Multiple manifestations of genetic and non-genetic factors in Multiple Sclerosis disentangled with a multi-omics approach to accelerate personalised medicine

Leistungen

R-packages for patient specific stratification

R-packages for patient specific stratificationMotivation for change:There has been delay in the development of R tools to be used for patient specific stratification as their application and hence development to data in retrospective cohort data has been delayed.

Software for stratification and clinical decision support system

Software for stratification and clinical decision support system. combination of previous D6.3 and D6.4.Motivation for change:After evaluating the market needs and existing software, we plan to combine software for stratification with that for clinical stratification into one product and hence would like to combine D6.3 and 6.4. Depending on intended users, we will make some features unavailable. The software is developed, and the core is ready. However, it is missing a few critical services to be genuinely market-ready which we estimate would require additional time.

Data availability and knowledge discovery tool to monitor for the availability of the different data types

Validation and formulation of candidate MS guidelines to be implemented into clinical practice

Validation and formulation of candidate MS guidelines to be implemented into clinical practiceMotivation for changeBuilds on results from D7376 and hare hence delayed

Report on novel biomarkers and suggestions for their application in clinical practice

Report on novel biomarkers and suggestions for their application in clinical practiceMotivation for changeBuilds on results from D7376 and hare hence delayed

Development of guidelines for reporting biomarker results and their classification into different levels of evidence

Project website

Veröffentlichungen

7 T imaging reveals a gradient in spinal cord lesion distribution in multiple sclerosis

Autoren: Russell Ouellette, Constantina A Treaba, Tobias Granberg, Elena Herranz, Valeria Barletta, Ambica Mehndiratta, Benjamin De Leener, Shahamat Tauhid, Fawad Yousuf, Sarah M Dupont, Eric C Klawiter, Jacob A Sloane, Rohit Bakshi, Julien Cohen-Adad, Caterina Mainero
Veröffentlicht in: Brain, Ausgabe 143/10, 2020, Seite(n) 2973-2987, ISSN 0006-8950
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/brain/awaa249

Longitudinal DNA methylation changes at MET may alter HGF/c-MET signalling in adolescents at risk for depression

Autoren: Diana M. Ciuculete, Sarah Voisin, Lara Kular, Nipuni Welihinda, Jörgen Jonsson, Maja Jagodic, Jessica Mwinyi, Helgi B. Schiöth
Veröffentlicht in: Epigenetics, Ausgabe 15/6-7, 2020, Seite(n) 646-663, ISSN 1559-2294
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15592294.2019.1700628

MRI‐Based Manual versus Automated Corpus Callosum Volumetric Measurements in Multiple Sclerosis

Autoren: Michael Platten, Juha Martola, Katharina Fink, Russell Ouellette, Fredrik Piehl, Tobias Granberg
Veröffentlicht in: Journal of Neuroimaging, Ausgabe 30/2, 2020, Seite(n) 198-204, ISSN 1051-2284
Herausgeber: Sage Science Press
DOI: 10.1111/jon.12676

Association between brain volume and disability over time in multiple sclerosis

Autoren: Moridi T, Stawiarz L, McKay KA, Ineichen BV, Ouellette R, Ferreira D, Muehlboeck JS, Westman E, Kockum I, Olsson T, Piehl F, Hillert J, Manouchehrinia A, Granberg T.
Veröffentlicht in: Mult Scler J Exp Transl Clin, 2022, ISSN 2055-2173
Herausgeber: Sage Publications
DOI: 10.1177/20552173221144230

LIBRA: an adaptative integrative tool for paired single-cell multi-omics data

Autoren: Xabier Martinez-de-Morentin , Sumeer A. Khan , Robert Lehmann , Sisi Qu , Alberto Maillo , Narsis A. Kiani , Felipe Prosper , Jesper Tegner , David Gomez-Cabrero
Veröffentlicht in: Quant. Biol, 2023, ISSN 2095-4697
Herausgeber: Higher Education Press
DOI: 10.15302/j-qb-022-0318

Seasonal variability of serum 25-hydroxyvitamin D on multiple sclerosis onset.

Autoren: Stridh P, Kockum I, Huang J
Veröffentlicht in: Sci Rep, Ausgabe 2021 Oct 25;11(1):20989, 2021, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-00344-0

Environmental risk factors in multiple sclerosis: bridging Mendelian randomization and observational studies.

Autoren: Vandebergh, Marijne; Degryse, Nicolas; Dubois, Benedicte; Goris, An
Veröffentlicht in: JOURNAL OF NEUROLOGY, Ausgabe J Neurol . 2022 Aug;269(8):4565-4574, 2022, ISSN 0340-5354
Herausgeber: Dr. Dietrich Steinkopff Verlag
DOI: 10.1007/s00415-022-11072-4

Smoking and Epstein–Barr virus infection in multiple sclerosis development

Autoren: Anna Karin Hedström, Jesse Huang, Nicole Brenner, Julia Butt, Jan Hillert, Tim Waterboer, Ingrid Kockum, Tomas Olsson, Lars Alfredsson
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-67883-w

Frequency of myelin oligodendrocyte glycoprotein antibodies in a large cohort of neurological patients

Autoren: Held F, Kalluri SR, Berthele A, Klein AK, Reindl M, Hemmer B
Veröffentlicht in: MULTIPLE SCLEROSIS JOURNAL-EXPERIMENTAL TRANSLATIONAL AND CLINICAL, Ausgabe Mult Scler J Exp Transl Clin . 2021 Jun 25;7(2):20552173211022767, 2021, ISSN 2055-2173
Herausgeber: SAGE PUBLICATIONS INC
DOI: 10.1177/20552173211022767

Body Mass Index, Interleukin-6 Signaling and Multiple Sclerosis: A Mendelian Randomization Study.

Autoren: Vandebergh, Marijne; Becelaere, Sara; Dubois, Benedicte; Goris, An; CHARGE, Inflammation Working Grp
Veröffentlicht in: Frontiers In Immunology, Ausgabe 2022 Mar 21;13:834644, 2022, ISSN 1664-3224
Herausgeber: FRONTIERS MEDIA SA
DOI: 10.3389/fimmu.2022.834644

Inflammation-related plasma and CSF biomarkers for multiple sclerosis

Autoren: Jesse Huang, Mohsen Khademi, Lars Fugger, Örjan Lindhe, Lenka Novakova, Markus Axelsson, Clas Malmeström, Clara Constantinescu, Jan Lycke, Fredrik Piehl, Tomas Olsson, Ingrid Kockum
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 117/23, 2020, Seite(n) 12952-12960, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1912839117

Finding cell-specific expression patterns in the early Ciona embryo with single-cell RNA-seq

Autoren: Garth R. Ilsley, Ritsuko Suyama, Takeshi Noda, Nori Satoh, Nicholas M. Luscombe
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-61591-1

Percentage brain volume change in multiple sclerosis mainly reflects white matter and cortical volume

