Cel
Cytogenetic diagnostic approaches provide information on the single-chromosome level but suffer from low resolution and throughput. In contrast, next generation sequencing (NGS) based diagnostics provides single base resolution and high throughput but suffer from short reads that prevent analysis of large genomic aberrations as well as being prone to PCR-amplification bias and erasure of epigenetic information. This proposal aims to bridge the gap between these domains by analyzing long individual DNA molecules without PCR-amplification via utilization of emerging optical DNA mapping technologies. We specifically address three types of challenges to current genomic based diagnostics:
1. Loss of relevant information such as DNA damage lesions, rare mutations or epigenetic markers following PCR amplification.
2. Limitations in resolving long-range variations in genomic layout and correlating them with single point mutations, preventing large scale screens.
3. Limitations imposed by the sample such as low sample amounts (micro biopsy, circulating tumor DNA) or inhomogeneous/highly variable samples (bacterial cultures).
We will develop a robust toolbox for integrated genetic and epigenetic profiling of single DNA molecules that will include automated sample preparation of native unamplified DNA as well as the hardware and software platforms and analysis tools for readout, extraction and quantification of medically relevant genomic information. This technology will be used to develop a set of specific, proof of principle diagnostic assays based on optical barcoding of individual DNA molecules. These assays will address:
-Bacterial infections and antibiotic resistance
-Diagnosis/prognosis tools for hematological malignancies
-Spinal Muscular Atrophy
-Early diagnosis of colorectal and lung cancer.
Ultimately our project will provide reagents, prototype DNA barcoding devices and data analysis software ready for large scale validation and early stage commercialization.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia rak płuc
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia rak jelita grubego
- medycyna i nauki o zdrowiu nauki o zdrowiu medycyna spersonalizowana
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna farmakologia i farmacja oporność na leki oporność na antybiotyki
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.3.1. - SOCIETAL CHALLENGES - Health, demographic change and well-being
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.3.1.3. - Treating and managing disease
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
RIA - Research and Innovation action
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-PHC-2014-2015
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
69978 Tel Aviv
Izrael
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.