Opis projektu
Dynamika struktura–funkcja jonotropowych receptorów glutaminowych
Jonotropowe receptory glutaminowe (ang. ionotropic glutamate receptor, iGluR) to kanaliki jonowe aktywowane przez neuroprzekaźnik glutaminian. Pośredniczą one w komunikacji neuronalnej i odgrywają kluczową rolę w plastyczności synaptycznej, która odpowiada za uczenie się i pamięć. Zaburzenie iGluR jest powiązane z takimi schorzeniami jak choroba Alzheimera i stwardnienie zanikowe boczne. W ramach finansowanego z działań „Maria Skłodowska-Curie” projektu MOLiNTEL zostanie przeprowadzone badanie dynamiki struktura–funkcja iGluR z perspektywy termodynamiki. Celem naukowców jest opisanie małych zmian strukturalnych, które odpowiadają za złożony charakter funkcji iGluR. Zespół połączy uczenie maszynowe, modele Markowa i dane pozyskane z symulacji dynamiki cząsteczkowej oraz wykorzysta techniki zaczerpnięte z termodynamiki, aby stworzyć kompleksowe modele funkcji iGluR.
Cel
Ionotropic Glutamate receptors (iGluRs) influence the timescales at which neurons communicate with each other. The dynamics and flexibility of the response of iGluRs to neurotransmitter binding give rise to the synaptic plasticity responsible for normal human intelligence. Dysfunction of the iGluRs is causally responsible for diseases such as Alzheimer's and Amyotrophic lateral sclerosis. It is therefore medically important to understand how the structure-function relationship in the iGluRs operates at the molecular level. Many drugs attempt to target iGluRs to treat neuropathologies. However, due to the inherent complexity of the dynamics of iGluRs it is difficult to accurately target the causative function of the iGluRs thus making it difficult to form a viable pharmaceutical strategy, without insight into the dynamics of iGluRs at the atomic level. Additionally, although the individual members of the iGluR family are structurally very similar, they display very different kinetic and allosteric behaviour. The proposed project aims to focus on the comprehensive picture of the comparative dynamics of the members of the iGluRs. In close collaborations with experimental and computational methods development groups, I plan to investigate how the relatively small differences in the structures of the iGluRs give rise to the complex behaviours of the iGluRs. This will be accomplished via state of the art Molecular Dynamics (MD) simulations and a large library of computational thermodynamics techniques. From this dataset, using Machine Learning (ML) techniques in combination with Markov State Models (MSMs) I will create robust and testable models that can determine the commonalities and variances between the dynamics of the members of the iGluRs while throwing light on their mechanisms of action.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna neurologia choroby neurodegeneracyjne demencja choroba Alzheimera
- nauki przyrodnicze informatyka sztuczna inteligencja uczenie maszynowe
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna neurologia stwardnienie zanikowe boczne
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia molekularna neuronauka molekularna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
00014 Helsinki
Finlandia
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.