Towards Early Molecular Diagnostics of Schizophrenia

Projektinformationen

SZ_TEST

ID Finanzhilfevereinbarung: 734791

DOI

10.3030/734791

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 5 Dezember 2016

Startdatum 1 Januar 2017

Enddatum 30 Juni 2022

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 990 000,00

EU-Beitrag

€ 990 000,00

Koordiniert durch

PROTOBIOS OU
Estonia

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Other (2)

Dissemination and communication plan

Dissemination and communication plan, responsible partner: PB, M5

SZ_TEST events

Project events taking place in months 12 24 36 66

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Promotional materials including a dedicated website

Promotional materials including a dedicated website, responsible partner: PB, M6

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (27)

The Unfolded Protein Response and Autophagy as Drug Targets in Neuropsychiatric Disorders.

Autoren: Srinivasan V, Korhonen L, Lindholm D.
Veröffentlicht in: Front Cell Neurosci., 2020, ISSN 1662-5099
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fncel.2020.554548

Sphingolipids as Modulators of SARS-CoV-2 Infection.

Autoren: Törnquist K, Asghar MY, Srinivasan V, Korhonen L, Lindholm D.
Veröffentlicht in: Front Cell Dev, 2021, ISSN 2296-634X
Herausgeber: Frontiers Media S.A
DOI: 10.3389/fcell.2021.689854

Daughterless, the Drosophila orthologue of TCF4, is required for associative learning and maintenance of the synaptic proteome

Autoren: Tamberg, Laura; Jaago, Mariliis; Säälik, Kristi; Shubina, Anastassia; Kiir, Carl Sander; Sirp, Alex; Timmusk, Tõnis; Palgi, Mari
Veröffentlicht in: Disease Models & Mechanisms, 2020, ISSN 1754-8403
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dmm.042747

The Fuchs corneal dystrophy-associated CTG repeat expansion in the TCF4 gene affects transcription from its alternative promoters

Autoren: Alex Sirp, Kristian Leite, Jürgen Tuvikene, Kaja Nurm, Mari Sepp & Tõnis Timmusk
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-75437-3

PGC-1α Signaling Increases GABA(A) Receptor Subunit α2 Expression, GABAergic Neurotransmission and Anxiety-Like Behavior in Mice.

Autoren: Vanaveski T, Molchanova S, Pham DD, Schäfer A, Pajanoja C, Narvik J, Srinivasan V, Urb M, Koivisto M, Vasar E, Timmusk T, Minkeviciene R, Eriksson O, Lalowski M, Taira T, Korhonen L, Voikar V, Lindholm D
Veröffentlicht in: Front Mol Neurosci., 2021, ISSN 1662-5099
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnmol.2021.588230

Antibody response to oral biofilm is a biomarker for acute coronary syndrome in periodontal disease

Autoren: Jaago M, Pupina N, Rähni A, Pihlak A, Sadam H, Vrana NE, Sinisalo J, Pussinen P, Palm K
Veröffentlicht in: Commun Biol., 2022, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42003-022-03122-4

Functional Annotation of Custom Transcriptomes.

Autoren: Hamid, F., Alasoo, K., Vilo, J., Makeyev, E
Veröffentlicht in: Methods in Molecular Biology, 2022, ISSN 1064-3745
Herausgeber: Humana Press, Inc.
DOI: 10.1007/978-1-0716-2521-7_9

Intronic enhancer region governs transcript-specific Bdnf expression in rodent neurons

Autoren: Jürgen Tuvikene Eli-Eelika Esvald Annika Rähni Kaie Uustalu Anna Zhuravskaya Annela Avarlaid Eugene V Makeyev Tõnis Timmusk
Veröffentlicht in: eLife, 2021, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.65161

A conserved role for the ALS-linked splicing factor SFPQ in repression of pathogenic cryptic last exons

Autoren: Patricia M. Gordon, Fursham Hamid, Eugene V. Makeyev & Corinne Houart
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12, 2021, Seite(n) 1918, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-22098-z

Hybridization-proximity labeling reveals spatially ordered interactions of nuclear RNA compartments

Autoren: Karen Yap; Tek Hong Chung;Eugene V. Makeyev;
Veröffentlicht in: Molecular Cell, 2022, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.10.009

Functional consequences of TCF4 missense substitutions associated with Pitt-Hopkins syndrome, mild intellectual disability, and schizophrenia

Autoren: Alex Sirp, Kaisa Roots, Kaja Nurm, Jürgen Tuvikene, Mari Sepp and Tõnis Timmusk
Veröffentlicht in: Journal of Biological Chemistry, Ausgabe 297, 2021, Seite(n) 101381, ISSN 0021-9258
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2021.101381

Immune response to a conserved enteroviral epitope of the major capsid VP1 protein is associated with lower risk of cardiovascular disease.