Autoren: Markus Lauerer, Matthias Bussas, Viola Pongratz, Achim Berthele, Jan S Kirschke, Benedikt Wiestler, Claus Zimmer, Bernhard Hemmer, Mark Mühlau
Veröffentlicht in: Ann Clin Transl Neurol, 2023, ISSN 2328-9503
Herausgeber: Wiley

Effect of Vitamin D on Experimental Autoimmune Neuroinflammation Is Dependent on Haplotypes Comprising Naturally Occurring Allelic Variants of CIITA (Mhc2ta)

Autoren: Sonja Hochmeister, Shahin Aeinehband, Charles Dorris, Rasmus Berglund, Michaela T. Haindl, Vid Velikic, Sven A. Gustafsson, Tomas Olsson, Fredrik Piehl, Maja Jagodic, Manuel Zeitelhofer, Milena Z. Adzemovic
Veröffentlicht in: Frontiers in Neurology, Ausgabe 11, 2020, ISSN 1664-2295
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fneur.2020.600401

A pharmacogenetic study implicates NINJ2 in the response to Interferon-β in multiple sclerosis

Autoren: Silvia Peroni, Melissa Sorosina, Sunny Malhotra, Ferdinando Clarelli, Ana Maria Osiceanu, Laura Ferrè, Tina Roostaei, Jordi Rio, Luciana Midaglia, Luisa María Villar, José Carlos Álvarez-Cermeño, Clara Guaschino, Marta Radaelli, Lorena Citterio, Jeannette Lechner-Scott, Nino Spataro, Arcadi Navarro, Vittorio Martinelli, Xavier Montalban, Howard L Weiner, Philip de Jager, Giancarlo Comi, Feder
Veröffentlicht in: Multiple Sclerosis Journal, Ausgabe 26/9, 2020, Seite(n) 1074-1082, ISSN 1352-4585
Herausgeber: SAGE Publications
DOI: 10.1177/1352458519851428

A genetic risk variant for multiple sclerosis severity is associated with brain atrophy

Autoren: Gasperi, Christiane; Wiltgen, Tun; McGinnis, Julian; Cerri, Stefano; Moridi, Thomas; Ouellette, Russell; Pukaj, Albert; Voon, Cuici; Bafligil, Cemsel; Lauerer, Markus; Andlauer, Till; Held, Friederike; Aly, Lilian; Shchetynsky, Klementy; Stridh, Pernilla; Harroud, Adil; Wiestler, Benedikt; Kirschke, Jan; Zimmer, Claus; Baras, Aris; Piehl, Fredrik; Berthele, Achim; Granberg, Tobias; Kockum, Ingrid;
Veröffentlicht in: Ann Neurol, 2023, ISSN 0364-5134
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/ana.26807

Cross-reactive EBNA1 immunity targets alpha-crystallin B and is associated with multiple sclerosis

Autoren: Thomas O G, Bronge M, Tengvall K, Akpinar B, Nilsson OB, Holmgren E, Hessa T, Gafvelin G, Khademi M, Alfredsson L, Martin R, Ortlieb Guerreiro-Cacais A, Grönlund H, Olsson T, Kockum I
Veröffentlicht in: Sci Adv., 2023, ISSN 2375-2548
Herausgeber: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.adg3032

Nervous System Involvement in Coronavirus Disease 2019: Results from a Retrospective Consecutive Neuroimaging Cohort

Autoren: Stefanos Klironomos, Antonios Tzortzakakis, Annika Kits, Claes Öhberg, Evangelia Kollia, Amir Ahoromazdae, Håkan Almqvist, Åsa Aspelin, Heather Martin, Russell Ouellette, Jonathan Al-Saadi, Mikael Hasselberg, Mansour Haghgou, Mitra Pedersen, Sven Petersson, Johannes Finnsson, Johan Lundberg, Anna Falk Delgado, Tobias Granberg
Veröffentlicht in: Radiology, Ausgabe 297/3, 2020, Seite(n) E324-E334, ISSN 0033-8419
Herausgeber: Radiological Society of North America
DOI: 10.1148/radiol.2020202791

Transcript-specific regulation in T-cells in multiple sclerosis susceptibility

Autoren: Lies Van Horebeek, An Goris
Veröffentlicht in: European Journal of Human Genetics, Ausgabe 28/7, 2020, Seite(n) 849-850, ISSN 1018-4813
Herausgeber: Natue Publishing Group
DOI: 10.1038/s41431-020-0615-y

Genetic Variation in WNT9B Increases Relapse Hazard in Multiple Sclerosis.

Autoren: Vandebergh, Marijne; Andlauer, Till FM; Zhou, Yuan; Mallants, Klara; Held, Friederike; Aly, Lilian; Taylor, Bruce V; Hemmer, Bernhard; Dubois, Benedicte; Goris, An
Veröffentlicht in: Annals Of Neurology, Ausgabe 2021 May;89(5):884-894., 2021, ISSN 0364-5134
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/ana.26061

Serum neurofilament light chain for individual prognostication of disease activity in people with multiple sclerosis: a retrospective modelling and validation study

Autoren: Benkert P, Meier S, Schaedelin S, Manouchehrinia A, Yaldizli Ö, Maceski A, Oechtering J, Achtnichts L, Conen D, Derfuss T, Lalive P H, Mueller C, Müller S, Naegelin Y, Oksenberg JR, Pot C, Salmen A, Willemse E, Kockum I, Blennow K, Zetterberg Z, Gobbi C, Kappos L, Wiendl H, Berger K, Sormani MP, Granziera C, Piehl F, Leppert D, Kuhle Jfor the RDB in the Swiss Multiple Sclerosis Cohort Study Grou
Veröffentlicht in: Lancet Neurology, Ausgabe 2022 Mar;21(3):246-257., 2022, ISSN 1474-4422
Herausgeber: The Lancet Publishing Group
DOI: 10.1016/s1474-4422(22)00009-6

Smoking and multiple sclerosis risk: a Mendelian randomization study

Autoren: Marijne Vandebergh, An Goris
Veröffentlicht in: Journal of Neurology, Ausgabe 267/10, 2020, Seite(n) 3083-3091, ISSN 0340-5354
Herausgeber: Dr. Dietrich Steinkopff Verlag
DOI: 10.1007/s00415-020-09980-4

Assessing the preanalytical variability of plasma and cerebrospinal fluid processing and its effects on inflammation-related protein biomarkers.

