Biophysical mechanisms of long-range transcriptional regulation

Informazioni relative al progetto

BioMeTRe

ID dell’accordo di sovvenzione: 759366

DOI

10.3030/759366

Progetto chiuso

Data della firma CE 4 Settembre 2017

Data di avvio 1 Gennaio 2018

Data di completamento 31 Dicembre 2023

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 500 000,00

Contributo UE

€ 1 500 000,00

Coordinato da

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Switzerland

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (12)

Cohesin and CTCF control the dynamics of chromosome folding

Autori: Pia Mach, Pavel I. Kos, Yinxiu Zhan, Julie Cramard, Simon Gaudin, Jana Tünnermann, Edoardo Marchi, Jan Eglinger, Jessica Zuin, Mariya Kryzhanovska, Sebastien Smallwood, Laurent Gelman, Gregory Roth, Elphège P. Nora, Guido Tiana & Luca Giorgetti
Pubblicato in: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group

deepBlink: Threshold-independent detection and localization of diffraction-limited spots

Autori: Bastian Th. Eichenberger; Bastian Th. Eichenberger; Yinxiu Zhan; Markus Rempfler; Luca Giorgetti; Jeffrey A. Chao
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 2, 2021, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2020.12.14.422631

DamC reveals principles of chromatin folding in vivo without crosslinking and ligation

Autori: Josef Redolfi, Yinxiu Zhan, Christian Valdes-Quezada, Mariya Kryzhanovska, Isabel Guerreiro, Vytautas Iesmantavicius, Tim Pollex, Ralph S. Grand, Eskeatnaf Mulugeta, Jop Kind, Guido Tiana, Sebastien A. Smallwood, Wouter de Laat, Luca Giorgetti
Pubblicato in: Nature Structural & Molecular Biology, Numero 26/6, 2019, Pagina/e 471-480, ISSN 1545-9993
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0231-0

The bipartite TAD organization of the X-inactivation center ensures opposing developmental regulation of Tsix and Xist

Autori: Joke G. van Bemmel, Rafael Galupa, Chris Gard, Nicolas Servant, Christel Picard, James Davies, Anthony James Szempruch, Yinxiu Zhan, Jan J. Żylicz, Elphège P. Nora, Sonia Lameiras, Elzo de Wit, David Gentien, Sylvain Baulande, Luca Giorgetti, Mitchell Guttman, Jim R. Hughes, Douglas R. Higgs, Joost Gribnau, Edith Heard
Pubblicato in: Nature Genetics, Numero 51/6, 2019, Pagina/e 1024-1034, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-019-0412-0

A symmetric toggle switch explains the onset of random X inactivation in different mammals

Autori: Verena Mutzel, Ikuhiro Okamoto, Ilona Dunkel, Mitinori Saitou, Luca Giorgetti, Edith Heard, Edda G. Schulz
Pubblicato in: Nature Structural & Molecular Biology, Numero 26/5, 2019, Pagina/e 350-360, ISSN 1545-9993
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0214-1

A Conserved Noncoding Locus Regulates Random Monoallelic Xist Expression across a Topological Boundary

Autori: Rafael Galupa, Elphège Pierre Nora, Rebecca Worsley-Hunt, Christel Picard, Chris Gard, Joke Gerarda van Bemmel, Nicolas Servant, Yinxiu Zhan, Fatima El Marjou, Colin Johanneau, Patricia Diabangouaya, Agnès Le Saux, Sonia Lameiras, Juliana Pipoli da Fonseca, Friedemann Loos, Joost Gribnau, Sylvain Baulande, Uwe Ohler, Luca Giorgetti, Edith Heard
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 77/2, 2020, Pagina/e 352-367.e8, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.10.030

Chromosome Conformation Capture and Beyond: Toward an Integrative View of Chromosome Structure and Function

Autori: Rachel Patton McCord, Noam Kaplan, Luca Giorgetti
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 77/4, 2020, Pagina/e 688-708, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.12.021

Challenges and guidelines toward 4D nucleome data and model standards

Autori: Marc A. Marti-Renom, Genevieve Almouzni, Wendy A. Bickmore, Kerstin Bystricky, Giacomo Cavalli, Peter Fraser, Susan M. Gasser, Luca Giorgetti, Edith Heard, Mario Nicodemi, Marcelo Nollmann, Modesto Orozco, Ana Pombo & Maria-Elena Torres-Padilla
Pubblicato in: Nature Genetics, 2018, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0236-3

HP1 drives de novo 3D genome reorganization in early Drosophila embryos

Autori: Fides Zenk, Yinxiu Zhan, Pavel Kos, Eva Löser, Nazerke Atinbayeva, Melanie Schächtle, Guido Tiana, Luca Giorgetti & Nicola Iovino
Pubblicato in: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-03460-z

Integrative approaches to study enhancer–promoter communication

Autori: Pia Mach, Luca Giorgetti
Pubblicato in: Current Opinion in Genetics & Development, 2023, ISSN 0959-437X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.gde.2023.102052

Integrating experiment, theory and simulation to determine the structure and dynamics of mammalian chromosomes

Autori: g tiana, l giorgetti
Pubblicato in: Elsevier, 2017, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2017.10.016

Nonlinear control of transcription through enhancer–promoter interactions

Autori: Jessica Zuin; Gregory Roth; Yinxiu Zhan; Julie Cramard; Josef Redolfi; Ewa Piskadlo; Pia Mach; Mariya Kryzhanovska; Gergely Tihanyi; Hubertus Kohler; Mathias Eder; Christ Leemans; Bas van Steensel; Peter Meister; Sebastien Smallwood; Luca Giorgetti
Pubblicato in: Zuin, Jessica; Roth, Gregory; Zhan, Yinxiu; Cramard, Julie; Redolfi, Josef; Piskadlo, Ewa; Mach, Pia; Kryzhanovska, Mariya; Tihanyi, Gergely; Kohler, Hubertus; Eder, Mathias; Leemans, Christ; van Steensel, Bas; Meister, Peter; Smallwood, Sebastien; Giorgetti, Luca (2022). Nonlinear control of transcription through enhancer-promoter interactions. Nature, 604(7906), pp. 571-577. Springer Nature 10.1, Numero 5, 2022, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04570-y