Readout of DNA methylation

Informazioni relative al progetto

ReaDMe

ID dell’accordo di sovvenzione: 667951

DOI 10.3030/667951

Progetto chiuso

Data della firma CE 9 Settembre 2015

Data di avvio 1 Gennaio 2016

Data di completamento 31 Dicembre 2020

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale € 2 136 969,00

Contributo UE € 2 136 969,00

Coordinato da

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Switzerland

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (7)

A genome-scale map of DNA methylation turnover identifies site-specific dependencies of DNMT and TET activity

Autori: Paul Adrian Ginno, Dimos Gaidatzis, Angelika Feldmann, Leslie Hoerner, Dilek Imanci, Lukas Burger, Frederic Zilbermann, Antoine H. F. M. Peters, Frank Edenhofer, Sébastien A. Smallwood, Arnaud R. Krebs, Dirk Schübeler
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-16354-x

Mechanisms of OCT4-SOX2 motif readout on nucleosomes

Autori: Alicia K. Michael, Ralph S. Grand, Luke Isbel, Simone Cavadini, Zuzanna Kozicka, Georg Kempf, Richard D. Bunker, Andreas D. Schenk, Alexandra Graff-Meyer, Ganesh R. Pathare, Joscha Weiss, Syota Matsumoto, Lukas Burger, Dirk Schübeler, Nicolas H. Thomä
Pubblicato in: Science, Numero 368/6498, 2020, Pagina/e 1460-1465, ISSN 0036-8075
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abb0074

Molecular Co-occupancy Identifies Transcription Factor Binding Cooperativity In Vivo

Autori: Can Sönmezer, Rozemarijn Kleinendorst, Dilek Imanci, Guido Barzaghi, Laura Villacorta, Dirk Schübeler, Vladimir Benes, Nacho Molina, Arnaud Regis Krebs
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 81/2, 2021, Pagina/e 255-267.e6, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.11.015

CG dinucleotides enhance promoter activity independent of DNA methylation

Autori: Dominik Hartl, Arnaud R. Krebs, Ralph S. Grand, Tuncay Baubec, Luke Isbel, Christiane Wirbelauer, Lukas Burger, Dirk Schübeler
Pubblicato in: Genome Research, Numero 29/4, 2019, Pagina/e 554-563, ISSN 1088-9051
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.241653.118

Binding of high mobility group A proteins to the mammalian genome occurs as a function of AT-content

Autori: Colombo, Daniele F; Burger, Lukas; Baubec, Tuncay; Schübeler, Dirk
Pubblicato in: PLoS Genetics, Numero 1, 2017, ISSN 1553-7404
Editore: Nick Gilbert, Edinburgh Cancer Centre
DOI: 10.5167/uzh-144792

Cis-regulatory landscapes of four cell types of the retina

Autori: Dominik Hartl, Arnaud R. Krebs, Josephine Jüttner, Botond Roska, Dirk Schübeler
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 45/20, 2017, Pagina/e 11607-11621, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkx923

Cell cycle-resolved chromatin proteomics reveals the extent of mitotic preservation of the genomic regulatory landscape

Autori: Paul Adrian Ginno, Lukas Burger, Jan Seebacher, Vytautas Iesmantavicius, Dirk Schübeler
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-06007-5