Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Regulation of mRNA homeostasis by Poly(A) binding proteins

Opis projektu

Badanie PABPC w zakresie regulacji i homeostazy RNA

RNA jest niezbędnym składnikiem życia, a do utrzymania jego stężenia (homeostazy RNA) komórki wykorzystują równoważenie syntezy i degradacji. Mechanizm sprzężenia zwrotnego może koordynować poziomy mRNA poprzez „czujnik”, który przekazuje informację o stężeniach mRNA do kontroli transkrypcji i degradacji. Cytoplazmatyczne białka wiążące poli(A) (PABPC) wiążą się z mRNA, regulując ich stabilność i translację, ale ich rola w utrzymaniu homeostazy RNA w warunkach fizjologicznych pozostaje słabo poznana. Realizowany przy wsparciu programu działań „Maria Skłodowska-Curie” projekt RNAhome wykorzysta miareczkowanie PABPC, znakowanie metaboliczne i multipleksowe obrazowanie do analizy dynamiki RNA w odpowiedzi na różne poziomy i lokalizację PABPC, aby doprowadzić do odkrycia mechanizmów homeostazy RNA i szerszych zasad regulacji genów.

Cel

RNA is a biomolecule central to all life forms, and cells regulate RNA production and degradation rates to maintain stable RNA concentrations (RNA homeostasis) through a largely unexplored mechanism. Increasing evidence indicates that a feedback mechanism coordinates mRNA synthesis and degradation, allowing cells to buffer mRNA concentration. For the coordination of these processes, I hypothesise the existence of a “sensor” that “measures” mRNA concentration and conveys this information to the transcription and/or degradation machinery, establishing a coordinated response.

Cytoplasmic Poly(A)-binding proteins (PABPCs) are highly conserved across eukaryotes, and specifically bind to polyadenylated mRNAs, regulating their stability, translation, and degradation. Several properties of PABPCs, such as nuclear shuttling and transcription inhibition in response to viral infection, make them ideal candidates as mRNA sensors, yet it is unclear whether they control mRNA homeostasis in physiological conditions.

RNAhome will characterise the role of PABPCs in mRNA buffering and homeostasis using a systemic approach. I will conduct PABPC titration, followed by metabolic labelling and multiplexed imaging, to analyse RNA dynamics in response to varying PABPC expression and localisation. I will use my extensive expertise in nanoinjection to introduce mRNA into live cells and assess if PABPCs can directly sense mRNA levels and modulate transcription/turnover accordingly. Finally, I will use SLAMseq to measure genome-wide RNA dynamics with transcript-level resolution, establishing the impact of PABPC expression on mRNA dynamics.

RNAhome is a prime example of interdisciplinary science, combining the researcher’s expertise in bio-nanotechnology and physical sciences with RNA dynamics knowledge of the host group, and world-class facilities of the host organisation to unravel the fundamental mechanisms governing RNA homeostasis and drive innovation in RNA-based technologies.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

FONDAZIONE HUMAN TECHNOPOLE
Wkład UE netto
€ 193 643,28
Adres
VIALE LEVI MONTALCINI RITA 1
20157 Milano
Włochy
Region
Nord-Ovest Lombardia Milano
Rodzaj działalności
Research Organisations
Linki
Koszt całkowity
Brak danych