta dei ribosomi di garantire la crescita cellulare. I ribosomi sono prodotti in importanti fasi in cui l’RNA ribosomiale viene assemblato alle proteine ribosomiali. La connessione tra biogenesi difettosa del ribosoma e le malattie umane è diventata chiara recentemente: le mutazioni a carico di proteine ribosomiali, o fattori di biogenesi, accrescono le possibilità di sviluppo del cancro. Quando una subunità pre-ribosomiale è soggetta a un errore di assemblaggio, la particella è trattenuta all’interno del nucleo. Alcune pre-particelle aberranti sfuggono ai meccanismi di controllo e sono esportate nel citoplasma. Il progetto RiboEscapers, finanziato dall’UE, si propone di applicare una profilazione ribosomiale d’avanguardia allo studio delle conseguenze funzionali delle mutazioni a carico delle proteine ribosomiali, che generano ribosomi difettosi esportati nel citoplasma e partecipano attivamente alla traduzione.

Obiettivo

Ribosomes are RNA-protein complexes found in all living cells. Ribosome biogenesis is a complex, cellular process that is tightly coordinated with ribosomes demand to ensure optimal cellular adaptation, growth and proliferation. In eukaryotes, ribosomes are sequentially generated in key steps where the ribosomal RNA (rRNA) is folded, modified, processed, and assembled with ribosomal proteins (r-proteins) to form the two ribosomal subunits. Recently, the connection of defective ribosome biogenesis with human diseases has become clear. This is the case of the so-called ribosomopathies, human syndromes caused by mutations in genes encoding either r-proteins or ribosome biogenesis factors, which are known to increase the probabilities of cancer development. Considering the multi-steps pathway of ribosome biogenesis, the possibilities to introduce errors with possible harmful effects for cell viability are high. In this context, cells have developed multiple surveillance mechanisms to supervise the structural and functional integrity of the ribosome particle. When a preribosomal subunit suffers an assembly error, in most of the cases, the aberrant particle is retained in the nucleus. However, some aberrant pre-particles have been shown to escape the surveillance mechanisms and to be exported to the cytoplasm.
This proposal, aims to explore the functional consequences of r-protein gene mutations, which generate defective ribosomal particles that are successfully exported to the cytoplasm (RiboEscapers) and actively participate in translation in yeast cell. For this purpose, the research action will combine traditional yeast tools together with state-of-the-art methodologies, such ribosome profiling to provide a detailed overview of the r-protein roles in ribosome biogenesis, as well as the consequences of specific defects in this process.

Coordinatore

UNIVERSIDAD DE SEVILLA
Contribution nette de l'UE
€ 160 932,48
Indirizzo
CALLE S. FERNANDO 4
41004 Sevilla
Spagna

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Regione
Sur Andalucía Sevilla
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
€ 160 932,48