EXtreme Analytics for MINing Data spaces

Informacje na temat projektu

EXA4MIND

Identyfikator umowy o grant: 101092944

DOI

10.3030/101092944

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 23 Listopada 2022

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2023

Data zakończenia 30 Kwietnia 2026

Finansowanie w ramach

• Digital, Industry and Space

Koszt całkowity

€ 4 911 425,00

Wkład UE

€ 4 911 425,00

Koordynowany przez

VSB - TECHNICAL UNIVERSITY OF OSTRAVA
Czechia

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Documents, reports (7)

Application Cases and Architecture Requirements
Extreme Data Flow Patterns – Report
Data and Workflow Management Toolbox Alpha Status Report
Dissemination & Communication Interim Report
Architecture of AQIS
Continuous Improvements of Architecture, and Release management Process and System
Impact Master Plan

Other (1)

Intermediate Version of the ADAMS4SIMS System

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Publikacje

Conference proceedings (17)

terazi: AI Fairness Tool for Doubly Imbalanced Data

Autorzy: Asli Umay Ozturk; Yigit Sever; Ata Yalcin; Viktoria Pauw; Stephan Hachinger; Ismail Hakki Toroslu; Pinar Karagoz
Opublikowane w: Proceedings of the 34th ACM International Conference on Information and Knowledge Management, 2025
Wydawca: ACM
DOI: 10.1145/3746252.3761465

Wine in the Cloud, or: Smart Vineyards with a Distributed “Extreme Data Database” and Supercomputing

Autorzy: Piyush Harsh,,∗ Stephan Hachinger, Marc Derquennes, Andy Edmonds,Pinar Karagoz, Martin Golasowski, Mohamad Hayek and Jan Martinovič
Opublikowane w: ISGC&HEPiX2023, 2023
Wydawca: PoS
DOI: 10.22323/1.434.0021

Explaining Veracity Predictions with Evidence Summarization: A Multi-Task Model Approach

Autorzy: Recep Firat Cekinel, Pinar Karagoz
Opublikowane w: 2024 IEEE International Conference on Big Data (BigData), 2025
Wydawca: IEEE
DOI: 10.48550/ARXIV.2402.06443

Multimodal Fact-Checking with Vision Language Models: A Probing Classifier based Solution with Embedding Strategies

Autorzy: Karagöz, Pınar; Çekinel, Recep Fırat; Çöltekin, Çağrı
Opublikowane w: Proceedings of the 31st International Conference on Computational Linguistics, 2025
Wydawca: Association for Computational Linguistics
DOI: 10.48550/ARXIV.2412.05155

Halton Scheduler For Masked Generative Image Transformer

Autorzy: Victor Besnier, Mickael Chen, David Hurych, Eduardo Valle, Matthieu Cord
Opublikowane w: International Conference on Learning Representations (ICLR), 2025
Wydawca: OpenReview
DOI: 10.48550/ARXIV.2503.17076

Three Pillars improving Vision Foundation Model Distillation for Lidar

Autorzy: Gilles Puy, Spyros Gidaris, Alexandre Boulch, Oriane Siméoni, Corentin Sautier, Patrick Pérez, Andrei Bursuc, Renaud Marlet
Opublikowane w: Proceedings of the IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), 2024
Wydawca: IEEE/CVPR
DOI: 10.48550/ARXIV.2310.17504

Annealed Winner-Takes-All for Motion Forecasting

Autorzy: Xu, Yihong; Letzelter, Victor; Chen, Mickaël; Zablocki, Éloi; Cord, Matthieu
Opublikowane w: 2025 IEEE International Conference on Robotics and Automation (ICRA), 2025
Wydawca: IEEE
DOI: 10.48550/ARXIV.2409.11172

Database-aided Workflows on HPC for Plasma Physics Simulation

Autorzy: Viktoria Maike Paula Pauw, Hachinger Stephan, Jan Martinovič, Stephan Hachinger
Opublikowane w: Proceedings of International Symposium on Grids & Clouds (ISGC2025) — PoS(ISGC2025), 2025
Wydawca: Sissa Medialab
DOI: 10.22323/1.488.0024

