Opis projektu
Izoformy białek w bakteriach
Bakterie – tradycyjnie uważane za haploidalne – mogą posiadać dwie wersje mRNA tego samego genu, dające różne izoformy białka o zmienionej aktywności. Edycja mRNA A-to-I (Adenosine-to-inosine), odkryta w Escherichia coli, zmienia funkcję białka i jest pod wpływem sygnałów środowiskowych podczas wzrostu. Nieznana jest jednak częstość występowania, regulacja i znaczenie tej edycji w bakteriach. Finansowany przez Europejską Radę ds. Badań Naukowych projekt REDBAC zakłada zbadanie powszechnej edycji mRNA u setek gatunków w różnych warunkach, co pozwolić poznać jej regulacji genetycznej i wpływu na proteom. Badanie to powinno doprowadzić do odkrycia nowego mechanizmu adaptacji bakterii, który może mieć wpływ na zdrowie ludzi, a który będzie wykraczał poza mechanizmy określone na podstawie obecnych danych genetycznych i proteomicznych.
Cel
"Bacteria are haploid, having a single copy of each gene. We suggest a paradigm shift in bacterial genetics: bacteria can have two RNA versions of the same gene, encoding protein isoforms at the single-bacterium and population level. These protein isoforms can have altered activity, which could be advantageous under different conditions.
Adenosine-to-inosine (A-to-I) mRNA editing can affect the sequence and the function of translated proteins because the ribosome identifies inosine as guanosine. We discovered that A-to-I mRNA editing occurs in bacteria (Escherichia coli), identified the mediating enzyme, and showed that it could affect protein function. Moreover, we discovered that environmental cues experienced during growth in culture affect bacterial mRNA editing. However, the prevalence and regulation of A-to-I mRNA editing across bacteria and the importance of editing for protein function and bacterial physiology in different environments are still unknown.
Here, we will test the hypothesis that mRNA editing is widespread in bacteria, producing two RNA ""alleles"" (pseudo-heterozygosity). Subsequently, these RNA ""alleles"" may co-exist in the same bacterial cell or population of cells. Thus, mRNA editing may enable the translation of protein isoforms, making bacteria better adapted to changing environments. We suggest (1) identifying mRNA editing events across environmental conditions in hundreds of species, (2) uncovering the regulatory genetic factors governing bacterial mRNA editing occurrence, and (3) determining the effect of mRNA editing on the proteome and its functional role in bacteria.
Our work could shed light on a new mechanism bacteria employ to grow and survive in different environments. Furthermore, bacterial mRNA editinginvisible to DNA sequencingmay account for unsolved problems or phenomena that current genetic and proteomic data cannot explain, affecting bacterial biology and human health."
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia bakteriologia
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna fizjologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka RNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka enzymy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2023-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
84105 Beer Sheva
Izrael
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.