Elucidating the causes and consequences of the global pattern of epigenetic variation in Arabidopsis thaliana

Projektinformationen

EPICLINES

ID Finanzhilfevereinbarung: 789037

DOI

10.3030/789037

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 15 Mai 2018

Startdatum 1 Juni 2018

Enddatum 31 Mai 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 498 468,00

EU-Beitrag

€ 2 498 468,00

Koordiniert durch

GREGOR MENDEL INSTITUT FUR MOLEKULARE PFLANZENBIOLOGIE GMBH
Austria

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Non-peer reviewed articles (3)

Towards an unbiased characterization of genetic polymorphism

Autoren: Anna A. Igolkina, Sebastian Vorbrugg, Fernando A. Rabanal, Hai-Jun Liu, Haim Ashkenazy, Aleksandra E. Kornienko, Joffrey Fitz, Max Collenberg, Christian Kubica, Almudena Mollá Morales, Benjamin Jaegle, Travis Wrightsman, Vitaly Voloshin, Victor Llaca, Viktoria Nizhynska, Ilka Reichardt, Christa Lanz, Felix Bemm, Pádraic J. Flood, Sileshi Nemomissa, Angela Hancock, Ya-Long Guo, Paul Kersey, Detle
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.05.30.596703

Alternative silencing states of Transposable Elements in Arabidopsis

Autoren: Valentin Hure, Florence Piron-Prunier, Tamara Yehouessi, Clémentine Vitte, Aleksandra E. Kornienko, Gabrielle Adam, Magnus Nordborg, Angélique Déléris
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.03.16.585326

Bisulphite sequencing in the presence of cytosine-conversion errors

Autoren: Thomas James Ellis, Viktoria Nyzhynska, Rahul Pisupati, Almudena Mollá-Morales, Magnus Nordborg
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.09.16.613193

Peer reviewed articles (6)

Extensive sequence duplication in Arabidopsis revealed by pseudo-heterozygosity

Autoren: Benjamin Jaegle, Rahul Pisupati, Luz Mayela Soto-Jiménez, Robin Burns, Fernando A. Rabanal, Magnus Nordborg
Veröffentlicht in: Genome Biology, Ausgabe 24, 2023, ISSN 1474-760X
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-023-02875-3

Population-level annotation of lncRNAs in Arabidopsis reveals extensive expression variation associated with transposable element–like silencing

Autoren: Aleksandra E Kornienko, Viktoria Nizhynska, Almudena Molla Morales, Rahul Pisupati, Magnus Nordborg
Veröffentlicht in: The Plant Cell, Ausgabe 36, 2023, Seite(n) 85-111, ISSN 1040-4651
Herausgeber: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plcell/koad233

Conditional GWAS of non-CG transposon methylation in Arabidopsis thaliana reveals major polymorphisms in five genes

Autoren: Eriko Sasaki; Joanna Gunis; Ilka Reichardt-Gomez; Viktoria Nizhynska; Magnus Nordborg
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 18(9), 2022, Seite(n) 1-24, ISSN 1553-7390
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1010345

Common alleles of CMT2 and NRPE1 are major determinants of CHH methylation variation in Arabidopsis thaliana

Autoren: Eriko Sasaki, Taiji Kawakatsu, Joseph R. Ecker, Magnus Nordborg
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 15/12, 2019, Seite(n) e1008492, ISSN 1553-7390
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1008492

On the causes of gene-body methylation variation in Arabidopsis thaliana

Autoren: Rahul Pisupati, Viktoria Nizhynska, Almudena Mollá Morales, Magnus Nordborg
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 19, 2023, Seite(n) e1010728, ISSN 1553-7390
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1010728

Genetic basis of Arabidopsis thaliana responses to infection by naïve and adapted isolates of turnip mosaic virus

Autoren: Anamarija Butkovic, Thomas James Ellis, Ruben Gonzalez, Benjamin Jaegle, Magnus Nordborg, Santiago F Elena
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 12, 2024, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.89749