Cel
Formation of specific protein-protein complexes is an essential requisite for most of biological processes, and constitutes one of the most relevant unsolved theoretical problems. Although several docking methods for abinitio prediction of protein-protein association have been reported, their systematic application at proteomic scale is still challenging.
Difficulties arise from both the definition of the scoring function and the complexity of conformational changes upon binding. An important step to solve this problem is the use of (1) docking simulations by Monte-Carlo techniques (pseudo-Brownian movements and Biased Probability minimization) and (2) soft potentials pre-calculated on a 3-D grid.
Based on this strategy, the candidate has developed, during his research work at The Scripps Research Institute (La Jolla, USA) and the University of Cambridge (UK), an accurate and efficient docking algorithm and several computational tools to predict protein-binding surfaces.
The application of these methods to large databases of structures (generated by structural genomics projects and by homology modeling), together with the integration of biophysical data and genomic information, will facilitate the structural characterization of protein-protein complexes at a proteomic scale.
The proposed project will have the following specific objectives:
- development and optimization of computational predictive methods for their high-throughput application to PDB structures and homology models (generated at different resolution levels);
- creation of a comparative database of protein-protein interactions in order to understand the structural and sequence factors that determine complex formation in proteins;
- biophysical and computational characterization of protein-protein interactions of biological and/or therapeutical interest; and (4) application of the developed computational methods to the design of selective inhibitors of protein-protein interactions.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- nauki przyrodnicze informatyka bazy danych
- nauki przyrodnicze informatyka nauki obliczeniowe
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP6-2002-MOBILITY-11
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
BARCELONA
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.