Readout of DNA methylation

Informacje na temat projektu

ReaDMe

Identyfikator umowy o grant: 667951

DOI 10.3030/667951

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 9 Września 2015

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2016

Data zakończenia 31 Grudnia 2020

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity € 2 136 969,00

Wkład UE € 2 136 969,00

Koordynowany przez

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Switzerland

Publikacje

Peer reviewed articles (7)

A genome-scale map of DNA methylation turnover identifies site-specific dependencies of DNMT and TET activity

Autorzy: Paul Adrian Ginno, Dimos Gaidatzis, Angelika Feldmann, Leslie Hoerner, Dilek Imanci, Lukas Burger, Frederic Zilbermann, Antoine H. F. M. Peters, Frank Edenhofer, Sébastien A. Smallwood, Arnaud R. Krebs, Dirk Schübeler
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-16354-x

Mechanisms of OCT4-SOX2 motif readout on nucleosomes

Autorzy: Alicia K. Michael, Ralph S. Grand, Luke Isbel, Simone Cavadini, Zuzanna Kozicka, Georg Kempf, Richard D. Bunker, Andreas D. Schenk, Alexandra Graff-Meyer, Ganesh R. Pathare, Joscha Weiss, Syota Matsumoto, Lukas Burger, Dirk Schübeler, Nicolas H. Thomä
Opublikowane w: Science, Numer 368/6498, 2020, Strona(/y) 1460-1465, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abb0074

Molecular Co-occupancy Identifies Transcription Factor Binding Cooperativity In Vivo

Autorzy: Can Sönmezer, Rozemarijn Kleinendorst, Dilek Imanci, Guido Barzaghi, Laura Villacorta, Dirk Schübeler, Vladimir Benes, Nacho Molina, Arnaud Regis Krebs
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 81/2, 2021, Strona(/y) 255-267.e6, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.11.015

CG dinucleotides enhance promoter activity independent of DNA methylation

Autorzy: Dominik Hartl, Arnaud R. Krebs, Ralph S. Grand, Tuncay Baubec, Luke Isbel, Christiane Wirbelauer, Lukas Burger, Dirk Schübeler
Opublikowane w: Genome Research, Numer 29/4, 2019, Strona(/y) 554-563, ISSN 1088-9051
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.241653.118

Binding of high mobility group A proteins to the mammalian genome occurs as a function of AT-content

Autorzy: Colombo, Daniele F; Burger, Lukas; Baubec, Tuncay; Schübeler, Dirk
Opublikowane w: PLoS Genetics, Numer 1, 2017, ISSN 1553-7404
Wydawca: Nick Gilbert, Edinburgh Cancer Centre
DOI: 10.5167/uzh-144792

Cis-regulatory landscapes of four cell types of the retina

Autorzy: Dominik Hartl, Arnaud R. Krebs, Josephine Jüttner, Botond Roska, Dirk Schübeler
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 45/20, 2017, Strona(/y) 11607-11621, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkx923

Cell cycle-resolved chromatin proteomics reveals the extent of mitotic preservation of the genomic regulatory landscape

Autorzy: Paul Adrian Ginno, Lukas Burger, Jan Seebacher, Vytautas Iesmantavicius, Dirk Schübeler
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-06007-5