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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Evolutionary genetics of transcription factor binding in closely related mammals

Obiettivo

The genetic differences found in gene regulatory regions are the largest contributing factor to the diversity of phenotypes within and between mammalian species. However, the micro-evolutionary mechanisms active in closely-related species remain poorly explored, particularly in mammals.
In Aim 1, we will exploit five recently sequenced mouse species to determine how often genetic sequence differences alter both the genome-wide binding and regulatory output of a core set of tissue-specific transcription factors (TFs) known to act combinatorially in liver. This project aim will establish the micro-evolutionary processes that drive interspecies changes in transcriptional regulation.
In Aim 2, we will create first-generation intercrosses of a subset of these mouse species to dissect the cis and trans contributions to TF binding differences between species, and to explore the functional implications for nearby chromatin and gene expression. This aim will also establish whether any tissue-specific TF binding sites show parent-of-chromosomal origin effects.
In Aim 3, we will use classically generated TF knockout mice to identify a set of functionally enriched TF binding sites, which will be further categorized by their conservation across the five mouse species. Then, using the revolutionary ability to rapidly and precisely delete individual binding sites (as well as combinations of binding sites) in the mouse genome by zinc finger nucleases, we will test whether conservation of these protein-DNA contacts can predict functional activity at target genes.
This integrated approach combines the comparison of TF binding in closely-related mammals with powerful new experimental tools to afford a comprehensive understanding of the genetics and mechanisms underlying the micro-evolution of transcriptional regulatory networks.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2013-CoG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-CG - ERC Consolidator Grants

Istituzione ospitante

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Contributo UE
€ 1 910 107,00
Indirizzo
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN Cambridge
Regno Unito

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Regione
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

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