Autoren: Huang J, Khademi M, Lindhe Ö, Jönsson G, Piehl F, Olsson T, Kockum I
Veröffentlicht in: Mol Cell Proteomics., 2021, ISSN 1535-9484
Herausgeber: ELSEVIER

Season of birth is associated with multiple sclerosis and disease severity

Autoren: Stridh P, Huang J, Hedström AK, Alfredsson L, Olsson T, Hillert J, Manouchehrinia A, Kockum I
Veröffentlicht in: MULTIPLE SCLEROSIS JOURNAL-EXPERIMENTAL TRANSLATIONAL AND CLINICAL, Ausgabe 2021 Dec 22;7(4):20552173211065730., 2021, ISSN 2055-2173
Herausgeber: SAGE PUBLICATIONS I
DOI: 10.1177/20552173211065730

Small noncoding RNA profiling across cellular and biofluid compartments and their implications for multiple sclerosis immunopathology

Autoren: Zheleznyakova GY, Piket E, Needhamsen M, Hagemann-Jensen M, Ekman D, Han Y, James T, Khademi M, Al Nimer F, Scicluna P, Huang J, Kockum I, Faridani OR, Olsson T, Piehl F, Jagodic M
Veröffentlicht in: Proc Natl Acad Sci U S A. 2021 Apr 27;118(17), 2021, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2011574118

Prognostic value of spinal cord lesion measures in early relapsing-remitting multiple sclerosis.

Autoren: Lauerer M, McGinnis J, Bussas M, El Husseini M, Pongratz V, Engl C, Wuschek A, Berthele A, Riederer I, Kirschke JS, Zimmer C, Hemmer B, Mühlau M.
Veröffentlicht in: J Neurol Neurosurg Psychiatry, 2023, ISSN 1468-330X
Herausgeber: BMJ

Human immune diversity: from evolution to modernity.

Autoren: Liston, Adrian; Humblet-Baron, Stephanie; Duffy, Darragh; Goris, An
Veröffentlicht in: Nature Immunology, Ausgabe 22, pages1479–1489 (2021), 2021, ISSN 1529-2908
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41590-021-01058-1

Genetic determinants of the humoral immune response in MS

Autoren: Christiane Gasperi, Till F.M. Andlauer, Ana Keating, Benjamin Knier, Ana Klein, Verena Pernpeintner, Peter Lichtner, Ralf Gold, Frauke Zipp, Florian Then Bergh, Martin Stangel, Hayrettin Tumani, Brigitte Wildemann, Heinz Wiendl, Antonios Bayas, Tania Kümpfel, Uwe K. Zettl, Ralf A. Linker, Ulf Ziemann, Matthias Knop, Clemens Warnke, Manuel A. Friese, Friedemann Paul, Björn Tackenberg, Achim Berth
Veröffentlicht in: Neurology - Neuroimmunology Neuroinflammation, Ausgabe 7/5, 2020, Seite(n) e827, ISSN 2332-7812
Herausgeber: Wolters Kluwer Health, Inc. on behalf of the American Academy of Neurology.
DOI: 10.1212/nxi.0000000000000827

Sustained Low Relapse Rate With Highly Variable B-Cell Repopulation Dynamics With Extended Rituximab Dosing Intervals in Multiple Sclerosis.

Autoren: Starvaggi Cucuzza C, Longinetti E, Ruffin N, Evertsson B, Kockum I, Jagodic M, Al Nimer F, Frisell T, Piehl F.
Veröffentlicht in: Neurol Neuroimmunol Neuroinflamm., 2022, ISSN 2332-7812
Herausgeber: Wolters Kluwer Health/Lippincott Williams & Wilkins

Overview of genotyping technologies and methods

Autoren: Kockum I, Huang J, Stridh P
Veröffentlicht in: Curr Protoc, 2023, ISSN 2691-1299
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/cpz1.727

Natural Killer Cells in Multiple Sclerosis: Entering the Stage

Autoren: Beliën, Jarne; Goris, An; Matthys, Patrick
Veröffentlicht in: FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, 2022, ISSN 1664-3224
Herausgeber: FRONTIERS MEDIA SA
DOI: 10.3389/fimmu.2022.869447

Quantitative MRI phenotypes capture biological heterogeneity in multiple sclerosis patients

Autoren: Ide Smets, An Goris, Marijne Vandebergh, Jelle Demeestere, Stefan Sunaert, Patrick Dupont, Bénédicte Dubois
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 11/1, 2021, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-81035-8

Impact of multiple sclerosis risk loci in postinfectious neurological syndromes

Autoren: Filippo Martinelli-Boneschi, Riccardo Currò, Silvia Santoro, Giulia Berzero, Melissa Sorosina, Laura Ferrè, Elisabetta Mascia, Silvia Peroni, Giancarlo Comi, Angelo Gugliemi, Elisa Vegezzi, Ilaria Callegari, Massimo Filippi, Andrea Cortese, Federica Esposito, Ferdinando Clarelli, Enrico Marchioni
Veröffentlicht in: Multiple Sclerosis and Related Disorders, Ausgabe 44, 2020, Seite(n) 102326, ISSN 2211-0348
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.msard.2020.102326

LSD-induced increase of Ising temperature and algorithmic complexity of brain dynamics

Autoren: Giulio Ruffini ,Giada Damiani,Diego Lozano-Soldevilla,Nikolas Deco,Fernando E. Rosas,Narsis A. Kiani,Adrián Ponce-Alvarez,Morten L. Kringelbach,Robin Carhart-Harris,Gustavo Deco
Veröffentlicht in: PLoS Comput Biol, 2023, ISSN 1553-734X
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010811

Epstein–Barr virus infection after adolescence and human herpesvirus 6A as risk factors for multiple sclerosis

Autoren: M. Biström, D. Jons, E. Engdahl, R. Gustafsson, J. Huang, N. Brenner, J. Butt, L. Alonso‐Magdalena, M. Gunnarsson, M. Vrethem, N. Bender, T. Waterboer, G. Granåsen, T. Olsson, I. Kockum, O. Andersen, A. Fogdell‐Hahn, Peter Sundström
Veröffentlicht in: European Journal of Neurology, Ausgabe 28/2, 2021, Seite(n) 579-586, ISSN 1351-5101
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/ene.14597

The Aryl Hydrocarbon Receptor-Dependent TGF-alpha/VEGF-B Ratio Correlates With Disease Subtype and Prognosis in Multiple Sclerosis

Autoren: Cirac A, Tsaktanis T, Beyer T, Linnerbauer M, Andlauer T, Grummel V, Nirschl L, Loesslein L, Quintana FJ, Hemmer B, Rothhammer V
Veröffentlicht in: Neurol Neuroimmunol Neuroinflamm, 2022, ISSN 2332-7812
Herausgeber: LIPPINCOTT WILLIAMS & WILKINS
DOI: 10.1212/nxi.0000000000001043

Cytomegalovirus seropositivity is associated with reduced risk of multiple sclerosis - a presymptomatic case-control study.

