Opis projektu
Bakteryjne geny dodatkowe pomagają w ucieczce przed antybiotykami
Mukowiscydoza jest chorobą wrodzoną wywołaną przez mutacje w genie błonowego regulatora przewodnictwa związanego z mukowiscydozą (ang. cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, CFTR). W płucach pacjentów z mukowiscydozą gromadzi się śluz, powodując nawracające infekcje, które znacząco obniżają ich jakość życia. Zespół finansowanego ze środków UE projektu AGAPE koncentruje się na bakteriach z gatunku Pseudomonas aeruginosa – oportunistycznym patogenie, który nie poddaje się leczeniu i występuje u większości pacjentów z mukowiscydozą. Badacze chcą poznać rolę genomu dodatkowego P. aeruginosa w rozwoju nawracających infekcji. Wyniki projektu rzucą nowe światło na mechanizm adaptowania się tego patogenu w różnych środowiskach, co jest szczególnie ważne w kontekście narastającego problemu antybiotykooporności.
Cel
Bacterial survival to antibiotic treatment poses an urgent problem to humanity, causing 25.000 deaths per year in the European Union alone. The inability to fully eradicate pathogens with antibiotics leads to the establishment of persistent infections (PIs). Pseudomonas aeruginosa, an opportunistic pathogen, is found chronically in the airways of 70% of Cystic Fibrosis (CF) patients. In CF, the anomalous production of mucus in the lung promotes the establishment of bacteria, with infections decreasing the life quality and expectancy of patients. The mechanisms by which P. aeruginosa is able to escape treatment and generate PIs within the CF lung have not been fully elucidated. Mostly, the success of P. aeruginosa relies on its adaptability, which derives from its large genome carrying genes for survival in a wide spectrum of environments. Most of these genes are not conserved among strains, composing the accessory genome (AG), which is built up through horizontal gene transfer (HGT). Previous studies have identified components of the AG involved in virulence and resistance, yet the extent of the AG involvement in PIs is unknown. Through AGAPE I seek to elucidate the relevance of the AG in the establishment of PIs in CF lungs. I will do so by studying both the conformation and function of the AG, through novel CRISPR-Cas tools in P. aeruginosa. First, I will determine the identity and quantity of HGT during infection by recording transfer events with a CRISPR-Cas recorder system. Second, I will generate individual and combinatorial knockdowns of every accessory gene through CRISPR interference (CRISPRi), to screen the effects of the repression on fitness during infection. I will follow the infections of the generated strains on lung organoids derived from the corresponding hosts. Overall, this bona fide action will allow to uncover novel mechanisms behind PIs relying on accessory genes, and to identify novel markers and targets to improve patient treatment.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- medycyna i nauki o zdrowiu biotechnologia medyczna inżynieria genetyczna terapia genowa
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia bakteriologia
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna farmakologia i farmacja lek antybiotyki
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
2800 Kongens Lyngby
Dania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.