Biophysical mechanisms of long-range transcriptional regulation

Projektinformationen

BioMeTRe

ID Finanzhilfevereinbarung: 759366

DOI

10.3030/759366

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 4 September 2017

Startdatum 1 Januar 2018

Enddatum 31 Dezember 2023

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 500 000,00

EU-Beitrag

€ 1 500 000,00

Koordiniert durch

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Switzerland

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (12)

Cohesin and CTCF control the dynamics of chromosome folding

Autoren: Pia Mach, Pavel I. Kos, Yinxiu Zhan, Julie Cramard, Simon Gaudin, Jana Tünnermann, Edoardo Marchi, Jan Eglinger, Jessica Zuin, Mariya Kryzhanovska, Sebastien Smallwood, Laurent Gelman, Gregory Roth, Elphège P. Nora, Guido Tiana & Luca Giorgetti
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group

deepBlink: Threshold-independent detection and localization of diffraction-limited spots

Autoren: Bastian Th. Eichenberger; Bastian Th. Eichenberger; Yinxiu Zhan; Markus Rempfler; Luca Giorgetti; Jeffrey A. Chao
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 2, 2021, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2020.12.14.422631

DamC reveals principles of chromatin folding in vivo without crosslinking and ligation

Autoren: Josef Redolfi, Yinxiu Zhan, Christian Valdes-Quezada, Mariya Kryzhanovska, Isabel Guerreiro, Vytautas Iesmantavicius, Tim Pollex, Ralph S. Grand, Eskeatnaf Mulugeta, Jop Kind, Guido Tiana, Sebastien A. Smallwood, Wouter de Laat, Luca Giorgetti
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe 26/6, 2019, Seite(n) 471-480, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0231-0

The bipartite TAD organization of the X-inactivation center ensures opposing developmental regulation of Tsix and Xist

Autoren: Joke G. van Bemmel, Rafael Galupa, Chris Gard, Nicolas Servant, Christel Picard, James Davies, Anthony James Szempruch, Yinxiu Zhan, Jan J. Żylicz, Elphège P. Nora, Sonia Lameiras, Elzo de Wit, David Gentien, Sylvain Baulande, Luca Giorgetti, Mitchell Guttman, Jim R. Hughes, Douglas R. Higgs, Joost Gribnau, Edith Heard
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 51/6, 2019, Seite(n) 1024-1034, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-019-0412-0

A symmetric toggle switch explains the onset of random X inactivation in different mammals

Autoren: Verena Mutzel, Ikuhiro Okamoto, Ilona Dunkel, Mitinori Saitou, Luca Giorgetti, Edith Heard, Edda G. Schulz
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe 26/5, 2019, Seite(n) 350-360, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0214-1

A Conserved Noncoding Locus Regulates Random Monoallelic Xist Expression across a Topological Boundary

Autoren: Rafael Galupa, Elphège Pierre Nora, Rebecca Worsley-Hunt, Christel Picard, Chris Gard, Joke Gerarda van Bemmel, Nicolas Servant, Yinxiu Zhan, Fatima El Marjou, Colin Johanneau, Patricia Diabangouaya, Agnès Le Saux, Sonia Lameiras, Juliana Pipoli da Fonseca, Friedemann Loos, Joost Gribnau, Sylvain Baulande, Uwe Ohler, Luca Giorgetti, Edith Heard
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 77/2, 2020, Seite(n) 352-367.e8, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.10.030

Chromosome Conformation Capture and Beyond: Toward an Integrative View of Chromosome Structure and Function

Autoren: Rachel Patton McCord, Noam Kaplan, Luca Giorgetti
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 77/4, 2020, Seite(n) 688-708, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.12.021

Challenges and guidelines toward 4D nucleome data and model standards

Autoren: Marc A. Marti-Renom, Genevieve Almouzni, Wendy A. Bickmore, Kerstin Bystricky, Giacomo Cavalli, Peter Fraser, Susan M. Gasser, Luca Giorgetti, Edith Heard, Mario Nicodemi, Marcelo Nollmann, Modesto Orozco, Ana Pombo & Maria-Elena Torres-Padilla
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2018, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0236-3

HP1 drives de novo 3D genome reorganization in early Drosophila embryos

Autoren: Fides Zenk, Yinxiu Zhan, Pavel Kos, Eva Löser, Nazerke Atinbayeva, Melanie Schächtle, Guido Tiana, Luca Giorgetti & Nicola Iovino
Veröffentlicht in: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-03460-z

Integrative approaches to study enhancer–promoter communication

Autoren: Pia Mach, Luca Giorgetti
Veröffentlicht in: Current Opinion in Genetics & Development, 2023, ISSN 0959-437X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.gde.2023.102052

Integrating experiment, theory and simulation to determine the structure and dynamics of mammalian chromosomes

Autoren: g tiana, l giorgetti
Veröffentlicht in: Elsevier, 2017, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2017.10.016

Nonlinear control of transcription through enhancer–promoter interactions

Autoren: Jessica Zuin; Gregory Roth; Yinxiu Zhan; Julie Cramard; Josef Redolfi; Ewa Piskadlo; Pia Mach; Mariya Kryzhanovska; Gergely Tihanyi; Hubertus Kohler; Mathias Eder; Christ Leemans; Bas van Steensel; Peter Meister; Sebastien Smallwood; Luca Giorgetti
Veröffentlicht in: Zuin, Jessica; Roth, Gregory; Zhan, Yinxiu; Cramard, Julie; Redolfi, Josef; Piskadlo, Ewa; Mach, Pia; Kryzhanovska, Mariya; Tihanyi, Gergely; Kohler, Hubertus; Eder, Mathias; Leemans, Christ; van Steensel, Bas; Meister, Peter; Smallwood, Sebastien; Giorgetti, Luca (2022). Nonlinear control of transcription through enhancer-promoter interactions. Nature, 604(7906), pp. 571-577. Springer Nature 10.1, Ausgabe 5, 2022, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04570-y