Description du projet
Graphes de connaissances pour caractériser les fermentations à base de plantes
Les produits laitiers et les substituts de viande à base de plantes gagnent en popularité. Cependant, ils peuvent être déséquilibrés sur le plan nutritionnel et nécessitent de meilleurs profils gustatifs. Les micro-organismes sont utilisés depuis des millénaires pour la production, la conservation et l’amélioration de la sécurité des aliments. Néanmoins, les communautés microbiennes complexes qui pilotent les fermentations à base de plantes doivent être mieux caractérisées, car les données sont dispersées dans diverses sources. Le projet FAIROmics, financé par le programme MSCA, vise à établir un programme de recherche interdisciplinaire pour la FAIRification des données omiques et l’interopérabilité des bases de données. Cette initiative vise également à développer des graphes de connaissances pour faciliter la prise de décision fondée sur des données et la conception de communautés microbiennes pour les aliments fermentés à base de plantes. En outre, le projet comprend un programme de formation destiné à améliorer les compétences des doctorants en IA, en sciences de la vie, en sciences humaines et sociales.
Objectif
A transition towards sustainable food systems is urgently needed to face challenges such as climate change or scarcity of resources. Food impact accounts for 26% of global greenhouse gas emissions. Animal-based food products in the European diet is the most important factor determining the footprint of food consumption. Plant-based dairy and meat alternatives have grown in popularity in recent years for various reasons, including sustainability and health benefits as well as lifestyle trends and dietary restrictions. However, plant-based food products can be nutritionally unbalanced, and their flavour profiles may limit their acceptance by consumers. Microorganisms have been used in making food products for millennia. Besides their primary role in food preservation, by virtue of their fermentative metabolism, they contribute to improving food safety and organoleptic properties and can provide additional health-promoting effects. However, the diversity of microbial communities driving plant-based fermentations, as well as their key genetic and phenotypic traits and potential synergies among community members, remain poorly characterized. Many data exist but they are spread into different literatures (scientific and grey) or in best case in different databases, but not always reusable because difficult to find, access and because databases are not systematically interoperable. The FAIROmics innovative interdisciplinary research programme will gather universities and private companies to enable the FAIRification of omics data and databases interoperability, and develop knowledge graphs for data-driven decision making to rationally design microbial communities for imparting desirable characteristics to plant-based fermented foods in the context of open science and its regulations. The FAIROmics training programme aims at developing Doctoral candidates’ skills at the interface between artificial intelligence, life sciences, humanities and social sciences.
Champ scientifique
Mots‑clés
Programme(s)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Régime de financement
HORIZON-TMA-MSCA-DN-JD - HORIZON TMA MSCA Doctoral Networks - Joint DoctoratesCoordinateur
75007 Paris
France
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Participants (10)
6718 ZB Ede Gld
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
10561 Athina
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2970 HORSHOLM
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1081 HV Amsterdam
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28006 Madrid
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3000 Leuven
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40126 Bologna
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31062 Toulouse Cedex 9
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33098 Paderborn
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1050 Bruxelles / Brussel
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Partenaires (16)
Les organisations partenaires contribuent à la mise en œuvre de l’action, mais ne signent pas la convention de subvention.
RG6 6AH Reading
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6720 Szeged
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75654 Paris
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75794 Paris
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91058 Evry-Courcouronnes Cedex
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
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91767 Palaiseau
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04318 Leipzig
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04109 Leipzig
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6708 PB Wageningen
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36310 Vigo Pontevedra
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46022 Valencia
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Participation terminée
4000 Liege
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67081 Strasbourg
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75003 Paris
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91120 Palaiseau
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91190 Gif-Sur-Yvette
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