Make Satire Boring Again: Reducing Stylistic Bias of Satirical Corpus by Utilizing Generative LLMs

Autorzy: Öztürk, Aslı Umay; Çekinel, Recep Fırat; Karagöz, Pınar
Opublikowane w: Proceedings of the 18th Workshop on Building and Using Comparable Corpora (BUCC), 2025
Wydawca: Association for Computational Linguistics
DOI: 10.48550/ARXIV.2412.09247

Management of Physics Simulations with Databases

Autorzy: Viktoria Maike Paula Pauw, David Číž, Vojtěch Mlýnský, Pavel Banáš, Michal Otyepka, Stephan Hachinger, Jan Martinovič
Opublikowane w: Proceedings of International Symposium on Grids & Clouds (ISGC) 2024 — PoS(ISGC2024), 2024
Wydawca: Sissa Medialab
DOI: 10.22323/1.458.0031

Towards Motion Forecasting with Real-World Perception Inputs: Are End-to-End Approaches Competitive?

Autorzy: Xu, Yihong; Chambon, Loïck; Zablocki, Éloi; Chen, Mickaël; Alahi, Alexandre; Cord, Matthieu; Pérez, Patrick
Opublikowane w: 2024 IEEE International Conference on Robotics and Automation (ICRA), 2024
Wydawca: IEEE
DOI: 10.48550/ARXIV.2306.09281

POP-3D: Open-Vocabulary 3D Occupancy Prediction from Images (pre-print version)

Autorzy: Antonín Vobecký, Oriane Siméoni, David Hurych, Spyros Gidaris, Andrei Bursuc, Patrick Perez, Josef Sivic
Opublikowane w: NeurIPS 2023, 2024
Wydawca: NeurIPS

ShowHowTo: Generating Scene-Conditioned Step-by-Step Visual Instructions

Autorzy: Tomás Soucek; Prajwal Gatti; Michael Wray; Ivan Laptev; Dima Damen; Josef Sivic
Opublikowane w: 2025 IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), 2025
Wydawca: IEEE
DOI: 10.48550/ARXIV.2412.01987

Cross-Lingual Learning vs. Low-Resource Fine-Tuning: A Case Study with Fact-Checking in Turkish

Autorzy: Firat Cekinel, Pinar Karagoz, Cagri Coltekin
Opublikowane w: Proceedings of the 2024 Joint International Conference on Computational Linguistics, Language Resources and Evaluation (LREC-COLING 2024), 2024
Wydawca: ELRA and ICCL

OccFeat: Self-supervised Occupancy Feature Prediction for Pretraining BEV Segmentation Networks

Autorzy: Sophia Sirko-Galouchenko, Alexandre Boulch, Spyros Gidaris, Andrei Bursuc, Antonin Vobecky, Patrick Pérez, Renaud Marlet
Opublikowane w: 2024 IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition Workshops (CVPRW), 2024
Wydawca: IEEE
DOI: 10.1109/CVPRW63382.2024.00452

GenHowTo: Learning to Generate Actions and State Transformations from Instructional Videos

Autorzy: Tomás Soucek; Dima Damen; Michael Wray; Ivan Laptev; Josef Sivic
Opublikowane w: 2024 IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), 2024
Wydawca: IEEE
DOI: 10.48550/ARXIV.2312.07322

IndexAI: AI Based Index Selection for NoSQL Databases (pre-print version)

Autorzy: Mohammad Mahdi Khosravi, Pinar Karagoz, and Ismail Hakki Toroslu
Opublikowane w: 2023 IEEE International Conference on Big Data, 2024
Wydawca: IEEE
DOI: 10.1109/BigData59044.2023.10386521

Other (11)

Poster: ADAMS4SIMS - Database Curation for MD Simulations

Autorzy: Číž, D., Furmánek, R., Pauw, V., Martinovič, J., Otyepka, M., Banáš, P., Mlýnský, V.
Opublikowane w: HPCSE 2024, 2024
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.12704253