Autoren: Pupina N, Avarlaid A, Sadam H, Pihlak A, Jaago M, Tuvikene J, Rähni A, Planken A, Planken M, Kalso E, Tienari PJ, Nieminen JK, Seppänen MRJ, Vaheri A, Lindholm D, Sinisalo J, Pussinen P, Timmusk T, Palm K.
Veröffentlicht in: EBioMedicine, 2022, ISSN 2352-3964
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ebiom.2022.103835

A transcriptome-wide antitermination mechanism sustaining identity of embryonic stem cells

Autoren: Yaroslav A. Kainov, Eugene V. Makeyev
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-14204-z

The Intellectual Disability and Schizophrenia Associated Transcription Factor TCF4 Is Regulated by Neuronal Activity and Protein Kinase A

Autoren: Mari Sepp, Hanna Vihma, Kaja Nurm, Mari Urb, Stephanie Cerceo Page, Kaisa Roots, Anu Hark, Brady J. Maher, Priit Pruunsild, Tõnis Timmusk
Veröffentlicht in: The Journal of Neuroscience, Ausgabe 37/43, 2017, Seite(n) 10516-10527, ISSN 0270-6474
Herausgeber: Society for Neuroscience
DOI: 10.1523/JNEUROSCI.1151-17.2017

Mutant Muscle LIM Protein C58G causes cardiomyopathy through protein depletion

Autoren: Mehroz Ehsan, Matthew Kelly, Charlotte Hooper, Arash Yavari, Julia Beglov, Mohamed Bellahcene, Kirandeep Ghataorhe, Giulia Poloni, Anuj Goel, Theodosios Kyriakou, Karin Fleischanderl, Elisabeth Ehler, Eugene Makeyev, Stephan Lange, Houman Ashrafian, Charles Redwood, Benjamin Davies, Hugh Watkins, Katja Gehmlich
Veröffentlicht in: Journal of Molecular and Cellular Cardiology, Ausgabe 121, 2018, Seite(n) 287-296, ISSN 0022-2828
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.yjmcc.2018.07.248

Recent Insights into the Role of Unfolded Protein Response in ER Stress in Health and Disease

Autoren: Dan Lindholm, Laura Korhonen, Ove Eriksson, Sulev Kõks
Veröffentlicht in: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Ausgabe 5, 2017, ISSN 2296-634X
Herausgeber: Frontiers in Cell and Developmental Biology
DOI: 10.3389/fcell.2017.00048

Altered Expression Profile of IgLON Family of Neural Cell Adhesion Molecules in the Dorsolateral Prefrontal Cortex of Schizophrenic Patients

Autoren: Karina Karis, Kattri-Liis Eskla, Maria Kaare, Karin Täht, Jana Tuusov, Tanel Visnapuu, Jürgen Innos, Mohan Jayaram, Tõnis Timmusk, Cynthia S. Weickert, Marika Väli, Eero Vasar, Mari-Anne Philips
Veröffentlicht in: Frontiers in Molecular Neuroscience, Ausgabe 11, 2018, ISSN 1662-5099
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fnmol.2018.00008

Prostaglandin D2 Receptor DP1 Antibodies Predict Vaccine-induced and Spontaneous Narcolepsy Type 1: Large-scale Study of Antibody Profiling

Autoren: Helle Sadam, Arno Pihlak, Anri Kivil, Susan Pihelgas, Mariliis Jaago, Priit Adler, Jaak Vilo, Olli Vapalahti, Toomas Neuman, Dan Lindholm, Markku Partinen, Antti Vaheri, Kaia Palm
Veröffentlicht in: EBioMedicine, Ausgabe 29, 2018, Seite(n) 47-59, ISSN 2352-3964
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ebiom.2018.01.043

Recent advances in applying mass spectrometry and systems biology to determine brain dynamics

