Cel
"We propose to investigate a number of algorithmic problems on jumbled strings, where we refer to a string t as a jumbled version of string s if t's positions can be permuted such that it is transformed into s. In other words, the two strings have the same Parikh vector, where the Parikh vector counts the number of occurrences of each character. For example, the strings AAGACGT and AAACGGT both have Parikh vector (3,1,2,1). All strings with the same Parikh vector build an equivalence class, which we refer to as a 'jumbled string.' We want to develop algorithms and dedicated data structures for searching, storing, comparing, and identifying jumbled strings.
Jumbled strings have important applications in bioinformatics, above all in interpretation of mass spectrometry data; but they have also been applied to alignment, pattern discovery in biological strings, or SNP detection. Searching for a jumbled pattern in a text constitutes a special case of approximate string matching, and is thus of particular interest in the pattern matching field. Similar problems regarding unique reconstruction of strings have been investigated in the area of formal languages.
The project involves both theoretical and practical parts. Besides searching for asymptotically optimal procedures for different models of the source which generates the text, we will also test on real instances of biological and textual data. We are not only interested in theoretically optimal algorithms but focus on algorithms that work well in practice. Thus, we consider also heuristics and ad hoc methods to enhance the practical implementation of our methods.
The project will enable the fellow to greatly enhance her competencies in algorithms development and formal languages, while training in information theory and extremal combinatorics, benefitting from the expertise at the host institution. This will constitute a major step in her career towards a professorship in algorithmic bioinformatics."
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka czysta matematyka dyskretna kombinatoryka
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia analityczna spektrometria mas
- nauki przyrodnicze informatyka sztuczna inteligencja programowanie heurystyczne
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP7-PEOPLE-2010-IEF
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
84084 Fisciano Sa
Włochy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.