Poster: Integrated Database of Force-Field Parameters, Experimental Measurements, and Molecular Dynamics Simulations as a Tool for Force Field Development

Autorzy: Pavel Banas, Mlynsky Vojtech, David Ciz, Radek Furmanek, Nestor Pilat, Anna Spackova, Viktoria Pauw, Stephan Hachinger, Jiri Sponer, Jan Martinovic, Michal Otyepka
Opublikowane w: CECAM Workshop “RNA Modelling Across Scales” 2025, 2025
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.19916756

Poster: A universal molecular force field format for transparent and accessible parameters for MD simulations of biomolecular systems

Autorzy: Banáš, P., Mlýnský, V., Číž, D., Furmánek, R., Pilát, N., Špačková, A., Pauw, V., Hachinger, S., Šponer, J., Martinovič, J., Otyepka, M.
Opublikowane w: CECAM Workshop “RNA Modelling Across Scales”, 2025
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.19923305

Poster: Integrated Database of Force-Field Parameters, Experimental Measurements and Molecular Dynamics Simulations as a Tool for Force Field Development

Autorzy: Banáš, P., Mlýnský, V., Číž, D., Furmánek, R., Pilát, N., Špačková, A., Pauw, V., Hachinger, S., Šponer, J., Martinovič, J., Otyepka, M.
Opublikowane w: EuChemS CompChem 2025 “Shaping the Future of Chemistry”, 2025
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.17174936

Poster: Optimised DBMS Deployments and DBMS Benchmarks for Extreme Data Workflows

Autorzy: Gurbanov, H., Brunati, R., Karagoz, P., Toroslu, I. H., Hayek, M., Golasowski, M., Hachinger, S., Martinovič, J.
Opublikowane w: HPCSE 2024, 2024
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.19923504

Poster: Tuning and tweaking of the state-of-the-art amber OL3 RNA force field

Autorzy: Mlýnský, V., Kührová, P., Krepl, M., Stadlbauer, P., Otyepka, M., Bussi, G., Banáš, P., Šponer, J.
Opublikowane w: EuChemS CompChem 2023, 2023
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.19923213

Poster: POP3D: Open-Vocabulary 3D Occupancy Prediction from Images

Autorzy: A. Vobecky, O. Siméoni, D. Hurych, S. Gidaris, A. Bursuc, P. Pérez, J. Šivic
Opublikowane w: NeurIPS 2023, 2024
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.12704479

Regularizing Self-supervised 3D Scene Flows with Surface Awareness and Cyclic Consistency

Autorzy: Patrik Vacek, David Hurych, Karel Zimmermann, Tomáš Svoboda
Opublikowane w: 2024
Wydawca: ArXiv
DOI: 10.48550/ARXIV.2312.08879

Poster: Tapping Data Spaces in HPC: Enabling, Exploring and Benchmarking Database & Object Store Usage

Autorzy: Mohamad Hayek, Stephan Hachinger, Huseyn Gurbanov, Viktoria Pauw, Martin Golasowski, Jan Martinovič, Pinar Karagoz, Ismail Hakki Toroslu
Opublikowane w: SCA/HPC Asia 2026, 2026
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.19912565

Poster: EXA4MIND AI Inference Service Solution

Autorzy: Adam Matus, Jan Martinovic, Jakub Konvicka, Tomas Martinovic, Firat Cekinel, Görkem Özer, Pinar Karagoz, Ismail Toroslu
Opublikowane w: SCA/HPC Asia 2026, 2026
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.19912708

Poster: How to Make Data Pipeline Scalable: A Case Study for Healthcare Data Analytics

Autorzy: Atakan Gelecek, Pinar Karagoz Ismail Hakki Toroslu, Stephan Hachinger, Jan Martinovic
Opublikowane w: SCA/HPC Asia 2026, 2026
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/ZENODO.19912338

Peer reviewed articles (10)

