Opis projektu
Badanie powiązań między modyfikacjami potranslacyjnymi u S. cerevisiae
Modyfikacje potranslacyjne (PTM) to zmiany chemiczne regulujące funkcjonowanie białek. Oddziałują one ze sobą poprzez wysyłanie sygnałów, które wpływają na siebie nawzajem w celu regulacji adaptacji komórkowej, w związku z czym nieprawidłowe interakcje między modyfikacjami często wiążą się z rozwojem chorób. Wiedza na temat złożoności tych wzajemnych oddziaływań może przyczynić się do lepszego zrozumienia etiologii i leczenia niektórych chorób. Celem finansowanego przez Europejską Radę ds. Badań Naukowych projektu PTMtalk jest opracowanie systematycznej metody badania funkcji, jaką pełnią wzajemne odziaływania PTM, i ich regulacji na przykładzie S. cerevisiae (drożdży piekarskich). Zespół projektu zamierza połączyć zaawansowane metody edycji oparte na CRISPR, aby stworzyć 30 000 mutantów PTM we wszystkich białkach zaangażowanych w szlaki sygnałów do chromatyny, a także opracować skalowalne podejście biologii systemów oparte na genetyce odwrotnej i chemogenomice umożliwiające profilowanie tych mutantów w 150 różnych warunkach stresowych.
Cel
Post-translational modifications (PTMs) regulate all aspects of protein functionality. Dysregulation of PTMs or the enzymes that regulate them is frequently associated with disease. Far from working in isolation, PTMs crosstalk with each other creating decision-making circuits that regulate the cellular adaptation to fluctuating environments. PTM crosstalk is a regulatory layer of the proteome across the tree of life. However, to what extent and how PTM crosstalk regulates biological processes is a long-standing question in biology that is experimentally challenging to tackle. The challenges lie in the natural complexity and infinite combinatorial possibilities of PTMs, and the lack of unbiased systematic methods to study their function.
We will use a combination of state-of-the-art CRISPR-based editing methods to construct 30.000 PTM-mutants in all the proteins involved in the signalling-to-chromatin pathways, and a scalable systems biology approach based on reverse genetics and chemical genomics to profile these mutants under 150 stress conditions. Mutants with similar phenotypic profiles are functionally associated, allowing us to infer functional relationships for PTMs, regulators and conditions. These functional associations will provide conditional regulatory PTM crosstalk events at an unprecedented scale. We will further mechanistically dissect the function of selected PTM crosstalk events by interrogating protein activity, cellular localization and interactions. Moreover, we will dissect their directionality and modularity. We expect these findings to be transferable to other eukaryotes due to the high degree of conservation in these core biological processes. Overall, this project will revolutionise the PTM field providing ground-breaking insights into the functional understanding of PTM crosstalk and their regulation in S. cerevisiae and unlocking the door for cracking the PTM code within and across biological processes.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka enzymy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2024-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
28006 MADRID
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.