GEMCAT—a new algorithm for gene expression-based prediction of metabolic alterations
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Suraj Sharma; Roland Sauter; Madlen Hotze; Aaron Marcellus Paul Prowatke; Marc Niere; Tobias Kipura; Anna-Sophia Egger; Kathrin Thedieck; Marcel Kwiatkowski; Mathias Ziegler; Ines Heiland
Opublikowane w:
NAR Genomics and Bioinformatics, Numer Volume 7, Numer 1, 2025, ISSN 2631-9268
Wydawca:
Oxford University Press
DOI:
10.1101/2024.01.15.575710
ODE-based models of signaling networks in autophagy
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Markus Galhuber, Kathrin Thedieck
Opublikowane w:
Current Opinion in Systems Biology, Numer 39, 2024, ISSN 2452-3100
Wydawca:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/J.COISB.2024.100519
TXNIP mediates LAT1/SLC7A5 endocytosis to limit amino acid uptake in cells entering quiescence
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Jennifer Kahlhofer, Nikolas Marchet, Kristian Zubak, Brigitta Seifert, Madlen Hotze, Anna-Sophia Egger-Hörschinger, Lucija Kucej, Claudia Manzl, Yannick Weyer, Sabine Weys, Martin Offterdinger, Sebas
Opublikowane w:
The EMBO Journal, Numer 44, 2025, ISSN 1460-2075
Wydawca:
Springer Science and Business Media LLC
DOI:
10.1038/S44318-025-00608-9
Nature Communications
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
André Gollowitzer; Helmut Pein; Zhigang Rao; Lorenz Waltl; Leonhard Bereuter; Konstantin Loeser; Tobias Meyer; Vajiheh Jafari; Finja Witt; René Winkler; Fengting Su; Silke Große; Maria Thürmer; Julia Grander; Madlen Hotze; Sönke Harder; Lilia Espada; Alexander Magnutzki; Ronald Gstir; Christina Weinigel; Silke Rummler; Günther Bonn; Johanna Pachmayr; Maria Ermolaeva; Takeshi Harayama; Hartmut Schlüter; Christian Kosan; Regine Heller; Kathrin Thedieck; Michael Schmitt; Takao Shimizu; Jürgen Popp; Hideo Shindou; Marcel Kwiatkowski; Andreas Koeberle
Opublikowane w:
Nature Communications, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/S41467-025-56711-2
Automated Liquid Handling Extraction and Rapid Quantification of Underivatized Amino Acids and Tryptophan Metabolites from Human Serum and Plasma Using Dual-Column U(H)PLC-MRM-MS and Its Application to Prostate Cancer Study
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Tobias Kipura; Madlen Hotze; Alexa Hofer; Anna-Sophia Egger; Lea E. Timpen; Christiane Opitz; Paul A. Townsend; Lee A. Gethings; Kathrin Thedieck; Marcel Kwiatkowski
Opublikowane w:
Metabolites, Numer Volume 14, Numer 7, 2024, ISSN 2218-1989
Wydawca:
Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI:
10.1101/2023.12.31.573763