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Contenuto archiviato il 2024-05-30

SUMO proteomics in C. elegans: focus on meiosis and the DNA damage response

Obiettivo

SUMO (small ubiquitin-like modifier) is a small peptide that can be covalently attached to target proteins in an analogous way to ubiquitin. SUMO is involved in transcriptional regulation, sub-cellular partitioning, stress response, and DNA damage response, among other processes. The roles for the SUMO conjugation pathway have been mainly addressed using transformed cell lines and yeast. To address the relevance of the SUMO conjugation pathway in a living organism, I will use the round worm, Caenorhabditis elegans, a multicellular eukaryotic organism simple enough to be studied in great detail. I plan to characterize the SMO-1 (the C. elegans orthologue of SUMO) proteome using high accuracy mass spectrometry (MS). Moreover, dynamic changes in the SMO-1 proteome in response to ionizing radiation as well as tissue-specific SMO-1 sub-proteomes will be assessed taking advantage of the recently developed SILAN (stable isotope labeling with amino acids in nematodes) technique. In parallel, the role of SMO-1 conjugation in the DNA damage response and meiotic recombination will be addressed by genetically altering the conjugation pathway. I will also study the dynamics of specific SMO-1 conjugates after ionizing irradiation, by applying multiple reaction monitoring (MRM)-mass spectrometry. The role of SMO-1 modification of selected target proteins will be addressed by generating transgenic strains carrying a sumoylation deficient allele. Overall, this project combines high accuracy mass spectrometry and the nematode C. elegans to provide insights into the biological consequences of dynamic, tissue-specific SUMO conjugation. Importantly, this project will guarantee a leading role for the European Research Area in this field and the expertise I will obtain with Dr Hay will be vital for carrying out my future career as independent researcher.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/it/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2011-IIF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IIF - International Incoming Fellowships (IIF)

Coordinatore

UNIVERSITY OF DUNDEE
Contributo UE
€ 209 033,40
Indirizzo
Nethergate
DD1 4HN Dundee
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
Scotland Eastern Scotland Angus and Dundee City
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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