Autoren: Grut V, Biström M, Salzer J, Stridh P, Jons D, Gustafsson R, Fogdell-Hahn A, Huang J, Brenner N, Butt J, Bender N, Lindam A, Alonso-Magdalena L, Gunnarsson M, Vrethem M, Bergström T, Andersen O, Kockum I, Waterboer T, Olsson T, Sundström P
Veröffentlicht in: Eur J Neurol., 2021, ISSN 1351-5101
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/ene.14961

Epigenetic insights into multiple sclerosis disease progression

Autoren: L. Kular, M. Jagodic
Veröffentlicht in: Journal of Internal Medicine, Ausgabe 288/1, 2020, Seite(n) 82-102, ISSN 0954-6820
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/joim.13045

Deep characterization of paired chromatin and transcriptomes in four immune cell types from multiple sclerosis patients. . 2021 Oct;13(20):1607-1618. doi: /

Autoren: Fernandes SJ, Ericsson M, Khademi M, Jagodic M, Olsson T, Gomez-Cabrero D, Kockum I, Tegnér J.
Veröffentlicht in: Epigenomics, 2021, ISSN 1750-1911
Herausgeber: Future Medicine Ltd.
DOI: 10.2217/epi-2021-0205

Systematic Assessment of Medical Diagnoses Preceding the First Diagnosis of Multiple Sclerosis

Autoren: Gasperi C, Hapfelmeier A, Daltrozzo T, Schneider A, Donnachie E, Hemmer B.
Veröffentlicht in: NEUROLOGY, Ausgabe 2021 Apr 26;10.1212/WNL.0000000000012074., 2021, ISSN 0028-3878
Herausgeber: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1212/wnl.0000000000012074

Lesion location across diagnostic regions in multiple sclerosis

Autoren: Viola Pongratz, Matthias Bussas, Paul Schmidt, Sophia Grahl, Christiane Gasperi, Malek El Husseini, Laura Harabacz, Viktor Pineker, Dominik Sepp, Lioba Grundl, Benedikt Wiestler, Jan Kirschke, Claus Zimmer, Achim Berthele, Bernhard Hemmer, Mark Mühlau
Veröffentlicht in: Neuroimage Clin., 2023, ISSN 2213-1582
Herausgeber: Elsevier BV

Neurological manifestations of coronavirus infections – a systematic review

Autoren: Jesper Almqvist, Tobias Granberg, Antonios Tzortzakakis, Stefanos Klironomos, Evangelia Kollia, Claes Öhberg, Roland Martin, Fredrik Piehl, Russell Ouellette, Benjamin V. Ineichen
Veröffentlicht in: Annals of Clinical and Translational Neurology, Ausgabe 7/10, 2020, Seite(n) 2057-2071, ISSN 2328-9503
Herausgeber: Wiley Periodicals LLC on behalf of American Neurological Association.
DOI: 10.1002/acn3.51166

GeneSetCluster: a tool for summarizing and integrating gene-set analysis results

Autoren: Ewoud Ewing, Nuria Planell-Picola, Maja Jagodic, David Gomez-Cabrero
Veröffentlicht in: BMC Bioinformatics, Ausgabe 21/1, 2020, ISSN 1471-2105
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-020-03784-z

DNA methylation as a mediator of HLA-DRB1*15:01 and a protective variant in multiple sclerosis

Autoren: Lara Kular, Yun Liu, Sabrina Ruhrmann, Galina Zheleznyakova, Francesco Marabita, David Gomez-Cabrero, Tojo James, Ewoud Ewing, Magdalena Lindén, Bartosz Górnikiewicz, Shahin Aeinehband, Pernilla Stridh, Jenny Link, Till F. M. Andlauer, Christiane Gasperi, Heinz Wiendl, Frauke Zipp, Ralf Gold, Björn Tackenberg, Frank Weber, Bernhard Hemmer, Konstantin Strauch, Stefanie Heilmann-Heimbach, Rajesh
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-04732-5

Epigenetic and Transcriptional Variability Shape Phenotypic Plasticity

Autoren: Simone Ecker, Vera Pancaldi, Alfonso Valencia, Stephan Beck, Dirk S. Paul
Veröffentlicht in: BioEssays, Ausgabe 40/2, 2018, Seite(n) 1700148, ISSN 0265-9247
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/bies.201700148

Impact of genetic risk loci for multiple sclerosis on expression of proximal genes in patients

Autoren: Tojo James, Magdalena Lindén, Hiromasa Morikawa, Sunjay Jude Fernandes, Sabrina Ruhrmann, Mikael Huss, Maya Brandi, Fredrik Piehl, Maja Jagodic, Jesper Tegnér, Mohsen Khademi, Tomas Olsson, David Gomez-Cabrero, Ingrid Kockum
Veröffentlicht in: Human Molecular Genetics, Ausgabe 27/5, 2018, Seite(n) 912-928, ISSN 0964-6906
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/hmg/ddy001

Epigenetic variation taking center stage in immunological research

Autoren: Simone Ecker, Stephan Beck
Veröffentlicht in: Epigenomics, Ausgabe 9/4, 2017, Seite(n) 375-378, ISSN 1750-1911
Herausgeber: Future Medicine Ltd.
DOI: 10.2217/epi-2017-0006

Plasma neurofilament light chain levels in patients with MS switching from injectable therapies to fingolimod

Autoren: Fredrik Piehl, Ingrid Kockum, Mohsen Khademi, Kaj Blennow, Jan Lycke, Henrik Zetterberg, Tomas Olsson
Veröffentlicht in: Multiple Sclerosis Journal, Ausgabe 24/8, 2018, Seite(n) 1046-1054, ISSN 1352-4585
Herausgeber: SAGE Publications
DOI: 10.1177/1352458517715132

Fourteen sequence variants that associate with multiple sclerosis discovered by meta-analysis informed by genetic correlations

Autoren: Sigurgeir Olafsson, Pernilla Stridh, Steffan Daniël Bos, Andres Ingason, Jack Euesden, Patrick Sulem, Gudmar Thorleifsson, Omar Gustafsson, Ari Johannesson, Arni J. Geirsson, Arni V. Thorsson, Bardur Sigurgeirsson, Bjorn Runar Ludviksson, Elias Olafsson, Helga Kristjansdottir, Jon G. Jonasson, Jon Hjaltalin Olafsson, Kjartan B. Orvar, Rafn Benediktsson, Ragnar Bjarnason, Sjofn Kristjansdottir, Th
Veröffentlicht in: npj Genomic Medicine, Ausgabe 2/1, 2017, ISSN 2056-7944
Herausgeber: NPJ Genom Med
DOI: 10.1038/s41525-017-0027-2

Serum heat shock protein 70 levels as a biomarker for inflammatory processes in multiple sclerosis

Autoren: Patricia Lechner, Dorothea Buck, Lisa Sick, Bernhard Hemmer, Gabriele Multhoff
Veröffentlicht in: Multiple Sclerosis Journal - Experimental, Translational and Clinical, Ausgabe 4/2, 2018, Seite(n) 205521731876719, ISSN 2055-2173
Herausgeber: Mult Scler J Exp Transl Clin.
DOI: 10.1177/2055217318767192

Multiple sclerosis risk variants alter expression of co-stimulatory genes in B cells

