Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Multi-view learning and quantitative genetics to identify the molecular basis of adaptation to chemical pollutants

Opis projektu

Adaptacja naturalnych populacji do pestycydów

Stosowanie pestycydów jest w rolnictwie powszechną praktyką, jednak niewiele wiadomo na temat ich długoterminowego wpływu na gatunki niebędące ich celem, takie jak zooplankton słodkowodny. Celem finansowanego ze środków UE projektu MultiOmicsTox jest zbadanie, w jaki sposób długotrwała obecność środków chemicznych w środowisku przez wiele pokoleń wpływa na zmienność genetyczną i ewolucję molekularną. Naukowcy zbadają ewolucję rozwielitki na przestrzeni 120 lat i powiążą zmiany molekularne z narażeniem na pestycydy. Pozwoli to na poznanie rzeczywistej wrażliwości populacji na pestycydy i ich reakcji adaptacyjnych. W perspektywie długoterminowej uzyskane informacje będą pomocne w sformułowaniu odpowiedniej polityki zdrowotnej i środowiskowej.

Cel

My project proposes to understand what genetic and functional genomic variation contribute to the process of adaptation and to the evolutionary fate of natural populations when confronted with modern threats, such as multi-generational exposure to a chemical pollutant in the environment. The current environmental health policies and regulatory decisions are based on ad hoc methods and do not reflect true population susceptibility. My solution is to apply multi-view machine learning, combined with quantitative genetics, to analyse a huge volume of multi-omics data to advance Precision Toxicology that brings greater certainty in the causal links between chemicals and their adverse effects. My project focuses on the multi-generational effect of pesticides in shaping genetic variation and the molecular evolutionary trajectory of Daphnia obtained from resurrected subpopulations from within dated lake sediments spanning 120 years. The adaptive phenotypes at different doses of pesticides were scored in common garden experiments and samples were taken to produce associated multi-omics data (genomes, transcriptomes, regulomes and metabolomes). I propose utilizing this data to meet the following two objectives:(1) To use quantitative genetics for the determination of genetic susceptibility of the subpopulation to pesticide exposure; (2) To identify the mechanisms and forms of evolution that result in adaptation, by integrating multi-omics data using multi-view machine learning. Expected outcomes of this work will (a) fill a gap in mechanistic understanding of the adaptive responses of natural populations, (b) identify segregating genetic variation within genomes that regulates the pace and magnitude of an adaptive response to chemical pollutants, and (c) discover putative biomarkers that estimate exposure-related genetic susceptibility of populations to the multi-generational harmful effects of chemicals for setting site-specific controls on chemical pollutants.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

THE UNIVERSITY OF BIRMINGHAM
Wkład UE netto
€ 224 933,76
Adres
Edgbaston
B15 2TT Birmingham
Zjednoczone Królestwo
Region
West Midlands (England) West Midlands Birmingham
Rodzaj działalności
Higher or Secondary Education Establishments
Linki
Koszt całkowity
€ 224 933,76