DocSpider: a dataset of cross-domain natural language querying for MongoDB

Autorzy: Arif Görkem Özer; Recep Firat Cekinel; Ismail Hakki Toroslu; Pinar Karagoz
Opublikowane w: Natural Language Processing, 2025, ISSN 2977-0424
Wydawca: Cambridge University Press
DOI: 10.1017/NLP.2024.63

Destabilization of Structured RNAs by OPC and TIP4PD Water Models

Autorzy: Miroslav Krepl, Vojtěch Mlýnský, Agnesa Rusnáková, Pavel Banáš, Michal Otyepka, Jiří Šponer
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 22, 2026, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCTC.5C01678

The Kink-Turn 7 Motif: An Additional Test for RNA Force Field Performance

Autorzy: Toon Lemmens, Vojtěch Mlýnský, Jiří Šponer, Martin Pykal, Pavel Banáš, Michal Otyepka, Miroslav Krepl
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 21, 2025, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCTC.5C00776

Unsupervised Semantic Segmentation of Urban Scenes via Cross-Modal Distillation

Autorzy: Antonín Vobecký; David Hurych; Oriane Siméoni; Spyros Gidaris; Andrei Bursuc; Patrick Pérez; Josef Sivic
Opublikowane w: International Journal of Computer Vision, 2025, ISSN 1573-1405
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1007/S11263-024-02320-3

MOCA: Self-supervised Representation Learning by Predicting Masked Online Codebook Assignments

Autorzy: Spyros Gidaris, Andrei Bursuc, Oriane Simeoni, Antonin Vobecky, Nikos Komodakis, Matthieu Cord, Patrick Pérez
Opublikowane w: Transactions on Machine Learning Research, Numer 2, 2024, ISSN 2835-8856
Wydawca: JMLR
DOI: 10.48550/arXiv.2307.09361

Let It Flow: Simultaneous Optimization of 3D Flow and Object Clustering

Autorzy: Patrik Vacek, David Hurych, Karel Zimmermann, Tomáš Svoboda
Opublikowane w: IEEE Transactions on Intelligent Vehicles, Numer 10, 2026, ISSN 2379-8904
Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
DOI: 10.1109/TIV.2024.3443316

Simple Adjustment of Intranucleotide Base-Phosphate Interaction in the OL3 AMBER Force Field Improves RNA Simulations

Autorzy: Vojtěch Mlýnský, Petra Kührová, Petr Stadlbauer, Miroslav Krepl, Michal Otyepka, Pavel Banáš*, and Jiří Šponer*
Opublikowane w: (JCTC) Journal of Chemical Theory and Computation, Numer Volume 19, Numer 22, 2023, ISSN 1549-9626
Wydawca: ACS Publications
DOI: 10.1021/acs.jctc.3c00990

Computer Folding of Parallel <scp>DNA</scp> G‐Quadruplex: Hitchhiker's Guide to the Conformational Space

Autorzy: Michal Janeček, Petra Kührová, Vojtěch Mlýnský, Petr Stadlbauer, Michal Otyepka, Giovanni Bussi, Jiří Šponer, Pavel Banáš
Opublikowane w: Journal of Computational Chemistry, Numer 46, 2025, ISSN 0192-8651
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/JCC.27535

Can We Ever Develop an Ideal RNA Force Field? Lessons Learned from Simulations of the UUCG RNA Tetraloop and Other Systems

Autorzy: Vojtěch Mlýnský, Petra Kührová, Martin Pykal, Miroslav Krepl, Petr Stadlbauer, Michal Otyepka, Pavel Banáš, Jiří Šponer
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 21, 2025, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCTC.4C01357

Data management for distributed computational workflows: An iRODS-based setup and its performance

Autorzy: Mohamad Hayek, Martin Golasowski, Stephan Hachinger, Rubén J. García-Hernández, Johannes Munke, Gabriel Lindner, Kateřina Slaninová, Philipp Tunka, Vít Vondrák, Dieter Kranzlmüller, Jan Martinovič
Opublikowane w: PLOS One, Numer 21, 2026, ISSN 1932-6203
Wydawca: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/JOURNAL.PONE.0340757