Autoren: Ide Smets, Barnaby Fiddes, Josselyn E Garcia-Perez, Di He, Klara Mallants, Wenjia Liao, James Dooley, George Wang, Stephanie Humblet-Baron, Bénédicte Dubois, Alastair Compston, Joanne Jones, Alasdair Coles, Adrian Liston, Maria Ban, An Goris, Stephen Sawcer
Veröffentlicht in: Brain, Ausgabe 141/3, 2018, Seite(n) 786-796, ISSN 0006-8950
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/brain/awx372

Increased DNA methylation variability in rheumatoid arthritis-discordant monozygotic twins

Autoren: Amy P. Webster, Darren Plant, Simone Ecker, Flore Zufferey, Jordana T. Bell, Andrew Feber, Dirk S. Paul, Stephan Beck, Anne Barton, Frances M. K. Williams, Jane Worthington
Veröffentlicht in: Genome Medicine, Ausgabe 10/1, 2018, ISSN 1756-994X
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13073-018-0575-9

Smoking induces DNA methylation changes in Multiple Sclerosis patients with exposure-response relationship

Autoren: Francesco Marabita, Malin Almgren, Louise K. Sjöholm, Lara Kular, Yun Liu, Tojo James, Nimrod B. Kiss, Andrew P. Feinberg, Tomas Olsson, Ingrid Kockum, Lars Alfredsson, Tomas J. Ekström, Maja Jagodic
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-14788-w

Hypermethylation of MIR21 in CD4+ T cells from patients with relapsing-remitting multiple sclerosis associates with lower miRNA-21 levels and concomitant up-regulation of its target genes

Autoren: Sabrina Ruhrmann, Ewoud Ewing, Eliane Piket, Lara Kular, Julio Cesar Cetrulo Lorenzi, Sunjay Jude Fernandes, Hiromasa Morikawa, Shahin Aeinehband, Sergi Sayols-Baixeras, Stella Aslibekyan, Devin M Absher, Donna K Arnett, Jesper Tegner, David Gomez-Cabrero, Fredrik Piehl, Maja Jagodic
Veröffentlicht in: Multiple Sclerosis Journal, Ausgabe 24/10, 2018, Seite(n) 1288-1300, ISSN 1352-4585
Herausgeber: SAGE Publications
DOI: 10.1177/1352458517721356

Ensembl 2018

Autoren: Daniel R Zerbino, Premanand Achuthan, Wasiu Akanni, M Ridwan Amode, Daniel Barrell, Jyothish Bhai, Konstantinos Billis, Carla Cummins, Astrid Gall, Carlos García Girón, Laurent Gil, Leo Gordon, Leanne Haggerty, Erin Haskell, Thibaut Hourlier, Osagie G Izuogu, Sophie H Janacek, Thomas Juettemann, Jimmy Kiang To, Matthew R Laird, Ilias Lavidas, Zhicheng Liu, Jane E Loveland, Thomas Maurel, Willia
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 46/D1, 2017, Seite(n) D754-D761, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkx1098

Association of Intrathecal Immunoglobulin G Synthesis With Disability Worsening in Multiple Sclerosis

Autoren: Christiane Gasperi, Anke Salmen, Gisela Antony, Antonios Bayas, Christoph Heesen, Tania Kümpfel, Ralf A. Linker, Friedemann Paul, Martin Stangel, Björn Tackenberg, Florian Then Bergh, Clemens Warnke, Frank Weber, Heinz Wiendl, Brigitte Wildemann, Uwe K. Zettl, Ulf Ziemann, Frauke Zipp, Hayrettin Tumani, Ralf Gold, Bernhard Hemmer
Veröffentlicht in: JAMA Neurology, Ausgabe 76/7, 2019, Seite(n) 841, ISSN 2168-6149
Herausgeber: American Medical Association
DOI: 10.1001/jamaneurol.2019.0905

Towards a European health research and innovation cloud (HRIC)

Autoren: F. M. Aarestrup, A. Albeyatti, W. J. Armitage, C. Auffray, L. Augello, R. Balling, N. Benhabiles, G. Bertolini, J. G. Bjaalie, M. Black, N. Blomberg, P. Bogaert, M. Bubak, B. Claerhout, L. Clarke, B. De Meulder, G. D’Errico, A. Di Meglio, N. Forgo, C. Gans-Combe, A. E. Gray, I. Gut, A. Gyllenberg, G. Hemmrich-Stanisak, L. Hjorth, Y. Ioannidis, S. Jarmalaite, A. Kel, F. Kherif, J. O. Korbel, C. L
Veröffentlicht in: Genome Medicine, Ausgabe 12/1, 2020, ISSN 1756-994X
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13073-020-0713-z

CHIT1 at Diagnosis Reflects Long‐Term Multiple Sclerosis Disease Activity

Autoren: Emanuela Oldoni, Ide Smets, Klara Mallants, Marijne Vandebergh, Lies Van Horebeek, Koen Poesen, Patrick Dupont, Bénédicte Dubois, An Goris
Veröffentlicht in: Annals of Neurology, 2020, ISSN 0364-5134
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/ana.25691

A Systematic Assessment of Prevalence, Incidence and Regional Distribution of Multiple Sclerosis in Bavaria From 2006 to 2015

Autoren: Tanja Daltrozzo, Alexander Hapfelmeier, Ewan Donnachie, Antonius Schneider, Bernhard Hemmer
Veröffentlicht in: Frontiers in Neurology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-2295
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fneur.2018.00871

CSF parameters associated with early MRI activity in patients with MS

Autoren: Ana Klein, Rebecca C. Selter, Alexander Hapfelmeier, Achim Berthele, Bertram Müller-Myhsok, Viola Pongratz, Christiane Gasperi, Claus Zimmer, Mark Mühlau, Bernhard Hemmer
Veröffentlicht in: Neurology - Neuroimmunology Neuroinflammation, Ausgabe 6/4, 2019, Seite(n) e573, ISSN 2332-7812
Herausgeber: A. Neurol Neuroimmunol Neuroinflamm.
DOI: 10.1212/nxi.0000000000000573

Increased Serological Response Against Human Herpesvirus 6A Is Associated With Risk for Multiple Sclerosis

Autoren: Elin Engdahl, Rasmus Gustafsson, Jesse Huang, Martin Biström, Izaura Lima Bomfim, Pernilla Stridh, Mohsen Khademi, Nicole Brenner, Julia Butt, Angelika Michel, Daniel Jons, Maria Hortlund, Lucia Alonso-Magdalena, Anna Karin Hedström, Louis Flamand, Masaru Ihira, Tetsushi Yoshikawa, Oluf Andersen, Jan Hillert, Lars Alfredsson, Tim Waterboer, Peter Sundström, Tomas Olsson, Ingrid Kockum, Anna Fog
Veröffentlicht in: Frontiers in Immunology, Ausgabe 10, 2019, ISSN 1664-3224
Herausgeber: Front immunol
DOI: 10.3389/fimmu.2019.02715

LncRNAs expression profile in peripheral blood mononuclear cells from multiple sclerosis patients