Autoren: Enzo Scifo, Giulio Calza, Martin Fuhrmann, Rabah Soliymani, Marc Baumann, Maciej Lalowski
Veröffentlicht in: Expert Review of Proteomics, Ausgabe 14/6, 2017, Seite(n) 545-559, ISSN 1478-9450
Herausgeber: Future Drugs Ltd.
DOI: 10.1080/14789450.2017.1335200

A Short Tandem Repeat-Enriched RNA Assembles a Nuclear Compartment to Control Alternative Splicing and Promote Cell Survival

Autoren: Karen Yap, Svetlana Mukhina, Gen Zhang, Jason S.C. Tan, Hong Sheng Ong, Eugene V. Makeyev
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 72/3, 2018, Seite(n) 525-540.e13, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2018.08.041

CREB family transcription factors are major mediators of BDNF transcriptional autoregulation in cortical neurons

Autoren: Eli-Eelika Esvald, Jürgen Tuvikene, Alex Sirp, Sudarshan Patil, Clive R. Bramham, Tõnis Timmusk
Veröffentlicht in: The Journal of Neuroscience, 2020, Seite(n) 0367-19, ISSN 0270-6474
Herausgeber: Society for Neuroscience
DOI: 10.1523/jneurosci.0367-19.2019

Isoform-Specific Reduction of the Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factor TCF4 Levels in Huntington's Disease.

Autoren: Nurm K, Sepp M, Castany-Pladevall C, Creus-Muncunill J, Tuvikene J, Sirp A, Vihma H, Blake DJ, Perez-Navarro E, Timmusk T
Veröffentlicht in: eNeuro, 2021, ISSN 2373-2822
Herausgeber: Society for Neuroscience
DOI: 10.1523/eneuro.0197-21.2021

Identification of two highly antigenic epitope markers predicting multiple sclerosis in optic neuritis patients.

Autoren: Sadam H, Pihlak A, Jaago M, Pupina N, Rähni A, Toots M, Vaheri A, Nieminen JK, Siuko M, Tienari PJ, Palm K.
Veröffentlicht in: EBioMedicine, 2021, ISSN 2352-3964
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ebiom.2021.103211

Melanoma-specific antigen-associated antitumor antibody reactivity as an immune-related biomarker for targeted immunotherapies.

Autoren: Rähni A, Jaago M, Sadam H, Pupina N, Pihlak A, Tuvikene J, Annuk M, Mägi A, Timmusk T, Ghaemmaghami AM, Palm K.
Veröffentlicht in: Commun Med, 2022, ISSN 2730-664X
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1038/s43856-022-00114-7

Differential patterns of cross-reactive antibody response against SARS-CoV-2 spike protein detected for chronically ill and healthy COVID-19 naïve individuals.

Autoren: Jaago M, Rähni A, Pupina N, Pihlak A, Sadam H, Tuvikene J, Avarlaid A, Planken A, Planken M, Haring L, Vasar E, Baćević M, Lambert F, Kalso E, Pussinen P, Tienari PJ, Vaheri A, Lindholm D, Timmusk T, Ghaemmaghami AM, Palm K.
Veröffentlicht in: SciRep, 2022, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-022-20849-6

Analysis of RNA-containing compartments by hybridization and proximity labeling in cultured human cells

Autoren: Karen Yap; Tek Hong Chung; Eugene V. Makeyev;
Veröffentlicht in: STAR Protocols, 2022, ISSN 2666-1667
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101139

Tuba8 drives Differentiation of Cortical Radial Glia into Apical Intermediate Progenitors by Tuning Modifications of Tubulin C Termini.

Autoren: Ramos SI, Makeyev EV, Salierno M, Kodama T, Kawakami Y, Sahara S. Tuba
Veröffentlicht in: Dev Cell, Ausgabe 15345807, 2020, ISSN 1534-5807
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2020.01.036

Other (1)

High seroreactivity against SARS-CoV-2 Spike epitopes in a pre SARS-CoV-2 cohort: implications for antibody testing and vaccine design

Autoren: Kaia Palm; Mariliis Jaago; Annika Rähnni, Nadezhda Pupina; Arno Pihlak; Helle Sadam; Annela Avarlaid; Anu Planken; Planken; Liina Haring; Eero Vasar; Miljana Bacevic; Eija Kalso; Pirkko J. Pussinen; Pentti J. Tienari;Antti Vaheri; Dan Lindholm; Tõnis Timmusk; Amir M. Ghaemmaghami;ni;
Veröffentlicht in: 2020
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2020.05.18.20105189