Readout of DNA methylation

Projektinformationen

ReaDMe

ID Finanzhilfevereinbarung: 667951

DOI 10.3030/667951

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 9 September 2015

Startdatum 1 Januar 2016

Enddatum 31 Dezember 2020

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 2 136 969,00

EU-Beitrag € 2 136 969,00

Koordiniert durch

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Switzerland

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (7)

A genome-scale map of DNA methylation turnover identifies site-specific dependencies of DNMT and TET activity

Autoren: Paul Adrian Ginno, Dimos Gaidatzis, Angelika Feldmann, Leslie Hoerner, Dilek Imanci, Lukas Burger, Frederic Zilbermann, Antoine H. F. M. Peters, Frank Edenhofer, Sébastien A. Smallwood, Arnaud R. Krebs, Dirk Schübeler
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-16354-x

Mechanisms of OCT4-SOX2 motif readout on nucleosomes

Autoren: Alicia K. Michael, Ralph S. Grand, Luke Isbel, Simone Cavadini, Zuzanna Kozicka, Georg Kempf, Richard D. Bunker, Andreas D. Schenk, Alexandra Graff-Meyer, Ganesh R. Pathare, Joscha Weiss, Syota Matsumoto, Lukas Burger, Dirk Schübeler, Nicolas H. Thomä
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 368/6498, 2020, Seite(n) 1460-1465, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abb0074

Molecular Co-occupancy Identifies Transcription Factor Binding Cooperativity In Vivo

Autoren: Can Sönmezer, Rozemarijn Kleinendorst, Dilek Imanci, Guido Barzaghi, Laura Villacorta, Dirk Schübeler, Vladimir Benes, Nacho Molina, Arnaud Regis Krebs
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 81/2, 2021, Seite(n) 255-267.e6, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.11.015

CG dinucleotides enhance promoter activity independent of DNA methylation

Autoren: Dominik Hartl, Arnaud R. Krebs, Ralph S. Grand, Tuncay Baubec, Luke Isbel, Christiane Wirbelauer, Lukas Burger, Dirk Schübeler
Veröffentlicht in: Genome Research, Ausgabe 29/4, 2019, Seite(n) 554-563, ISSN 1088-9051
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.241653.118

Binding of high mobility group A proteins to the mammalian genome occurs as a function of AT-content

Autoren: Colombo, Daniele F; Burger, Lukas; Baubec, Tuncay; Schübeler, Dirk
Veröffentlicht in: PLoS Genetics, Ausgabe 1, 2017, ISSN 1553-7404
Herausgeber: Nick Gilbert, Edinburgh Cancer Centre
DOI: 10.5167/uzh-144792

Cis-regulatory landscapes of four cell types of the retina

Autoren: Dominik Hartl, Arnaud R. Krebs, Josephine Jüttner, Botond Roska, Dirk Schübeler
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 45/20, 2017, Seite(n) 11607-11621, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkx923

Cell cycle-resolved chromatin proteomics reveals the extent of mitotic preservation of the genomic regulatory landscape

Autoren: Paul Adrian Ginno, Lukas Burger, Jan Seebacher, Vytautas Iesmantavicius, Dirk Schübeler
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-06007-5