Autoren: Chiara Fenoglio, Emanuela Oldoni, Maria Serpente, Milena A. De Riz, Marina Arcaro, Marianna D'Anca, Anna M. Pietroboni, Alberto Calvi, Elisabetta Lecchi, An Goris, Klara Mallants, Bénédicte Dubois, Cristoforo Comi, Roberto Cantello, Elio Scarpini, Daniela Galimberti
Veröffentlicht in: Journal of Neuroimmunology, Ausgabe 324, 2018, Seite(n) 129-135, ISSN 0165-5728
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jneuroim.2018.08.008

The influence of human leukocyte antigen-DRB1*15:01 and its interaction with smoking in MS development is dependent on DQA1*01:01 status

Autoren: Anna Karin Hedström, Ola Hössjer, Jan Hillert, Pernilla Stridh, Ingrid Kockum, Tomas Olsson, Lars Alfredsson
Veröffentlicht in: Multiple Sclerosis Journal, 2019, Seite(n) 135245851987768, ISSN 1352-4585
Herausgeber: SAGE Publications
DOI: 10.1177/1352458519877685

Low sun exposure increases multiple sclerosis risk both directly and indirectly

Autoren: Anna Karin Hedström, Tomas Olsson, Ingrid Kockum, Jan Hillert, Lars Alfredsson
Veröffentlicht in: Journal of Neurology, 2019, ISSN 0340-5354
Herausgeber: Dr. Dietrich Steinkopff Verlag
DOI: 10.1007/s00415-019-09677-3

A large case-control study on vaccination as risk factor for multiple sclerosis

Autoren: Alexander Hapfelmeier, Christiane Gasperi, Ewan Donnachie, Bernhard Hemmer
Veröffentlicht in: Neurology, Ausgabe 93/9, 2019, Seite(n) e908-e916, ISSN 0028-3878
Herausgeber: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1212/wnl.0000000000008012

Genetic Architecture of Adaptive Immune System Identifies Key Immune Regulators

Autoren: Vasiliki Lagou, Josselyn E. Garcia-Perez, Ide Smets, Lies Van Horebeek, Marijne Vandebergh, Liye Chen, Klara Mallants, Teresa Prezzemolo, Kelly Hilven, Stephanie Humblet-Baron, Matthieu Moisse, Philip Van Damme, Guy Boeckxstaens, Paul Bowness, Bénédicte Dubois, James Dooley, Adrian Liston, An Goris
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 25/3, 2018, Seite(n) 798-810.e6, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2018.09.048

A nonsynonymous mutation in PLCG2 reduces the risk of Alzheimer’s disease, dementia with Lewy bodies and frontotemporal dementia, and increases the likelihood of longevity

Autoren: Sven J. van der Lee, Olivia J. Conway, Iris Jansen, Minerva M. Carrasquillo, Luca Kleineidam, Erik van den Akker, Isabel Hernández, Kristel R. van Eijk, Najada Stringa, Jason A. Chen, Anna Zettergren, Till F. M. Andlauer, Monica Diez-Fairen, Javier Simon-Sanchez, Alberto Lleó, Henrik Zetterberg, Marianne Nygaard, Cornelis Blauwendraat, Jeanne E. Savage, Jonas Mengel-From, Sonia Moreno-Grau, Mich
Veröffentlicht in: Acta Neuropathologica, Ausgabe 138/2, 2019, Seite(n) 237-250, ISSN 0001-6322
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00401-019-02026-8

Non-parametric combination analysis of multiple data types enables detection of novel regulatory mechanisms in T cells of multiple sclerosis patients

Autoren: Sunjay Jude Fernandes, Hiromasa Morikawa, Ewoud Ewing, Sabrina Ruhrmann, Rubin Narayan Joshi, Vincenzo Lagani, Nestoras Karathanasis, Mohsen Khademi, Nuria Planell, Angelika Schmidt, Ioannis Tsamardinos, Tomas Olsson, Fredrik Piehl, Ingrid Kockum, Maja Jagodic, Jesper Tegnér, David Gomez-Cabrero
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 9/1, 2019, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-48493-7

Leveraging human genetics to inform intervention strategies for multiple sclerosis

Autoren: An Goris, Bénédicte Dubois
Veröffentlicht in: Neurology, Ausgabe 92/16, 2019, Seite(n) 735-736, ISSN 0028-3878
Herausgeber: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1212/wnl.0000000000007298

Validation of rapid magnetic resonance myelin imaging in multiple sclerosis

Autoren: Russell Ouellette, Gabriel Mangeat, Ildiko Polyak, Marcel Warntjes, Yngve Forslin, åsa Bergendal, Michael Plattén, Martin Uppman, Constantina Andrada Treaba, Julien Cohen‐Adad, Fredrik Piehl, Maria Kristoffersen Wiberg, Sten Fredrikson, Caterina Mainero, Tobias Granberg
Veröffentlicht in: Annals of Neurology, 2020, ISSN 0364-5134
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/ana.25705

DeepWAS: Multivariate genotype-phenotype associations by directly integrating regulatory information using deep learning

Autoren: Janine Arloth, Gökcen Eraslan, Till F. M. Andlauer, Jade Martins, Stella Iurato, Brigitte Kühnel, Melanie Waldenberger, Josef Frank, Ralf Gold, Bernhard Hemmer, Felix Luessi, Sandra Nischwitz, Friedemann Paul, Heinz Wiendl, Christian Gieger, Stefanie Heilmann-Heimbach, Tim Kacprowski, Matthias Laudes, Thomas Meitinger, Annette Peters, Rajesh Rawal, Konstantin Strauch, Susanne Lucae, Bertram Mül
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 16/2, 2020, Seite(n) e1007616, ISSN 1553-7358
Herausgeber: PLoS Comput Biol
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1007616

Low-Frequency and Rare-Coding Variation Contributes to Multiple Sclerosis Risk

Autoren: Mitja Mitrovič, Nikolaos A. Patsopoulos, Ashley H. Beecham, Theresa Dankowski, An Goris, Bénédicte Dubois, Marie B. D’hooghe, Robin Lemmens, Philip Van Damme, Helle Bach Søndergaard, Finn Sellebjerg, Per Soelberg Sorensen, Henrik Ullum, Lise W. Thørner, Thomas Werge, Janna Saarela, Isabelle Cournu-Rebeix, Vincent Damotte, Bertrand Fontaine, Lena Guillot-Noel, Mark Lathrop, Sandra Vukusik, P
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 175/6, 2018, Seite(n) 1679-1687.e7, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2018.09.049

Multiple sclerosis genomic map implicates peripheral immune cells and microglia in susceptibility

Autoren: Patsopoulos, N.A., Baranzini, S.E., Santaniello, A., Shoostari, P., Cotsapas, C., Wong, G., Beecham, A.H., James, T., Replogle, J., Vlachos, I.S., McCabe, C., Pers, T.H., Brandes, A., White, C., Keenan, B., Cimpean, M., Winn, P., Panteliadis, I-P., Robbins, A., Andlauer, T.F M., Zarzycki, O., Dubois, B., Goris, A., Sondergaard, H.B., Sellebjerg, F., Sorensen, P.S., Ullum, H., Thorner, L.W., Saarel
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 365/6460, 2019, Seite(n) eaav7188, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aav7188

