Biophysical mechanisms of long-range transcriptional regulation

Informacje na temat projektu

BioMeTRe

Identyfikator umowy o grant: 759366

DOI

10.3030/759366

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 4 Września 2017

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2018

Data zakończenia 31 Grudnia 2023

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 500 000,00

Wkład UE

€ 1 500 000,00

Koordynowany przez

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Switzerland

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (12)

Cohesin and CTCF control the dynamics of chromosome folding

Autorzy: Pia Mach, Pavel I. Kos, Yinxiu Zhan, Julie Cramard, Simon Gaudin, Jana Tünnermann, Edoardo Marchi, Jan Eglinger, Jessica Zuin, Mariya Kryzhanovska, Sebastien Smallwood, Laurent Gelman, Gregory Roth, Elphège P. Nora, Guido Tiana & Luca Giorgetti
Opublikowane w: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group

deepBlink: Threshold-independent detection and localization of diffraction-limited spots

Autorzy: Bastian Th. Eichenberger; Bastian Th. Eichenberger; Yinxiu Zhan; Markus Rempfler; Luca Giorgetti; Jeffrey A. Chao
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 2, 2021, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2020.12.14.422631

DamC reveals principles of chromatin folding in vivo without crosslinking and ligation

Autorzy: Josef Redolfi, Yinxiu Zhan, Christian Valdes-Quezada, Mariya Kryzhanovska, Isabel Guerreiro, Vytautas Iesmantavicius, Tim Pollex, Ralph S. Grand, Eskeatnaf Mulugeta, Jop Kind, Guido Tiana, Sebastien A. Smallwood, Wouter de Laat, Luca Giorgetti
Opublikowane w: Nature Structural & Molecular Biology, Numer 26/6, 2019, Strona(/y) 471-480, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0231-0

The bipartite TAD organization of the X-inactivation center ensures opposing developmental regulation of Tsix and Xist

Autorzy: Joke G. van Bemmel, Rafael Galupa, Chris Gard, Nicolas Servant, Christel Picard, James Davies, Anthony James Szempruch, Yinxiu Zhan, Jan J. Żylicz, Elphège P. Nora, Sonia Lameiras, Elzo de Wit, David Gentien, Sylvain Baulande, Luca Giorgetti, Mitchell Guttman, Jim R. Hughes, Douglas R. Higgs, Joost Gribnau, Edith Heard
Opublikowane w: Nature Genetics, Numer 51/6, 2019, Strona(/y) 1024-1034, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-019-0412-0

A symmetric toggle switch explains the onset of random X inactivation in different mammals

Autorzy: Verena Mutzel, Ikuhiro Okamoto, Ilona Dunkel, Mitinori Saitou, Luca Giorgetti, Edith Heard, Edda G. Schulz
Opublikowane w: Nature Structural & Molecular Biology, Numer 26/5, 2019, Strona(/y) 350-360, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0214-1

A Conserved Noncoding Locus Regulates Random Monoallelic Xist Expression across a Topological Boundary

Autorzy: Rafael Galupa, Elphège Pierre Nora, Rebecca Worsley-Hunt, Christel Picard, Chris Gard, Joke Gerarda van Bemmel, Nicolas Servant, Yinxiu Zhan, Fatima El Marjou, Colin Johanneau, Patricia Diabangouaya, Agnès Le Saux, Sonia Lameiras, Juliana Pipoli da Fonseca, Friedemann Loos, Joost Gribnau, Sylvain Baulande, Uwe Ohler, Luca Giorgetti, Edith Heard
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 77/2, 2020, Strona(/y) 352-367.e8, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.10.030

Chromosome Conformation Capture and Beyond: Toward an Integrative View of Chromosome Structure and Function

Autorzy: Rachel Patton McCord, Noam Kaplan, Luca Giorgetti
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 77/4, 2020, Strona(/y) 688-708, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.12.021

Challenges and guidelines toward 4D nucleome data and model standards

Autorzy: Marc A. Marti-Renom, Genevieve Almouzni, Wendy A. Bickmore, Kerstin Bystricky, Giacomo Cavalli, Peter Fraser, Susan M. Gasser, Luca Giorgetti, Edith Heard, Mario Nicodemi, Marcelo Nollmann, Modesto Orozco, Ana Pombo & Maria-Elena Torres-Padilla
Opublikowane w: Nature Genetics, 2018, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0236-3

HP1 drives de novo 3D genome reorganization in early Drosophila embryos

Autorzy: Fides Zenk, Yinxiu Zhan, Pavel Kos, Eva Löser, Nazerke Atinbayeva, Melanie Schächtle, Guido Tiana, Luca Giorgetti & Nicola Iovino
Opublikowane w: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-03460-z

Integrative approaches to study enhancer–promoter communication

Autorzy: Pia Mach, Luca Giorgetti
Opublikowane w: Current Opinion in Genetics & Development, 2023, ISSN 0959-437X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.gde.2023.102052

Integrating experiment, theory and simulation to determine the structure and dynamics of mammalian chromosomes

Autorzy: g tiana, l giorgetti
Opublikowane w: Elsevier, 2017, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2017.10.016

Nonlinear control of transcription through enhancer–promoter interactions

Autorzy: Jessica Zuin; Gregory Roth; Yinxiu Zhan; Julie Cramard; Josef Redolfi; Ewa Piskadlo; Pia Mach; Mariya Kryzhanovska; Gergely Tihanyi; Hubertus Kohler; Mathias Eder; Christ Leemans; Bas van Steensel; Peter Meister; Sebastien Smallwood; Luca Giorgetti
Opublikowane w: Zuin, Jessica; Roth, Gregory; Zhan, Yinxiu; Cramard, Julie; Redolfi, Josef; Piskadlo, Ewa; Mach, Pia; Kryzhanovska, Mariya; Tihanyi, Gergely; Kohler, Hubertus; Eder, Mathias; Leemans, Christ; van Steensel, Bas; Meister, Peter; Smallwood, Sebastien; Giorgetti, Luca (2022). Nonlinear control of transcription through enhancer-promoter interactions. Nature, 604(7906), pp. 571-577. Springer Nature 10.1, Numer 5, 2022, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04570-y