Molecular mimicry between Anoctamin 2 and Epstein-Barr virus nuclear antigen 1 associates with multiple sclerosis risk

Autoren: Katarina Tengvall, Jesse Huang, Cecilia Hellström, Patrick Kammer, Martin Biström, Burcu Ayoglu, Izaura Lima Bomfim, Pernilla Stridh, Julia Butt, Nicole Brenner, Angelika Michel, Karin Lundberg, Leonid Padyukov, Ingrid E. Lundberg, Elisabet Svenungsson, Ingemar Ernberg, Sigurgeir Olafsson, Alexander T. Dilthey, Jan Hillert, Lars Alfredsson, Peter Sundström, Peter Nilsson, Tim Waterboer, Tomas O
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 116/34, 2019, Seite(n) 16955-16960, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1902623116

Prognostic value of white matter lesion shrinking in early multiple sclerosis: An intuitive or naïve notion?

Autoren: Viola Pongratz, Paul Schmidt, Matthias Bussas, Sophia Grahl, Christian Gaser, Achim Berthele, Muna‐Miriam Hoshi, Jan Kirschke, Claus Zimmer, Bernhard Hemmer, Mark Mühlau
Veröffentlicht in: Brain and Behavior, Ausgabe 9/12, 2019, ISSN 2162-3279
Herausgeber: Brain Behav
DOI: 10.1002/brb3.1417

Confounding effect of blood volume and body mass index on blood neurofilament light chain levels

Autoren: Ali Manouchehrinia, Fredrik Piehl, Jan Hillert, Jens Kuhle, Lars Alfredsson, Tomas Olsson, Ingrid Kockum
Veröffentlicht in: Annals of Clinical and Translational Neurology, Ausgabe 7/1, 2019, Seite(n) 139-143, ISSN 2328-9503
Herausgeber: Ann Clin Transl Neurol.
DOI: 10.1002/acn3.50972

A robust pipeline with high replication rate for detection of somatic variants in the adaptive immune system as a source of common genetic variation in autoimmune disease

Autoren: Lies Van Horebeek, Kelly Hilven, Klara Mallants, Annemarie Van Nieuwenhuijze, Tiina Kelkka, Paula Savola, Satu Mustjoki, Susan M Schlenner, Adrian Liston, Bénédicte Dubois, An Goris
Veröffentlicht in: Human Molecular Genetics, Ausgabe 28/8, 2018, Seite(n) 1369-1380, ISSN 0964-6906
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/hmg/ddy425

Somatic Variants: New Kids on the Block in Human Immunogenetics

Autoren: L. Van Horebeek, B. Dubois, A. Goris
Veröffentlicht in: Trends in Genetics, Ausgabe 35/12, 2019, Seite(n) 935-947, ISSN 0168-9525
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2019.09.005

Cytokine and immune cell profiling in the cerebrospinal fluid of patients with neuro-inflammatory diseases

Autoren: Gildas Lepennetier, Zsuzsanna Hracsko, Marina Unger, Martijn Van Griensven, Verena Grummel, Markus Krumbholz, Achim Berthele, Bernhard Hemmer, Markus C. Kowarik
Veröffentlicht in: Journal of Neuroinflammation, Ausgabe 16/1, 2019, ISSN 1742-2094
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12974-019-1601-6

Blood neurofilament light levels segregate treatment effects in multiple sclerosis

Autoren: Bénédicte Delcoigne, Ali Manouchehrinia, Christian Barro, Pascal Benkert, Zuzanna Michalak, Ludwig Kappos, David Leppert, Jon A. Tsai, Tatiana Plavina, Bernd C. Kieseier, Jan Lycke, Lars Alfredsson, Ingrid Kockum, Jens Kuhle, Tomas Olsson, Fredrik Piehl
Veröffentlicht in: Neurology, 2020, Seite(n) 10.1212/WNL.0000000000009097, ISSN 0028-3878
Herausgeber: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1212/wnl.0000000000009097

A systems biology approach uncovers cell-specific gene regulatory effects of genetic associations in multiple sclerosis

Autoren: Madireddy, L., Patsopoulos, N.A., Cotsapas, C., Bos, S.D., Beecham, A., McCauley, J., Kim, K., Jia, X., Santaniello, A., Caillier, S.J., Andlauer, T.F M., Barcellos, L.F., Berge, T., Bernardinelli, L., Martinelli-Boneschi, F., Booth, D.R., Briggs, F., Celius, E.G., Comabella, M., Comi, G., Cree, B.A C., D'Alfonso, S., Dedham, K., Duquette, P., Efthimios, D., Esposito, F., Fontaine, B., Gasperi, C.
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-09773-y

Gsta4 controls apoptosis of differentiating adult oligodendrocytes during homeostasis and remyelination via the mitochondria-associated Fas-Casp8-Bid-axis

Autoren: Karl E. Carlström, Keying Zhu, Ewoud Ewing, Inge E. Krabbendam, Robert A. Harris, Ana Mendanha Falcão, Maja Jagodic, Gonçalo Castelo-Branco, Fredrik Piehl
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-17871-5

C-type lectin receptors Mcl and Mincle control development of multiple sclerosis–like neuroinflammation

Autoren: Marie N’diaye, Susanna Brauner, Sevasti Flytzani, Lara Kular, Andreas Warnecke, Milena Z. Adzemovic, Eliane Piket, Jin-Hong Min, Will Edwards, Filia Mela, Hoi Ying Choi, Vera Magg, Tojo James, Magdalena Linden, Holger M. Reichardt, Michael R. Daws, Jack van Horssen, Ingrid Kockum, Robert A. Harris, Tomas Olsson, Andre O. Guerreiro-Cacais, Maja Jagodic
Veröffentlicht in: Journal of Clinical Investigation, Ausgabe 130/2, 2019, Seite(n) 838-852, ISSN 0021-9738
Herausgeber: American Society for Clinical Investigation
DOI: 10.1172/jci125857

Trends in the environmental risk assessment for the early onset of multiple sclerosis

Autoren: Huang J, Kockum I, Stridh P
Veröffentlicht in: Mult Scler Relat Disord., 2021, ISSN 2211-0356
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.msard.2022.104250

Locus for severity implicates CNS resilience in progression of multiple sclerosis

Autoren: International Multiple Sclerosis Genetics Consortium, MultipleMS Consortium, , Adil Harroud, Pernilla Stridh, Jacob L. McCauley, Janna Saarela, Ingileif Jónsdóttir, Aletta M. R. van den Bosch, Hendrik J. Engelenburg, Ashley H. Beecham, Lars Alfredsson, Katayoun Alikhani, Lilyana Amezcua, Till F. M. Andlauer, Maria Ban, Lisa F. Barcellos, Nadia Barizzone, Tone Berge, Achim Berthele, Stefan Bittne
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 619, 2023, Seite(n) 323–331, ISSN 1476-4687
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06250-x

Association between exposure to combustion-related air pollution and multiple sclerosis risk

Autoren: Hedström AK, Segersson D, Hillert J, Stridh P, Kockum I, Olsson T, Bellander T, Alfredsson L.
Veröffentlicht in: Int J Epidemiol, 2023, ISSN 1464-3685
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1212/nxi.0000000000200056

A topological data analysis based classification method for multiple measurements.

Autoren: Henri Riihimäki, Wojciech Chachólski, Jakob Theorell, Jan Hillert, Ryan Ramanujam
Veröffentlicht in: BMC Bioinformatics, 2020, ISSN 1471-2105
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-020-03659-3

Pregnancy does not modify the risk of MS in genetically susceptible women

Autoren: Cameron J. Adams, Sean L. Wu, Xiaorong Shao, Patrick T. Bradshaw, Edlin Gonzales, Jessica B. Smith, Anny H. Xiang, Kalliope H. Bellesis, Terrence Chinn, Steffan D. Bos, Marte Wendel-Haga, Tomas Olsson, Ingrid Kockum, Annette M. Langer-Gould, Catherine Schaefer, Lars Alfredsson, Lisa F. Barcellos
Veröffentlicht in: Neurology - Neuroimmunology Neuroinflammation, Ausgabe 7/6, 2020, Seite(n) e898, ISSN 2332-7812
Herausgeber: Wolters Kluwer Health, Inc. on behalf of the American Academy of Neurology.
DOI: 10.1212/nxi.0000000000000898

A Scoping Review on Body Fluid Biomarkers for Prognosis and Disease Activity in Patients with Multiple Sclerosis.

Autoren: Barizzone N, Leone M, Pizzino A, Kockum I; MultipleMS Consortium; Martinelli-Boneschi F, D'Alfonso S.
Veröffentlicht in: J Pers Med., 2022, ISSN 2075-4426
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/jpm12091430

Methylome and transcriptome signature of bronchoalveolar cells from multiple sclerosis patients in relation to smoking

Autoren: Mikael V Ringh, Michael Hagemann-Jensen, Maria Needhamsen, Susanna Kullberg, Jan Wahlström, Johan Grunewald, Boel Brynedal, Maja Jagodic, Tomas J Ekström, Johan Öckinger, Lara Kular
Veröffentlicht in: Multiple Sclerosis Journal, 2020, Seite(n) 135245852094376, ISSN 1352-4585
Herausgeber: SAGE Publications
DOI: 10.1177/1352458520943768

Multiple sclerosis lesions in motor tracts from brain to cervical cord: spatial distribution and correlation with disability

Autoren: Anne Kerbrat, Charley Gros, Atef Badji, Elise Bannier, Francesca Galassi, Benoit Combès, Raphaël Chouteau, Pierre Labauge, Xavier Ayrignac, Clarisse Carra-Dalliere, Josefina Maranzano, Tobias Granberg, Russell Ouellette, Leszek Stawiarz, Jan Hillert, Jason Talbott, Yasuhiko Tachibana, Masaaki Hori, Kouhei Kamiya, Lydia Chougar, Jennifer Lefeuvre, Daniel S Reich, Govind Nair, Paola Valsasina, Mar
Veröffentlicht in: Brain, Ausgabe 143/7, 2020, Seite(n) 2089-2105, ISSN 0006-8950
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/brain/awaa162

Multiple sclerosis genomic map implicates peripheral immune cells and microglia in susceptibility.

Autoren: Patsopoulos, Nikolas A; Baranzini, Sergio E; Santaniello, Adams; Shoostari, Parisa; Cotsapas, Chris; Wong, Garrett; Beecham, Ashley H; James, Tojo; Replogle, Joseph; Vlachos, Ioannis S; McCabe, Cristin; Pers, Tune H; Brandes, Aaron; White, Charles; Keenan, Brendan; Cimpean, Maria; Winn, Phoebe; Panteliadis, Ioannis-Pavlos; Robbins, Allison; Andlauer, Till FM; Zarzycki, Onigiusz; Dubois, Benedicte;
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 2019 Sep 27;365(6460):eaav7188., 2019, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aav7188

Enlarged perivascular spaces in multiple sclerosis on magnetic resonance imaging: a systematic review and meta-analysis

Autoren: Tobias Granberg, Thomas Moridi, Judith S. Brand, Susanne Neumann, Martin Hlavica, Fredrik Piehl, Benjamin V. Ineichen
Veröffentlicht in: Journal of Neurology, Ausgabe 267/11, 2020, Seite(n) 3199-3212, ISSN 0340-5354
Herausgeber: Dr. Dietrich Steinkopff Verlag
DOI: 10.1007/s00415-020-09971-5

Ensembl 2021

Autoren: Kevin L Howe, Premanand Achuthan, James Allen, Jamie Allen, Jorge Alvarez-Jarreta, M Ridwan Amode, Irina M Armean, Andrey G Azov, Ruth Bennett, Jyothish Bhai, Konstantinos Billis, Sanjay Boddu, Mehrnaz Charkhchi, Carla Cummins, Luca Da Rin Fioretto, Claire Davidson, Kamalkumar Dodiya, Bilal El Houdaigui, Reham Fatima, Astrid Gall, Carlos Garcia Giron, Tiago Grego, Cristina Guijarro-Clarke, Lea
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 49/D1, 2020, Seite(n) D884-D891, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa942

Machine Learning and Multiparametric Brain MRI to Differentiate Hereditary Diffuse Leukodystrophy with Spheroids from Multiple Sclerosis

Autoren: Gabriel Mangeat, Russell Ouellette, Maxime Wabartha, Benjamin De Leener, Michael Plattén, Virginija Danylaité Karrenbauer, Marcel Warntjes, Nikola Stikov, Caterina Mainero, Julien Cohen‐Adad, Tobias Granberg
Veröffentlicht in: Journal of Neuroimaging, Ausgabe 30/5, 2020, Seite(n) 674-682, ISSN 1051-2284
Herausgeber: Sage Science Press
DOI: 10.1111/jon.12725

Decomposing filtered chain complexes: Geometry behind barcoding algorithms

Autoren: Wojciech Chachólski, Barbara Giunti, Alvin Jin, Claudia Landi
Veröffentlicht in: Computational Geometry, 2023, ISSN 0925-7721
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.comgeo.2022.101938

Supervised Learning Using Homology Stable Rank Kernels

Autoren: Jens Agerberg, Ryan Ramanujam, Martina Scolamiero, Wojciech Chachólski
Veröffentlicht in: Front. Appl. Math. Stat. Sec. Mathematics of Computation and Data Science, 2021, ISSN 2297-4687
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fams.2021.668046

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